Leptotrichia rugosa: AB8B22_09085
Help
Entry
AB8B22_09085 CDS
T10901
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
lrug Leptotrichia rugosa
Pathway
lrug01501
beta-Lactam resistance
lrug01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
Transporters [BR:
lrug02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AB8B22_09085
Antimicrobial resistance genes [BR:
lrug01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
AB8B22_09085
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XDU66549
UniProt:
A0AB39VGZ7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1782789..1785863)
Genome browser
AA seq
1024 aa
AA seq
DB search
MTVAEFATKRVVSTTMILIFMIFAGWVAMTGMKQERIPDFDIPIVVINATWTGATAEDVK
TQVSKKLEDAALNVDGIKNITTSSSYGSSVVTIEFNYGVDTDIKQVQVQTQIDKIKGQLP
DDDNFKDPTVSKMDATGSSNMALMIGITGKNKELITSFVEETLQPRLKRNRGIGNISVMG
NATRQIKVWLNPSRLKEYNLSAAEIYSKIKAANTVTPAGTITDGTKEFILKVDGELKELD
QIQDIVISNQNNQTVRLADVAKVEYGTEDPTSYVTYNGKEMVAVMIQKSKDGNLVEVAKK
AKETLKEAKPLFPEGSNYNIIVDNSEQVSKSIQNVASSGLQAVIITIIVLFVFLKNLRAS
LVVGTLIPISAMFTFFLLTTQGITLNMISLMGLSLAVGSLVDNGVVTLDNIFDHIQVNKE
PANVAAIRGTNEVILPMMASTATSVCVFLPIILFDGIAKEVFKSIAFSMMFALSASIIVA
MLWVPMASSLFLDVKKISENSEKAARFNTFRDKYKELVAKVLENRWKMVIGVVIAFVVVV
FGIGKTVKTTFFPTIDDNQYSVVATLATGLDLDVSRDIANKMEAVVKADPVTKDINVLAS
KGAAVINVDVKKDTMKAMNRVREKLKDLPNVTLAVSPQKAGGRSSQKDYSFQIEGDDPQE
LDRIANSIMNDMKRQSWFKDVKSSTEGGYPQAKLEVDRVKAESYGITVTDITQMLFMTAS
GSANPIDVTQSTETLDVVLELEKNQKNSLNKIMDLEIKTNKGTYVRLGDIATMQYEESAS
TISTENGTRIVTVGANLDKSKGFNDAAAFIQQSFKKTNPAEGYKIGVAGQAKNQSEMGGQ
IMKDLLLAIVLIYTVLAVQLESFILPLMIMTTLPLSMIGVIFGLAITRIQLSMFVMIGIL
MLFGMAVNNAIVMLDFVAGLRKKGWTIHDALVEACGSRLRPILMTTLTTVLGWLPMVFSS
KGSSGYYQGMAIAVMFGLSFCTVLTLFFTPVLYSLVEERKERKQKEREERRRQEKEEERR
GYAK
NT seq
3075 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagtagcagaatttgcaacgaagagagtagtgtcgacaacgatgatacttatattt
atgatttttgctggttgggtagcgatgacaggtatgaaacaggaaagaataccagatttc
gatataccgatagttgttattaatgccacttggacgggagcaacagcggaggatgtaaaa
acacaagtatcaaaaaaactagaagatgcggcattaaatgtagatggaattaaaaatata
acaacttcatcttcttatggttcatcagtagttacgatagagtttaactatggtgtagat
acggatattaaacaggtacaagttcaaacacaaatagataaaataaaaggacaattgcca
gatgatgataactttaaagatcctacagtatcaaaaatggatgcgacaggtagttccaat
atggcactgatgattgggattactgggaaaaataaagagttaataacatcatttgttgaa
gaaacattacagcctagattgaagagaaatagaggtattggtaatatttctgtaatgggt
aatgcgacaagacaaattaaagtttggttgaatccatctagattaaaggagtataatttg
tcagcggcagaaatttatagtaaaataaaagcggctaatacggtaacaccagcaggtaca
ataactgatgggacgaaagaatttatcttaaaagttgatggagagttaaaagagcttgat
caaattcaggatattgttatttcaaatcaaaataatcaaacggttagattggctgatgtg
gcaaaagttgagtatggaacagaggatccaacatcgtatgtaacatataatggaaaagaa
atggttgctgttatgattcaaaagagtaaagatggtaacttggtggaggttgcgaaaaag
gctaaggaaactttgaaagaagcaaaaccattatttccagaaggttctaattataatata
atagttgataacagtgaacaagttagtaaatcaatacaaaatgttgcgagttccgggctg
caagcggttatcattacaattatagtgctttttgtattcttgaaaaacttgagagcatca
ttagttgtaggaacattgattccaatttcagcaatgtttacattcttcttgcttacaaca
caagggataacactgaatatgatttcgttaatgggattgtcacttgcggttgggtcactg
gtagataacggggttgttacgctggataatatttttgatcatattcaggttaataaggaa
ccagcaaatgtagcagcgatacgaggtacaaatgaagtaattcttccaatgatggcatca
acggcaacttcagtttgtgtattcttgccaattatattatttgacggaatagctaaggaa
gtatttaagagtattgcgttttcaatgatgtttgcgttgtcagcttcgattattgttgcg
atgttatgggttccgatggcttcaagtttatttttagatgttaaaaaaatctcagaaaat
tctgaaaaagctgctagatttaatacatttagagataaatacaaggaattagtggcaaaa
gtattggaaaatagatggaaaatggtaattggagttgtaatagcatttgtagtagttgta
tttggaataggaaaaacagtaaaaactacattctttccaacgattgatgataatcaatat
tcggtggttgcgacgcttgcgacaggattagatttagatgtatcgagagatattgcgaat
aaaatggaagctgttgtaaaagcagatccagtaactaaagatataaatgtacttgcttca
aagggtgcagcggtaataaatgtcgatgtaaaaaaagacacaatgaaagcaatgaaccgt
gttagggaaaaattaaaggatttaccaaatgtaacacttgcagtttcgccacaaaaagca
ggaggtcgttcgtcgcagaaagattattcgtttcaaatagaaggtgatgatccacaagaa
ttagacagaattgcaaattcaataatgaatgacatgaagagacagtcttggtttaaagat
gtcaagtcatcaactgagggtgggtatccacaagctaagttggaagttgatagagtaaaa
gcagaaagttatggaataactgtaacagatattactcaaatgttatttatgacagcttct
ggatctgcaaatccgattgatgtaactcaaagtacagaaacattggatgtagtattggaa
ttggaaaaaaatcaaaaaaattcattgaataaaattatggatttagagataaaaactaat
aaaggaacttatgttagattaggagatattgctacaatgcaatatgaagaaagtgcttca
actatttcaacagaaaatggtacaagaattgtaacagttggtgcaaacttggataaatca
aaaggatttaacgatgcagcagcatttattcaacagtcattcaagaaaacaaatccagct
gaaggatacaaaattggggtagcaggacaagctaaaaaccaatctgaaatgggtggacaa
attatgaaagacttgttgcttgcgattgtgttgatttatacagtacttgcggttcagcta
gaatcatttatattgccgcttatgattatgacaacattgccgctttctatgattggagta
atttttggattagcgataactagaatacaacttagtatgttcgttatgatcggtattttg
atgttatttggtatggcggttaataatgcgattgtaatgcttgatttcgttgcaggattg
cgaaaaaaaggctggacgatacacgatgccttagtagaagcctgtggttcaagacttcga
ccaattttaatgacaacacttacaacagtattaggatggcttccaatggtattttcaagt
aaaggaagttcgggatactatcaaggtatggcaattgcagtaatgtttggactttcattc
tgtacggtgttgacattgttttttacaccagtattgtattcattagttgaagaaagaaaa
gaaagaaaacaaaaagaaagagaagaaagaagaagacaagaaaaagaagaagaaagaaga
ggatatgctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system