Nanorana parkeri (Xizang Plateau frog): 108792195
Help
Entry
108792195 CDS
T04897
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
npr
Nanorana parkeri (Xizang Plateau frog)
Pathway
npr04350
TGF-beta signaling pathway
npr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
npr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
108792195 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
108792195 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
npr00536
]
108792195 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
npr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
108792195 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
FBN_EGF_st1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108792195
NCBI-ProteinID:
XP_018418410
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2888 aa
AA seq
DB search
MRRLGCVLGLAVGFTVFLSFGASQGADKDATTAADTVKEARANRAKRRGGGAGAGHDVLK
GPNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHTCGDGFCSRPNMCTCPSGQTAPSCGSK
SVQQCSVRCMNGGTCNDEHCLCQKGYAGTHCGQPVCEHGCSNGGRCVAPNRCACTYGFTG
PQCERDYRTGPCFSLVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRG
FIPNIRTGACQDVDECQAIPGMCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEITQKCEDIDECAT
IPGICESGECANTVSSYFCKCPTGFFTSADGSRCIDIRPGHCYSSLSNGRCTNQLPQLLP
KMQCCCDTGRCWAPAANIAPEVCPFRGTDDYRKLCTMSWVRPGQIPGMEPGPVIPPGGHF
PDYPPAIGPQIPPGYPPVFPPPLIPGYPVPSRVPPVVLPVNLTHQQPVTDYCVLFRNLCL
HGRCVPTPGSYRCECNKGFQLDGRGECIDVEECERNPCLHADCVNTQGSYICQCYSGFQS
TSTRTECRDIDECLANGRICNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVAPDGKNCQDMDECSVRNM
CLNGMCINEDGSFKCICKPGFQLAPNGRFCTDIDECETPGICMNGHCVNTDGSFRCECFP
GLAVGLDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLQGAVTKSECCCASTEFAFGEPCKPCPA
KTSDEYQALCSSGPGITSTGTDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCVCNSGYEVDTTGK
SCNDIDECALNRLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGYVYKPDLKTCEDIDECESNPCINGAC
KNIPGSFVCECPPGSTLDTTKTICIETVKGTCWKDIVNGRCEVNINGATLRSQCCSTLGA
AWGSPCLPCEPDPVCAKGFSRSRGTACEDVDECKVFPGLCINARCVNTLGSFTCECPNGM
TLDASGRTCLDIRLETCYLKHEDEECSAPIAGRHRMDACCCSVGAAWGFDCEQCPPKGTT
EFETICPRGPGFASKEITPGKVFSKDINECKMIPSLCKYGKCRNTIGSFKCRCDNGFALD
AEERNCTDIDECRISPDLCGQGNCINTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPL
LCRGGNCLNTEGSFKCECPDGHEVTLDGTACSDINECELSTDLCRNGRCINLIGRYQCAC
NSGYKPSDDXXXXIDVDECEIFNGGCDTNCTNSQGSYECSCVEGYALMPDDRSCTDIDEC
ETNPNICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGYMASIDMKACLDVDECELHDNICLSGSCENTKGS
FICHCNPGYSGKKGQTGCADINECEIGAHNCDRHATCTNTPGAFKCSCNPGWVGNGIKCA
DLDECSNGTHLCSSNADCKNTMGSYRCLCKEGYSGDGFECTDIDECTENLNLCGNGQCLN
TPGGYRCDCDMGFLPSIDGKTCEDIDECALPNICVYGTCKNLPGLFRCDCDIGYELDRSG
GNCTDVDECTDPTACISGTCSNTPGSYSCECPPDFQLNPTRVGCVDTRSGSCYLEVKPRG
DNGDLSCSTEIGVGISKASCCCSLGKAWGTPCEHCPPVNSSDYKVLCPGGEGFRPNPITV
ILEDIDECLELPGLCQGGKCINTFGSFQCRCPPGFFLNEETRVCDDVNECDQPGICGPGT
CYNTVGNYTCICPPDYMPVNGGNNCMDMRRSLCFRNYNADNQTCDGELLYNMTKKMCCCS
YNIGRAWNRPCEECPLPSTDEFAGLCGSARPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVC
INMVGSFRCECPMGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQRNADCVNTQGSFRCDCKPGYKFT
PTGQCVDRNECLEIPNVCSHGECHDKVGGYYCVCHNGFKTNDDQTMCLDINECERDPCGN
GTCRNTIGSYNCRCHDGFILSHNNDCIDIDECTTLNGQLCRNGQCVNIIGSFQCICNEGY
EMTSDGRTCLDINECELDPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYVLKDDTCEDIDECVEEPE
ICALGTCSNVPGSFTCLCPEGFVLSSTGRRCQDLRVGLCYTKFEAGQCLSPKTLNHTKQE
CCCAMREAGWGSPCEICPVEGDEAFREICPFGSGVVVGPNDERIDMDECTDPDKCKNGQC
INTDGSYRCECSFGYVISGDECTDIDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMM
SCEDVNECAQNPLLCAFRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQDECEDGLHDCDSKQ
MMCKNLIGTYMCICGPGFQRRPDGESCIDLNECLKPGLCENGKCLNTMGSYKCECKDGFN
ASITETECIDNRLGYCFADVLHTMCQLGSSNQNSVTKSECCCNGGRGWGITCEICPFSGT
LQFRKLCPYGKGYTTGGEGMXECHVLHGICRNGQCINERGTYKCECNLGYISDVTGTSCI
DLDECTQSPKPCNFICKNTEGSFQCSCPRGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFICVNT
MGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECSQEVNLCGAKGVCQNTPGSYMCDCQRGFSLDQSGS
SCEDVDECEGSHRCQHGCQNIVGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECMSTQMCGGAMCH
NTLGSFKCICPTGFHFEQFAGSCQDVNECSSSQAPCNFGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQ
GHCVTGAGLSRGSQDMAVSGEIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSANDTVSSEDEE
QLQLEAPVSLDSWDSEETAILSFNISHLNSRDRILELTPALTTLKHHNRYLIDSGNQDGL
FRINQKDGISYLHLTKKKPVSGVYNIQISSFPLYKEKELIQLEDRHDRDYLTGELGDILK
MKIRILLH
NT seq
8667 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggcggctggggtgtgtgttgggactggcagtgggatttacagtgttcctgtccttc
ggtgccagccaaggtgccgacaaagatgccaccaccgcagcagacacggtgaaggaagcc
agggccaacagagccaagagaaggggtggaggagctggagcagggcacgacgtgctcaaa
ggaccaaatgtttgtggatcccgttacaatgcctactgctgtcctggatggaaaacgtta
cctggagggaaccagtgtattgtccctatttgtcggcacacctgtggtgatgggttctgc
tcacggcccaatatgtgcacatgtccatcgggtcagacagctccatcatgcggttccaaa
tctgttcagcagtgtagtgtcagatgtatgaatggaggcacatgcaacgatgagcactgt
ctatgccagaaaggttatgctgggacacattgtggacagcctgtgtgtgaacatggatgt
tcaaatggtggaagatgtgtcgctccaaaccgatgtgcctgcacttatggctttacagga
ccacaatgtgaaagggattacaggaccggaccttgtttctcacttgtcagcaaccagatg
tgtcagggacagctgagtggaatagtttgcacaaagacactgtgctgtgctacagttgga
agagcatggggccacccttgcgagatgtgcccagcccagccacatccctgtcgtcgtgga
tttattccaaacattcgaacaggagcgtgtcaagatgtggatgaatgccaagcaatccct
gggatgtgtcaaggaggaaattgcattaatacagttggatcttttgagtgcaaatgccca
gctggacacaaatttaatgaaataacacaaaaatgtgaagatattgatgaatgtgccaca
atccccgggatctgtgaatctggtgaatgtgctaatacagtgagcagctacttttgcaag
tgtccaacagggttttttacatcggcagatggatcaagatgcatagatattcgtcctggc
cattgttattcatcgctatctaatggccgctgcaccaatcagctcccccaactgctacct
aagatgcagtgttgctgtgatactggaaggtgttgggctccagcagcaaatatagcaccc
gaagtgtgccccttccgtgggacagatgattaccgtaaactgtgcacaatgtcttgggtg
cgtcctggacagatccctggaatggaaccaggaccagtcattcctcctggcgggcacttt
ccagattaccctcctgcaataggtccacagatcccaccaggctatcctcctgtctttcca
cctccacttattcctggatatcctgtgccttcccgggttcctccagtggtgctgccagta
aacctcactcatcagcagcctgtgaccgattactgtgtcttattccggaatctgtgtttg
catggccgctgcgtacctactcctggaagctatcgttgtgagtgtaacaagggattccag
ctggatggtagaggagaatgcatagatgttgaagagtgtgaaagaaatccttgcctccat
gcagactgtgtaaatacacagggatcatacatctgtcagtgttattctggattccagagt
acatctactaggacagaatgcagagacattgatgagtgcttagcgaatggaaggatctgt
aacaatggcagatgtgttaacacggatggcagtttccactgtgtgtgcaatgcaggcttt
caagtggcacctgatgggaaaaattgtcaagatatggatgaatgcagtgtgaggaacatg
tgccttaatggaatgtgtattaacgaggatggaagttttaaatgcatctgtaaacctgga
ttccagcttgctccaaatggacgcttttgcacagatattgatgagtgtgagacaccaggc
atctgcatgaatggacattgtgtgaacacagatggatcttttagatgtgaatgcttccct
ggtctagcagttggacttgatggtcgtgtttgtgtagatacccacatgaggagcacttgc
tatggtggttacaagagaggtcagtgtgtcagaccactgcagggagcagtgactaaatca
gagtgttgctgtgccagcactgaatttgcttttggtgaaccatgtaaaccctgccctgcc
aagacttcagatgaatatcaagctctctgcagcagtggcccaggaataacatctacagga
actgatattaatgaatgtgctctggatcctgatatctgtcctaatggaatttgtgaaaac
cttcgtggaacctacaaatgcgtttgtaattctggatacgaggtggacactactgggaag
agttgcaatgatattgatgaatgtgcattaaacagactgttatgtgacaacggacaatgt
cggaatactccaggaagctttacctgcacttgtcctaaaggatatgtctataaacctgat
cttaaaacttgtgaagatatcgatgaatgtgagtccaacccctgcatcaatggtgcatgc
aaaaacatcccaggatcttttgtgtgtgaatgcccccctggaagtacactggatacaacc
aagacaatctgcattgaaactgtcaagggaacatgctggaaagatatagtgaatggaaga
tgtgaagtcaacatcaatggagcaaccttacgttcacagtgctgttctacattaggtgct
gcctggggaagcccttgtctaccctgtgaaccagatcctgtctgcgcaaaaggtttttca
aggtcaagaggcacagcatgtgaagatgtcgacgagtgtaaggtgtttcctggattgtgc
atcaatgctcgatgtgttaacacactgggatcctttacttgcgaatgccccaatgggatg
acgcttgatgcttctggacgcacatgccttgacatacgcttggagacttgctacctaaaa
cacgaagatgaggagtgctctgctcctattgctggacgccaccggatggatgcctgttgc
tgttctgttggggctgcctggggatttgattgtgagcagtgcccaccaaaaggaacgaca
gaattcgagaccatttgtcccagaggacctggatttgcttctaaagaaataacacctgga
aaagtcttctccaaagatattaatgaatgtaagatgatcccaagtttatgcaagtatgga
aaatgcagaaacacaattggcagctttaagtgtcgatgtgacaatggttttgccttggat
gcagaagaaaggaactgcacagatattgatgaatgcaggatatcaccagatttgtgtggg
caaggcaactgcattaacacaccaggagactttgagtgtgactgctttgaaggatacgag
agtggattcatgatgatgaagaactgcatggacattgatgaatgccagcggaatccactc
ctgtgccgtggtggcaactgccttaacacagagggaagttttaaatgtgaatgtcctgat
gggcatgaggttacacttgatggcactgcctgctcagatatcaatgagtgtgagctcagc
actgacttgtgccgaaatgggcgatgtataaacctaattggaagataccaatgtgcttgt
aattctggttataagccatcagatgatnnnnnnnnnnttatagatgttgatgagtgtgaa
attttcaatggtggatgtgacacaaattgtacaaactcccaaggaagttatgaatgcagt
tgcgttgaaggttatgctttaatgccggacgacaggagctgtacagatattgatgagtgt
gaaacaaaccccaatatttgtgatggaggccagtgtacaaacatacctggagagtaccgg
tgcctctgctacgatggttacatggcatccattgatatgaaggcttgtctagatgttgat
gagtgtgaactccatgataacatctgtctgagtggaagttgtgagaacacaaaaggctcc
ttcatctgccactgcaatcctggctattctggaaagaaaggacaaactggatgcgcagat
attaatgaatgcgagattggtgcccacaactgtgacagacatgccacatgtacaaacacg
cctggagctttcaaatgcagctgtaatcctggatgggtaggaaatggcatcaagtgtgca
gacctcgatgaatgttcaaatggaacacatttgtgtagttcaaatgcagactgtaaaaac
accatgggatcatatagatgtctatgcaaagaaggatactctggagatggctttgaatgt
acagatattgatgagtgcacagagaatctgaatctgtgcggaaatggtcaatgcctcaat
acccctggtggataccgctgtgactgtgatatgggtttcttaccgagcattgatggaaaa
acatgtgaagatattgatgaatgtgcattgcccaacatctgtgtctatggcacctgcaag
aatctccctggtctctttagatgtgattgtgacataggatatgagctggatagaagtgga
ggcaactgtacagatgtggatgaatgtaccgatccaacagcctgtattagtggtacatgt
tcgaatactcctggtagctacagttgcgagtgtccaccagacttccaactaaatcccact
cgagttggatgtgttgacactcggtctggcagctgctacctagaggtaaagccgcgggga
gataatggagacctgtcctgcagtactgagattggtgttggtatatctaaggcttcatgt
tgttgctcacttgggaaggcctgggggaccccctgtgaacactgccccccagtgaattct
agtgattataaagttctgtgcccaggaggagaaggattcagaccaaatcctattacagtt
attttagaagatatcgatgaatgtcttgagttgccaggtctctgtcaaggtggaaagtgt
ataaacacatttggaagtttccagtgccgctgtccaccaggatttttcctcaatgaagaa
actcgtgtttgtgatgatgtcaatgaatgtgaccagcctggaatttgtggccccggaaca
tgttataacactgtcggaaattatacctgtatatgtccacctgattatatgccagtaaat
ggaggaaacaactgtatggacatgaggaggagcttgtgcttcagaaattataatgctgac
aatcagacttgtgatggagaattactttacaacatgacaaaaaaaatgtgttgctgttcc
tacaatattggacgcgcatggaatcgaccctgtgaggaatgtcctttgccaagcactgat
gagtttgctggactttgtggaagtgctcgacctggctttgtcattgatatttacactgga
ctaccagttgatatcgatgaatgcagagaaattcctggtgtttgtgaaaatggcgtttgt
ataaacatggtgggaagcttccgctgtgaatgtccaatgggatttttctacaatgacaag
ttactcatctgtgaagatattgatgaatgccagaatggcccagtgtgtcagaggaatgca
gactgtgttaatacacaagggagcttccgctgtgactgcaaacctggctacaagttcaca
cccacgggacaatgcgtcgatcgcaatgagtgtctagaaatccccaatgtctgcagtcat
ggagagtgccatgataaggttgggggttattactgcgtatgccacaatggatttaagacc
aatgatgatcagactatgtgtctagatattaatgaatgtgaaagagatccttgtggcaat
gggacatgtaggaatacaattggatcttacaactgtcgctgtcatgatggatttatcctc
tcacacaacaatgattgtatagatattgatgaatgtaccacactcaacggtcagctatgt
agaaatggacagtgtgttaatattattggatccttccaatgtatctgtaatgaaggatat
gaaatgacatccgatggaagaacatgtctagatatcaatgagtgcgaacttgatccaggg
aagtgcgctcctggaacttgtcaaaatctggacggctcctaccgctgcatctgtcctcct
ggatatgtgctgaaagatgatacatgtgaagatattgatgaatgtgttgaagagccagag
atttgtgctctggggacttgtagcaatgttcctggcagcttcacctgtctgtgtcctgag
ggttttgtactatcatcaacaggaaggagatgccaagatttacgagttggtttatgctac
accaaatttgaagcaggacaatgcctttctccaaagactctaaaccacaccaaacaagaa
tgttgctgtgcaatgagagaggcgggatggggatctccatgtgaaatatgcccagtggaa
ggagatgaggctttccgagagatctgtccgtttggaagtggtgtggtggttggaccaaat
gatgagcgaattgacatggacgaatgtaccgatcccgacaaatgcaagaatggccagtgt
attaacacagacggatcgtatcgatgcgaatgctcctttggatatgtgatttcaggagac
gaatgtacagatattgatgagtgctctgttggaaacccatgcggtaatggcacttgtaag
aatgtgattggtggatttgagtgcacatgtgaagaagggtttgagcctggaccaatgatg
tcctgtgaagatgttaatgaatgcgctcagaaccctctgttgtgtgctttccgatgtgtt
aacacctatggctcatatgaatgcaagtgcccagctggttatgtgctccgtgaagacaag
agaatgtgcaaagatcaggatgagtgtgaagatggtcttcatgactgtgattctaaacaa
atgatgtgcaagaatctcattggaacatatatgtgtatatgtggaccagggttccagcgt
agaccggatggtgaaagctgtatagatctgaatgaatgccttaaacctggtctatgtgaa
aatggaaaatgtctgaacaccatgggcagctacaagtgtgagtgcaaagacggatttaat
gccagcattaccgagacagaatgtattgacaatcgacttggatattgctttgctgatgta
ttacatacaatgtgccagcttggatcttcaaaccagaattccgttaccaagtccgagtgt
tgctgtaatggtggccggggctggggtattacctgtgagatctgccctttctctggcaca
cttcagtttagaaagctttgtccttatggcaaaggatatacaactggaggggaaggtatg
nnngaatgtcatgttctgcatggaatctgtcgcaatggacaatgtatcaacgagagggga
acatacaaatgtgaatgtaatctaggttatatttctgatgtgactggtacttcttgtata
gatcttgatgaatgcactcagtccccaaaaccttgcaattttatttgcaaaaatactgaa
ggaagtttccagtgttcttgcccacgtggttacattttgcaggaagatggaagaagctgc
aaagatcttgatgaatgtgccaccaaacaacataattgtcagtttatttgtgtgaacaca
atgggaggatttacatgtaaatgtcctcctggatttacacagcatcatactgcctgcatt
gataacaacgagtgttctcaggaagtgaacctgtgtggtgctaaaggcgtttgccagaat
actccaggcagctatatgtgtgattgtcagcgtggcttttcccttgatcagagtggatca
tcatgtgaagatgtggatgagtgtgaaggaagtcatcgctgtcagcatggatgccagaac
attgtaggcgggtatagatgtagctgcccacaaggctatctccaacattatcagtggaac
caatgtgtggatgagaatgaatgcatgagcacacaaatgtgtgggggagctatgtgccat
aacacattgggaagcttcaagtgcatatgcccaacaggatttcattttgaacagtttgct
ggttcttgtcaagatgtcaatgagtgcagctcttcccaagcaccatgtaactttggttgt
tcaaacactgaaggaggatatgtctgcggctgtccacctggatacttcagaataggacaa
ggacactgtgtaacaggagccggactaagcagaggttcccaggatatggcagtgagtgga
gaaatagatgataactctctgtctcctgaagcttgctatgactgcaagatcaatggctat
cccaagagaggaaggaagcggcggagtgccaatgataccgtgtccagtgaggatgaggaa
cagcttcaattggaagcccctgttagccttgacagttgggactctgaggaaacggctatc
ctttcctttaacatttcccacttgaacagcagagaccgcattctggagctcacaccagct
ctcactactctaaaacaccacaatcgatacctaatagactctgggaatcaagatggctta
tttaggatcaaccaaaaggatggcatcagttacctgcatctaaccaagaagaagccagtg
tctggtgtttataacattcagattagcagtttccctctttataaggagaaagagcttatc
cagcttgaagacagacatgacagagactacctcactggtgaactaggtgacattcttaaa
atgaaaattagaatcttacttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system