Lagopus muta (rock ptarmigan): 125698394
Help
Entry
125698394 CDS
T09141
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
lmut
Lagopus muta (rock ptarmigan)
Pathway
lmut04350
TGF-beta signaling pathway
lmut04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lmut00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
125698394 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
125698394 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lmut00536
]
125698394 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lmut00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
125698394 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125698394
NCBI-ProteinID:
XP_048812610
LinkDB
All DBs
Position
10:10065512..10213158
Genome browser
AA seq
2869 aa
AA seq
DB search
MWRGRLLGIALGVAVLWASQAGAAAAAGHSEGTSAKELRASRAKRRGQGGGGHDALKGPN
VCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPNGQIAPSCGSKSIQ
HCNIRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCENGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQC
ERDYRTGPCFTLVTNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIP
NIRTGACQDVDECQAIPGICQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCDDIDECSTIPG
ICDGGECSNTVSSYFCKCPPGFYTAPDGLKCIDVRPGYCFSTLTNGRCGNQLPQPLSKMQ
CCCDSGRCWSSTAASAPEMCPIRSTDEYRKLCAVAALLPARPDLPPGRPEVIPPPLLPGP
YPPLVPQQPEIVYPSRAPPPHVILPVNFTDYCQLFRHLCLNGHCIPTPGSYRCKCNKGFQ
LDVRGECIDVDECEKNPCISGDCVNTQGSYMCQCRVGYQSTPTRTECRDIDECLQNGRIC
NNGRCINTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECNIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKPG
FQLASDGRYCRDIDECETAGICMNGRCVNTDGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRSTC
YGGYKRGQCVRPLTGAVTKSECCCASTDYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGSGMTAGG
NDINECLLDPDLCPNGRCENLHGTYKCICNPGYEVDSTGKNCIDIDECALNMLLCDNGQC
RNTPGSFTCTCPKGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCVNGVCKNTPGSFACECSPESTLDTT
RTICIETVKGTCWQNMVDGRCEININGATLKSECCSTLGAAWGSPCTQCERDRICQKGFS
RVRGTVCEDVNECEVFPGVCTNGQCVNTLGSFVCQCPSGMTLDASGRTCLDIRLESCYLQ
HEDEQCTAQIPGRHRMDACCCSVGAAWGFECEECPLKGSPEFEALCPRGSGFSTKIEITG
KPFSKDINECKMVPSLCTHGKCRNTIGSFKCRCDSGFALDSEERNCTDIDECRISPDLCG
QGICVNTPGDFECECFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPLLCRGGTCINTEGSFRCDCPP
GHHISPNISACIDINECDLSTNLCRNGHCVNLIGKYQCACNPGYQSTPDKLYCVDIDECS
IMNGGCENFCTNSEGSYECSCKQGFALMPDHRTCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPGEYR
CLCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLHPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTGCTD
INECEIGAHNCDRHAVCTNTPGSFKCSCSSGWIGNGIKCTDLDECSNGTHMCSPHADCKN
TMGSYRCLCKEGYTGDGFTCTDLDECSENLNLCENGQCLNAPGGYRCECDMGFLPSLDGK
ACEDIDECSLPNICVYGTCHNLPGLFRCECEVGYELDRSGGNCTDVNECADPTTCISGTC
VNTAGSYTCECPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIKTRGDNGGTFCSNEIGVGVSKASC
CCSLGRAWGVPCEQCPSVNTTEYKVLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGKC
INTFGSFQCQCPSGYYLNEETRVCDDVNECDTPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYMQVN
GGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIPSTD
EFSTLCGSQRPGFFIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGICINMVGSFRCECPVGFFYNDK
LLICEDIDECQNGPVCQQNAECVNTAGSYRCDCKPGYRFTSTGRCTDRNECQEIPNICSH
GQCIDTVGSFYCICHNGFKTNDDRTMCIDINECERDACGNGTCRNTIGSFNCRCNLGFIL
SHNNDCIDVDECASGNGMLCRNGQCVNTIGSFQCLCNDGYEVALDGRTCVDVNECALEPG
KCAPGTCQNLDGSFRCICPPGYVLQNDKCEDIDECVEQPEICALGTCSNTPGSFKCLCPE
GFVLSSTGRRCQDLRVSYCFTKFEDGKCSVPKSRNHSKQECCCALKGQGWGDPCELCPEE
ADEAFRQICPFGIGILVGPGDARLDVDECLDPDNCKFGQCINTDGSFRCECPYGYILQET
QCVDTDECAVGNPCGNGTCRNVVGGFECTCVDGFEPGPMMTCEDVNECIQNPLLCAFRCV
NTFGSYECKCPAGYVLREDRRMCRDQNECEEGSHDCDSKQMECKNLIGTYMCICGPGYQR
RPDGEGCIDENECQTKPGLCENGRCVNTVGSYRCECNEGFTVSDTQNECLDNREGYCFTE
VLQSMCQIGSSNRNSVTKSECCCDGGRGWGPNCEVCPFPGTVAFKKLCPHGRGYMSNGAD
IDECKVIHDVCRNGECINERGSYRCHCNLGYTTDITGTLCIDLNECNESPKPCNFICKNT
EGSFQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHHTAC
IDNNECATEINLCGAKGICQNTPGSFVCECQRGFSLDQTGLSCEDVDECDGNHRCQHGCQ
NIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQYEQF
SGGCQDINECGSAQAPCSYGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQGHCVSGVGLGKGQGQELSL
SGEMDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRSTNETANEAEDEQELEPPVSLASWDIEKAA
VFSINISDLSNKDRILKLLPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGFFRINKKDGISYLHFTKKKP
VPGNYSLQISSIPLYKKKELNQLEEKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggcgggggcggctgctggggatcgccctgggagttgccgtgctgtgggcgtcccag
gcgggcgccgccgccgccgccgggcactccgaggggacgagcgccaaggagctgcgggcc
agccgggccaagaggagagggcagggcggcggcgggcacgacgcgctcaaaggaccaaat
gtgtgtggatcacgttacaatgcttactgttgccctggatggaaaactttacctggtgga
aaccaatgcatagtcccaatttgcagacattcctgtggggatggattttgctctagacca
aacatgtgcacatgcccaaatggtcagatagccccctcctgtggttcaaaatcaatacaa
cactgtaacatccggtgcatgaatggaggtagctgtagtgatgaccactgcctctgtcag
aagggatatacaggaacgcattgtggacagcctgtctgtgaaaatggatgtcttaacgga
ggaagatgcgttgccccaaaccgctgtgcatgcacatatggatttactggaccccagtgt
gaaagagattacaggaccggcccttgcttcactttggtcacgaaccagatgtgccaggga
cagctcagtggaatagtctgcacaaaaaccctttgctgtgcaactgttgggagagcatgg
ggccacccctgtgaaatgtgtcctgcacagccacatccctgtcgacgaggcttcattcca
aacattcgaactggggcctgtcaagatgtggatgaatgccaagctatccctgggatctgt
caagggggaaattgcattaatactgttggatcttttgagtgcaaatgcccagctggacac
aagtttaatgaagtgacacaaaaatgcgatgatattgatgaatgcagcaccattcctgga
atctgtgatggaggagagtgctcaaacacagtcagtagttacttctgcaagtgtcctcca
gggttttatacagctcctgatggcttaaaatgcatagatgtgcgtcctggatactgcttc
tctactctgaccaatgggcgctgtggcaatcagctcccacagcctttgtccaaaatgcag
tgttgctgtgacagcggccgatgctggtcttctactgcagccagcgcccctgaaatgtgc
ccaatcagatccactgatgagtatcgcaaattgtgcgcagtagctgctctgctgccagca
agacctgaccttcctccaggccgtcctgaagtcatccctccaccccttcttcctggtcct
taccctcccctagtccctcagcagccagaaattgtctatccgtctcgggctccaccacct
catgtgatcttgccggtgaacttcactgactattgccagctgttccggcatctctgcctt
aatgggcattgtattcctactcctgggagctaccgctgcaagtgcaacaagggcttccaa
ctggacgttagaggggaatgtattgatgttgatgaatgtgagaagaatccatgtatcagt
ggagactgtgtgaatacccagggatcctacatgtgccagtgtcgagtagggtatcagagc
acaccaactagaacagagtgccgagacattgatgaatgcttacagaatggccgtatctgc
aataatggacgatgcataaatacagatggcagttttcactgtgtgtgcaacgctggcttt
caagtggcagctgatgggaaaaactgcgaagatatggacgaatgcaacataaggaatatg
tgcctgaatgggatgtgcatcaatgaagatggcagttttaaatgtatttgtaaaccgggg
ttccagctggcatctgatggacgctattgcagagacatcgatgagtgtgagacagctgga
atatgcatgaacggacgctgtgtgaacactgatggctctttcagatgtgaatgcttccct
ggccttgcagtaggcctcgatggacgtgtgtgtgttgatactcatatgcgaagcacgtgc
tacggtggctacaagagaggacaatgtgtgagaccattaactggtgcagttacaaaatca
gagtgctgctgtgccagcactgactatgccttcggggagccttgtcagccctgtccagca
caaaattcagctgaatatcaggctctatgcagtagtggatctggtatgactgcaggagga
aatgacattaatgagtgcttactggatcctgatctctgtcccaatggaaggtgtgagaat
ctgcatggaacatacaaatgtatttgtaaccctgggtatgaagtggattcaactgggaaa
aattgcattgatattgatgaatgtgcgctgaacatgctgctttgtgataatgggcaatgc
agaaatacccctggaagtttcacttgcacttgtcccaaaggatttgtatacactcctgac
ctaaaaacatgtgaagatattgacgagtgcgaatctaatccctgcgttaatggggtatgc
aaaaacactccaggctctttcgcttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatacaaca
agaactatctgcatagaaactgttaagggtacctgttggcagaacatggtagatggaaga
tgtgagataaatatcaatggagcaactctgaagtctgagtgctgttcaacactgggtgct
gcttggggtagcccgtgtacgcagtgtgaacgagaccgaatatgccaaaagggattttca
agagtaagaggaacagtatgtgaagatgtaaatgaatgtgaggtgtttcctggagtctgt
accaatgggcagtgtgtcaataccctgggatcgtttgtttgccagtgccccagtggaatg
actttagatgcttctggacggacttgtcttgacattcgcttggagagttgctacctgcaa
catgaagatgagcaatgcactgcacaaataccaggccgacaccgaatggatgcttgctgc
tgttcagtgggggcagcgtggggctttgagtgtgaggaatgccctctgaagggatcacct
gaatttgaagctctttgtccccgagggtctgggttctctacaaagatagagataactggg
aaacctttctctaaagatatcaatgaatgtaaaatggtccccagtctttgtactcatgga
aaatgcagaaacaccattggcagttttaaatgcagatgtgacagtggatttgcccttgat
tctgaagagaggaactgtacagatattgatgaatgccgcatctctcctgatctttgtggc
caaggcatctgtgtcaatactcctggagactttgaatgtgaatgttttgaaggctatgaa
agtggatttatgatgatgaagaactgcatggacatcgatgagtgtcagcgcaatcccctt
ctctgccgaggtggcacctgcatcaacacagagggaagttttcggtgtgattgtcctcca
ggccatcacatatcaccaaatatctctgcatgtatagacattaatgaatgtgacctaagc
accaatttgtgccgaaacggacattgcgtcaacctgattggaaagtatcagtgtgcttgc
aaccctggttatcagtccacacctgacaagttatactgtgttgatattgatgaatgcagc
ataatgaatggtggctgtgagaacttctgtacaaactcagagggcagctatgaatgtagc
tgtaaacaagggtttgcactcatgccagaccacaggacatgcacagatattgatgagtgt
gaagataatccaaatatctgcgatggaggccaatgcacaaacatcccaggagaatacaga
tgtctttgctatgatggattcatggcatctgaagacatgaagacttgtgtagatgttaat
gaatgtgatctgcatccaaacatttgtctgagtggaacctgtgagaacacaaaaggctca
tttatctgccattgtgatatgggatattcaggcaagaaaggcacaactggatgcacagat
atcaatgagtgtgaaattggagcccataactgtgatagacacgccgtttgtacaaacaca
ccaggaagttttaaatgtagctgcagcagcggctggattggaaatggtatcaaatgcaca
gatctggatgagtgctccaatggaacccacatgtgtagcccacatgctgactgcaagaat
acaatgggctcttaccgctgcctgtgcaaagaaggttatactggggatggcttcacttgt
acagacctagatgaatgctccgaaaacttgaatctctgtgaaaatgggcagtgcctcaat
gccccaggagggtatcgctgtgaatgtgatatgggatttttgccaagtctggatgggaaa
gcatgtgaagatattgatgagtgctcacttcctaacatctgtgtctatggaacttgtcat
aaccttcctggacttttccgatgcgagtgtgaagtgggctatgagttggacagaagtggt
ggtaattgcacagatgttaatgaatgtgcagatcccacaacctgcattagtggtacatgt
gtcaatacagctggtagttacacctgtgagtgccctccagattttgaactgaatcccacc
cgtgttggctgcgttgatacacgatcaggcaactgttacctggacattaaaactcgtgga
gataatggtggcaccttctgcagcaatgaaattggagtgggtgtttctaaggcttcctgt
tgctgctccctgggcagagcttggggagttccctgtgaacagtgcccatctgtgaacaca
actgagtataaggttctttgccctggaggagaaggattccgaccgaaccctattacagtt
atattagaggatattgatgaatgtcaagaactgcctgggctctgccaaggaggaaaatgt
attaatacatttggtagcttccagtgtcagtgtccatcaggttactatttgaatgaggag
actcgagtatgtgatgatgtgaatgagtgtgatacacctggcatttgtggacctggcacg
tgttacaatactgttgggaactacacctgcatctgtcctcctgattacatgcaagtcaat
ggagggaacaactgtatggatatgagaagaagtctgtgctacagaaattattatgctgac
aatcaaacctgtgatggcgaactactctttaatatgaccaagaaaatgtgctgttgttcg
tacaacattggacgtgcatggaataagccttgtgaacagtgtcctatccctagcactgat
gagttttctacactctgtggaagtcaaaggcctggattcttcattgacatttacacagga
ttaccagttgatattgatgaatgcagagagattcctggagtgtgtgaaaatggaatctgt
ataaacatggttggcagcttccgatgcgagtgtccggtgggcttcttctacaatgacaag
ctgctgatctgtgaagatatcgatgaatgccaaaacggaccagtgtgccagcaaaatgca
gaatgtgtcaacacagctgggagctaccgttgtgactgtaaacctggctataggttcaca
tcaactggccgctgcactgatcggaatgaatgtcaagaaattcccaatatctgcagccat
gggcagtgcatcgacactgttggaagtttttactgcatttgtcacaatggattcaagacc
aacgacgacagaacaatgtgtatagatattaatgaatgtgagagagatgcctgtggcaat
ggtacctgtagaaacaccattggctctttcaactgccgctgcaatttgggattcattctc
tcgcacaacaatgactgcatagatgtggatgaatgtgcaagtggaaatgggatgctctgc
aggaacggtcagtgtgtgaacactattggatccttccaatgtctgtgcaatgatggctat
gaggtggctctggatggaaggacttgtgttgatgtcaatgagtgtgcactggagcctgga
aaatgcgcgccaggcacatgccagaacttggatgggtcattcagatgcatttgtcctcct
ggatatgtcctgcaaaatgacaaatgtgaagacattgatgagtgcgtggaacagccagaa
atttgtgccctgggcacatgcagcaacactccaggcagtttcaaatgcctgtgtccagaa
ggttttgtgttgtcttccacaggaaggcggtgccaagatctgcgagtgagttactgcttt
accaaatttgaagatggaaaatgttctgtgccaaagtcccgaaaccactccaaacaagaa
tgttgttgtgccctaaaaggacagggatggggagatccctgtgaactctgcccagaggaa
gcagacgaggcattcagacaaatttgtccatttggaattggcatccttgttggacctggt
gatgcaagactggatgtggatgagtgccttgatccagataactgtaaatttggccagtgt
atcaacacggatggatctttccgctgtgaatgtccatatggttacatcctacaagaaact
caatgtgtggatactgatgaatgtgctgttggaaatccatgtggaaatggaacttgcagg
aatgtggtgggaggttttgaatgtacctgtgttgatgggtttgagcctggaccaatgatg
acctgtgaagatgtcaacgagtgcattcagaaccctctgctctgcgctttccgctgtgtg
aacacttttggatcctatgagtgcaagtgccctgcagggtatgttctgcgagaggaccgg
agaatgtgcagagatcagaatgagtgtgaagaaggcagtcatgattgtgactcaaaacaa
atggagtgcaaaaacctaataggcacctatatgtgcatctgcggaccaggttaccaacgc
aggccagatggagaaggttgtatagatgagaatgaatgtcagaccaagcctggactctgt
gagaatggtcggtgtgtaaacacagtgggaagttacagatgtgaatgcaatgagggattc
acagtcagtgacactcagaacgaatgccttgacaacagggaaggctactgcttcactgaa
gtcttacaaagtatgtgtcagattggatcaagtaacagaaactctgtcaccaagtctgaa
tgctgctgtgatggtggccgaggctgggggccaaactgcgaggtctgccccttcccaggc
actgtggcctttaagaagctttgtcctcatggtcggggatacatgtccaatggagcagat
attgatgagtgcaaggttatccacgatgtctgccgtaatggggaatgcatcaatgaaagg
ggatcttaccgttgtcactgcaaccttggctatactacagatataactggcactctttgc
atagatctgaatgaatgtaatgagtcccccaaaccttgcaatttcatctgcaaaaacaca
gaggggagcttccagtgttcatgtccaaaagggtacatccttcaagaagatgggagaagc
tgcaaagatcttgatgaatgtgcaacaaagcagcacaactgccagttcctttgtgtcaac
actattgggggctttacttgtaaatgtcctccgggattcactcagcaccatacagcctgc
attgataataatgaatgtgctacagaaattaatttatgtggggcaaaaggtatttgccag
aatactccaggaagttttgtgtgtgaatgtcagcgtggcttctcactcgaccagactggg
cttagctgtgaagatgttgatgaatgtgatggaaaccatcggtgtcagcatggctgccaa
aacataatcggaggatacaggtgtagctgcccacaaggatatctccagcattaccagtgg
aaccaatgtgttgatgaaaatgaatgtctaagtgcacacatttgtggaggagcatcttgc
cacaatactttgggaagctataaatgtatgtgccctaccggatttcagtatgaacagttt
agtggaggttgccaagatatcaatgaatgcggttctgcacaagccccatgcagttatggt
tgttcaaatactgaaggtggctatgtctgtggatgtccacctggttacttcagaatagga
caaggacactgtgtttctggagttgggctaggcaaaggtcaaggacaagagctttcactc
agcggagaaatggatgacaactccctctctccagaagcttgctatgaatgtaaaatcaat
ggctatcccaagagaggaaggaagcgcaggagtactaatgaaactgcaaatgaagcagag
gatgagcaagagctggagcctccagtcagtcttgccagctgggatattgagaaagcagca
gtcttttctatcaacatctccgatctcagtaacaaagatcgcatcctgaaactgcttcct
gccctcacaacactgacaaaccataaccgatatttaattgactccggaaacgaagatggt
ttctttagaatcaataagaaggacggaataagttaccttcatttcacaaagaagaagcca
gtgcctggaaactattcattacaaatcagtagcattccactctataaaaagaaggaactt
aaccagcttgaagagaaacatgacaaagactacctcagtggtgagctgggagataacctg
aaaatgaaaattcagatattgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
