KEGG   Nanorana parkeri (Xizang Plateau frog): 108792195
Entry
108792195         CDS       T04897                                 
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
  KO
K06825  fibrillin 1
Organism
npr  Nanorana parkeri (Xizang Plateau frog)
Pathway
npr04350  TGF-beta signaling pathway
npr04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:npr00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04350 TGF-beta signaling pathway
    108792195 (FBN1)
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    108792195 (FBN1)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:npr00536]
    108792195 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:npr00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   108792195 (FBN1)
SSDB
Motif
Pfam: EGF_CA cEGF FXa_inhibition EGF hEGF TB EGF_3 Plasmod_Pvs28 Fibrillin_U_N FBN_EGF_st1
Other DBs
NCBI-GeneID: 108792195
NCBI-ProteinID: XP_018418410
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 2888 aa
MRRLGCVLGLAVGFTVFLSFGASQGADKDATTAADTVKEARANRAKRRGGGAGAGHDVLK
GPNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHTCGDGFCSRPNMCTCPSGQTAPSCGSK
SVQQCSVRCMNGGTCNDEHCLCQKGYAGTHCGQPVCEHGCSNGGRCVAPNRCACTYGFTG
PQCERDYRTGPCFSLVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRG
FIPNIRTGACQDVDECQAIPGMCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEITQKCEDIDECAT
IPGICESGECANTVSSYFCKCPTGFFTSADGSRCIDIRPGHCYSSLSNGRCTNQLPQLLP
KMQCCCDTGRCWAPAANIAPEVCPFRGTDDYRKLCTMSWVRPGQIPGMEPGPVIPPGGHF
PDYPPAIGPQIPPGYPPVFPPPLIPGYPVPSRVPPVVLPVNLTHQQPVTDYCVLFRNLCL
HGRCVPTPGSYRCECNKGFQLDGRGECIDVEECERNPCLHADCVNTQGSYICQCYSGFQS
TSTRTECRDIDECLANGRICNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVAPDGKNCQDMDECSVRNM
CLNGMCINEDGSFKCICKPGFQLAPNGRFCTDIDECETPGICMNGHCVNTDGSFRCECFP
GLAVGLDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCVRPLQGAVTKSECCCASTEFAFGEPCKPCPA
KTSDEYQALCSSGPGITSTGTDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCVCNSGYEVDTTGK
SCNDIDECALNRLLCDNGQCRNTPGSFTCTCPKGYVYKPDLKTCEDIDECESNPCINGAC
KNIPGSFVCECPPGSTLDTTKTICIETVKGTCWKDIVNGRCEVNINGATLRSQCCSTLGA
AWGSPCLPCEPDPVCAKGFSRSRGTACEDVDECKVFPGLCINARCVNTLGSFTCECPNGM
TLDASGRTCLDIRLETCYLKHEDEECSAPIAGRHRMDACCCSVGAAWGFDCEQCPPKGTT
EFETICPRGPGFASKEITPGKVFSKDINECKMIPSLCKYGKCRNTIGSFKCRCDNGFALD
AEERNCTDIDECRISPDLCGQGNCINTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECQRNPL
LCRGGNCLNTEGSFKCECPDGHEVTLDGTACSDINECELSTDLCRNGRCINLIGRYQCAC
NSGYKPSDDXXXXIDVDECEIFNGGCDTNCTNSQGSYECSCVEGYALMPDDRSCTDIDEC
ETNPNICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGYMASIDMKACLDVDECELHDNICLSGSCENTKGS
FICHCNPGYSGKKGQTGCADINECEIGAHNCDRHATCTNTPGAFKCSCNPGWVGNGIKCA
DLDECSNGTHLCSSNADCKNTMGSYRCLCKEGYSGDGFECTDIDECTENLNLCGNGQCLN
TPGGYRCDCDMGFLPSIDGKTCEDIDECALPNICVYGTCKNLPGLFRCDCDIGYELDRSG
GNCTDVDECTDPTACISGTCSNTPGSYSCECPPDFQLNPTRVGCVDTRSGSCYLEVKPRG
DNGDLSCSTEIGVGISKASCCCSLGKAWGTPCEHCPPVNSSDYKVLCPGGEGFRPNPITV
ILEDIDECLELPGLCQGGKCINTFGSFQCRCPPGFFLNEETRVCDDVNECDQPGICGPGT
CYNTVGNYTCICPPDYMPVNGGNNCMDMRRSLCFRNYNADNQTCDGELLYNMTKKMCCCS
YNIGRAWNRPCEECPLPSTDEFAGLCGSARPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVC
INMVGSFRCECPMGFFYNDKLLICEDIDECQNGPVCQRNADCVNTQGSFRCDCKPGYKFT
PTGQCVDRNECLEIPNVCSHGECHDKVGGYYCVCHNGFKTNDDQTMCLDINECERDPCGN
GTCRNTIGSYNCRCHDGFILSHNNDCIDIDECTTLNGQLCRNGQCVNIIGSFQCICNEGY
EMTSDGRTCLDINECELDPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYVLKDDTCEDIDECVEEPE
ICALGTCSNVPGSFTCLCPEGFVLSSTGRRCQDLRVGLCYTKFEAGQCLSPKTLNHTKQE
CCCAMREAGWGSPCEICPVEGDEAFREICPFGSGVVVGPNDERIDMDECTDPDKCKNGQC
INTDGSYRCECSFGYVISGDECTDIDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMM
SCEDVNECAQNPLLCAFRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQDECEDGLHDCDSKQ
MMCKNLIGTYMCICGPGFQRRPDGESCIDLNECLKPGLCENGKCLNTMGSYKCECKDGFN
ASITETECIDNRLGYCFADVLHTMCQLGSSNQNSVTKSECCCNGGRGWGITCEICPFSGT
LQFRKLCPYGKGYTTGGEGMXECHVLHGICRNGQCINERGTYKCECNLGYISDVTGTSCI
DLDECTQSPKPCNFICKNTEGSFQCSCPRGYILQEDGRSCKDLDECATKQHNCQFICVNT
MGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECSQEVNLCGAKGVCQNTPGSYMCDCQRGFSLDQSGS
SCEDVDECEGSHRCQHGCQNIVGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECMSTQMCGGAMCH
NTLGSFKCICPTGFHFEQFAGSCQDVNECSSSQAPCNFGCSNTEGGYVCGCPPGYFRIGQ
GHCVTGAGLSRGSQDMAVSGEIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSANDTVSSEDEE
QLQLEAPVSLDSWDSEETAILSFNISHLNSRDRILELTPALTTLKHHNRYLIDSGNQDGL
FRINQKDGISYLHLTKKKPVSGVYNIQISSFPLYKEKELIQLEDRHDRDYLTGELGDILK
MKIRILLH
NT seq 8667 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcggcggctggggtgtgtgttgggactggcagtgggatttacagtgttcctgtccttc
ggtgccagccaaggtgccgacaaagatgccaccaccgcagcagacacggtgaaggaagcc
agggccaacagagccaagagaaggggtggaggagctggagcagggcacgacgtgctcaaa
ggaccaaatgtttgtggatcccgttacaatgcctactgctgtcctggatggaaaacgtta
cctggagggaaccagtgtattgtccctatttgtcggcacacctgtggtgatgggttctgc
tcacggcccaatatgtgcacatgtccatcgggtcagacagctccatcatgcggttccaaa
tctgttcagcagtgtagtgtcagatgtatgaatggaggcacatgcaacgatgagcactgt
ctatgccagaaaggttatgctgggacacattgtggacagcctgtgtgtgaacatggatgt
tcaaatggtggaagatgtgtcgctccaaaccgatgtgcctgcacttatggctttacagga
ccacaatgtgaaagggattacaggaccggaccttgtttctcacttgtcagcaaccagatg
tgtcagggacagctgagtggaatagtttgcacaaagacactgtgctgtgctacagttgga
agagcatggggccacccttgcgagatgtgcccagcccagccacatccctgtcgtcgtgga
tttattccaaacattcgaacaggagcgtgtcaagatgtggatgaatgccaagcaatccct
gggatgtgtcaaggaggaaattgcattaatacagttggatcttttgagtgcaaatgccca
gctggacacaaatttaatgaaataacacaaaaatgtgaagatattgatgaatgtgccaca
atccccgggatctgtgaatctggtgaatgtgctaatacagtgagcagctacttttgcaag
tgtccaacagggttttttacatcggcagatggatcaagatgcatagatattcgtcctggc
cattgttattcatcgctatctaatggccgctgcaccaatcagctcccccaactgctacct
aagatgcagtgttgctgtgatactggaaggtgttgggctccagcagcaaatatagcaccc
gaagtgtgccccttccgtgggacagatgattaccgtaaactgtgcacaatgtcttgggtg
cgtcctggacagatccctggaatggaaccaggaccagtcattcctcctggcgggcacttt
ccagattaccctcctgcaataggtccacagatcccaccaggctatcctcctgtctttcca
cctccacttattcctggatatcctgtgccttcccgggttcctccagtggtgctgccagta
aacctcactcatcagcagcctgtgaccgattactgtgtcttattccggaatctgtgtttg
catggccgctgcgtacctactcctggaagctatcgttgtgagtgtaacaagggattccag
ctggatggtagaggagaatgcatagatgttgaagagtgtgaaagaaatccttgcctccat
gcagactgtgtaaatacacagggatcatacatctgtcagtgttattctggattccagagt
acatctactaggacagaatgcagagacattgatgagtgcttagcgaatggaaggatctgt
aacaatggcagatgtgttaacacggatggcagtttccactgtgtgtgcaatgcaggcttt
caagtggcacctgatgggaaaaattgtcaagatatggatgaatgcagtgtgaggaacatg
tgccttaatggaatgtgtattaacgaggatggaagttttaaatgcatctgtaaacctgga
ttccagcttgctccaaatggacgcttttgcacagatattgatgagtgtgagacaccaggc
atctgcatgaatggacattgtgtgaacacagatggatcttttagatgtgaatgcttccct
ggtctagcagttggacttgatggtcgtgtttgtgtagatacccacatgaggagcacttgc
tatggtggttacaagagaggtcagtgtgtcagaccactgcagggagcagtgactaaatca
gagtgttgctgtgccagcactgaatttgcttttggtgaaccatgtaaaccctgccctgcc
aagacttcagatgaatatcaagctctctgcagcagtggcccaggaataacatctacagga
actgatattaatgaatgtgctctggatcctgatatctgtcctaatggaatttgtgaaaac
cttcgtggaacctacaaatgcgtttgtaattctggatacgaggtggacactactgggaag
agttgcaatgatattgatgaatgtgcattaaacagactgttatgtgacaacggacaatgt
cggaatactccaggaagctttacctgcacttgtcctaaaggatatgtctataaacctgat
cttaaaacttgtgaagatatcgatgaatgtgagtccaacccctgcatcaatggtgcatgc
aaaaacatcccaggatcttttgtgtgtgaatgcccccctggaagtacactggatacaacc
aagacaatctgcattgaaactgtcaagggaacatgctggaaagatatagtgaatggaaga
tgtgaagtcaacatcaatggagcaaccttacgttcacagtgctgttctacattaggtgct
gcctggggaagcccttgtctaccctgtgaaccagatcctgtctgcgcaaaaggtttttca
aggtcaagaggcacagcatgtgaagatgtcgacgagtgtaaggtgtttcctggattgtgc
atcaatgctcgatgtgttaacacactgggatcctttacttgcgaatgccccaatgggatg
acgcttgatgcttctggacgcacatgccttgacatacgcttggagacttgctacctaaaa
cacgaagatgaggagtgctctgctcctattgctggacgccaccggatggatgcctgttgc
tgttctgttggggctgcctggggatttgattgtgagcagtgcccaccaaaaggaacgaca
gaattcgagaccatttgtcccagaggacctggatttgcttctaaagaaataacacctgga
aaagtcttctccaaagatattaatgaatgtaagatgatcccaagtttatgcaagtatgga
aaatgcagaaacacaattggcagctttaagtgtcgatgtgacaatggttttgccttggat
gcagaagaaaggaactgcacagatattgatgaatgcaggatatcaccagatttgtgtggg
caaggcaactgcattaacacaccaggagactttgagtgtgactgctttgaaggatacgag
agtggattcatgatgatgaagaactgcatggacattgatgaatgccagcggaatccactc
ctgtgccgtggtggcaactgccttaacacagagggaagttttaaatgtgaatgtcctgat
gggcatgaggttacacttgatggcactgcctgctcagatatcaatgagtgtgagctcagc
actgacttgtgccgaaatgggcgatgtataaacctaattggaagataccaatgtgcttgt
aattctggttataagccatcagatgatnnnnnnnnnnttatagatgttgatgagtgtgaa
attttcaatggtggatgtgacacaaattgtacaaactcccaaggaagttatgaatgcagt
tgcgttgaaggttatgctttaatgccggacgacaggagctgtacagatattgatgagtgt
gaaacaaaccccaatatttgtgatggaggccagtgtacaaacatacctggagagtaccgg
tgcctctgctacgatggttacatggcatccattgatatgaaggcttgtctagatgttgat
gagtgtgaactccatgataacatctgtctgagtggaagttgtgagaacacaaaaggctcc
ttcatctgccactgcaatcctggctattctggaaagaaaggacaaactggatgcgcagat
attaatgaatgcgagattggtgcccacaactgtgacagacatgccacatgtacaaacacg
cctggagctttcaaatgcagctgtaatcctggatgggtaggaaatggcatcaagtgtgca
gacctcgatgaatgttcaaatggaacacatttgtgtagttcaaatgcagactgtaaaaac
accatgggatcatatagatgtctatgcaaagaaggatactctggagatggctttgaatgt
acagatattgatgagtgcacagagaatctgaatctgtgcggaaatggtcaatgcctcaat
acccctggtggataccgctgtgactgtgatatgggtttcttaccgagcattgatggaaaa
acatgtgaagatattgatgaatgtgcattgcccaacatctgtgtctatggcacctgcaag
aatctccctggtctctttagatgtgattgtgacataggatatgagctggatagaagtgga
ggcaactgtacagatgtggatgaatgtaccgatccaacagcctgtattagtggtacatgt
tcgaatactcctggtagctacagttgcgagtgtccaccagacttccaactaaatcccact
cgagttggatgtgttgacactcggtctggcagctgctacctagaggtaaagccgcgggga
gataatggagacctgtcctgcagtactgagattggtgttggtatatctaaggcttcatgt
tgttgctcacttgggaaggcctgggggaccccctgtgaacactgccccccagtgaattct
agtgattataaagttctgtgcccaggaggagaaggattcagaccaaatcctattacagtt
attttagaagatatcgatgaatgtcttgagttgccaggtctctgtcaaggtggaaagtgt
ataaacacatttggaagtttccagtgccgctgtccaccaggatttttcctcaatgaagaa
actcgtgtttgtgatgatgtcaatgaatgtgaccagcctggaatttgtggccccggaaca
tgttataacactgtcggaaattatacctgtatatgtccacctgattatatgccagtaaat
ggaggaaacaactgtatggacatgaggaggagcttgtgcttcagaaattataatgctgac
aatcagacttgtgatggagaattactttacaacatgacaaaaaaaatgtgttgctgttcc
tacaatattggacgcgcatggaatcgaccctgtgaggaatgtcctttgccaagcactgat
gagtttgctggactttgtggaagtgctcgacctggctttgtcattgatatttacactgga
ctaccagttgatatcgatgaatgcagagaaattcctggtgtttgtgaaaatggcgtttgt
ataaacatggtgggaagcttccgctgtgaatgtccaatgggatttttctacaatgacaag
ttactcatctgtgaagatattgatgaatgccagaatggcccagtgtgtcagaggaatgca
gactgtgttaatacacaagggagcttccgctgtgactgcaaacctggctacaagttcaca
cccacgggacaatgcgtcgatcgcaatgagtgtctagaaatccccaatgtctgcagtcat
ggagagtgccatgataaggttgggggttattactgcgtatgccacaatggatttaagacc
aatgatgatcagactatgtgtctagatattaatgaatgtgaaagagatccttgtggcaat
gggacatgtaggaatacaattggatcttacaactgtcgctgtcatgatggatttatcctc
tcacacaacaatgattgtatagatattgatgaatgtaccacactcaacggtcagctatgt
agaaatggacagtgtgttaatattattggatccttccaatgtatctgtaatgaaggatat
gaaatgacatccgatggaagaacatgtctagatatcaatgagtgcgaacttgatccaggg
aagtgcgctcctggaacttgtcaaaatctggacggctcctaccgctgcatctgtcctcct
ggatatgtgctgaaagatgatacatgtgaagatattgatgaatgtgttgaagagccagag
atttgtgctctggggacttgtagcaatgttcctggcagcttcacctgtctgtgtcctgag
ggttttgtactatcatcaacaggaaggagatgccaagatttacgagttggtttatgctac
accaaatttgaagcaggacaatgcctttctccaaagactctaaaccacaccaaacaagaa
tgttgctgtgcaatgagagaggcgggatggggatctccatgtgaaatatgcccagtggaa
ggagatgaggctttccgagagatctgtccgtttggaagtggtgtggtggttggaccaaat
gatgagcgaattgacatggacgaatgtaccgatcccgacaaatgcaagaatggccagtgt
attaacacagacggatcgtatcgatgcgaatgctcctttggatatgtgatttcaggagac
gaatgtacagatattgatgagtgctctgttggaaacccatgcggtaatggcacttgtaag
aatgtgattggtggatttgagtgcacatgtgaagaagggtttgagcctggaccaatgatg
tcctgtgaagatgttaatgaatgcgctcagaaccctctgttgtgtgctttccgatgtgtt
aacacctatggctcatatgaatgcaagtgcccagctggttatgtgctccgtgaagacaag
agaatgtgcaaagatcaggatgagtgtgaagatggtcttcatgactgtgattctaaacaa
atgatgtgcaagaatctcattggaacatatatgtgtatatgtggaccagggttccagcgt
agaccggatggtgaaagctgtatagatctgaatgaatgccttaaacctggtctatgtgaa
aatggaaaatgtctgaacaccatgggcagctacaagtgtgagtgcaaagacggatttaat
gccagcattaccgagacagaatgtattgacaatcgacttggatattgctttgctgatgta
ttacatacaatgtgccagcttggatcttcaaaccagaattccgttaccaagtccgagtgt
tgctgtaatggtggccggggctggggtattacctgtgagatctgccctttctctggcaca
cttcagtttagaaagctttgtccttatggcaaaggatatacaactggaggggaaggtatg
nnngaatgtcatgttctgcatggaatctgtcgcaatggacaatgtatcaacgagagggga
acatacaaatgtgaatgtaatctaggttatatttctgatgtgactggtacttcttgtata
gatcttgatgaatgcactcagtccccaaaaccttgcaattttatttgcaaaaatactgaa
ggaagtttccagtgttcttgcccacgtggttacattttgcaggaagatggaagaagctgc
aaagatcttgatgaatgtgccaccaaacaacataattgtcagtttatttgtgtgaacaca
atgggaggatttacatgtaaatgtcctcctggatttacacagcatcatactgcctgcatt
gataacaacgagtgttctcaggaagtgaacctgtgtggtgctaaaggcgtttgccagaat
actccaggcagctatatgtgtgattgtcagcgtggcttttcccttgatcagagtggatca
tcatgtgaagatgtggatgagtgtgaaggaagtcatcgctgtcagcatggatgccagaac
attgtaggcgggtatagatgtagctgcccacaaggctatctccaacattatcagtggaac
caatgtgtggatgagaatgaatgcatgagcacacaaatgtgtgggggagctatgtgccat
aacacattgggaagcttcaagtgcatatgcccaacaggatttcattttgaacagtttgct
ggttcttgtcaagatgtcaatgagtgcagctcttcccaagcaccatgtaactttggttgt
tcaaacactgaaggaggatatgtctgcggctgtccacctggatacttcagaataggacaa
ggacactgtgtaacaggagccggactaagcagaggttcccaggatatggcagtgagtgga
gaaatagatgataactctctgtctcctgaagcttgctatgactgcaagatcaatggctat
cccaagagaggaaggaagcggcggagtgccaatgataccgtgtccagtgaggatgaggaa
cagcttcaattggaagcccctgttagccttgacagttgggactctgaggaaacggctatc
ctttcctttaacatttcccacttgaacagcagagaccgcattctggagctcacaccagct
ctcactactctaaaacaccacaatcgatacctaatagactctgggaatcaagatggctta
tttaggatcaaccaaaaggatggcatcagttacctgcatctaaccaagaagaagccagtg
tctggtgtttataacattcagattagcagtttccctctttataaggagaaagagcttatc
cagcttgaagacagacatgacagagactacctcactggtgaactaggtgacattcttaaa
atgaaaattagaatcttacttcattaa

DBGET integrated database retrieval system