Orbus wheelerorum: RHO14_09485
Help
Entry
RHO14_09485 CDS
T10511
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
owh Orbus wheelerorum
Pathway
owh01501
beta-Lactam resistance
owh01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
Transporters [BR:
owh02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RHO14_09485
Antimicrobial resistance genes [BR:
owh01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
RHO14_09485
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD70585
LinkDB
All DBs
Position
2127225..2130437
Genome browser
AA seq
1070 aa
AA seq
DB search
MAKFFIDRPVFAWVIAIMMMLGGLLGIKLLAVEQYPDIAPPAVTVTASYPGADAETINNT
VTQLIEQNLTGIDNLIYMQSTSSSQGIVQTTLTFAPGTDPDFAQVQVLNKVESVKARLPE
SVQKNGVSVAKNNTNFLKVIGFYSTNPDKTQTDIADFVYSTVQDPIRRVQGVGDTTLFGS
EYAMRIWLDPNKMTYFKLSTDEVSAAIQAQNAQVTAGQLGSLPATKGQELNATITAQSRL
KTVDQFKNILVRVNTDGSKILLSEIADIELGSADYNFQSRYDGLPSAGLAIYLATGANQL
ETSNAVDAKLEELSSIFPEDIHYKYPYDTTKFVELSIENVVDTLIEAIILVVIVMFVFLQ
NFRSTLIPTITVPVVLLGTFAVLYILGFTINTLSMFALVLAIGLLVDDAIVVIENVERIM
EDEGLSPYDATVKSMEQITSALVGIAVVLSAVFVPMAFYGGAAGGIYKQFSITIVTSMAL
SVLMAIVLTPALCVQILKAPSKFKNKKATFTQRIAKLPPFCWFSWLLAKFFAGFDAVFSR
SLHLYEKGVIKVIKYPLFSFVTYGLVILALLFGFNKLPTAFLPDEDQGVIIMMTELPPGA
TLSETQAVLDKAEVYFKTQHAKSVEEVFTVAGFSMMGRGQNMGLGFIKLKDWSLRKDKDQ
SVDYLVSNANQFLATITQARSFALNIPAVPALGMANGFSYMLKDSGAAGHDALMAAFYQM
LGAAAQNPNLAQIRPAGMLDVPQYKINVDFEKAQALGTSISSINTVLSTSLGSSYIDDFI
YNNRVKKVYVQGAAPYRMLPNDFSYWHVQNSNGEMVPFDSFATTSKTYGSPSLVRYNGSA
AMGISGSGAPGQSSGQAMAEMAKLSKNLPKGFTYEWTGVSYQEQQTGSQTTTLYMISIIV
VFLSLAALYESWTVPISILFIIPIGIVGTVYATMFRGLSNDVYFIVGLLTTMGLAAKNAI
LIVEFAKDALEKEGKSLIDATLEACRLRLRPILMTSFAFILGVLPLAINSGAGSASQNAV
GTGVIGGMLTATFLAIFYVPLFFVFVTKLFTKHKNKVVLPCSPKPKKEND
NT seq
3213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaagttttttatagatcgcccagtctttgcttgggtaattgcaataatgatgatg
ctaggcggtttgcttggtattaaactacttgcagttgaacaatatcctgatatcgcgcca
cccgcggtaacagtaaccgcatcataccctggtgctgatgcggaaacgattaataatacc
gtaactcagttaattgagcagaatttaacgggtattgataatttaatttatatgcaatct
actagtagttcacaagggattgtacaaacaaccttaacatttgcaccaggtaccgaccca
gactttgcgcaagtacaggtattaaataaagtcgagagtgtaaaagcacgattacctgaa
agtgtgcaaaaaaatggggttagtgttgcgaaaaacaataccaacttcttaaaagttatt
ggtttttactcaacaaaccctgataaaacccaaacggacattgccgactttgtttattca
acagtgcaagatccgattcgacgtgttcaaggtgtcggtgatacaactttatttggctct
gaatacgctatgcgtatttggcttgatccaaataaaatgacttacttcaaactttcaact
gatgaagttagtgcggcaattcaagcacaaaatgcgcaagtgaccgctgggcagttaggt
tcactaccagcaactaaagggcaagaacttaatgcaaccatcacagctcaatcgcgatta
aaaacggttgatcagtttaaaaatattttggtgcgagtcaatactgatggttcaaaaata
ttattaagtgaaattgccgatattgaattaggatctgctgattataacttccaatctcgc
tacgatggactcccttctgctggtttagctatctatttagcaacaggtgcaaaccaactt
gaaacctcaaatgccgttgatgctaaacttgaagaattatcatcaatttttcctgaagat
attcactataaatatccttacgatacgactaaatttgttgaattatcaattgagaacgta
gttgatacattaattgaagcgattatattagttgttattgtaatgtttgttttcttacaa
aactttagatcgacattaattccaacaattacagtacccgttgtgttacttggtacgttt
gcagtattatatattttaggttttactatcaataccctttctatgtttgcattagtactc
gccatcggtttgctggtggatgatgctatcgtcgttatcgaaaacgtagaacgtatcatg
gaagatgaaggattatccccttatgatgcaaccgtaaaatcgatggaacaaattacctca
gctttagttgggatcgcggtagtattatcagccgtatttgtaccaatggcattttatggc
ggcgctgcgggtggaatttataaacagttctccattaccattgtaacatcaatggcatta
tcagtattaatggcaattgtattaacccctgcattatgtgtgcagatcttaaaagcgcct
tcaaaattcaaaaacaaaaaagcaaccttcacgcagcgaatagctaagttaccacctttt
tgttggtttagttggttattagcaaaattctttgctggttttgatgcagtattttctcgt
agccttcatttgtatgaaaaaggtgtaattaaggttatcaaatatccattattcagtttt
gttacttatggattagtaattcttgccttattatttggctttaataaattaccaactgca
ttcttacctgatgaagaccaaggtgttatcatcatgatgactgaactaccgcctggcgca
acattatcagaaacacaagcagtactcgataaagctgaagtttactttaaaacccaacat
gcaaaatcggttgaagaagtatttaccgtcgcaggatttagtatgatgggccgtggacaa
aacatggggcttggctttattaaactgaaagattggagtttacgtaaagataaagatcag
tcagtagattaccttgttagtaatgctaaccagttcttagcaacaattactcaggcgcgt
agctttgcattaaatattccagcagttcccgctttaggcatggctaatggcttctcttat
atgctaaaagatagtggtgccgctggtcatgatgcgttaatggcggcattttatcaaatg
ctaggtgctgctgcgcaaaatcctaatttagcgcaaataagaccggctggcatgttagat
gtaccacaatataaaatcaatgttgactttgaaaaagcacaagcgctaggtacatcgata
tcgtcaattaatacggtgttatcaacgagcctaggatcttcatacattgatgactttatc
tataacaatagagttaaaaaagtctatgtgcaaggtgctgcgccttatcgtatgttacca
aatgattttagttactggcatgtacaaaatagtaatggtgaaatggtaccattcgactca
tttgcaacaacctcaaaaacttatggttcaccttcattagtccgttataatggttctgct
gcgatggggattagtggttctggtgcaccgggtcaaagttcgggtcaagcaatggctgaa
atggcgaaattatcgaaaaatcttcctaaaggctttacgtatgagtggactggtgtttct
taccaagaacagcaaacgggttcacaaactacaacactttatatgatttcgattattgtt
gtattcttatcgttagctgcattatatgaaagttggactgtaccaatctctattttattt
attataccaatagggatagtaggaaccgtctatgcgaccatgttccgtggtttatctaac
gatgtttactttatcgttggactattaacaacaatggggcttgctgctaaaaatgcgatc
ctaatcgttgagtttgctaaagatgcacttgaaaaagagggtaaatcgttaattgatgca
acacttgaagcgtgtcgtttacgtttacgtccaattttaatgacatcatttgcctttata
ttaggggtattaccacttgcaattaatagtggtgctggttctgcaagccaaaatgcggta
ggtactggggtaattggcggaatgttaacagcaacattcttagcaattttctatgtacca
ttattctttgtctttgtgactaaattatttacaaaacataagaataaagtcgtactgcct
tgttcacccaaacctaaaaaagagaatgactaa
DBGET
integrated database retrieval system