Arcobacter acticola: AACT_0865
Help
Entry
AACT_0865 CDS
T06605
Name
(GenBank) RND family efflux system, inner membrane transporter, AcrB family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
paco
Arcobacter acticola
Pathway
paco01501
beta-Lactam resistance
paco01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paco00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
AACT_0865
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
AACT_0865
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paco02000
]
AACT_0865
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
paco01504
]
AACT_0865
Transporters [BR:
paco02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AACT_0865
Antimicrobial resistance genes [BR:
paco01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
AACT_0865
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKE28059
UniProt:
A0A6M8EJB2
LinkDB
All DBs
Position
843905..847024
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MFSKFFINRPIFSTVVSVIIILAGIISLNILPIKEYPSVTPPQINVVATYPGADATTLSS
TVATTLENAINGVDNMTYMTSTASPSGILSLSVIFNVGTDVAQAKVDVNNRVQLALSSLP
EEVQRQGISVKEKSPDMLKVIAFTSKNAVHDTTYISNYLTVNVIDDIKRIKGIGDATVFG
AKDYAIRIWVNPEKLAFYNLTSEDITSVVNSQNNQYSTGSVGAEPLNVIQPFTYSISTEG
RLKNVEAFENIIVRSNKDGSTLKLKDVAEVKLGSDSLNTIGKFNSEPMIPVGIFLAPGAN
ALEVSAALDATLKEVSKNFPEDIEYRVPYDATLFVQESIKEVVKTLFEAILFVIILIYLF
LGNFRATIIPVLAIPVSVIGTFAGLYIAGFSINLLTLFGMILAIGLVVDDAIIVIENVER
VLRTKKISVKDATIEAMKELTTPLVAIILVLSAVFIPAALTGGFSGVMYKQFAITIVIAV
LISGLVALTLTPALCAIFLKEHESEPIWPIRKFNAFFDWLTTVFIGITKQTIRLWFFSLA
IFAFIIYSTYAIMKITPTGLVPTEDKGVLMVLTYMMPSTSLGESLKVTDEIRKDLLANPN
VKSVGAITGLDIATFAYKTDAALMFALLKPWDERPLAEQNSKVIAGKLMGQFMMTNKDAF
VIPVNPPPIMGMSTTGGFEMWIQDRTGGDIQALSAYTQEIVAKAAQDKRLMAVRTTLNAN
VPKYMLTVNKEKAKSMSVDISSVYAVIQNSFGKGYINDFNLYGRTFHVNIQSESEFRSTK
DNFKNIFVKSDLGNLIPVSELVTIKRDVGASVIQRFNMFNSAQVTGTPGAGFASSDATTA
IEEIAKSVLPEGYTIAWSGTTYQEKKLSSEGNYTAVYAAIFVFLILAALYESWSIPLAVI
ISIPFGIFGAALSVYLRGLEADIYFQVGLITLVGLSAKNAILIVEFAMDKLRDGMPLLEA
TIEAAKLRFRPIIMTSLAFIAGTLPLALSSGAGSASRHIIGTTVVGGMAAAMIIGVLFIP
LFFYGVLRIKQKFSSKKEI
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcaaaattttttattaatagacctattttttcaacagtagtctctgttattatt
atattagcaggaattatttctttaaatatattacctattaaagaatatccatcggttacg
cctccacaaattaatgtggtagcaacatatccaggtgcagatgcaacaacattatcatca
actgttgccacaactttagaaaatgcaattaatggtgttgataatatgacttatatgaca
tcaactgcatcccctagtggaatactttctttaagtgttatctttaatgttggaactgat
gttgcacaagcaaaagtagacgtaaacaatagagttcaactagcacttagtagtttacct
gaagaggtacaaagacaaggaatttctgtaaaagagaaatctcctgatatgttaaaagtt
attgcttttacatctaaaaatgcagttcatgatactacatatatttcaaattatttaaca
gtaaatgttattgatgatattaaaagaattaaaggtattggtgatgctacagtttttggt
gcaaaagattatgcgattagaatttgggttaatcctgaaaaacttgcattttataattta
acatctgaagatattacaagtgttgttaatagtcaaaacaatcaatactcaacaggatca
gttggtgctgaacctttaaatgttattcaaccttttacatattcaattagtacagaagga
agattaaaaaatgtagaagcatttgaaaatattatagttcgttcaaataaagatggatct
acattaaaattaaaagatgttgctgaggttaaattaggttctgattcacttaatactatt
ggtaaatttaatagtgagccaatgattccagtaggtatcttcttagctccaggagcaaat
gcccttgaagtatcagcagcacttgatgcaactttaaaagaagtatcaaaaaattttcct
gaagatatagagtatagagttccatatgatgcaacactatttgtacaagaatcaatcaaa
gaagttgtaaaaacactttttgaagcaattctttttgtaatcattttaatttatcttttc
ttaggtaattttagagcaacgattattccagttcttgcgattcctgtttctgtaattggt
acatttgctggactttatattgcaggattttctataaatttacttacactttttggtatg
attttggctattggattggtagttgatgatgcaattattgtaattgaaaatgttgaaagg
gttttaagaactaaaaaaatcagcgttaaagatgcaacaatagaagctatgaaagagtta
acaactccacttgttgctattattcttgtactttcggctgtatttattccagctgcacta
acaggtggatttagtggggtgatgtataaacagtttgccattactattgtaattgctgtt
ttaatctcaggattagttgcgcttactttgacacctgcactttgtgctattttcttaaaa
gagcatgaaagtgagccaatttggccaatcagaaaatttaatgctttctttgactggtta
acaacagtatttataggtattactaaacaaactattagattatggttcttttcacttgct
atatttgcttttataatttattcaacatatgcaattatgaaaataacaccaacaggttta
gtaccaactgaagataaaggtgtattaatggtattaacatatatgatgccatcaacttct
ttgggtgaatctttaaaagtaacagatgaaattagaaaagatttattagcaaatccaaat
gtaaaatcagttggagcaattacaggtttagatattgccacatttgcttataaaactgat
gctgcattaatgtttgccttattaaaaccttgggatgaaagaccacttgcagaacaaaat
tctaaagtaattgcagggaaacttatgggtcaatttatgatgacaaataaagatgccttt
gtaattcctgttaatcctcctccaattatgggtatgagtacaacaggcggatttgagatg
tggattcaagatagaacaggtggagatattcaagcattaagtgcatacactcaagaaatc
gttgcaaaagctgcacaagataaaagattaatggctgtaagaacaacattaaatgctaat
gttcctaaatatatgctaacagtaaataaagaaaaagcaaaatcaatgagtgttgatata
agctctgtttatgcagtaattcaaaatagttttggaaaaggatatataaatgatttcaat
ctttatggtagaactttccatgtaaatattcaatctgaatcagaatttagatctacaaaa
gataatttcaaaaatatctttgtgaaatctgatttaggaaatttaattccagttagtgaa
ttagtaacaattaaaagagatgttggagctagtgttattcaaagatttaatatgtttaac
tctgctcaagttacaggaactccaggtgctggatttgcttcaagtgatgcaacaactgca
attgaagaaattgcaaaatctgtattacctgaagggtatacaatagcttggtcaggaaca
acatatcaagagaaaaaattatcatcagaaggtaattatacagcagtttatgcagctatc
tttgtatttctaattcttgctgctctttatgagagctggagtattccattagctgttatt
atttctattccttttggaatctttggtgcggcgttatctgtttatttaagaggattagaa
gctgatatttatttccaagttggtttaattacccttgttggtttaagtgctaaaaatgca
attttaattgttgagtttgcaatggataaattaagagatggaatgccacttcttgaagct
actattgaagctgctaaattaagatttagacctattattatgacttcattagcatttatt
gcaggtacattaccacttgctttaagttcaggtgcaggaagtgcaagtagacatatcatt
ggtacaacagttgttggtggaatggcagctgctatgattattggagttttatttattcca
ttgtttttctatggtgttttaagaataaaacaaaaattctcttcaaaaaaagagatttag
DBGET
integrated database retrieval system
