Malus domestica (apple): 103418745
Help
Entry
103418745 CDS
T03194
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
mdm
Malus domestica (apple)
Pathway
mdm03015
mRNA surveillance pathway
mdm03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mdm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
103418745
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
103418745
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
mdm03041
]
103418745
Spliceosome [BR:
mdm03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
103418745
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103418745
NCBI-ProteinID:
XP_008355075
LinkDB
All DBs
Position
03:complement(join(4864533..4864647,4865024..4865099,4865174..4865324,4865535..4866261,4866469..4866589,4866675..4866912))
Genome browser
AA seq
475 aa
AA seq
DB search
MAGMYGQEGDGAPPPYGSSGGGGYGGSGGYGGGSGGYGGGGGGGSYGGSGGGGYGGKGGD
GYGGGGGRGGGGYGGGGGRGGGYQGDRGGGGRGGDRGGGGGRGGRGGSGRDGDWLCPNPG
CGNLNFARRVECNKCGTPSPSGAAGGDRGSGGGGNYNRGGTGGGNRGGGNRGGRGGNYDG
GRSGNYEGGKGSSYDGGRGGSYESRGGGGSRGGSYGGSQGRDDGGYGQVPPNAPPSYGTA
GGNYPSYNASYGTDAVPPPTSYTGGPASYPPSYGGPAGGYGGDGPGDARGGARGGPPAKY
DGGYGAGGRGGYGSAATEAPSKVKQCDQNCDDTCDNARIYISNLPPDVTVDELQQLFGGI
GQVGRIKQKRGYKDQWPYNIKIYTDESGKNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNDYELRGYK
ISVAMAERSAPRPSFEQGGGGGGGRGGYGGGDRRNNYRDGGADRHQHGGNRSRPY
NT seq
1428 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggaatgtacggtcaagagggcgatggcgcccctcctccgtacggatctagcggc
ggcggtggctatggtggctctggcgggtacggaggcggttctggtggttatggaggtggt
ggtggaggcggaagctatggtggaagcggcggtggtggctatggaggtaagggcggcgat
ggttatggaggcggtggcggacgtggcggtggaggttatggcggcggtggcggtcgaggt
ggaggatatcaaggagatcgcggtggcggcggcagaggtggcgaccgtggtggaggcggc
ggcagaggcggccgcggtggcagtggaagagatggcgattggctgtgccctaatccaggc
tgtgggaatttgaactttgcaagaagagttgagtgtaacaagtgtggcactccctctcct
tcgggtgccgccggtggtgatcgtggcagtggtggtggcggcaattataacagaggagga
actggtggtggtaaccgtggtggtggtaaccgtggtggtaggggtggtaactatgatggg
ggtcgaagtggtaactatgaaggaggtaagggtagcagttatgacggaggcagaggcggt
agttatgaaagtagaggcggaggtggtagtaggggtggttcttatggtggtagccaagga
agagatgatggggggtacggtcaggttcctccaaatgcaccaccgtcctatggcacagct
ggaggcaattacccatcttacaatgctagttatggaacggatgcagttccgcctcctaca
agttatactggtggacctgcatcatatcccccatcttatggtggtcctgcaggcggttat
ggtggtgatggtccaggtgatgcaaggggtggtgcccgagggggccctcctgctaaatat
gatggtggatacggtgctggtggtcgtggtgggtatggaagtgctgctacggaagcgcca
tctaaggtgaagcagtgcgaccagaattgtgatgatacttgtgacaatgctagaatctac
atatcaaacttgccaccagatgttactgttgacgaacttcagcagctctttggaggcatt
ggacaagtgggaagaatcaaacagaaacgtggctataaggatcaatggccatataatatc
aaaatatacacagatgagtctggaaaaaacaaaggcgacgcatgtttagcctatgaagat
ccctctgctgcacattcagctggtggattttacaatgattatgagttaaggggctataag
atcagtgttgcgatggcggagaggtcagctccaaggccttcgtttgaacaaggtggtggt
ggtggtggtggtagaggtggatatgggggcggtgacaggcgcaacaactatagagatggt
ggagcggatagacatcagcatggtggaaaccgttcgcgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
