Pseudoalteromonas lipolytica: D0907_17705
Help
Entry
D0907_17705 CDS
T05890
Name
(GenBank) multidrug efflux RND transporter permease subunit
KO
K18299
multidrug efflux pump
Organism
pdj
Pseudoalteromonas lipolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pdj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pdj02000
]
D0907_17705
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
pdj01504
]
D0907_17705
Transporters [BR:
pdj02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
D0907_17705
Antimicrobial resistance genes [BR:
pdj01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexEF-OprN [MD:
M00641
]
D0907_17705
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
DUF4407
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXV67157
UniProt:
A0AAD0S312
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:309020..312166
Genome browser
AA seq
1048 aa
AA seq
DB search
MKFSHFFIQRPIFAAMLSLIFLIAGAISLFQLPVSEYPEVVPPTVVVTASYPGANPTVIA
ETVATPLEQEINGTENMLYMFSQATSDGRMTLTVTFALGTDLDRAQVQVQNRVNSALPRL
PQEVQRLGVVAEKSSPDLTMVVHLYSPEKTHDTTYLANYADLYIKDQIARLPGVGDVRMF
GGGQYSMRVWLNPDALSARELTAMDVVNALRAQNQQVAAGSLGAQPTSKSNQFQILMNVK
GRLSSQEEFENVIIKVGEQGQLTRLSDVARLELGQDTYALRAMLDGQPALAMPVFQRPGS
NAIELSDQVRETMKVLAKDFPSGVEYDIVYDPTIFVRGSIDAVIKTLLEAIALVVIVVVV
FLQTWRASVIPLIAVPVSLIGTFAVMQWLGVSINTLSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVE
RNIEQGLSPLEATRVAMTEVTGPIIAIALVLCAVFIPTAFITGLSGQFYKQFALTITIST
VISAFNSLTLSPALSALLLKGHDAKPDRLTKLLNRLFGNWLFKPFNRVFDKGANGFEKLV
QKLIRMSVIVLVAYVALVGGTVKLFDAVPGGFIPQQDKQYLVAVAQLPDAASLDRTQEVV
QEMEKIALQVPGVANTVSFPGLSVNGFTNSPNSGIVFTPLAPFEERQDPSMSAMAIAAQL
NQKFAAIDEAFVAVFPPPPIQGLGTTGGFKLQIEDRANKGFEALFNSLQATITKAQQDPA
LMGLYSSFRIQVPQMDIDIDREQALIQGIPLDEVFNALQVYLGSVYVNDFNLFGRTYQVN
AQADADYRQDPEQILNLKVRNRMGEMVPLGSVLTVTPTTGPDRVMHYNGYPTAELNGSPA
PGYSSGQAQQAIEAILADTLPNGIEFEWTEVTYQQILAGNTMVYVFPLVVLLVFMVLAAQ
YESLRLPLAIILIVPMTIFSALLGVWFVGDDNNIFTQIALIVLVALASKNAILMVEFARD
QHKTGMSHLEAIIKACRLRLRPILMTSIAFTAGVVPLVLATGAGAEMRHAMGNAVFSGMI
GVTVFGLLFTPVFYMLVTKKSQKEQHDA
NT seq
3147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattttcacacttttttattcagcgacccatctttgctgcgatgctgtcgcttatc
tttcttatcgcaggggccatctcgttatttcaattgccagtcagtgagtatccagaagtg
gtgccgccaacggttgttgtgacggcaagttacccgggtgcaaacccaacggtgattgct
gaaacagtggcgactccgcttgagcaagaaatcaatggtaccgaaaacatgttgtatatg
ttttcgcaagcaaccagtgatggccgcatgacactaacggtaacgtttgcgttaggtact
gatttagaccgtgcacaagtacaagtgcaaaatcgtgtaaatagtgcactaccgcgatta
ccacaagaagttcagcgtttaggtgtcgtagccgaaaaatcatcacccgatttaaccatg
gtggtgcatttatactcgcctgaaaaaacgcacgatacgacctacttagcgaactatgct
gacttgtatatcaaagaccaaattgcacgtcttccgggagtgggtgacgtacgtatgttc
ggtggtggccaatactcgatgcgcgtttggctaaatccagatgcgctatcggcacgcgaa
ttaacggcaatggatgtagtaaatgcattgcgtgcgcaaaaccaacaagttgctgcgggt
agcttgggtgcacaacctacgtcgaaaagtaaccaattccaaattctaatgaatgtaaaa
gggcgcttaagctcacaagaagaatttgaaaatgtgatcattaaagtcggtgaacaaggt
cagcttacacgcctaagtgatgttgcacgccttgagcttggccaagacacgtatgcacta
agagcgatgctagatggtcaaccagcccttgctatgcccgtattccaacgccccggttct
aatgcgattgagctttctgatcaagtgcgtgaaaccatgaaggtgttagctaaagacttt
ccatcaggagtagaatacgacattgtttatgaccccactattttcgtacgcggctcgatt
gatgctgtaattaaaacgcttttagaagcaatcgcgttagttgttattgttgtggtggtg
tttttacaaacatggcgtgcatcggttatcccactgattgctgtgccagtatctttgatt
ggtacgtttgcggtaatgcaatggttaggcgtatctattaataccttatcgttatttggg
ctcgtactcgcaattggtattgttgtcgatgatgccattgttgtggttgaaaacgttgaa
cgaaatatcgaacagggcttatcaccactagaagcaactcgtgttgcgatgacagaagta
accgggccaattatcgctattgcgttagtattgtgcgcggtatttattcctacggctttt
attactggtttatcgggtcagttttataagcaatttgcactcactattactatttcaacg
gttatctcagcatttaactcgttaacattatcgcctgcgttatcggcgttattattaaaa
ggccatgatgcaaaaccagaccgtttaactaagttattaaaccgcctatttggcaactgg
ctatttaaaccctttaaccgcgtgtttgataaaggcgccaatggcttcgaaaaactcgtg
caaaagcttattcgtatgagtgtgattgtattagttgcttatgttgcgcttgttggtggc
accgttaaattgtttgatgctgttccgggtggctttattccacagcaagacaagcaatat
ttagtggctgttgcacagttacctgatgcggcaagcttagacagaacccaagaagtcgtg
caagaaatggaaaaaattgcactacaagtccccggtgttgcaaacactgtgtcgtttcct
ggtttatctgtaaatggtttcaccaatagcccaaatagcggcattgtgtttactccgctt
gcaccttttgaagagcgtcaagacccgagtatgtctgcaatggcgatagcggcgcagtta
aatcaaaaatttgccgctattgatgaagcgtttgtcgcggtgttcccgccaccgccaatt
caaggtttagggactactggcggctttaaactgcaaattgaagaccgtgctaacaaaggc
tttgaagcactctttaacagtttacaagcaaccattactaaagcgcagcaagaccctgca
ttaatgggactttactctagctttagaattcaagtgccacaaatggatatcgacattgac
cgagagcaagcgcttattcaaggcattcctcttgatgaagtatttaatgccttacaagtc
tatttaggttctgtgtatgtgaatgactttaacttgtttggtcgtacttatcaggtaaat
gcgcaagctgatgctgattaccgtcaagatccagagcaaattttgaatctaaaagtacgt
aaccgtatgggtgagatggtgccattaggttctgtattaacggtcacaccaacaacaggc
ccagatcgtgtgatgcactataacggttatcctacagctgaactaaatggtagcccagca
ccaggttatagctcaggccaagcacagcaagctattgaagcaatccttgcagacacactc
cccaatgggattgagtttgaatggacagaagtaacctatcagcaaatattagcgggtaac
accatggtgtatgttttcccacttgttgtattgcttgtgttcatggtacttgcggcgcag
tacgagagcttgagattaccacttgctattattctgattgtgcctatgactattttctcg
gccttgttaggtgtgtggtttgtgggtgatgacaacaatatcttcacacaaatcgcacta
atcgtactggttgcgctagcaagtaaaaacgccattttaatggttgagtttgcacgagat
cagcataaaacgggaatgtctcatcttgaagccattattaaagcgtgtcgcttacgactt
cgcccaattctaatgacatcaattgcttttacggcaggtgttgtacctcttgttcttgcc
actggtgcaggtgctgagatgcgtcacgctatggggaacgcggtattctcaggcatgatt
ggtgtaaccgtgtttggcttattgtttaccccggtgttttatatgttagtaacgaaaaaa
tcgcagaaggagcaacacgatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system