Nicotiana tabacum (common tobacco): 107816212
Help
Entry
107816212 CDS
T04643
Name
(RefSeq) RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3-like
KO
K15216
RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
Organism
nta
Nicotiana tabacum (common tobacco)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nta00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
nta03021
]
107816212
Transcription machinery [BR:
nta03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
Other transcription-related factors
Transcription initiation factors
107816212
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRN3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107816212
NCBI-ProteinID:
XP_016497395
UniProt:
A0A1S4C8D3
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
619 aa
AA seq
DB search
MGMVLPAEQAGYAEMENVEITDTELFYHVRGALKSALQGDPDKYNQLVGVMHCKERLVPE
EVALLVTCLKALSGSVSCLDIVHHQSLLSSILGMSMWNYGTDVMDALMELLISLATSGGQ
YVDLCLEMLVNNFVPPPSFISLLNQPRGILRKGQVIDRVHSTLIDIAELVPLSPLRLEKI
VKEKMQKMPINYTKEPFIMAYVENMLKLEGGAIGGLVGGTMLVAIMDWLIDLDVDIAWDE
ILNEDFTKCIFDMELEDLDGPVDDGQQDGDQLRISWMERLGNASAQKLDSLMVLTFEHLN
FCQESGRLSQVFETLLQSFQHTVLTAYKSKFAQFVMFYACTLDPENCGRRFADTLFDIFK
SSIYPQWRMSAVAYLASYLARTKFLSISSVAEYVESLVEWCSTYCSNQSGGINPKAHKEF
YAGCQAMMYILCFRMRSMLAYPRIRSRLSKHIEDILRHPLSPLMVCLPSVVKEFLRLAKV
TNLDVPDNFVSSGLLESDLSISFGGRERLDTFFPFDPCLLLRSDRFIRPNFVYWSMVRSS
YDNDDDEGTSDEDDVEICTAGKGMNIADGVARSYDQDLDEFDLEMSKMSITPKVAQWFGG
ELRPDMQMPSRIRPCPESL
NT seq
1860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggatggtattaccagctgagcaggcaggctatgctgagatggagaatgttgagatt
acggatacagagttgttctatcatgttagaggtgcccttaaatctgctctccagggtgat
ccggacaaatataaccagcttgttggggttatgcactgtaaggaacgccttgtacccgag
gaggttgccctactggtgacatgtttaaaagctttgtcaggatcagtttcttgtctagac
attgttcatcatcaaagtctcctttcatctattttaggaatgagcatgtggaactatggg
actgatgtaatggatgctttgatggaattacttatatccttggctacatccggtgggcag
tatgtcgatttgtgcttggaaatgcttgtgaacaattttgtgccgcctccttcattcata
tcgttgttgaatcagccacgtggcatactacgaaagggccaagtcattgatcgtgtccat
tcaactttaatagacattgcagagttagttcctctctcccccttgagacttgagaagata
gtaaaggagaagatgcagaagatgccaatcaattacacaaaggaaccattcatcatggca
tatgtggagaacatgttaaaactggagggtggagcaattggtggtcttgttgggggaact
atgcttgtggcaattatggattggctgatagatttggatgtagacattgcatgggatgaa
atcttaaatgaggatttcaccaaatgcatctttgatatggagctggaagatctggatggt
ccagtagatgacggtcagcaagatggtgaccagctccgaatttcttggatggaacggctt
ggaaatgccagtgctcaaaaattggatagcttgatggtgcttacctttgaacaccttaac
ttttgccaagagagtggacgcctgagtcaggtttttgagactcttctccagtcttttcag
catactgttttgacagcatacaagtctaaatttgcccagtttgtcatgttttatgcctgt
accctggatcctgaaaactgcggcaggagatttgctgatacactatttgatatatttaag
agcagtatctatccacaatggagaatgagtgctgttgcctatcttgctagttatttggct
cgtacaaagtttttgtctatctcatctgttgctgaatatgtagaaagtttggttgaatgg
tgttccacttattgctccaaccagagtggtggcatcaatccaaaagctcacaaggaattc
tatgctgggtgccaggccatgatgtacatactttgttttcgcatgagatcaatgcttgct
tatcctcgtatcaggtcacggctctcaaagcacatagaggatatcctgaggcatccattg
agcccattaatggtatgcttgccatcagtagtgaaagaatttcttcggttggcaaaagta
actaatcttgatgtgcctgataactttgtatcaagtggtctgctcgagtctgatctttca
atctcttttggtggtagagagaggcttgacacatttttcccatttgatccttgtctgcta
ttgagatctgacagattcatccggccaaattttgtgtactggtcaatggttcggagctca
tatgacaatgatgatgatgagggtactagtgatgaagacgatgttgaaatttgtactgca
gggaaggggatgaatatagctgatggagtcgcccgaagttatgatcaggatctcgatgaa
tttgatcttgaaatgagcaaaatgtccataacacctaaagttgctcaatggtttggaggt
gaattacgacctgatatgcagatgccttcaagaatcagaccatgtccggagtccttgtag
DBGET
integrated database retrieval system
