Monodelphis domestica (gray short-tailed opossum): 100025769
Help
Entry
100025769 CDS
T01031
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin 1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
mdo
Monodelphis domestica (gray short-tailed opossum)
Pathway
mdo04350
TGF-beta signaling pathway
mdo04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mdo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
100025769 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
100025769 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mdo00536
]
100025769 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mdo00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100025769 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100025769
NCBI-ProteinID:
XP_001369848
Ensembl:
ENSMODG00000002675
UniProt:
F7CYW8
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(178543176..178856747)
Genome browser
AA seq
2871 aa
AA seq
DB search
MRRGGLLELALGFTVLLSSYTSHGAEGNSETGNVKETRASRAKRRGGGGHDALKGPNVCG
SRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQISPSCGSRSIQHCN
IRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCESGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQCERD
YRTGPCFTLVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIR
TGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVTQKCEDIDECATIPGVCD
GGECSNTVSSYFCKCPPGFYTSPDGTRCIDVRQGFCYASLTNGRCNNQLPQQLTKIQCCC
EIGRCWAAGPAMAPEMCPIRATEEFHRLCTLPGIVPGRPDIPLPPIFPPSGPVPPGGPVP
PIIYPSIPRPPLPELPYPSREPRVLPVNITDYCQLYRGLCLNGHCIPTPGSYRCECNKGF
QLDIRGECIDVDECEKNPCVGGECVNTPGSYICQCRVGYQSTLTRTECRDIDECLQNGRI
CNNGRCINTDGSFHCVCNAGFHVASDGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICKP
GFQLASDGRYCKDINECETPGICMNGRCVNTDGSYRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRST
CYGGYKRGQCVKPLFGAVTKSECCCASTEYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPGMTSG
GSDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNLGYEVDASGKNCVDINECALNTLLCDNGQ
CRNTPGSFTCTCPKGFVYKPDLKTCEDINECESSPCVNGACKNTLGSFVCECSPESTLDA
TKTICIETIKGTCWQTIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCKIDTICAKGY
SRIKGTQCEDIDECTVFPGVCKNGLCVNTLGSFVCQCPSGMTLDLTGRICLDIRLETCYL
SHEDEECSLPIAGRHRMDACCCSVGAAWGSTECEECPVRNTPEYDALCPRGPGFATRGEV
INGKPFFKDINECKMIPSLCTYGKCRNTIGSFKCRCDNGFALDSEERNCTDIDECRISPD
LCGQGICVNTPGDFTCECFDGYESGFMMMKNCMDIDECQRDPLLCRGGTCLNTEGSYRCE
CPPGHQMAPNISACIDINECDLSVNLCRNGRCVNLIGKYQCACNPGYHSTPDKLFCVDID
ECSIMNGGCDTFCTNSEGSYECSCRQGFALMPDQRSCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIPG
EYRCLCFDGFMASEDMKTCVDVNECDLNPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTTG
CTDINECEIGAHNCDRHAVCTNTAGSFKCSCSPGWIGNGIKCTDLDECSNGTHMCNQHAD
CKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCIDLDECSENLNLCGNGQCLNAPGGYRCECDMGFVPST
DGKACEDIDECSLPNICVFGTCHNLPGLFRCECETGYELDRTGGNCTDVNECLDPTTCIS
GNCVNTPGSYTCDCPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIRPRGDNGDTSCSNEIGVGVSK
ASCCCSLGKAWGTPCELCPPVNTSEYKILCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQG
GKCINTFGSFQCRCPTGYYLNEETRVCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDYM
QVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPIP
STDEFATLCGSQRPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPVGFFY
NDKLLICEDIDECQNGPVCQRNAECINTAGSFRCDCKPGYRFTSTGQCNDRNECQEIPNI
CSHGQCIDTVGSFYCLCHTGFKTNAEQNMCVDINECERDACGNGTCRNTVGSFNCRCNHG
FILSHNNDCIDVDECATGNGNLCRNGQCLNTVGSFQCQCNEGYEVTADGRSCVDINECLA
DPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYSLQNDNCEDIDECVEEPEICALGTCSNTPGSFKCL
CPEGFSLSSTGRRCQDLRMSYCYAKFEGGKCSSPKSRNHSKQECCCALKGEGWGDPCELC
PTEPDEAFRQICPYGSGIIVGLDDTRVDMDECKEPDICKYGQCINTDGSYRCECPFGYIL
HGVECVDTDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCAF
RCVNTYGSYECKCPIGYVLREDRRMCKDENECEEGKHDCAEKQMECKNLIGTYMCICGPG
YQRRPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCLNTRGSYTCECNDGFTASPAQDECLDNREGYC
FTEVLQSMCQIGSSNRNPVTKSECCCDGGRGWGPHCEICPFQGTVAFKKLCPHGRGFMTN
GADIDECKVIHDVCRNGECINERGSYHCNCNTGYTPDITGTACVDLNECNQAPKPCNFIC
KNTEGSYQCSCPKGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFTQHH
TACIDNNECTSEVNLCGAKGVCQNTPGSFTCECQRGFSLDQSGASCEDVDECEGNHRCQH
GCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCMCPTGFQY
EQFSGGCQDVNECGSAQAPCSYGCSNTEGGYLCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGMGRGPEAP
VSGEVDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRRRRSVNETDALDAEDQPEMEAPVSLASWDVEK
TAVFVFNVSSISNKVRILELLPALTTLTNHNRYLIESGNEDGFFKINQKEGISYLHFSKK
KPVAGTYSLQISSIPLYKKKELNQLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKIQILLH
NT seq
8616 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggagagggggtctgctggagctagccctgggatttacagtgctcttgtcttcctat
acgagccatggtgctgaaggaaattcagagacaggcaatgtgaaggaaaccagagccagc
cgggcaaaaagaagaggcggaggaggacacgatgcgctcaaaggaccaaatgtgtgtgga
tcacgttacaatgcttactgttgccctggatggaaaactttacctggtggaaatcaatgc
attgtcccaatctgtcggcattcctgtggagatggattttgttcaaggccaaacatgtgt
acttgcccaactggacagatatctccttcctgtggctccagatcaatacaacactgtaac
atccggtgtatgaatggaggtagctgtagtgacgaccactgtttgtgccagaaaggatac
acaggaacgcattgtggacaacctgtctgtgagagtggttgtctaaatggaggtagatgt
gtggcacccaaccgctgcgcttgtacatatggcttcacaggaccacagtgtgaaagagat
tacagaacaggcccatgtttcacactggtcagcaaccagatgtgccagggacagctcagt
gggatcgtctgtacaaagaccctttgctgtgctacagtaggaagagcttggggacatccc
tgtgagatgtgcccagcccagcctcatccttgtcgccgaggctttatcccaaacattaga
accggagcttgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggctctgtcaaggagga
aattgcattaacactgttggatcttttgagtgcaagtgccctgctggacacaaatttaat
gaagtgacacaaaaatgtgaagatattgacgagtgtgccactattcctggagtctgtgat
gggggtgaatgttcaaacactgtcagcagttacttttgcaaatgtcccccaggattctat
acctctcctgatggaaccagatgcatagatgttcgccaaggattctgttatgcatctctg
accaatggacgctgcaataaccagctaccccagcagctcaccaagatccagtgctgctgt
gaaataggccgctgctgggctgcagggcctgccatggccccagagatgtgccccatccgg
gctacagaggagttccacaggctttgcaccctgcctgggatagttcctggaaggcctgat
attcctctgcctcccatcttccctcccagtggcccagttcctccaggtggccctgtgcca
cctattatctatccatcgatccctagaccacccctcccagaacttccatatccatctcgg
gaaccacgtgtgttgccagtcaatatcactgattattgccagctgtaccgaggtctctgc
ctcaatgggcactgcattcccacccctggaagctatcgttgtgaatgcaataaaggattt
cagctggacattcgtggagaatgcattgatgttgatgagtgtgagaaaaatccttgtgta
ggtggagagtgtgttaatactcctggatcctacatatgccagtgtcgagttggctatcag
agcacattgacaaggactgaatgtcgagatattgatgaatgtttacagaatggacggatc
tgcaataacggacgttgtataaacacagatggcagtttccactgcgtgtgtaatgctggt
ttccatgtggcaagtgatgggaaaaattgtgaagatatggatgaatgcagcatacgaaac
atgtgcctcaatggaatgtgtatcaacgaggatggcagttttaagtgcatttgtaaaccc
ggcttccagttggcatcagatggccgctactgcaaagatattaatgaatgtgaaacacct
ggaatctgcatgaatggacgctgtgtgaacacagatggatcctaccgatgtgaatgcttc
cctggtctggcagtgggactagatggacgagtgtgtgttgatacacacatgcggagcaca
tgctatggtggatacaagagaggccaatgtgtcaaacccttatttggagcagttaccaag
tctgaatgctgctgtgccagtactgaatatgcctttggggaaccttgccagccatgccct
gctcagaattcagctgaatatcaagcactttgcagcagtggcccaggaatgacttcagga
ggcagtgatataaatgaatgtgccttggatcctgatatttgcccaaatggaatttgtgag
aatctacgtggcacatacaaatgtatatgcaatttgggatatgaagtggatgcaagtggg
aaaaactgtgttgatattaatgaatgtgcattaaacaccttgctttgtgacaatggacaa
tgcagaaacactcctgggagtttcacctgtacctgtcccaagggatttgtatacaaacct
gacctaaaaacttgtgaagatattaatgaatgcgaatcaagcccttgtgttaatggagca
tgcaaaaataccctgggttcttttgtttgtgaatgttctcctgaaagtactttggatgca
acaaaaactatctgcatagaaacaattaaaggcacttgttggcagactattgttgatgga
agatgtgaaattaatatcaatggagccacactgaagtcacagtgctgttcttcactgggt
gctgcctggggaagcccatgcacaccttgtaaaatagacacaatatgtgctaaggggtac
tcaagaattaaaggaacacagtgtgaagatatagatgagtgtactgtattccctggagtg
tgcaaaaatggcctttgtgtcaacactctggggtcatttgtttgccagtgccctagtggg
atgacattggatctcactggaagaatctgtcttgatatccgcctagaaacttgctacctg
agtcatgaggatgaggaatgctctttgcctattgctggccgccatcggatggatgcatgc
tgctgttctgttggggcagcctggggaagcacagaatgtgaggagtgcccagtgagaaat
acacctgagtatgatgctctttgtcctagagggcccggatttgccacaaggggagaggtt
ataaatggaaaacctttcttcaaagatataaatgaatgcaagatgatcccaagtctgtgt
acctatggcaagtgcagaaataccatcggcagctttaaatgtaggtgtgataatggcttt
gccctggattctgaagaaaggaactgtacagatattgatgaatgccggatctctcctgat
ctgtgtggccaaggcatctgtgtgaacactccaggggactttacatgcgagtgctttgat
ggatatgaaagtggatttatgatgatgaagaactgcatggatattgacgaatgccagaga
gaccctcttctctgtcgaggtggcacctgcctgaacacggagggcagttaccgctgcgag
tgccctcctggccatcagatggctcccaatatctctgcctgtatagacatcaatgagtgt
gatctaagcgttaacctctgccgaaacggccgctgtgtgaacctgattgggaagtaccag
tgtgcttgcaatcccggctatcactccacacccgacaaactcttttgtgttgatattgat
gaatgtagcataatgaatgggggttgtgacaccttctgcaccaattccgaaggcagctat
gaatgcagctgtcgacagggattcgcactcatgccagatcagagatcatgcactgacatc
gatgagtgtgaagataaccccaatatttgtgatggaggccagtgtacaaacatacctgga
gagtatagatgtctctgctttgatgggtttatggcatctgaggacatgaaaacttgtgtc
gatgttaatgaatgtgaccttaatccaaacatttgtctgagtggcacctgtgagaacacg
aaaggctcattcatctgccattgtgacatgggatattcgggcaaaaaaggaacaactggc
tgtacagacatcaatgaatgtgaaattggagcacataattgtgacaggcatgctgtctgc
accaacacagcagggagcttcaaatgcagctgcagcccagggtggattggcaatggcatt
aagtgcacagatttggacgaatgctctaatgggacgcatatgtgtaaccaacatgctgac
tgtaaaaatacgatgggatcttaccgctgtttgtgtaaggaaggatatactggagatggc
ttcacttgtatagatcttgatgaatgctcagaaaatctgaacctttgcggaaatgggcag
tgcctcaatgccccgggaggatatcgttgtgaatgtgatatgggatttgtgccaagcact
gatggaaaagcctgtgaagatattgatgaatgttcccttcctaatatctgtgtctttggt
acttgtcacaaccttcctggtcttttccgctgtgagtgtgagactggctatgaactggac
agaactggagggaactgcacagatgttaatgaatgtctcgaccctacaacttgtatcagt
gggaattgtgtcaataccccgggtagctacacctgtgactgtccacctgattttgagctg
aaccccaccagagttggctgtgttgatacacgatctggaaactgctatttggatattcgt
cctcgaggagacaatggagatacatcctgtagcaatgaaattggagttggtgtttctaag
gcttcctgctgctgttccctgggtaaagcttggggtactccatgtgaactctgccctcct
gtgaacacatctgaatataagattctttgtcctggaggagaaggcttccgaccaaatcct
atcacagttatattggaagatattgatgagtgccaagaactgcctggactttgccaagga
gggaaatgtatcaatacatttggcagtttccaatgtcgttgcccaactggttactacttg
aatgaagaaacccgagtgtgtgatgatgtaaatgaatgtgaaactcctggtatttgcggt
cctggaacatgttataacacagttgggaactacacttgtatttgtcccccagactatatg
caagttaatggtgggaataactgcatggatatgagaaggagtttatgctatcgaaattat
tatgcagacaaccagacctgtgatggagaactgctgttcaatatgaccaaaaaaatgtgt
tgctgctcttataacatcggccgtgcctggaataagccctgtgaacagtgtcccatcccc
agcactgatgagtttgctacactctgtggtagtcagagacctggctttgtcattgacatt
tataccggcttacctgttgatattgatgagtgccgagagattcctggagtgtgtgaaaat
ggagtttgtatcaatatggttggtagcttcagatgtgaatgcccagtggggttcttttat
aatgacaaactattgatttgtgaagatattgatgaatgtcagaatggtccagtctgtcag
cgcaatgcagaatgtatcaacacagccggcagcttccgctgtgactgtaagccaggatat
aggttcacctcaacagggcagtgcaatgataggaacgaatgccaagaaatccccaatatc
tgcagccatggtcagtgtattgacacagttggaagtttctattgcctttgtcacactgga
tttaagacaaatgctgaacaaaacatgtgtgtggatataaatgagtgtgaaagggatgcc
tgtggaaatggaacatgcagaaatacagtcggttctttcaactgccgatgcaaccatgga
tttatcctctcccataacaatgattgtatagatgttgatgaatgtgctactgggaatggg
aatctttgcagaaatggtcaatgcctcaatactgttggatccttccagtgtcagtgcaat
gaaggctatgaggtcactgctgatggaagaagttgtgttgatataaatgagtgtctagct
gatcctggaaaatgtgcaccaggcacatgtcaaaacttggatggatcctaccgatgcatt
tgtcctcctggatacagcctgcagaatgacaactgtgaagatattgatgagtgtgtggaa
gagccagaaatctgtgccttgggcacatgcagtaacactccaggcagcttcaaatgtctg
tgtccagaaggcttttcgttatcgtctactggtagaagatgccaagacttgagaatgagc
tattgctacgcgaagtttgaagggggcaaatgttcatcacctaaatccagaaatcattcc
aaacaagaatgctgctgtgccttaaagggagaaggttggggggacccatgtgagctgtgt
cctactgaaccagatgaggcatttcgacaaatctgtccatatggaagtgggatcattgtt
ggacttgatgacactcgtgttgatatggatgaatgcaaagagcctgatatctgcaaatat
ggccagtgcatcaacacagatggttcctaccgctgcgagtgtccttttgggtatatacta
catggagttgagtgtgtagatactgatgaatgctcggtgggtaatccttgtggaaatgga
acatgtaagaatgttattggaggttttgaatgtacatgtgaggaagggtttgagccaggt
ccaatgatgacatgtgaagatataaatgagtgtgctcagaaccctctcctctgtgccttc
cgatgcgtaaatacttatggatcatatgaatgtaaatgtcccatcggttatgttcttaga
gaagacaggagaatgtgcaaagatgagaatgagtgtgaagaaggaaagcatgactgtgca
gaaaaacaaatggaatgcaagaacctaattggaacatatatgtgcatttgtggccctggc
taccaacggagacctgatggagaaggttgcattgatgagaatgaatgtcagactaagcca
ggaatctgtgaaaatggacggtgcctcaataccagaggaagctacacgtgcgagtgcaat
gatggcttcacagccagccctgcccaggatgagtgccttgacaaccgagaaggatactgc
ttcactgaagttctacaaagcatgtgtcagattggatcgagtaaccggaatccagtcacc
aagtctgagtgttgctgcgatggagggagaggctggggcccccactgtgaaatctgccca
ttccagggcactgtcgcttttaagaaactttgccctcatggccgaggattcatgaccaat
ggagcagatattgatgaatgcaaggttattcatgatgtgtgccggaatggagaatgtatt
aatgagagaggatcctaccattgcaactgtaacactggctatactccagatattactggt
accgcctgtgtagatctaaatgaatgtaaccaggctcccaaaccctgcaatttcatatgc
aaaaacaccgaagggagttaccagtgttcatgtccaaaaggatacatccttcaggaggat
ggaagaagctgcaaagatcttgatgagtgtgcaaccaaacaacataattgtcagttcctt
tgtgttaacaccattggaggcttcacgtgcaaatgtccacctggattcacccaacaccat
acagcttgtattgataacaatgaatgtacctctgaagtcaacctttgtggagctaagggt
gtttgtcagaacactcctggaagcttcacttgtgaatgtcaaaggggcttctcactagat
cagagtggagccagctgtgaagatgtggatgagtgtgagggaaaccaccggtgccaacat
ggctgccagaacatcattggaggatacaggtgtagctgccctcagggatatctccagcac
taccagtggaaccagtgtgtggatgaaaatgaatgcctcagtgcacacatatgtggagga
gcctcctgccacaacaccctgggaagctacaaatgcatgtgtcccaccggattccagtat
gagcagtttagtggaggatgccaggatgtcaatgaatgtggctcagcacaggccccttgc
agctatgggtgctccaatacggaaggaggctacttgtgtggctgtcccccaggctacttc
aggattggccaagggcattgtgtttctggaatgggtatgggccgaggacctgaggctcct
gtcagtggagaagtggatgacaattccctttcaccagaagcttgctatgaatgtaaaatc
aacggctaccccaaaagaggcagaagacggagaagcgttaatgaaacagatgcccttgat
gcagaagatcagcctgagatggaagccccagtgagtctggcaagttgggacgttgagaag
acagctgtctttgttttcaatgtttcctcgatcagtaacaaagttcggattctggaactc
cttccagcccttacaactctgacaaatcacaatcgatatttaatcgaatctgggaatgaa
gatggcttctttaaaatcaaccaaaaggaaggcataagctatcttcatttctcaaagaag
aagccagtggctggaacctattcattacaaatcagtagtattcctctttataaaaagaag
gaacttaaccagctagaagacaaacatgacaaagactacctcagtggtgaactgggtgat
aacctgaaaatgaaaattcagattttgcttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
