Mesoflavibacter sp. HG96: C7H62_1223
Help
Entry
C7H62_1223 CDS
T06472
Name
(GenBank) RND efflux system, inner membrane transporter
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
mesq
Mesoflavibacter sp. HG96
Pathway
mesq01501
beta-Lactam resistance
mesq01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesq00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
C7H62_1223
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
C7H62_1223
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mesq02000
]
C7H62_1223
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
mesq01504
]
C7H62_1223
Transporters [BR:
mesq02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
C7H62_1223
Antimicrobial resistance genes [BR:
mesq01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
C7H62_1223
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Patched
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIJ89032
UniProt:
A0A6G7RU61
LinkDB
All DBs
Position
1344233..1347364
Genome browser
AA seq
1043 aa
AA seq
DB search
MLKTFIERPVLSTVISIIIVILGVLGLTNLPIEQYPDIAPPTITVSANYTGASAETIMES
VVIPIEEQINGVEGMTYITSTASNSGTAQITVYFDQETDPDIAAVNVQNRVARANPLLPQ
VVTQSGVLTQKQQTSALMFMSFYSENEDYDATFLQNYLKINVIPSIQRVNGVGNVNVFSS
QDYAMRIWLKPEKLAAYNLNPSDITSALNEQSLEASAGSLGENSGESFSYTITYSGRFKT
EQQYSDIIIKALDNGQYLRLKDVADVELDSQSYASFGSTNGYPSVNMGIFQTAGSNAQEI
IETIKSELSRLEKDFPDGIKVIIPFDTNQFLEASIDKVVSTFIEAFILVFLVVFIFLQDF
RSTLIPAIAVPVAIVGTFFFLNLFGYSINLLTLFALVLAIGIVVDDAIVVVEAVHSKMDE
GETNAKKATLSAMHEISGAIISITLVMAAVFIPVTFVQGPTGVFYEQFGVTLIVAILISA
LNALTLSPALCALFLKSHDDSHKNKNVVQRFYSAFNKGFNATTERYGRSLQFLYKNKLVT
VVILLLAGVGIWWSATTTPTGFVPSEDRGVLFIDVQLAPGASMDRTKQITDLVYKNASQI
PGIDGVTVVNGRSLINGSGSNYGFGFIKLKDWSERTADDQTIDAITGKLFGMAAGIQDAR
VLFFAPPSIPGFGLSSGFEVNLLDKSGGSVEQLNEATQNFIGNLMQHPEIQYGQTSFNTN
YPQYQLDINVPVAKDLGVSVSSIFSTLQGYIGGIYAADFARFGKQYRVYVQSLPEDRTDE
NSLNQLYIRTGSGDMAPITQFVSLKRVYGPQSVTRFNLYNSAKVSGASNPGFSTGDALAI
VNAEASKLPSNFEVAYSGLSREESSAGNQTTIIFGLSILFVFFLLAAQYESYLLPLAVIL
SLPVGIFGAFISTKLFGLENNIYFQIALVMLVGLLAKNAILIVEFALQRRKQGEDLVEAA
IHGAKARLRPILMTSFAFILGLMPLVLANGVGAEGNRSIGTGAAGGMLIGTLLGVFVIPI
LFIFFQWLQEKFTGQPQTNNLED
NT seq
3132 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaaacatttatagaaagacctgtactatctacagttatttcaattattatagtc
attttaggagttctaggacttactaatttgccaatagaacagtatccagatattgcgcct
ccaacaattacagtatctgcaaattatacaggagcaagtgcagaaactattatggaatct
gttgttattcctatagaagaacaaattaacggtgtagaaggtatgacttatattacctct
acagcttctaactctggaacagcacaaatcacagtttattttgatcaagaaacagatcca
gatattgctgctgtaaatgtacaaaaccgtgttgcaagagccaatcctttgttaccacaa
gtagtgacgcaatctggagttttaactcaaaagcagcaaacttcggcattaatgttcatg
tcgttttattcagaaaatgaagactacgatgctacatttcttcaaaattatttaaagatt
aatgttatcccatcaatacaacgtgtaaatggtgtaggtaatgttaatgtgttttcatct
caagattacgccatgcgtatttggctaaaaccagaaaagttagcagcgtataatttaaat
ccttcagatattacatcagctttaaacgagcaaagtttagaagcttctgctggatcttta
ggggaaaatagtggtgagtcattttcatatacaataacctatagtggtagatttaaaaca
gaacaacagtacagcgatataattataaaagcattagataatggtcaatatttaaggctt
aaagatgttgcagatgtcgaactagattctcaatcctacgcttcttttgggtcaaccaat
ggatatcctagtgttaatatgggtatttttcaaactgctggatctaatgctcaagaaata
attgaaactattaaatctgaattatcaaggttagaaaaagattttcctgacggaattaaa
gtgataattccgtttgatactaatcaatttttagaagcttctatagacaaggtagtaagc
acatttattgaagcttttatcttagtatttttagttgtatttatctttttacaagatttt
agatctactttaattcctgctatagcagtacctgtagcaattgttggtacctttttcttt
ttaaatttatttggctattccataaacctgctaacgctgtttgcattagtcttagcaata
ggtattgtagttgacgatgcaattgttgtggtagaagctgtacactctaaaatggatgaa
ggcgaaacaaatgctaaaaaggcaacacttagtgctatgcacgaaatatctggagccatt
atttctattacattagttatggctgcagtatttatacctgtaacttttgttcaaggtcca
acaggtgtgttttacgagcaatttggtgtgacattaattgttgctatattaatttcagcc
ttaaatgcattaacgcttagtcctgcattatgtgcattgtttttaaaatctcatgacgat
tcacataaaaacaaaaatgtcgtacaacgtttttattctgcttttaataaaggatttaat
gcaacgactgaacgttatggaagaagcttacagtttttatataaaaacaaacttgttact
gtagtcatactacttttagcaggtgttggaatttggtggtctgccacaacaacaccaact
ggatttgtaccaagtgaagatagaggcgttttatttatagatgtacaattagcaccagga
gcatcaatggatagaacaaaacaaattacagatttagtctataaaaatgcatctcaaatt
cccggaatagatggtgtaacagttgtaaatggtagaagtttaattaatggatcgggtagc
aactatggatttggatttataaaattaaaagactggagcgaacgtactgcagacgatcaa
actatagatgctataacaggtaaattgtttgggatggcagcaggaatacaagatgctaga
gtattgttttttgcgccgccaagtatacctggatttggtttgtcttctggttttgaagtt
aatttacttgataaatctggtggtagtgtagagcaattaaatgaagcaactcaaaatttt
attggtaatttaatgcagcatccagaaatacaatatggacaaacttcttttaatactaat
tatccacaatatcaattagatattaatgtaccagtagcaaaagatttaggcgtatctgta
agtagtattttctctactttacaagggtatattggaggaatttacgctgcagattttgca
agatttggtaagcaataccgtgtgtatgtacaatcacttcctgaagatagaacagatgaa
aactcattaaatcaattatatattagaacaggaagtggtgatatggcaccaataacacag
tttgtttctttaaaacgtgtttatggtccgcaatcggtaactcgatttaacttatataat
tcggcaaaagtatctggagcttcaaatcctggttttagtacaggtgatgcattagcaatt
gtaaatgcagaagcctcaaaattaccatcaaattttgaagttgcctattctggtttatct
agagaagaatctagcgcaggtaatcaaacaacaataatttttggattaagtatactcttt
gtctttttcttattagcagcacaatacgagagttacttattaccattagcagtaatttta
tctttaccagtaggtatctttggcgcatttatttcaacaaaattatttggtttagaaaat
aatatttacttccagatagccttagttatgcttgtaggtttactcgctaaaaacgccata
ttaattgtagagtttgctttacaaagaagaaaacaaggcgaagatctagtagaagctgca
atacatggtgctaaagcgcgtctaagaccaattttaatgacgtcttttgcttttatttta
ggattaatgccacttgtgttagcaaatggtgttggagcagaaggtaacagatctattggt
actggtgcagcaggaggaatgttaataggaacacttttaggtgtatttgtaattcctatt
ctattcatcttttttcaatggttacaagaaaaatttactggacaaccgcaaactaacaat
ttagaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
