Malus domestica (apple): 103407983
Help
Entry
103407983 CDS
T03194
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At3g12770-like
Organism
mdm
Malus domestica (apple)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
E_motif
PPR_3
Eplus_motif
AEP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103407983
NCBI-ProteinID:
XP_070667321
LinkDB
All DBs
Position
13:21648155..21650047
Genome browser
AA seq
630 aa
AA seq
DB search
MNLSYACKTFALTTSRYYTCATAVHLPLNLLHFLQLAGTHHSLSLAEQAHAHIVTHGLQQ
NPFLATKLISAYALCGKPTESKLVFDSATLKSVYLWNSLINGYVKNCAYNEAFDLFMEMC
NSYVLPDGYTLATMAKVSSEVRDLATGKYVHGKGLRAGFVVDTVVANSLMSLYYKCGRID
ECRKLFDEMPQRNVGSWNALIAGYTSSLDHDFDKEIWEIAKSMVMNGVKPDGFTVSSLLP
MCGGDDIRKWDHGRELHCYVVKYELDFKWGSDVHLGCCLIDMYSRSDRVASARRVFNHMK
CRNVYAWTAMVNGYVQNGAPDEALVLFQKMQVEDGVQPNRVSLVSVLPACSSHVGLMGGK
QIHGFAIRKEMSREVSLCNALIDMYSKCGSLDFARQVFEDDSFSKDAISWSSMISGYGLH
GRGEEALDVYNKMLHLGIKPDTITIVGLLSGCGRSGLVKEGLSIYSSVTADFGIKPTVEM
CACVVDLLGRSGELDRALDFIKTMPVEPGPSVWGALVTASVLHGNHDMQDLAYRFLIQVE
PRNPSNYISLSNFYALSRRWDAVAEMRRMMKERGLKKEPGCSWISINSETHCFYVADKLH
PRSISIYEMLDYLILAMKGACSSEAFEHPA
NT seq
1893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacctctcgtacgcatgcaagacatttgccctcacaacctcccgttattacacttgc
gccactgcggtccaccttcccctgaatctcctccattttcttcagcttgcaggaacccac
cattccctttcgctcgccgaacaagctcacgcccacattgtcactcatggcctccaacaa
aaccctttcctcgccacaaagctcatctctgcttatgcactctgtggaaagccgaccgag
tcgaaactcgtcttcgactcggctactctcaagagtgtgtatttatggaactcactgatt
aatggctatgtgaagaattgtgcgtacaatgaagcttttgatctgtttatggaaatgtgc
aatagttatgtattgccagatggttataccttggcgaccatggcgaaagtttcaagcgag
gttcgggatttggcaaccggaaagtatgttcatgggaagggtttgagagccgggtttgtc
gtggataccgttgttgcgaattctctgatgtctttgtattataaatgcgggaggattgat
gagtgtcggaaactgttcgatgaaatgcctcaaagaaatgttgggtcttggaatgcgtta
atagcggggtatacaagttctttggatcatgattttgataaggagatttgggaaattgct
aaatccatggtgatgaatggggtgaaacctgacggatttaccgtttcaagtcttttgcct
atgtgtggaggggatgatatcaggaaatgggatcatgggagagaactgcattgttatgtt
gtgaagtatgaattggatttcaagtggggttcggacgttcatcttgggtgttgtttgatt
gatatgtattctaggagtgatagagtagcttcggccagacgggtatttaaccacatgaag
tgtagaaatgtttatgcttggacggcgatggtcaatggctatgtgcagaatggagctcct
gatgaagctttggttctttttcaaaagatgcaggtggaagatggggtacaacccaataga
gtatcacttgtgagtgtcctccctgcttgtagttcgcacgttggtttaatgggcggaaaa
caaattcatggatttgctatcaggaaggaaatgagtcgtgaagtatctttgtgtaatgct
ttaatcgatatgtattcgaaatgtgggagcttggattttgcaaggcaagtgtttgaggat
gattctttttctaaggatgcaatctcttggagctcaatgatttcaggatatggattacat
ggaaggggtgaggaagcccttgatgtgtataataagatgctccatcttggaatcaaaccc
gacacgataacaatcgttgggctcctttctggttgtggaaggtcaggattggtaaaagaa
ggcctttccatatatagctctgtaacagctgattttggaattaaaccaacggtggagatg
tgtgcttgtgtggtggatctgttaggccgatcaggagagcttgatcgagcattagatttc
atcaaaacgatgcctgtagaacctggtccaagtgtttggggagccttagttactgcttct
gtgttgcatgggaatcatgacatgcaagatctagcttatagatttcttattcaagtagaa
cccagaaacccttcgaactatatttcactttcaaatttttatgcattgtctaggagatgg
gatgctgtagcggaaatgagaagaatgatgaaagaaagaggtttaaagaaggagcccgga
tgcagttggataagcattaattctgagactcattgtttctatgttgctgataaattacat
cctcgttcaatttcaatctatgagatgctggattacctcatcttagcaatgaagggagcc
tgctcttctgaagcgtttgaacatccagcgtag
DBGET
integrated database retrieval system