KEGG   Zophobihabitans entericus: IPMB12_01980
Entry
IPMB12_01980      CDS       T06493                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
orb  Zophobihabitans entericus
Pathway
orb01501  beta-Lactam resistance
orb01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:orb00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    IPMB12_01980
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    IPMB12_01980
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:orb02000]
    IPMB12_01980
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:orb01504]
    IPMB12_01980
Transporters [BR:orb02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   IPMB12_01980
Antimicrobial resistance genes [BR:orb01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    IPMB12_01980
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran SecD_SecF_C BT4734-like_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: QIQ20555
UniProt: A0A6G9I8L6
LinkDB
Position
429135..432161
AA seq 1008 aa
MNFSSWSIRNPIPVIVLFLVLTVLGIHSFNKMNIQNFPDIEFPIVNVDVTWHGASPEQLE
TEVVRKIEDALANINYLRHTYTTVVDGSVKIIVEFELEKSVNEAIEDVRNAVDSIYNDLP
AAVQKPTISKLNISNQPIATYVVSSTSLDKVDLSWFIDNKINKALMQVSGVGQVSRVGGV
DREVRVELNTTQMNGLGITASEVSQAITQMQQDAPGGVGRIAGQEQTIRILGNIATVDEL
RELKIPTSSMASIRLADIATVLDTTAEQKSRALLDGNEVIMFSINRSKDTSEVTVLHDAR
QMIEMLQEQYPTMTIKEINDSVKYVENQYKDSIWLLIEGAILAVLVVWWFLRNNRATIVA
AVALPLSIIPTFWVMDLIGFNINTISLISFSLVIGVLVDDAIVEVENIIRHMQMGKTPLQ
AAIDGTNEIGLAVIATTMTLIAVFLPTAFMEGIIGKFFVQYGWTTSIAVFFSLLVARLLT
PMMCAYLLKDKMILSTAHEHKDSRWMRSYLWLVRKCLTYRWTTITTAGGLFIASILLLGA
LPAGFMPSSDLSATIINVQLPPGSTLSQTQETAEKIRTTILADEPSIRDVYSVIGSDEVN
HADIHVLLVEPKMRQESQQDIEKRLRDKVQAIAGARITVNSVDSGEAKFEFSLVGENTQL
LEQTANQLEKEIRTISGLGAVTSSASLLRPQVIIRPDYARASIAGVTTENLANIIRIATN
ADYSQTLPKLSLPERLVPIAIRMMDFDREHLDTIADLRVSGHNGLVPLASVATVELSMGA
ISITRLDRKRNIDFSIELNDIPLGDLVNQIQQLSTMQHLPDGVEYQDSGNAQMMLELFTG
FATAMIIGILAVYLILILLFHDFLQPITILSALPLATIGAFIALFLCQFAISMPALIGII
MLMGIVTKNSILLVDYILIAYKEGAGRLEAIIDACHKRSRPIVMTTIAMVAGMLPTALGF
SSDPSFSAPMAVVVVGGLLTSTLLSLIVIPVVYSVIDDMKIKVKSIVY
NT seq 3027 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatttttcctcctggtctattcgtaatccgatccctgtcattgttctatttttggtc
ctcactgtgctggggattcattcatttaacaaaatgaatattcaaaattttcctgatatt
gaatttcctattgttaatgtcgatgtaacctggcacggagcatctcctgaacaattagaa
acagaagtggtacgaaaaattgaagatgctctggcaaatattaactatctacggcacacc
tataccactgtggttgatggttcagtaaaaattattgttgagtttgagctagaaaagtca
gtcaatgaagcgattgaagatgtgcgtaatgctgtcgatagtatttacaatgatctgccg
gccgctgtgcaaaaaccaacgatttctaaattgaatatctctaatcagcctattgccact
tatgtagtgagttcaacgagtctggataaggtcgatttatcctggtttattgataataaa
atcaataaagcattaatgcaggtatctggtgttggtcaggtttctcgtgttggtggtgtt
gatcgtgaagtgagagttgaattaaatacgactcaaatgaatgggttgggtataacggca
agtgaggtctctcaggctatcactcaaatgcaacaagatgcaccaggtggtgtgggacga
attgccggacaagaacaaacgattcgtattttgggtaatatcgcgacagttgatgagcta
agagaactaaaaattccgacctcgagtatggcttcgattcgattagcagatattgccact
gttttagatacgacagctgagcaaaaaagccgggcactgttggatggcaatgaagtcata
atgtttagcattaatcgcagtaaagataccagtgaagttaccgtattacatgatgctcgt
cagatgatcgagatgctacaagagcaatacccgacgatgaccattaaagaaattaatgat
tcagtaaaatatgtcgaaaaccagtacaaggattccatttggttactgatagaaggcgct
attttagccgttttagttgtctggtggtttttgcgtaacaatcgcgccactattgtggcg
gcggtcgctttacctttatctattattccgacattttgggtgatggatttgatcgggttt
aatattaacacgatttctctcatctcgttttcactggttattggagtattagtggatgat
gcgattgttgaagtagaaaatattatccgtcatatgcaaatggggaaaactccgctgcag
gctgcaatagatggcactaatgaaattggtttagctgtaattgcaacgactatgacgtta
attgcggtgttcttacccactgcatttatggaaggtattattggaaaattctttgtgcaa
tatggttggaccacttctattgcagtgttcttttctcttcttgtggcaaggcttctgaca
ccaatgatgtgtgcttatctgctaaaagataagatgatattaagtacagcgcacgaacac
aaagatagccgttggatgcgcagttatttatggttagtcagaaagtgtctgacttatcgt
tggacaacgattacgactgcgggcggattatttattgcctccatattattactcggtgca
ttacctgccgggtttatgcccagcagcgatttatccgcgacgattattaatgttcaatta
ccgccgggctcgactttatcccaaactcaggaaacagcagaaaagatccgtactacgata
ttggccgatgagcccagtattagagatgtgtatagtgttattggtagtgatgaggtgaat
catgcggatatacacgttttattggtcgagcctaagatgcgacaagagagccagcaagat
attgaaaaacggttacgtgataaagtacaagctattgcgggtgcaaggattacggttaat
agtgtagatagtggtgaagctaagtttgaattctcactcgtgggtgagaatacgcagttg
ctcgaacaaacagctaatcagctggaaaaagaaatacgtactatttctggtcttggtgcc
gtgacatccagtgcgagtttactgcgaccacaagtgattattcgtcccgattatgccaga
gcatctattgcaggtgtcacgactgaaaatttggcgaacatcatccgcattgcaaccaat
gcagattatagccagacgttacccaaactcagtttaccagaaaggctggtgcctattgca
attagaatgatggattttgatcgtgaacatcttgataccattgctgatttgcgtgtatct
ggtcataacgggctggtgccacttgccagtgttgcaactgttgagttatcaatgggagcg
atatcgatcactcggttagatagaaaacgtaatattgatttttcaattgagcttaatgat
attccactaggtgatttggtgaatcaaatacaacaattatccaccatgcagcatctgcca
gatggcgtagaatatcaagattcgggtaatgctcaaatgatgttagagctttttactggg
tttgctaccgcaatgattattggaattttagcggtgtatctcatcctgattttacttttt
catgactttttacaacctatcaccattctgtcggctttacctttggcaacaattggggct
tttattgcgctattcctttgtcaatttgctatttcaatgccggcattgattggcatcatt
atgctaatggggatcgtaaccaaaaactctattttattagtggattatattttaatcgct
tataaagagggtgcggggcgtttagaggcaattattgatgcctgccataaacgttcacga
ccaatcgttatgacgactattgctatggttgctggtatgttaccgacagctcttggattt
agttcagatcctagtttcagtgcgccaatggctgtcgttgtcgtgggtggcttgctgaca
tctactttgcttagtttgattgttattccggtggtttattctgtcattgatgatatgaag
ataaaggtaaaatcaattgtttattaa

DBGET integrated database retrieval system