Prevotella herbatica: prwr041_06810
Help
Entry
prwr041_06810 CDS
T08008
Name
(GenBank) multidrug transporter AcrB
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
pher
Prevotella herbatica
Pathway
pher01501
beta-Lactam resistance
pher01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pher00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
prwr041_06810
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
prwr041_06810
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pher02000
]
prwr041_06810
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
pher01504
]
prwr041_06810
Transporters [BR:
pher02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
prwr041_06810
Antimicrobial resistance genes [BR:
pher01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
prwr041_06810
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCS84788
LinkDB
All DBs
Position
complement(923632..926895)
Genome browser
AA seq
1087 aa
AA seq
DB search
MTLTNFIKRPVLSTVISILFVLLGTIGLISLPVEQYPDIAPPTISVMTTYTGADAQTVLN
SVVTPLEESINGVENMTYMTSSATNDGMASITVYFKQGSDANMAQVNVQNRVQQAQALLP
AEVTRAGVTVSKRQSSNVIMFSLTTEDGRYDDQFVTNYALINVIPQLKRINGVGDIQTPG
TRTYSMRIWLKPDKMKQYGLIPSDITKALEGQNIEAAPGKFGENSDMAYEYVLRYKGRLK
TIPDYENIIISSTTNGQTLKLGDVAKVELGGLQYNVNLLNNGHPAVLGMVNQIAGSNATQ
IASDVKKTLEEAKKSFPPGLEYTIEQDVTEFLFASIHEVVFTLFITLALVFLVVYIFLQD
FRSTLIPMIAVPVALIGTFFFLWVFGFSVNLLTLSALLLAIAIVVDDAIVVVEAVHAKLD
QGYKSALAASIDAMNEISGAIISITLVMAAVFVPVSFMGGTSGTFYREFGVTMAISIVIS
SLNALTLSPALCAMFLKPHEDDEHSEKKTTFVTRFHDGFNHQFDKITSKYKKGVQWIINH
YLIVGGAVVLGIAALVITMATTKTGLVPDEDTGTLFVTISAAPGTSQERTKQIVAQVDKM
LANNPAIKRRESILGYNFIAGQGSDQATFIIKLKSFEERSGSFTTRIENAIKNADVMALF
VNPLENTSVLGMIYKQTATIKDAQILAFGPPMIPGFSMQNGVTLSMQDKTGGSIVKFYNV
TKDFIAELNKRPEIQMAQTSYNPNYPQYMVDVDVAKTKQAGIAPSDVLTTLQGYYGGLYA
SNFNAFGKLYRVMIQGDVASRMRPDGLSNIYIRTPTGMSPVSEFVKLRRIYGPSNISRFN
LFTSINVSVTPQTGYSSGQAMQAIKEVSENTLPEGYSYDYSGLTRSEAESSNSTALIFVL
CIVFVYLILSAQYESYILPLAVILSIPFGLAGAFIFTLIFGHSNDIYMQISLIMLIGLLA
KNAILIVQFALERRRTGMAIKYSAILGAGARLRPILMTSLAMVVGLLPLMFASGVGKNGN
QTLGAAAIGGMFIGTLCQVFVVPALFTVFQWLQEKLTPLKFEDEENAEAASELAQYANAK
STVSPKN
NT seq
3264 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattaactaactttataaagcgcccagtactttcaacggtgatttccatcttgttt
gtattgttgggcactataggattgatatcactgccagtagagcagtatccggatatcgcg
ccgcctactatttccgttatgaccacttatactggtgctgacgctcagacggtgcttaac
tccgttgttactcctcttgaagagagtatcaatggtgttgagaatatgacctacatgaca
tcttcagccaccaatgatggtatggcttcgattactgtgtatttcaagcagggatccgac
gccaatatggcacaggtgaatgtacagaaccgtgttcagcaggctcaggctttgttgcct
gccgaggttactcgtgctggtgtgacggtgtctaaacgtcagtcatcaaacgttataatg
ttctctcttactacagaggacggtcgctacgatgaccagtttgttaccaattatgcactt
atcaacgttatacctcagttgaaacgtatcaatggtgtaggtgacattcagaccccgggt
actcgtacttattctatgcgtatttggcttaagccagataagatgaaacagtatggactt
attccttctgacataacaaaagctcttgaaggacagaatattgaggctgcgccaggtaaa
tttggtgagaatagcgatatggcttatgagtatgttcttcgctataagggacgtttgaag
acaatccctgattatgaaaatatcatcatatctagtacaactaatggtcaaacattaaag
ttgggagatgtagcaaaggtagaacttggcggattacagtataatgtaaaccttctaaac
aatggacatccagccgtacttggtatggttaatcagattgccggctctaatgcaactcag
attgcttctgatgtaaagaaaactttggaagaggcaaagaaaagtttcccaccaggactg
gaatatactattgagcaggatgtaaccgaattcttgttcgcttcaatccatgaagttgta
ttcacgttgtttatcacattggcacttgtgttccttgtggtttatatattccttcaggat
ttccgttcaacattgataccaatgattgcggttcctgttgcgttgataggtacgttcttc
ttcctatgggtatttggattctccgtcaacttactgacactgtccgccttgctgcttgcg
atagccatagtggtggatgatgctatagtcgttgtggaggcggttcatgccaagttggac
caaggttataagagtgcactcgctgcatctattgatgccatgaatgagatttctggagct
atcatatcaatcacattggtaatggctgctgtgtttgtgcctgtatctttcatgggtgga
acttctggaactttctatcgtgagtttggtgttacgatggctatttctatcgtgatttct
tcccttaacgcccttacactttctcctgcactttgtgcaatgttcctgaaacctcatgag
gatgatgagcatagcgaaaagaagacaacgttcgtaacccgtttccatgacggattcaat
catcagtttgataagattacaagtaagtataagaaaggtgtacaatggattatcaaccat
tatttgattgttggtggagctgtcgtattaggtattgctgctttagttataacaatggct
acaactaagactggtcttgtacctgatgaggatactggaactctgtttgttacaatatct
gctgcaccaggaacaagtcaggaacgtactaagcaaattgttgctcaggttgataaaatg
ctagccaataaccctgctattaagcgccgtgagtcaatcttaggatataacttcatcgct
ggacaaggttcagatcaggctacattcattattaaactgaaatcgtttgaggaacgttcg
ggaagtttcacgactcgtatagagaatgcaatcaaaaatgccgatgtaatggcattgttt
gtgaaccctctcgaaaatacgtctgttcttggtatgatttataagcagacggcaacgata
aaggatgctcagatattagctttcggtcctccaatgattccaggtttctctatgcagaac
ggtgttactttgtctatgcaggataagactggtggaagtattgttaagttctataatgta
actaaggacttcattgccgaactcaataagcgaccagagatacagatggctcagacttcg
tataatcctaactatcctcagtatatggtggatgtagatgttgcaaagacaaaacaggca
ggaatagctccttctgatgtgttgacaacattgcaaggatattatggtggtctctatgcg
tcaaacttcaatgctttcggtaaactgtatcgtgtaatgattcagggtgatgttgcaagt
agaatgcgccctgacggacttagcaatatctatataagaactcctacaggaatgtctcct
gtaagtgagtttgttaagttgcgccgtatatatggaccttcaaatatatcacgtttcaac
ctgtttacatcaatcaatgtgagcgttactccacagacaggttattcttcaggtcaggct
atgcaagcaattaaggaagtatcagaaaatactcttcccgagggctatagttatgactat
tcgggtttgactcgttctgaggcagaaagtagtaattctacggcattgatattcgtactt
tgtattgtattcgtttacttgattcttagtgcgcagtatgaaagttacattcttccgttg
gctgtaattctttcaataccgtttggattggctggagcgtttatttttacattgatattc
ggtcattccaatgatatctatatgcagatatcgctaattatgcttatcggtctgttagca
aagaatgctatacttatcgtgcagtttgctcttgaacgacgacgcacaggtatggctata
aaatattcagctatccttggagctggagcacgtttgcgaccaatcctaatgacatctctc
gcaatggttgtaggtttgcttccgttaatgtttgcttccggtgttggtaagaatggtaac
caaactttgggtgccgccgcaattggaggtatgtttataggtacattatgtcaggtgttt
gtcgttcctgctttgtttaccgtattccagtggttgcaagagaagctcactccgctcaag
tttgaggatgaggagaatgctgaggctgcttctgaactggcacagtatgcaaatgctaag
tcaacggtttcaccaaaaaactag
DBGET
integrated database retrieval system