Nicotiana tabacum (common tobacco): 107825586
Help
Entry
107825586 CDS
T04643
Name
(RefSeq) phytochrome E-like
KO
K12123
phytochrome E
Organism
nta
Nicotiana tabacum (common tobacco)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nta00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99995 Signaling proteins
107825586
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HisKA
PAS_4
HATPase_c
PAS_9
PAS_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107825586
NCBI-ProteinID:
XP_016507943
UniProt:
A0A1S4D3M8
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1145 aa
AA seq
DB search
MEFQSSSKAKRKARPTSHNLQNNKNSNKDSTFSSSAASNMNNNNNNNNTSKATMAQYNAD
AKLMAEFEQSGVSGKSFNYSRSVLYAPQDNANEEEITSYLSRIQRGGLVQPFGCMLAIEE
HTFKIIGYSENCFDMLGFKIAESSKLITLIGVDARTLFTPSSGASLAKAMTSREISLLNP
IWVHSRSTHKPFYAILHRIDVGIVIDLEPANSSDPALLLAGAVQSQKLAVRSISRLQSLP
GGDIGVLCDTVVEDVQKLTGYDRVMVYKFHDDNHGEVLSEIRRSELEPYLGLHYPATDIP
QAARFLFKQNRIRMICDCNAQPVKIVQSEELKRPLCLVNSTLRSPHGCHAQYMANMGSIS
SLVMSVVINSSDLRKLWGLVVCHHSTPRYVPFPLRYACEFFMQAFGLQLYMELQLASQLA
EKKTLQMQTLLCDMLLRDVPFGIVTQSPSIMDLVKCDGAALYYGGKCWLLGVTPTEAQVK
DIAEWLLGTHKDSTGLSTDSLADAGYPGATLLGDEVCGMATARITSKDFLFWFRSHTAKE
VKWXGAKHHPDDRDDGGKMHPRSSFNAFLEVVKSRSMPWDVPEINAIHSLQIIMRESIQE
IENSSLKTMTSSQQNDADGPSMDELSSVAMEMVRLIETATAPIFGVDLSGLINGWNGKIA
DLTGLQASEAIGKSLINDIAHEDSHETVEKVLHRALLGEEDKNVEIKLRRFGKDPPKSVL
YLVTNTCTSRDHKNDVVGVCFVAQDVTPEKAVMDKFIQLQGDYEAIVQSLNPLIPPIFAS
DGNACCSEWNAAMERLTGWTRYEILGRTLPGEVFGGLCRLRGQDAVTKFMILFYQAISGH
DTKKLPFGFFNRTGEFVEVFLTANKRTDEHGNIIGCFCFLQPTLVDPEASDERQDNKDSL
SKIKEFSYIRQQMKNPLNGIQFTHKLLEATCVSDNQKQLLETSEACEKQILSVIDNMDFG
RIEDGKVELNMEEFVLGNVVDAIVSQVMILLKEKNLQLLHDIPDQIKTLPLYGDQIKLQL
ILSDFLLSIVHHAPSPDGWVEIKVLPGLKLIQDGNEFIHLQFRMTHPGQGLPAALIEDMS
GGRNRGTTQEGIALNFSQKLVNMMNGHVRYVREENKCYFLIDLELKTGKSTQHGPDSDGT
EKMEI
NT seq
3438 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagtttcagagcagcagcaaagccaaaagaaaagcaagacccactagccataatctc
caaaacaacaagaattctaacaaagattcaaccttttcttcctctgctgctagtaacatg
aacaacaacaacaacaacaacaatactagcaaggcaactatggctcagtacaatgctgat
gctaagctcatggctgagtttgaacagtctggtgtctctggtaagtcctttaattattca
agatcagtactttatgcacctcaggataatgccaatgaagaagaaatcacttcttatctt
tcaagaattcaaaggggtgggcttgttcaaccatttggttgtatgcttgctattgaggaa
catactttcaagattataggttacagtgagaattgctttgatatgttaggttttaagatt
gctgagtcatcaaagttgattactttgattggtgttgatgctagaacccttttcacccct
tcttctggggcttcattggctaaagccatgacttctagggaaatctctttgttgaaccct
atatgggttcattctaggagtacccataagcctttttatgctatacttcacaggattgat
gtggggattgtgattgatttagagcctgctaattctagtgaccctgcattgctgcttgct
ggggcagtgcagtcacaaaaactggctgtccggtcgatatctaggttgcagtcactacct
ggtggagatataggggttctgtgtgatacagtggtggaagatgtgcagaagctgactgga
tatgatagggtgatggtttataagtttcatgatgataatcatggtgaagttctgtctgag
attaggagatcagaattggaaccttatttgggcttgcattatcctgcaacagatatcccc
caagctgcccggttcttgttcaagcagaacagaattaggatgatatgtgattgcaatgca
cagcctgttaagattgttcagagtgaagaactaaagcggcctctctgcttggtaaattcg
actcttagatcacctcatggctgccatgcacagtatatggccaacatgggatctatttca
tcgttggtgatgtcagtagttatcaatagcagtgatttgaggaagctttggggtttggtt
gtttgtcatcacagtactccccgctatgtgcctttcccacttcggtatgcatgtgaattc
ttcatgcaggcatttggcctgcagctttatatggagctccaattagcatcacagttggcg
gagaagaaaaccctccaaatgcagaccttattatgtgacatgcttcttcgagatgttcca
tttggcattgtaacacaatcccctagtattatggatcttgtcaagtgcgatggagctgca
ctttattacggtggaaaatgttggttgcttggggtgacaccaactgaagcacaagttaaa
gatattgcagagtggttgctaggcactcataaggactcgacaggtttaagtacggacagt
cttgcagatgctggttatcctggtgcaactttactgggagatgaagtttgtggcatggct
actgcgagaattacttccaaggatttcctattctggttcaggtctcacacggcaaaggaa
gtcaagtggngaggtgctaagcatcatccagatgatagagatgatggaggaaaaatgcac
ccgcgatcttcatttaatgcctttcttgaagtggttaaaagtagaagtatgccttgggat
gttccggagattaatgccattcattctctacaaatcataatgagagaatcaattcaagaa
atcgagaacagttctctgaaaactatgacttcttctcaacagaatgatgctgatggtcca
agcatggatgaacttagttctgtggcaatggaaatggttaggttgattgagacggccact
gctccaatttttggagttgatctatctggcttaataaatggatggaatgggaagattgct
gacttgacagggttgcaagctagtgaagctattggaaagtctctcattaatgatattgct
catgaagattcacatgaaactgttgaaaaagttctacatagagctctgttaggtgaggag
gacaaaaatgtggaaataaagttgcgaaggtttgggaaagatccaccaaaatcagtttta
taccttgtgactaatacctgcacaagcagggaccacaaaaatgatgttgttggcgtgtgc
tttgtggctcaagatgtcactcctgaaaaagctgtcatggataaatttattcagttgcaa
ggagattatgaggctattgtacaaagtcttaatccactgattccaccaatatttgcttct
gatggaaatgcttgctgttcggagtggaatgcagcgatggaaaggttgaccggttggaca
agatatgagatcctggggaggacacttcctggtgaagtttttggtggtctttgtcgtctt
aggggacaagatgccgttaccaaatttatgattcttttctaccaagcaattagtggccat
gacaccaaaaagcttccatttggcttttttaataggacaggggagtttgtggaagtgttc
ctaacagcaaacaagagaactgatgagcatgggaatataattgggtgtttctgcttcttg
cagcctacactggttgacccagaggcatcggatgagagacaagacaataaagactccctt
tcaaaaattaaagaattttcttatatccgacagcagatgaaaaatccattgaacgggatc
cagtttacccataaactccttgaagcaacctgtgtttcagataatcagaagcagcttctg
gagacaagtgaagcctgtgagaaacagatactatctgttattgacaatatggattttgga
agaatagaggatggcaaagtggagctaaacatggaggaattcgttctaggaaatgttgtg
gatgctattgtgagtcaagtaatgattttgctcaaggaaaaaaatttacaactgctgcat
gatattcctgaccagatcaagactcttcctctatatggtgatcaaattaagcttcagctt
attctctcagatttcttgcttagtatagtgcatcatgcaccttccccggatggttgggtg
gaaatcaaggtgttacctggtctgaaactcatacaagatggaaatgaatttatccatctc
caattcagaatgactcaccctggccaaggactaccggctgctctaatcgaagacatgtct
ggaggaagaaatagagggacaacacaagaaggaatcgcgctaaatttttcccagaaactt
gtcaatatgatgaatgggcatgtccgctatgtcagagaggaaaacaaatgttatttccta
atagacctggaactcaaaacagggaaatctacacaacatggtccagattcggatggaact
gaaaagatggaaatttag
DBGET
integrated database retrieval system