Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121421815
Help
Entry
121421815 CDS
T11173
Name
(RefSeq) fibrillin-1-like
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
lvg Lytechinus variegatus (green sea urchin)
Pathway
lvg04350
TGF-beta signaling pathway
lvg04518
Integrin signaling
lvg04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
121421815
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
121421815
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
121421815
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lvg00536
]
121421815
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lvg00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
121421815
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF_3
EGF
hEGF
EGF_TEN
FXa_inhibition
Plasmod_Pvs28
He_PIG
EGF_MSP1_1
NIDO
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121421815
NCBI-ProteinID:
XP_041472548
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(13001568..13131941)
Genome browser
AA seq
3187 aa
AA seq
DB search
MNYREGDLQWQSTTKEISARVGYNIIESVSNLYESNDEGTRDLSYSRDTRIGNTGQMGSY
IYRLDTNTADYINPCVGCLTWYEEDLASTYNYSAASVCPCTKPQAARDINFRKCVFPRGS
DTDFSSSSYSSVQCYQSSTDIDEGYRCTYISNALVTEYQSLWESSNFVSVLIPNNRNSLY
DDWKRDDVFPREMCCMMTSGLLGEYYCNLYQERRPQITSCDGYYPPTAGQGDGDPHFQTI
DGKEYTFNGLGEYIVLQYNDGNPFTVQMRTGRAFKNGVPINSGTVFTGVAASQGRTEMSL
ILNDERTALLLSINGTAVNISTLLTDGYVSSDPTFTMRIDDEEVSTVDDLRIIAIFNLPD
YPSSGINARFTNGLLSSQVFIAREYATSGAANGLLGLINGDATDDFQFQNGTILMDTIEG
NLTEEQIFEFGQSWMTTAAESIFEYYDRDWAYYNDPSFVPQFFSSLEAADPVLAEQARAT
CGNNTACIFDTLAVDALLGLHTLNSQNSFEAVLHDLDNFPPNITSVVENSVTNALAESDM
GVLRVTVGQPVSLQITASDPNEGDVIQFSLEGSVPNATIDSVTGVFEWTPQSIEDSSQRI
VIVASDSTGANALLIYKVKICECFNGGTCQFNTEASNQDLNNNGFAVVICDCTAGWTGDH
CDIDFNPCDGYCYDQVLCTDNLPPSLDAICGPCPSYLTGDGQQCTNIDECANATLNECDQ
ICADKLDGYDCSCNDGYILHPDQRGCIDIDECRNETTHACRNNSLCNNIIGSYECYCEDG
FSPITNDNTNCEDIDECSDMSSCDPQATCENNIGSFLCTCNEGYFGNGTTCSDVNECLDP
LANDCAIEASCTNEVGGFSCTCDDGWTGNGTFCDNINECSNNMDDCSNDAMCMDNPGSYV
CICNDGYIGNGRECFDIDECATGLDNCTSMDQCLNTNGSFVCRCLDGYAFDAQGIDCEDI
NECNGDPGCDLNAACMNTDGSFICSCENGYEGNGTFCQDINECDLGTHNCQQMCVNDVPG
FNCTCFEGFQLENDGTCQVSSSAMCNSTMQLVCGTVACIMQSGEPSCVCEAGFQFNATLQ
ICEDIDECIGNNTCESDNLCENFDGGYNCTCNSGYELDSNGRTCSDIDECQLGLDSCDGN
AACINTEGNYTCSCNSGFMGDGNICSDVDECMTLTPCSMNASCADTIGSFTCMCLPGYTG
DGFNCVDIDECELGSDNCHMNADCINNNGSFNCLCDPGYTGDGLTCENIDECDSMPCGEN
ADCTDDDGSFTCSCQLGYQGDPYMSCIDINECQNPALFSCHPLASCINTPGNFTCECDEG
YEGNGTNDCSDRNECDDILEFCGPFSTCVNSDGSYECMCLEGFLKESVDSNCTDLNECDT
VQNTCPPDISTCTNIDGDFNCTCHTGFENDTPKSCIDINECDRGTDNCMGGEDCINVIGD
FRCICSENFTEIVGSCEASLSLELRVRFEAILGLVVSASPTVLDSSANLNQLEGDMLSFL
QSTPELGLNGLAVTVLNVNVTGQYAYVDFRVDVNTTLSMNNMELESVFFNSLPDNQRFGS
LAQQNVVSQEDVDECMDDSELCSNGTCTNTIGSFYCTCNEGYMEDDAGTACLDIDECDDS
SLCTNGECENNNGSFSCICNEGFEINVSGDQCQDIDECNGDNECTGTGICMNTEGSYTCI
CIPGYQLSPNMTSCEDINECLNDPSLCANGICDNTQSSYICMCNEGFVESSNGRACDDID
ECLESPCGNGTCTNNNGSYTCACNEGFELSSNGSTCSDIDECAGNVNPCFNGTCTNTIGS
YTCNCSIGFTLSNDSSTCGVSCGSSVCQNGGTCIGSNQCSCITGFNGSVCENNIDDCSPD
PCMNEATCNDGVDSFTCSCVSGYTGNLCQMDIDECTEDSTLCTNGRCFNLNGTFTCVCNT
NFTLTNGSACTAITNDLATSKVRVNITGTALNEEPLVYTTDLTIRSSAIFIELEIKFCFV
FREYVRNLLGQQLEAYNCIVIAFSQGSVVADIEMELGAGTQDTADGLALTLTEMASNFSG
SLSADGQTLDASIAINVQCDQTNCQNGGSCITSGDPCDCLAGFNGDLCQNDINECLSDPC
MNGGNCTEGVDYFNCACPDGYNGTMCEEDIDECQASNPCVNGNCTNNMGSYTCNCNNGYM
LSPDGSTCIDIDECLGDNPCVNGTCDNTDGSYTCNCTVGFQLSSDNSTCDVECGNSVCEN
GGSCIDGNCSCVAGFNGTMCENNIDDCLPDPCVNGGNCTDGVNYFTCTCPDGYNGTMCEE
DIDECSGTNPCDQGNCTNTNGSYTCSCYSGFMLSQDESTCIDIDECSGNNLCINGTCDNE
SGYYTCTCDDGFMLSVDNSTCIDIDECLESNPCGNGTCSNNNGSYTCSCDNGYELSIDAS
TCNDIDECTGSNPCVNGTCNNNDGSYTCSCDSGFMFNGSTCNDIDECSGSNPCVNGTCNN
NDGSYTCSCDTGFMFNGSTCNDIDECSGSNPCVNGTCNNNDGSYTCSCDTGFMFNGSTCN
DIDECSGSNPCVNGTCSNNDGSYTCSCVIGFMFNGSTCNDIDECTGTNPCGNGTCNNNDG
SYTCSCDNGFAELSLDASTCIDIDECAVNNPCVNGTCSNNNGSYTCSCNSGFELSLDAST
CNDIDECAGNNPCVNGSCTNNNGSYTCSCDSGFMFNGSTCNDIDDCSPNPCANGGTCTDG
LNSFTCSCASGFSGDTCTDVTCGTISCQNGGTCTTPEQCDCVTGFNGTMCENNIDDCSPD
PCLNGVCVDGVNSFSCNCTTGFTDDTCETEVCGSNACQNGGSCANANTGQCSCVTGYIGD
MCEININDCSPNPCENGGNCTDGLNSFTCSCPTAFTGITCQTDVDECVDSSLCTNGRCVN
LAGSYTCVCNMGFTLTNTDSCTAISSSLATSSVRIRLTGVRLNGLPLTFTADLTNRSSAL
FMEYDTSYCFIFTNYVSALLSIGLPSCEVVGFSQGSIIGVLDLTIAAATQTLADDLALEV
PTLSTNSLLASFNGITLEGSFNANVQCDQTNCQNGGSCITSGDPCDCLAGFNGDLCQNDT
GNSELSVGAIIGIALGVFGFVIIIVGCVCCMFLQSFRQNQATKAMLSNGRYDYPSFNMNG
SYDGSEEYDSFEGRRMAVGQALDRLRGNGAMYNGNGRSPEEGRNFRTPYVVGDRDTENGV
ERNPVYF
NT seq
9564 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactatcgtgaaggtgatcttcaatggcaatcaactacaaaagaaatttcagctcga
gttggatacaacatcattgaaagtgtatcaaatctatatgagagcaatgatgaaggaaca
agagatcttagttatagccgggacacacgcattggaaacactggtcagatgggtagctat
atctaccgtctggatacaaacacagctgattatatcaatccttgtgttggatgtttaact
tggtatgaggaggacctggctagtacatacaattattctgctgcttctgtgtgtccctgt
acaaaacctcaggctgctagggacattaacttcagaaagtgtgtgtttccaaggggaagt
gatacagatttcagtagttccagctatagttcagtacagtgttaccagtcttccacagat
atagatgagggataccgatgtacatatatcagtaatgcccttgtcacagagtaccagagc
ttgtgggagtccagtaattttgtttcagttttgattccaaacaacagaaactcattgtat
gatgattggaaacgtgatgatgttttcccaagagagatgtgttgtatgatgacatctggt
ctactaggtgaatactattgtaatctttatcaagaacgtcgtccacaaattacaagttgt
gatggctactaccctcctaccgctggtcagggagatggtgacccacattttcaaacaatt
gatgggaaggaatacacgttcaatggattgggggagtacatagtactacagtacaatgat
ggcaatccatttactgttcagatgcggacaggtagagcattcaagaatggagtacccatt
aattctgggacagtgttcactggagttgctgcatcacaaggacgcacagagatgtcactt
attttgaatgacgaaagaacagccttgcttttatctatcaatgggactgcagtcaatatt
agtactttactcacagatggttatgtttcttctgacccaactttcacaatgcgcattgat
gatgaagaagtttctactgtagacgaccttaggatcattgcaatcttcaatctgccagac
tatccaagctctggaattaatgcacgttttacaaatggattattatcatcacaagttttt
attgctcgagagtatgccactagtggagcagcaaatggcctattaggcttgattaatgga
gatgcaactgatgatttccagttccagaatggaaccattctcatggacacgattgaggga
aatttaacagaagaacaaatctttgaatttggacaaagttggatgactacagcagctgaa
tctatttttgaatactatgatcgtgattgggcttattataatgatcccagctttgtacct
cagttcttttcaagcctagaagctgctgatccagtattagcagaacaagctcgagcaaca
tgtggcaataatacagcatgcatatttgataccttggcagttgatgccttgcttggtctt
catacattgaattcacaaaattcctttgaagctgtattgcatgacttagacaactttcca
ccaaacatcacatcagttgttgagaacagtgtaaccaatgccttagcagagagtgacatg
ggtgtactacgtgttactgttggacaaccagtttctttacaaattactgcatcggatcct
aatgagggagatgttatacagttttcattggaaggttctgttccaaatgcaactatagat
agtgtaactggtgtatttgaatggactcctcaaagcatagaagattcttcacagaggatt
gtgattgtagccagtgattctacgggagcgaatgcattgctaatctataaagttaagatt
tgtgagtgtttcaatgggggaacatgtcagttcaacacagaagcatcaaatcaagacctc
aacaacaatggatttgctgttgttatttgtgactgtacagctggctggacaggtgatcat
tgtgatatagactttaatccgtgtgatggttattgttatgatcaagttctctgcactgat
aatttaccaccatcattggatgccatatgtggaccatgcccatcatatcttacaggagat
ggtcaacaatgtaccaatattgatgagtgtgcaaacgccacactaaatgagtgtgatcag
atatgtgctgacaaacttgatgggtatgattgttcatgtaatgatggctatatattacat
cctgatcaacggggatgcattgatattgatgaatgtagaaatgaaactacacatgcatgc
agaaacaacagtctttgtaacaatattattggttcatatgaatgctattgtgaagatgga
ttctcaccaattacaaatgataatacaaactgcgaagatattgatgagtgcagtgacatg
agttcatgtgatccacaggcaacatgcgaaaacaatattggctctttcttatgcacatgt
aatgaaggttactttggaaatggaacgacatgttcagatgtaaatgagtgtctggaccca
cttgccaatgactgtgccatagaagcgagctgtactaatgaagtaggaggcttttcatgt
acatgtgatgatggatggactgggaatggaaccttctgtgataacattaatgagtgctct
aataacatggatgattgtagtaatgatgcaatgtgtatggacaacccaggcagctatgtt
tgcatctgtaatgatggctatatcggaaatggaagggaatgctttgacatcgatgagtgt
gctactggactagataactgcacctcgatggatcaatgtctcaacacgaatggatcgttt
gtttgtcggtgcttagatggctatgcctttgatgcacaagggattgattgtgaagatatc
aatgaatgcaatggtgatcctggctgtgatctcaatgcagcatgcatgaatacagatggc
tcatttatttgttcatgtgaaaatggatatgaagggaatggaacgttctgtcaagatata
aatgaatgtgatcttggtactcataactgtcagcagatgtgtgttaatgatgttcctgga
tttaattgcacctgttttgaagggttccagttagagaatgatggtacatgtcaagtgtct
tcttctgccatgtgtaactcaacaatgcaattggtttgtggaacggttgcttgtattatg
caatcaggagaaccaagttgtgtgtgtgaggcaggatttcagttcaatgcaactcttcaa
atctgtgaagatattgatgaatgcattggaaacaatacatgtgagtcagataacctgtgt
gagaactttgatggaggatataattgtacctgcaattctggatatgaacttgattcaaat
ggaagaacatgctcagacattgatgaatgtcaactaggtcttgatagctgtgatgggaat
gctgcatgtataaacaccgaaggaaactacacctgttcttgtaattctggcttcatggga
gatggaaatatatgttctgatgtggatgagtgcatgactctaactccatgctccatgaat
gcaagttgtgcagatacaatcggctcattcacctgcatgtgtcttcctggatacactgga
gatggattcaattgtgttgatattgatgaatgtgaacttggaagtgataactgtcatatg
aatgctgactgtatcaacaataatggaagcttcaattgtctttgtgatcctggctataca
ggagatggacttacatgtgaaaatattgacgaatgtgactcaatgccttgtggagaaaat
gctgactgtacagatgatgatggttccttcacatgctcctgtcaattaggataccaagga
gatccttatatgagttgcatagacatcaatgagtgccagaacccagcattgttctcatgt
catccactcgcatcttgtataaacacacctggtaacttcacatgtgaatgtgatgagggc
tatgagggcaatgggactaatgattgctcagatcgtaatgaatgtgatgacatccttgag
ttttgtggaccttttagcacctgtgtaaactctgatggatcctatgaatgtatgtgcctt
gaaggtttcttgaaagagtctgtggacagtaactgtactgatttgaatgaatgtgacact
gttcaaaacacctgtcctcctgatatctctacatgcactaacatagatggtgatttcaac
tgtacatgtcacactgggtttgagaatgacacacccaaatcttgcattgacataaatgag
tgtgaccgtggtaccgacaactgtatgggcggtgaagattgtatcaatgttattggagat
tttaggtgtatttgcagcgaaaacttcactgaaatcgttggaagctgtgaagcttcatta
tccttggaattgagagtaagatttgaagctatcctaggacttgttgtttcagccagccca
actgttcttgattcttctgcaaatcttaatcaacttgaaggagatatgctctcattcctt
caaagtactccagaacttggattaaacggccttgctgtaacagtattaaatgtgaatgtg
actggtcagtatgcatatgtagacttcagggttgatgtcaacacaacgttgagtatgaat
aacatggagttagaatcagtgtttttcaattctcttccggataaccagcggtttggatct
cttgcccaacaaaacgtggttagtcaagaggatgttgatgaatgtatggatgattctgag
ctttgcagcaatggaacttgtacaaacactattggatctttctactgcacatgcaatgaa
ggatatatggaagatgacgcaggcactgcttgtttagacattgatgaatgtgatgattca
agcctgtgtacaaatggagagtgtgaaaacaacaatggttcattttcttgcatttgtaat
gaaggatttgaaatcaatgtttcgggtgatcagtgccaagatatcgatgagtgcaatggt
gataatgaatgcactggtactggaatatgcatgaacactgagggatcatacacatgtatt
tgtattccaggatatcaactcagcccaaatatgacttcttgtgaagatattaatgagtgt
ttgaatgatccttcactctgtgctaatggaatatgtgacaatacacagtcatcatatatc
tgcatgtgtaatgaaggatttgtagagtctagcaatggacgagcttgtgacgacatagac
gagtgtctggaaagcccttgtggtaatgggacctgcaccaataacaatggatcttacaca
tgtgcctgtaatgaaggctttgaactgagtagtaatggcagtacatgttcagatattgat
gaatgtgctggaaatgttaatccctgcttcaatggtacctgtaccaataccatcggatca
tatacatgcaactgcagcattggatttactttgagtaatgatagcagtacatgtggggtt
tcatgtggttcatctgtgtgtcaaaatggtgggacatgcataggttctaatcaatgttcc
tgtattactggatttaatgggtctgtgtgtgagaataatatagatgattgttcccctgat
ccttgcatgaatgaagcgacttgtaatgatggtgttgacagcttcacctgctcctgtgtg
tccggttatactggaaatctatgtcaaatggatattgatgaatgtactgaggattcaact
ctttgtaccaatggaagatgtttcaatctcaatggaactttcacctgcgtatgcaacact
aatttcacattgacgaatggaagtgcctgcactgctatcacaaatgaccttgctacaagt
aaagtgagggtgaatattacaggaactgcactaaatgaagagcccttagtttacactaca
gacttaactattaggtcatcggccatattcattgaattagagattaaattctgttttgtg
tttagggaatatgtgaggaaccttttgggtcaacagctcgaagcgtataattgcattgtg
atagcatttagccaaggcagtgtggttgctgatatagaaatggaactgggtgctggcacc
caagatactgcagacggacttgcactgactttaactgaaatggccagcaactttagtgga
tctttatcagctgatggacaaacccttgatgcaagtatagcaataaatgttcaatgtgat
cagacgaattgtcagaatggaggatcttgtattacttcaggagacccatgtgattgcctg
gctggtttcaatggagatctatgccaaaatgatatcaatgaatgcctgtcggatccttgc
atgaatggagggaattgcacggagggggttgactacttcaactgtgcttgcccagatggt
tacaatggaactatgtgtgaagaagatattgatgagtgtcaagcaagtaatccttgtgta
aatggaaattgcacgaataacatgggatcttatacatgcaactgtaacaacggatatatg
cttagtcctgatggtagtacatgcattgatattgatgaatgccttggggacaatccctgc
gtcaatggaacatgtgataatactgatggatcttacacttgcaactgtactgttggtttt
cagttaagttctgataacagtacatgtgatgttgagtgtggtaattcagtttgtgagaat
ggtggatcatgtatagacggtaactgttcttgtgtggcgggattcaatggaactatgtgt
gaaaacaatattgatgattgtttacctgatccctgtgtgaatggagggaattgcacggat
ggggttaactacttcacctgcacttgtccagatggttacaatggaactatgtgtgaagaa
gatatcgatgagtgctcaggaactaatccttgtgaccagggcaattgcactaataccaat
ggatcatatacatgcagctgctacagtggttttatgctaagccaagatgaaagtacatgc
attgatattgacgagtgttcaggaaataatctgtgtataaatggcacatgtgacaatgaa
tctggatattatacttgcacctgtgatgatggattcatgttaagtgttgataacagtaca
tgcattgatattgatgagtgcttggaaagtaatccttgtggaaatggtacatgtagtaat
aacaatggatcttatacatgtagctgtgataatggttatgagttaagcattgatgccagt
acatgtaatgatatcgacgagtgtactggatctaatccttgtgtaaatggtacatgtaat
aataatgatggatcctatacatgtagctgtgactctggttttatgttcaatggcagtaca
tgcaatgatattgatgagtgctctggatctaatccttgtgtaaatggtacatgtaataat
aatgatggatcctatacatgtagctgtgacactggttttatgttcaatggcagtacatgc
aatgatattgatgagtgctctggatctaatccttgtgtaaatggtacatgtaataataat
gatggatcctatacatgtagctgtgacactggttttatgttcaatggcagtacatgcaat
gatattgatgagtgctctggatctaatccttgtgtaaatggtacatgtagtaataatgat
ggatcctatacatgtagctgtgtcattggttttatgttcaatggcagtacatgcaatgat
attgatgagtgtactggaactaatccttgtggaaatggtacatgtaataataatgatgga
tcctatacatgtagctgtgacaatggttttgccgagctaagccttgatgccagcacatgc
attgacattgatgaatgtgcagtaaataatccatgtgtaaatgggacatgtagtaataac
aatggatcctatacatgcagctgtaacagtggtttcgagttgagccttgatgcaagtaca
tgcaatgatattgatgagtgtgccggaaataatccttgtgtaaatggaagctgtactaat
aacaatggatcctatacatgtagctgtgacagtggttttatgtttaatggcagtacatgc
aatgacatagatgattgttctcctaatccttgtgccaatggaggtacctgtactgatgga
ttgaatagtttcacttgttcctgtgcttcagggttcagtggggatacctgtacagatgtg
acctgtggcacaattagctgtcagaatggtggcacatgtacaacccctgaacaatgtgat
tgtgttactggtttcaatggtactatgtgtgagaataatattgatgactgttctcctgat
ccatgtttgaatggggtttgcgttgatggtgtgaattccttctcatgtaattgtactact
ggttttactgatgacacatgtgaaacagaggtatgtggttccaatgcatgtcagaatggc
ggatcatgtgcaaatgcaaacactggccaatgttcatgtgttactggttatattggtgat
atgtgtgagataaatatcaatgattgttcacctaacccctgtgaaaatggaggaaattgt
actgatggtctcaattccttcacatgttcctgtcctactgcatttactggaattacttgt
caaacagatgttgacgagtgtgttgattctagtctgtgtaccaatgggagatgtgttaat
cttgctggctcctacacatgtgtatgcaatatgggttttacattgacaaatacagattct
tgcactgctatctcatcatcccttgctacaagttcggtaaggattcggctaacaggagta
cgtctaaacggtcttcctcttaccttcactgcggacttaacaaatagatcgtcagcctta
ttcatggaatatgatacttcttactgtttcattttcacaaactatgtaagtgcattattg
tcaattggccttccaagttgtgaagtggttggattcagccaaggtagtattattggtgtc
cttgaccttacaattgccgctgcaacccaaaccttagctgatgatcttgcgttggaagta
ccaacactgtctaccaactctctactagcatcatttaatggtattactctagaaggatcc
tttaatgctaatgttcaatgtgatcagacgaattgtcagaatggaggatcttgtattact
tcaggagacccatgtgattgcctggctggtttcaatggagatctatgccaaaatgatact
ggtaattcagagttgtctgttggagccataattggtattgcacttggagtatttggattt
gtaatcataatagttggctgtgtctgctgtatgttccttcaaagcttcagacaaaatcaa
gcaacaaaagccatgctttcgaatggacgttatgactatccatcttttaatatgaatggt
tcctatgatggttctgaagagtatgattcttttgaaggacgtcgtatggctgtgggtcaa
gctttggatcgccttcgtggaaatggagcaatgtataacggcaatggaagatcgcctgag
gaaggccgcaatttcaggacgccatacgttgtcggtgatagagatacggaaaacggagtg
gagcgaaatcctgtctacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
