Malus domestica (apple): 103435730
Help
Entry
103435730 CDS
T03194
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
mdm
Malus domestica (apple)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
VAR1
LRR_10
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103435730
NCBI-ProteinID:
XP_028957250
LinkDB
All DBs
Position
01:join(24426394..24426999,24427805..24429294,24429386..24429527,24429675..24429782,24429954..24430166,24430285..24430395,24431680..24431874,24432787..24432961,24433226..24433269)
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MVTDAYSKMMSEMSMRSMSKSGDYSEDLSTLIREQRRQHEASEREKELNIYRSGSAPPTV
EGSLNAVGGLFEASALSGFTKNGTKGFATEEELLADPAYVNYYYSNVNLNPRLPPPLLSK
EDWRFSQRLQGGGGGSAVGDRRIGGRSGGEGSLFSVQPGIGGKEENGVQARKGAAEWGGD
GLIGLPGLGLGSRQKSIAEIIQDDIHNTNVSRHPSRPASRNAFDDGVEASDTQFAHLQGM
SAVQNGGSSSSHTYASALGASLSRSNTPDPQLVARAPSPRIPPVGRVSSMDKKIGNGQNS
FNGASLNVNESADLAAALSGMNLSTNGRIDEDNRARSQMQHEIDNHHNLYDMQGDWNHIK
QNSYLNKSDSGNFHLHSASQSSNKSYQNMGRGSGFGRDLNSPSYMSDNLVDINNPAVSSG
NSYLRGPVPALNGRGSSHSHYQNVENTSFPNYGYSGSPSSPSMMGSPLGNGSLPPLFENA
AAASAMGGLDSGAFGGMSLGPNLLAAAAELQNIRVGNHGGGSALQVPMMDPLYVQYLRSN
EYAAAQLAALNDPTKDREGMGNTYMDLLGLQKAYLGQLLSPQKSQFGAPYIGKSGSLNHG
YYGNPAYGHGMSYSGTPLGGPLLPNSPVGPGSPARHGERNLRFSSGLRNMGGSLMGAWHS
ENGGNLDESFASSLLDEFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATIEEK
NMVFDEIMPQAPSLMTDVFGNYVIQKFFEHGTPAQIRELADQLTGHVLTLSLQMYGCRVI
QKAIEVVELDQQTKMVAELDGHVMRCVRDQNGNHVVQKCIECVPEDAIQFVVSTFYDQVV
TLSTHPYGCRVIQRVLEHCRDPKTQQIMMDEILQSVCILAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHE
RSCIIKELTGQIVQMSQQKFASNVIEKCLSFGTLAERQALVTEMLGTTDENEPLQAMMKD
QFANYVVQKVLETCDDQQLELILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRISIL
APQASAA
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcaccgatgcttattcaaagatgatgtctgaaatgtcaatgcgatcgatgtcaaag
agtggcgattacagcgaagatttgagtacgttgattcgtgaacagaggcggcagcatgaa
gcaagtgagcgggagaaggagctgaacatatacaggagtgggtcagcgccgcccaccgtg
gaaggctcgttgaatgctgtcggaggcttgtttgaggcgtctgcactgtcgggtttcacg
aaaaacggcactaaagggtttgcgaccgaagaggagcttctcgctgatccagcttatgtg
aattactactattccaatgttaatctcaatccacggcttccgccgccgctgctttcgaag
gaggactggcgtttttcccagcggttgcaaggcggaggtgggggttcggcagttggagat
aggaggatagggggtaggagtggcggtgaagggtcacttttttctgtgcagccggggatt
ggagggaaggaggagaatggtgtgcaggcgaggaagggtgcggcagagtggggcggtgat
gggttgattgggttgccagggttgggacttgggagtaggcagaagagtattgcagagatt
attcaggatgatatacataatacaaatgtctcaaggcacccttctcgtcctgctagccgg
aatgcgtttgatgatggtgttgaagcttcagatacccagtttgctcatttacagggaatg
tcagctgttcagaacggcggttcatctagttctcatacatatgcttctgctctgggtgct
tcattgtcgagaagcaacacaccagaccctcagcttgtagctagggctcctagtcctcga
attccaccagttggaagggtttcctccatggataaaaaaattggcaatggtcaaaactca
ttcaatggtgcctcacttaatgtgaatgagtctgcagatctggcagctgctttatctggt
atgaacctgtcaacaaatggtaggattgatgaggacaatcgtgcacgctcacaaatgcaa
catgaaattgataatcaccataacctttatgacatgcaaggtgattggaaccatattaaa
caaaattcgtacttgaataagtctgattctgggaattttcatctgcattctgcttcccaa
tcttctaacaaatcttatcagaatatgggaagaggcagtggatttggtagggatctgaac
agcccttcttatatgtctgacaatctagttgatattaataatcctgctgtatcttctggt
aactcatacttaagaggacctgtgccagctcttaatggccgaggaagctcacactcccac
tatcagaatgtagaaaatacctcatttccgaactatggctattctggtagtccttcatct
ccatcaatgatgggtagtccacttggtaatggtagtttaccacccttatttgaaaatgct
gctgctgcgtctgcaatgggtgggttggactctggagcttttggagggatgtctctagga
ccaaatctgttggctgcagctgctgaattgcagaatattagggttggaaatcatggtggt
gggagtgctcttcaggttcccatgatggacccattgtatgttcagtacttgagatcaaat
gaatatgcagctgcacagcttgcagcccttaatgatcccacaaaagatagggaaggcatg
ggtaatacgtacatggatttacttggtttgcaaaaagcttatttggggcagttgctttcg
ccccaaaaatcacaatttggtgctccctacattggcaagtctggtagcttgaatcatggt
tattatggaaatccagcatatgggcatgggatgtcttattctggaacaccattgggtggt
ccccttcttccaaactctcctgttggacctggtagtcctgccaggcatggtgagcggaac
ttgcgtttttcttctgggttgaggaacatgggtggaagtctgatgggagcttggcactcc
gaaaatggtggaaatttggatgaaagttttgcctcctctttactagatgagttcaaaagc
aataagactaaatgttttgaactttcagagattgcagggcatgttgttgagttcagtgcc
gaccagtatggaagtcggtttattcaacaaaaacttgaaactgccacaattgaagagaag
aacatggtttttgatgaaattatgccccaagcaccatctcttatgaccgatgtgtttggt
aattatgtgattcagaagttttttgagcatggaactccagcacaaataagagaacttgca
gaccagctcactgggcatgtgctgacccttagccttcaaatgtatggctgtcgagtgatc
cagaaggctatagaagttgttgagctggaccagcagactaaaatggtagctgaactggat
ggtcatgttatgcgttgtgttcgtgatcaaaatggcaaccatgttgtccagaagtgtatt
gaatgtgtacctgaagatgccatccagtttgttgtttcaactttttatgaccaagtcgtg
acactgtctactcatccatatggttgtcgtgtcatacagagagttttggagcactgccgt
gaccccaaaacgcagcaaataatgatggatgagattttgcagtctgtttgcattttggca
caagaccaatatggaaattatgttgtccagcatgtgctggaacatggaaagccacatgaa
cggtcatgtataattaaggaactaactgggcaaatcgttcaaatgagccagcagaagttt
gcgtcaaatgtcatagaaaagtgtttaagttttggaactcttgctgaacgccaggccctt
gtaactgagatgcttggtaccactgacgaaaatgagccccttcaggcgatgatgaaggat
cagttcgcaaactatgttgtacagaaagtgttggaaacttgtgacgatcagcaacttgaa
ctaatccttaaccgaattaaggttcacctgaatgccctgaagaagtatacttatgggaag
catatagttgcccgtgtagagaaacttgttgctgctggggagaggaggattagcattctg
gctccccaggcttctgctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system
