Malus domestica (apple): 103420573
Help
Entry
103420573 CDS
T03194
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
mdm
Malus domestica (apple)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103420573
NCBI-ProteinID:
XP_008356857
LinkDB
All DBs
Position
03:complement(join(7261039..7261076,7261571..7261745,7262415..7262609,7263681..7263791,7263894..7264106,7264402..7264509,7264597..7264738,7264829..7266363,7267140..7267793))
Genome browser
AA seq
1056 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMLGGNEGSFGDEFEKEIGMLLREQRRQDADDRESELNIYRSGSAPPTVEGS
LNAVGGLFAGGGGGGGGGGAGAAFSEFPGAKNGNGFESEEELRSDPAYIQYYYSNVNLNP
RLPPPLLSKEDWRFAQRMKGGGSSVLGGIGDRRKVNRVDEASGRSLFSMPPGFNSRKQES
ETESDKVRGSAEWGVDGLIGLPGLGLGNKQKSLAEIFQDDLGRAAPVSGHPSRPASRNAF
DDNAESVGSAESDLAHLRRDLMTSDALRSSANGQGSSAAQSMGPPSSYSYAAALGASLSR
STTPDPQVVARAPSPCLTPIGGGRVGASEKRGISSPSSFNGVSSGRNESGDLVGAFSSMN
LSANGVKDDESHLPSQIKQDADDHQNYLFGLQGGENHARQLAYLKKSESGHMHMPSAPHS
AKGSYTDLGKSNGGGSDSSDRQVELQKSAVSSGNLYSKGSPTSNLNGGGGLLHQYQQVDH
ANSPFPNYGLSGYSMNPALASMVASQLGTGNLPPLFESAMGSPGMDSRALGGRMSSGPNL
AAAANESHNLGGLGSPIAGSGLQAPFVDPMYLQYLRTSEYAAAQLAALNDPSVDRNYLGN
SYMNLLELQKAYLGALLSPQKSQYGVPMVGKSGGSNHQGYYGNPAFGLGMSYPGSPPVIP
NSPVGPGTPIRHNELNMCYPSGMRNLAPWHLDGGCNIDESFASSLLEEFKSNKAKSFELS
EIGGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEEKNMVYQEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFE
HGLQPQRRELANKLFSHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVEELDGHVMRCVRD
QNGNHVIQKCIECVPEEAIRFIVSTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCKDENTQSKVM
DEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCL
TFGGPVERELLVNEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVH
LNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRVAQSAQHPA
NT seq
3171 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtcggaattaggaaggaggccaatgctcggaggaaacgagggttcctttggggat
gaattcgagaaggagattgggatgctgctgagggagcagcgtaggcaagacgccgatgat
cgcgaaagtgagctgaatatatatagaagtggatcagcacctcccactgtggagggttct
ttgaatgcggtcggtgggttgtttgctggtggcggtggcggcggtggcggtggcggtgct
ggtgccgccttttcggagtttcctggagctaagaatggaaatgggttcgagtccgaagag
gagcttaggtctgatcctgcttatattcaatactattactcgaatgtgaacctgaatccg
cggcttccgcctcctttgctatcgaaggaggattggaggtttgcacaaaggatgaaagga
ggagggagttctgtgttgggtgggataggagacaggaggaaagtgaatagggttgacgag
gccagcggaagatcgctgttttcgatgccgccgggtttcaactcaaggaaacaagagagt
gagaccgagtcggacaaagtgcgtggctcagcagagtggggtgttgatggactgattggt
ctgccaggtttaggacttggtaacaaacaaaagagccttgccgaaatctttcaggatgac
ttgggtcgtgctgctcctgtttctgggcatccttctcgtccagcaagcaggaatgcattt
gatgacaatgcagagtctgttggttctgctgaatctgatctagctcatttgcgccgtgac
ttgatgacttctgatgctctacgatctagtgcaaatggccagggctcatctgcagcacaa
agtatgggcccgccttcgtcatattcgtatgctgcagccctaggcgcttccttatcaaga
agcaccactcctgatcctcaagttgttgctagggctcctagtccttgcctcacacctatt
ggaggaggacgggttggtgcttcagaaaagagaggcattagtagtccgagttccttcaat
ggtgtctcatctggcaggaatgagtctggggatctggtgggcgcgttttccagcatgaac
ttgtctgcaaatggtgtaaaagatgatgagagccatttgccatcacagattaagcaagat
gcagatgatcaccagaattatctctttggtcttcaaggtggcgagaatcatgccaggcag
cttgcatacctcaagaagtctgaatctgggcatatgcacatgccttctgctccacactct
gcaaaaggttcatacacagatttgggtaagagcaatggcggtggttcagattcctctgat
aggcaagttgaactgcaaaagtctgctgtttcttcgggtaacttgtactcgaagggatct
cccacatccaatcttaatggtgggggtggcttgcttcatcagtatcagcaagtggatcat
gcgaactcaccatttcctaactatggtttaagtgggtactctatgaatccagcgttggcg
tccatggtggctagccaacttggcactggtaatcttccacccttgtttgaatcagctatg
ggatcccctggaatggattcaagagcgcttggaggccgtatgtcctctggaccaaaccta
gcagctgctgcaaatgaatcacataatcttggtggcttggggagtccgattgcagggagt
ggtcttcaggctccctttgttgatcctatgtatcttcagtacttgaggacatctgagtat
gctgcagcacagcttgctgctcttaatgatccttctgtggataggaactacttgggtaat
tcatacatgaatttactggaacttcaaaaggcgtatcttggagccttgctgtcaccacag
aagtcacagtatggtgttcctatggttggcaagtctggtggttctaatcatcaggggtat
tatggaaatcctgcatttggtctaggcatgtcttatcctggaagtcctcctgttattcct
aactctccagttggaccaggtactcctattaggcacaatgaactcaatatgtgttatccc
tctgggatgaggaatttagctccctggcacctggatggtggatgtaacatagatgaaagt
tttgcttcttcactcttagaagaattcaagagcaacaaagccaagtcttttgaactttca
gagatcggtggacatgttgtggagttcagtgcggatcagtatgggagtcgttttattcaa
caaaaacttgaaactgccactacagaagagaaaaacatggtttatcaagaaatcatgcct
caagctcttgctctaatgactgatgtgtttggtaattatgtgattcaaaagttttttgag
catggacttcaacctcagagaagggaattggccaacaagcttttcagtcatgtactgaca
cttagccttcaaatgtatggttgtcgggtgatccagaaggcaatagaagttgtagatctg
gaccaaaagatcaaaatggttgaagaacttgacggtcatgtcatgcgctgcgtacgtgat
cagaatgggaaccatgtcatccagaagtgtattgaatgtgtccctgaagaggccattcgt
tttattgtgtcaacattttttgatcaagttgtgaccctttcaacccatccatatgggtgt
cgtgtgatacagagagttcttgagcactgcaaagatgagaatacacagagtaaagttatg
gatgagattctaggagctgttagcatgttggcacaagatcagtatggcaattatgtcgtt
cagcatgtgctggagcatggaaaaccgcatgagcgctctgctatcataaaagaattagct
gggaaaatagtccaaatgagtcagcagaagtttgcctccaatgtagtagagaagtgttta
acttttggaggtcctgttgagcgtgaattgctagtgaatgagatgcttggcactactgat
gaaaatgagcctcttcaggcaatgatgaaggatcaatttgcaaactatgttgtacaaaaa
gtgttggagacttgtgatgaccaacaacgtgaactgattctttcccgaattaaagtccat
ttgaatgcattaaagaaatacacttatggaaagcatattgttgctcgtgtagaaaaactt
gttgctgctggggaaaggagagttgctcagtctgctcagcaccctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system
