Monodelphis domestica (gray short-tailed opossum): 100025769
Help
Entry
100025769 CDS
T01031
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin 1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
mdo
Monodelphis domestica (gray short-tailed opossum)
Pathway
mdo04350
TGF-beta signaling pathway
mdo04518
Integrin signaling
mdo04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mdo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
100025769 (FBN1)
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
100025769 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
100025769 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mdo00536
]
100025769 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mdo00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100025769 (FBN1)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_PEAR1L
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100025769
NCBI-ProteinID:
XP_001369848
Ensembl:
ENSMODG00000002675
UniProt:
F7CYW8
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(178543176..178856747)
Genome browser
AA seq
2871 aa
AA seq
DB search
MRRGGLLELALGFTVLLSSYTSHGAEGNSETGNVKETRASRAKRRGGGGHDALKGPNVCG
SRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQISPSCGSRSIQHCN
IRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCESGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQCERD
YRTGPCFTLVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIR
TGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCEDIDECATIPGVCD
GGECSNTVSSYFCKCPPGFYTSPDGTRCIDVRQGFCYASLTNGRCNNQLPQQLTKIQCCC
EIGRCWAAGPAMAPEMCPIRATEEFHRLCTLPGIVPGRPDIPLPPIFPPSGPVPPGGPVP
PIIYPSIPRPPLPELPYPSREPRVLPVNITDYCQLYRGLCLNGHCIPTPGSYRCECNKGF
QLDIRGECIDVDECEKNPCVGGECVNTPGSYICQCRVGYQSTLTRTECRDIDECLQNGRI
CNNGRCINTDGSFHCVCNAGFHVASDGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKP
GFQLASDGRYCKDINECETPGICMNGRCVNTDGSYRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRST
CYGGYKRGQCVKPLFGAVTKSECCCASTEYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPGMTSG
GSDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNLGYEVDASGKNCVDINECALNTLLCDNGQ
CRNTPGSFTCTCPKGFVYKPDLKTCEDINECESSPCVNGACKNTLGSFVCECSPESTLDA
TKTICIETIKGTCWQTIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCKIDTICAKGY
SRIKGTQCEDIDECTVFPGVCKNGLCVNTLGSFVCQCPSGMTLDLTGRICLDIRLETCYL
SHEDEECSLPIAGRHRMDACCCSVGAAWGSTECEECPVRNTPEYDALCPRGPGFATRGEV
INGKPFFKDINECKMIPSLCTYGKCRNTIGSFKCRCDNGFALDSEERNCTDIDECRISPD
LCGQGICVNTPGDFTCECFDGYESGFMMMKNCMDIDECQRDPLLCRGGTCLNTEGSYRCE
CPPGHQMAPNISACIDINECDLSVNLCRNGRCVNLIGKYQCACNPGYHSTPDKLFCVDID
ECSIMNGGCDTFCTNSEGSYECSCRQGFALMPDQRSCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPG
EYRCLCFDGFMASEDMKTCVDVNECDLNPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTG
CTDINECEIGAHNCDRHAVCTNTAGSFKCSCSPGWIGNGIKCTDLDECSNGTHMCNQHAD
CKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCIDLDECSENLNLCGNGQCLNAPGGYRCECDMGFVPST
DGKACEDIDECSLPNICVFGTCHNLPGLFRCECETGYELDRTGGNCTDVNECLDPTTCIS
GNCVNTPGSYTCDCPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIRPRGDNGDTSCSNEIGVGVSK
ASCCCSLGKAWGTPCELCPPVNTSEYKILCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQG
GKCINTFGSFQCRCPTGYYLNEETRVCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYM
QVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIP
STDEFATLCGSQRPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPVGFFY
NDKLLICEDIDECQNGPVCQRNAECINTAGSFRCDCKPGYRFTSTGQCNDRNECQEIPNI
CSHGQCIDTVGSFYCLCHTGFKTNAEQNMCVDINECERDACGNGTCRNTVGSFNCRCNHG
FILSHNNDCIDVDECATGNGNLCRNGQCLNTVGSFQCQCNEGYEVTADGRSCVDINECLA
DPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYSLQNDNCEDIDECVEEPEICALGTCSNTPGSFKCL
CPEGFSLSSTGRRCQDLRMSYCYAKFEGGKCSSPKSRNHSKQECCCALKGEGWGDPCELC
PTEPDEAFRQICPYGSGIIVGLDDTRVDMDECKEPDICKYGQCINTDGSYRCECPFGYIL
HGVECVDTDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCAF
RCVNTYGSYECKCPIGYVLREDRRMCKDENECEEGKHDCAEKQMECKNLIGTYMCICGPG
YQRRPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCLNTRGSYTCECNDGFTASPAQDECLDNREGYC
FTEVLQSMCQIGSSNRNPVTKSECCCDGGRGWGPHCEICPFQGTVAFKKLCPHGRGFMTN
GADIDECKVIHDVCRNGECINERGSYHCNCNTGYTPDITGTACVDLNECNQAPKPCNFIC
KNTEGSYQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHH
TACIDNNECTSEVNLCGAKGVCQNTPGSFTCECQRGFSLDQSGASCEDVDECEGNHRCQH
GCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQY
EQFSGGCQDVNECGSAQAPCSYGCSNTEGGYLCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGMGRGPEAP
VSGEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRRRRSVNETDALDAEDQPEMEAPVSLASWDVEK
TAVFVFNVSSISNKVRILELLPALTTLTNHNRYLIESGNEDGFFKINQKEGISYLHFSKK
KPVAGTYSLQISSIPLYKKKELNQLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8616 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggagagggggtctgctggagctagccctgggatttacagtgctcttgtcttcctat
acgagccatggtgctgaaggaaattcagagacaggcaatgtgaaggaaaccagagccagc
cgggcaaaaagaagaggcggaggaggacacgatgcgctcaaaggaccaaatgtgtgtgga
tcacgttacaatgcttactgttgccctggatggaaaactttacctggtggaaatcaatgc
attgtcccaatctgtcggcattcctgtggagatggattttgttcaaggccaaacatgtgt
acttgcccaactggacagatatctccttcctgtggctccagatcaatacaacactgtaac
atccggtgtatgaatggaggtagctgtagtgacgaccactgtttgtgccagaaaggatac
acaggaacgcattgtggacaacctgtctgtgagagtggttgtctaaatggaggtagatgt
gtggcacccaaccgctgcgcttgtacatatggcttcacaggaccacagtgtgaaagagat
tacagaacaggcccatgtttcacactggtcagcaaccagatgtgccagggacagctcagt
gggatcgtctgtacaaagaccctttgctgtgctacagtaggaagagcttggggacatccc
tgtgagatgtgcccagcccagcctcatccttgtcgccgaggctttatcccaaacattaga
accggagcttgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggctctgtcaaggagga
aattgcattaacactgttggatcttttgagtgcaagtgccctgctggacacaaatttaat
gaagtgacacaaaaatgtgaagatattgacgagtgtgccactattcctggagtctgtgat
gggggtgaatgttcaaacactgtcagcagttacttttgcaaatgtcccccaggattctat
acctctcctgatggaaccagatgcatagatgttcgccaaggattctgttatgcatctctg
accaatggacgctgcaataaccagctaccccagcagctcaccaagatccagtgctgctgt
gaaataggccgctgctgggctgcagggcctgccatggccccagagatgtgccccatccgg
gctacagaggagttccacaggctttgcaccctgcctgggatagttcctggaaggcctgat
attcctctgcctcccatcttccctcccagtggcccagttcctccaggtggccctgtgcca
cctattatctatccatcgatccctagaccacccctcccagaacttccatatccatctcgg
gaaccacgtgtgttgccagtcaatatcactgattattgccagctgtaccgaggtctctgc
ctcaatgggcactgcattcccacccctggaagctatcgttgtgaatgcaataaaggattt
cagctggacattcgtggagaatgcattgatgttgatgagtgtgagaaaaatccttgtgta
ggtggagagtgtgttaatactcctggatcctacatatgccagtgtcgagttggctatcag
agcacattgacaaggactgaatgtcgagatattgatgaatgtttacagaatggacggatc
tgcaataacggacgttgtataaacacagatggcagtttccactgcgtgtgtaatgctggt
ttccatgtggcaagtgatgggaaaaattgtgaagatatggatgaatgcagcatacgaaac
atgtgcctcaatggaatgtgtatcaacgaggatggcagttttaagtgcatttgtaaaccc
ggcttccagttggcatcagatggccgctactgcaaagatattaatgaatgtgaaacacct
ggaatctgcatgaatggacgctgtgtgaacacagatggatcctaccgatgtgaatgcttc
cctggtctggcagtgggactagatggacgagtgtgtgttgatacacacatgcggagcaca
tgctatggtggatacaagagaggccaatgtgtcaaacccttatttggagcagttaccaag
tctgaatgctgctgtgccagtactgaatatgcctttggggaaccttgccagccatgccct
gctcagaattcagctgaatatcaagcactttgcagcagtggcccaggaatgacttcagga
ggcagtgatataaatgaatgtgccttggatcctgatatttgcccaaatggaatttgtgag
aatctacgtggcacatacaaatgtatatgcaatttgggatatgaagtggatgcaagtggg
aaaaactgtgttgatattaatgaatgtgcattaaacaccttgctttgtgacaatggacaa
tgcagaaacactcctgggagtttcacctgtacctgtcccaagggatttgtatacaaacct
gacctaaaaacttgtgaagatattaatgaatgcgaatcaagcccttgtgttaatggagca
tgcaaaaataccctgggttcttttgtttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatgca
acaaaaactatctgcatagaaacaattaaaggcacttgttggcagactattgttgatgga
agatgtgaaattaatatcaatggagccacactgaagtcacagtgctgttcttcactgggt
gctgcctggggaagcccatgcacaccttgtaaaatagacacaatatgtgctaaggggtac
tcaagaattaaaggaacacagtgtgaagatatagatgagtgtactgtattccctggagtg
tgcaaaaatggcctttgtgtcaacactctggggtcatttgtttgccagtgccctagtggg
atgacattggatctcactggaagaatctgtcttgatatccgcctagaaacttgctacctg
agtcatgaggatgaggaatgctctttgcctattgctggccgccatcggatggatgcatgc
tgctgttctgttggggcagcctggggaagcacagaatgtgaggagtgcccagtgagaaat
acacctgagtatgatgctctttgtcctagagggcccggatttgccacaaggggagaggtt
ataaatggaaaacctttcttcaaagatataaatgaatgcaagatgatcccaagtctgtgt
acctatggcaagtgcagaaataccatcggcagctttaaatgtaggtgtgataatggcttt
gccctggattctgaagaaaggaactgtacagatattgatgaatgccggatctctcctgat
ctgtgtggccaaggcatctgtgtgaacactccaggggactttacatgcgagtgctttgat
ggatatgaaagtggatttatgatgatgaagaactgcatggatattgacgaatgccagaga
gaccctcttctctgtcgaggtggcacctgcctgaacacggagggcagttaccgctgcgag
tgccctcctggccatcagatggctcccaatatctctgcctgtatagacatcaatgagtgt
gatctaagcgttaacctctgccgaaacggccgctgtgtgaacctgattgggaagtaccag
tgtgcttgcaatcccggctatcactccacacccgacaaactcttttgtgttgatattgat
gaatgtagcataatgaatgggggttgtgacaccttctgcaccaattccgaaggcagctat
gaatgcagctgtcgacagggattcgcactcatgccagatcagagatcatgcactgacatc
gatgagtgtgaagataaccccaatatttgtgatggaggccagtgtacaaacatacctgga
gagtatagatgtctctgctttgatgggtttatggcatctgaggacatgaaaacttgtgtc
gatgttaatgaatgtgaccttaatccaaacatttgtctgagtggcacctgtgagaacacg
aaaggctcattcatctgccattgtgacatgggatattcgggcaaaaaaggaacaactggc
tgtacagacatcaatgaatgtgaaattggagcacataattgtgacaggcatgctgtctgc
accaacacagcagggagcttcaaatgcagctgcagcccagggtggattggcaatggcatt
aagtgcacagatttggacgaatgctctaatgggacgcatatgtgtaaccaacatgctgac
tgtaaaaatacgatgggatcttaccgctgtttgtgtaaggaaggatatactggagatggc
ttcacttgtatagatcttgatgaatgctcagaaaatctgaacctttgcggaaatgggcag
tgcctcaatgccccgggaggatatcgttgtgaatgtgatatgggatttgtgccaagcact
gatggaaaagcctgtgaagatattgatgaatgttcccttcctaatatctgtgtctttggt
acttgtcacaaccttcctggtcttttccgctgtgagtgtgagactggctatgaactggac
agaactggagggaactgcacagatgttaatgaatgtctcgaccctacaacttgtatcagt
gggaattgtgtcaataccccgggtagctacacctgtgactgtccacctgattttgagctg
aaccccaccagagttggctgtgttgatacacgatctggaaactgctatttggatattcgt
cctcgaggagacaatggagatacatcctgtagcaatgaaattggagttggtgtttctaag
gcttcctgctgctgttccctgggtaaagcttggggtactccatgtgaactctgccctcct
gtgaacacatctgaatataagattctttgtcctggaggagaaggcttccgaccaaatcct
atcacagttatattggaagatattgatgagtgccaagaactgcctggactttgccaagga
gggaaatgtatcaatacatttggcagtttccaatgtcgttgcccaactggttactacttg
aatgaagaaacccgagtgtgtgatgatgtaaatgaatgtgaaactcctggtatttgcggt
cctggaacatgttataacacagttgggaactacacttgtatttgtcccccagactatatg
caagttaatggtgggaataactgcatggatatgagaaggagtttatgctatcgaaattat
tatgcagacaaccagacctgtgatggagaactgctgttcaatatgaccaaaaaaatgtgt
tgctgctcttataacatcggccgtgcctggaataagccctgtgaacagtgtcccatcccc
agcactgatgagtttgctacactctgtggtagtcagagacctggctttgtcattgacatt
tataccggcttacctgttgatattgatgagtgccgagagattcctggagtgtgtgaaaat
ggagtttgtatcaatatggttggtagcttcagatgtgaatgcccagtggggttcttttat
aatgacaaactattgatttgtgaagatattgatgaatgtcagaatggtccagtctgtcag
cgcaatgcagaatgtatcaacacagccggcagcttccgctgtgactgtaagccaggatat
aggttcacctcaacagggcagtgcaatgataggaacgaatgccaagaaatccccaatatc
tgcagccatggtcagtgtattgacacagttggaagtttctattgcctttgtcacactgga
tttaagacaaatgctgaacaaaacatgtgtgtggatataaatgagtgtgaaagggatgcc
tgtggaaatggaacatgcagaaatacagtcggttctttcaactgccgatgcaaccatgga
tttatcctctcccataacaatgattgtatagatgttgatgaatgtgctactgggaatggg
aatctttgcagaaatggtcaatgcctcaatactgttggatccttccagtgtcagtgcaat
gaaggctatgaggtcactgctgatggaagaagttgtgttgatataaatgagtgtctagct
gatcctggaaaatgtgcaccaggcacatgtcaaaacttggatggatcctaccgatgcatt
tgtcctcctggatacagcctgcagaatgacaactgtgaagatattgatgagtgtgtggaa
gagccagaaatctgtgccttgggcacatgcagtaacactccaggcagcttcaaatgtctg
tgtccagaaggcttttcgttatcgtctactggtagaagatgccaagacttgagaatgagc
tattgctacgcgaagtttgaagggggcaaatgttcatcacctaaatccagaaatcattcc
aaacaagaatgctgctgtgccttaaagggagaaggttggggggacccatgtgagctgtgt
cctactgaaccagatgaggcatttcgacaaatctgtccatatggaagtgggatcattgtt
ggacttgatgacactcgtgttgatatggatgaatgcaaagagcctgatatctgcaaatat
ggccagtgcatcaacacagatggttcctaccgctgcgagtgtccttttgggtatatacta
catggagttgagtgtgtagatactgatgaatgctcggtgggtaatccttgtggaaatgga
acatgtaagaatgttattggaggttttgaatgtacatgtgaggaagggtttgagccaggt
ccaatgatgacatgtgaagatataaatgagtgtgctcagaaccctctcctctgtgccttc
cgatgcgtaaatacttatggatcatatgaatgtaaatgtcccatcggttatgttcttaga
gaagacaggagaatgtgcaaagatgagaatgagtgtgaagaaggaaagcatgactgtgca
gaaaaacaaatggaatgcaagaacctaattggaacatatatgtgcatttgtggccctggc
taccaacggagacctgatggagaaggttgcattgatgagaatgaatgtcagactaagcca
ggaatctgtgaaaatggacggtgcctcaataccagaggaagctacacgtgcgagtgcaat
gatggcttcacagccagccctgcccaggatgagtgccttgacaaccgagaaggatactgc
ttcactgaagttctacaaagcatgtgtcagattggatcgagtaaccggaatccagtcacc
aagtctgagtgttgctgcgatggagggagaggctggggcccccactgtgaaatctgccca
ttccagggcactgtcgcttttaagaaactttgccctcatggccgaggattcatgaccaat
ggagcagatattgatgaatgcaaggttattcatgatgtgtgccggaatggagaatgtatt
aatgagagaggatcctaccattgcaactgtaacactggctatactccagatattactggt
accgcctgtgtagatctaaatgaatgtaaccaggctcccaaaccctgcaatttcatatgc
aaaaacaccgaagggagttaccagtgttcatgtccaaaaggatacatccttcaggaggat
ggaagaagctgcaaagatcttgatgagtgtgcaaccaaacaacataattgtcagttcctt
tgtgttaacaccattggaggcttcacgtgcaaatgtccacctggattcacccaacaccat
acagcttgtattgataacaatgaatgtacctctgaagtcaacctttgtggagctaagggt
gtttgtcagaacactcctggaagcttcacttgtgaatgtcaaaggggcttctcactagat
cagagtggagccagctgtgaagatgtggatgagtgtgagggaaaccaccggtgccaacat
ggctgccagaacatcattggaggatacaggtgtagctgccctcagggatatctccagcac
taccagtggaaccagtgtgtggatgaaaatgaatgcctcagtgcacacatatgtggagga
gcctcctgccacaacaccctgggaagctacaaatgcatgtgtcccaccggattccagtat
gagcagtttagtggaggatgccaggatgtcaatgaatgtggctcagcacaggccccttgc
agctatgggtgctccaatacggaaggaggctacttgtgtggctgtcccccaggctacttc
aggattggccaagggcattgtgtttctggaatgggtatgggccgaggacctgaggctcct
gtcagtggagaagtggatgacaattccctttcaccagaagcttgctatgaatgtaaaatc
aacggctaccccaaaagaggcagaagacggagaagcgttaatgaaacagatgcccttgat
gcagaagatcagcctgagatggaagccccagtgagtctggcaagttgggacgttgagaag
acagctgtctttgttttcaatgtttcctcgatcagtaacaaagttcggattctggaactc
cttccagcccttacaactctgacaaatcacaatcgatatttaatcgaatctgggaatgaa
gatggcttctttaaaatcaaccaaaaggaaggcataagctatcttcatttctcaaagaag
aagccagtggctggaacctattcattacaaatcagtagtattcctctttataaaaagaag
gaacttaaccagctagaagacaaacatgacaaagactacctcagtggtgaactgggtgat
aacctgaaaatgaaaattcagattttgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
