Malus domestica (apple): 114824323
Help
Entry
114824323 CDS
T03194
Name
(RefSeq) extensin-2-like isoform X1
Organism
mdm
Malus domestica (apple)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pollen_Ole_e_1
Extensin_2
HCV_NS4a
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114824323
NCBI-ProteinID:
XP_070675993
LinkDB
All DBs
Position
04:complement(join(3377925..3380617,3381280..3382594))
Genome browser
AA seq
1335 aa
AA seq
DB search
MRSVGGGPSWGRFWPQMAVALAATLVVISSNVGSVEASAYPYSSPPPPPYVYSSPPPPPY
VYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPSP
PPPYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPSPPPPYVYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPP
SPSPPPPYYYKSPPPPEYSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKS
PPPPEYSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPKSPTPYYYKSPPPPEYSPPPPY
YYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPAP
KPPTPYYYKSPPPPSPYPPSPYYYKSPPPPTPYYYTSPPPPAPYYPKPPLVKVVGRVYCY
RCYDWKNPSKSHDKKHSTGSVVVVTCWNGKKEIKAYGKTKNNGKFSVVIPGFEYGKYGAK
ACTAKLYAAPKGSKCNIPTKLNKGDKGAKLKVKSKTKYEVVLEAGKFAYASKTPYEECEK
SKPQYPPPYVYKSPPPPTPTYVYKSPPPPPPKYYYKSPPPPVYYYKSPPPPAYVYKSPPP
PSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYNSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYN
SPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTP
YYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPK
PPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPP
PSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPEPPTPYYYKSPPPPSPEPPTPYYYK
SPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTPYYYKSPPPPSPKPPTP
YYYKSPPPPTPYYYKSPPPPSPKLPTPYYYKSPPPPSHSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPY
YYKSPPPPSPSLPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPKYSP
PPPYYYKSPPPPSSSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPP
SPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPLPYIYKSPPPPEYSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYIYKS
PPPPEYSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPSSSPPPPYKYNSPPPPSPSPPLPY
KYNSPPPPSPSPPPPYKYNSPPPPSPSPPPPYKYNSPPPPSPSPPPPYIYKSPPPPVETP
PPVYIYGSPPPPIHY
NT seq
4008 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggagtgtgggcggcggcccctcttggggtcggttttggcctcaaatggcagtggcg
ttagctgccacactggtggtgatttcaagcaatgtgggttcagtagaagcaagtgcttat
ccctactcttcaccaccaccaccaccttacgtttacagctcaccaccaccaccaccatat
gtctacaagtctccaccaccaccatcgccttcaccgccaccgccttatgtctacaagtct
ccgccacctccatcaccatcaccaccaccaccttatgtgtacaagtccccgccaccgcca
tcaccttctccaccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccgtcaccatctcct
ccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccatcaccgtctcccccaccaccgtat
gagtacaaatcaccacctcctccatcaccctccccaccaccaccatatgtttacaagtct
ccaccaccaccttccccttcaccgccaccaccatattactacaagtctccaccaccacct
tctccctctccacctcctccttactactacaagtctccaccacccccggagtactcccca
ccaccaccatactactacaaatccccaccacctccttctccttcacctcctcccccttac
tactacaaatcaccacccccaccatcaccaaaaccaccaaccccgtactactacaagtct
ccaccacccccagaatactccccaccaccaccatactactacaaatccccaccacctcct
tctccttcacctcctccaccttactactataaatccccacccccaccatcaccaaaatca
ccaaccccatactactacaagtcgccaccacccccagaatactccccaccaccaccatac
tactacaaatccccaccacctccttctccttcacctcctccaccttactactacaaatcc
ccacctccaccatcaccaaaaccaccaaccccatactactacaagtctccaccaccacca
ccaccttcacccaaaccaccaactccatactattacaaatcaccaccaccaccagcccca
aaacccccaaccccatactattacaagtctcctcctccaccctcaccgtatcctccttct
ccttactattacaagtctccaccaccaccaaccccttactactacacttctccaccacca
ccagctccttactatccgaagccaccattggtgaaggttgtcggaagggtctactgctac
agatgctatgactggaagaatccatcgaagtcacacgacaagaagcactccacaggctca
gttgttgtggtaacttgctggaatggcaagaaggaaatcaaggcctacggtaaaactaag
aacaatgggaaattcagcgtagttatccctggctttgagtatggcaaatatggagccaag
gcttgcacggccaagctctacgcagcaccaaagggttcgaaatgcaacattcccactaag
ctaaacaagggtgacaagggtgccaaactcaaagtgaaatccaagactaaatatgaagtt
gtgctcgaggctggcaaatttgcttatgcttccaagactccgtacgaggagtgtgaaaag
tccaagccccaatatcctcctccttacgtttacaagtcaccgccaccgcctacgcctact
tacgtctacaagtcaccacctccaccgccacccaagtactactacaagtcaccaccacca
ccggtttactactacaagtcaccaccacctccggcatacgtttacaagtcaccaccacca
ccatcacccaagccaccaaccccatattactacaagtcccctccaccgccatcacccaag
ccgccaaccccatactactacaactctcctcctccaccatcacctaagccaccaacccca
tattactacaagtctcctccaccgccatcacccaagccgccaaccccatactactacaac
tctcctcctccaccatcacccaagccaccaaccccatattactacaagtctcctccaccg
ccatcgcccaagccgccaaccccatactactacaagtctcctccaccgccatcgcctaag
ccgccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaagccgccaacccca
tactactacaagtctcctccaccgccatcgcctaagccgccaaccccatattactacaaa
tccccaccaccaccatcgcccaagccgccaaccccatactactacaagtctcctccaccg
ccatcgcctaagccgccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaag
ccaccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaaaccaccaactcca
tactactacaaatccccaccaccaccatcgcccaagccaccaaccccatactactacaaa
tccccaccaccaccatcgcccaaaccaccaaccccatactactacaaatccccaccacca
ccatcacccaagccaccaaccccatactactacaaatcccctcctccaccatcacccaag
ccaccaaccccatactactacaaatcccctcctccaccatcgcccgaaccaccaactcca
tactactataaatctcctcctcccccatcacccgagccaccaaccccatactactacaaa
tctccaccaccaccatcaccaaaaccaccaacaccatactactacaagtctcctccacca
ccatcacccaagccaccaactccatactactacaagtctcctcctccgccatcacccaag
ccaccaactccatactactacaaatccccaccgccaccatcaccaaaacctccaacccca
tactactacaagtctcctcccccaccaaccccatactactacaaatccccaccaccccca
tccccaaaactaccaaccccatactactacaagtctcctccaccaccgtctcattctccc
ccaccaccatactactacaaatcaccaccaccaccatcaccatcacccccacccccatac
tactacaagtctcctccaccaccgtctccttctctcccacctccatattactacaaatca
ccgccaccaccttcaccttctcctccacctccatactactacaagtctcctccaccacca
tctccttctcccccacccccttattactacaagtctccaccacccccaaaatactcccca
ccaccaccatattattacaaatccccaccacctccttcatcttcacctcctccaccttac
tactacaaatcaccaccaccaccatcaccatcacctccacccccttactattacaagtct
cccccaccaccttcaccttctcccccacctccatactactacaagtcccctcctccaccc
tcaccgtctcccccaccaccctactactacaaatctccacctccaccatcaccctcccct
cctctcccttacatctacaaatccccaccacccccagaatactcaccaccaccaccatac
tactacaaatctccacctccaccatcaccgtctcctcctcccccttacatctacaaatct
ccaccacctccagaatactcaccaccaccaccatactactacaaatccccaccaccacca
tcaccctcccctcctcccccttacatctacaagtctccaccaccaccttcttcatctcca
ccaccaccatacaaatacaactcaccaccaccaccttccccatctcctccactgccatac
aaatacaactccccaccaccaccttccccatctcctcctccaccatacaaatacaattcc
ccacccccaccttccccatcacctcctccaccatacaaatacaactccccaccgccacca
tcaccctctcctcctccaccttacatctacaagtcccctccacctccggtggaaacacca
ccgccggtttacatttatggatctcccccacctccaattcattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
