Malus domestica (apple): 103412797
Help
Entry
103412797 CDS
T03194
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
mdm
Malus domestica (apple)
Pathway
mdm03015
mRNA surveillance pathway
mdm03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mdm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
103412797
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103412797
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
mdm03041
]
103412797
Spliceosome [BR:
mdm03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
103412797
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103412797
NCBI-ProteinID:
XP_028944002
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(join(5312449..5312560,5313009..5313084,5313161..5313311,5313513..5314230,5314453..5314570,5314656..5314878))
Genome browser
AA seq
465 aa
AA seq
DB search
MAGIYGQGGDGAPPTYGSSGGGGGYGGSGGYGGGSGGYGGGGGGGSYGGSGGGGYGGKGG
DGGGYGGGRGGGGRGGGYQGDRGGGGRGGDRGGGGRGGRGGSGRDGDWLCPNPGCGNSNF
ARRVECNKCGTPSPSGAGGDRGSGGGYNRGGSGGGYGGGNRGGRGGNYDGGRSGNYEGGK
SSSYDGGRGGSYDSRGGGGSRGGSYGGSQGRDDGGYGQVPPSAPPSYGAAGGNYAPSYNA
GYGTDAVPPPTSYTGGPGSYPPSYGGPAGGYGGDGLGDARGGGRGGPPAKYDGGYSAGGR
GGYGSGATEAAAKVKQCDQNCDDTCDNARIYISNLPPDVTVDELQQLFGGIGQVGRIKQK
RGYKDQWPYNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNDYDLRGYKISVTMAERS
APRPSFEQGSGGGGRGGYGGGDRRNSYRDGGADRHQHGGNRSRPY
NT seq
1398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggaatctacggtcaagggggcgatggtgcccctccgacatacggatctagcggc
ggcggcggcggctatggtggttctggcggatacggaggcggttctggtggttatggaggt
ggtggtggaggcgggagctatggtggaagcggtggcggtggatatggaggtaagggcggc
gatggaggtggttacggtggtggacggggcggtggcggtcgaggtggaggatatcaaggc
gaccgtggtggtggaggcagaggtggcgaccgtggtggtggcggcagaggcggccgcggt
ggcagtggaagagatggtgattggctgtgtcctaatccaggctgtgggaattcgaacttt
gcaagaagagttgagtgtaataagtgtggcacgccctctccttcgggtgccggtggtgat
cgtggcagtggtggtggttataacagaggaggaagtggtgggggctacggtggcggtaac
cgtggtggtaggggtggtaattatgatgggggtcgaagtggtaactatgaaggaggtaaa
agtagcagttatgatggaggcagaggcggtagttatgacagtagaggcggtggtggtagt
agaggtggttcttatggtggtagccaaggaagagatgatggtgggtatggtcaggttcct
ccaagtgctccaccgtcctatggtgcagctggaggcaattacgcaccatcttacaatgct
ggttatggaacagatgcagttcctcctcctacaagctatactggtggacctggatcgtat
cccccatcttacggtggtcctgcaggcggttatggtggtgatggtctaggtgatgcaagg
ggtggtgggcgtgggggccctccagctaaatatgatggtggatacagtgctggtggtcgt
ggtggatatggcagtggtgctacagaagccgcagctaaggtgaagcagtgcgaccagaat
tgtgatgatacttgtgacaatgctagaatctacatatcaaacttaccaccagatgttacc
gttgacgaacttcagcagctctttggaggcattggacaagtgggaagaatcaagcagaaa
cgtggctataaggatcaatggccatataatatcaaaatatacacagacgagtctggaaaa
aacaaaggcgacgcatgtttagcctatgaagatccctctgctgcacattcagctggtgga
ttttacaatgattatgacttaaggggctataagatcagtgttacaatggcggagagatca
gctccaaggccttcgtttgaacaaggcagtggtggtggtggtagaggtggatatggtggc
ggtgacaggcgcaacagttatagagacggtggagctgatagacatcaacacggcggaaac
cgttcgcgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
