Proteus mirabilis BB2000: BB2000_2202
Help
Entry
BB2000_2202 CDS
T02789
Name
(GenBank) chondroitin ABC endolyase 1 precursor
KO
K08961
chondroitin-sulfate-ABC endolyase/exolyase [EC:
4.2.2.20
4.2.2.21
]
Organism
pmib
Proteus mirabilis BB2000
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmib00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09191 Unclassified: metabolism
99980 Enzymes with EC numbers
BB2000_2202
Enzymes [BR:
pmib01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.20 chondroitin-sulfate-ABC endolyase
BB2000_2202
4.2.2.21 chondroitin-sulfate-ABC exolyase
BB2000_2202
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Lyase_catalyt
Lyase_N
Lyase_8
Lyase_8_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGS60667
LinkDB
All DBs
Position
2398682..2401747
Genome browser
AA seq
1021 aa
AA seq
DB search
MPIFRFTALAMTLGLLSTPYHVIAATSNPAFDPNHLMQSEIYHFAQSDPLADFSSDKNST
LTLSDKRSIMGNQSLLWQWKGGSSFTLHKKLIVPTDKEASKAWGRASTPVLSFWLYNEKP
IDGYLTVDLGEKLNATSEAQAGFKVKLNFTGWRAIGISLNNDLENREMTLNATNTSSDGT
QDSIGRSLGANVDSIRFKAPSNISQGEIYIDRIMFSIDDARYQWSDYQIKTRLSEPEIEF
HTVQPQLPVTPENLAAIDLIRQRLINEFVGGEKETNLALEENISKLKTDFEALNIRPLSD
GGMQGRHLITDKQTIIYQPEQLNSQDKQLFDNYVILGNYTTLMFNISRAYVLEKDPTQKE
QLKQMYLLMTKHLLDQGFVKGSALVTTHHWGYSSRWWYISTLLMADALKEANLQTEVYDS
LLWYSREFKSSFDMKVGANSSDLDYFNTLSRQHLALLLLEPDDQKRINLVNSFSHYITGA
LTQVPPGSKDGLRPDGTAWRHEGNYPGYSFPAFKNASQLIYLLRETPFSVGESGWNNLKK
AMISAWIYSNPEVGLPLAGRHPFNSPSLQSIAQGYYWLAMSAQPAPDKQLASIYLAISGK
SRNESPTIFGEEITPASLPQGFYAFNGGAFGIHRWQDKMVTLKAYNTNVWSSEIYNKDNR
YGRYQSHGVAQIVRNGSQLSQGYQQEGWDWNRMPGATTIHLPLKELDSPNPHTLMQRGER
GFSGTSALEGKYGMMAFDLLYPANLARFDANFTAKKTVLAADNHLIFVGSNINSSDKDHP
VETTLFQHAITPELNTIWINGQKIEGFPYQTTLKQGDWIIDSNGNGYLITQAEKVNVSRQ
HQTSAENKNRQPTQGNFSSAWIDHGIQPKDHSYEYMVFLDATPEKMAQLAEKFRANNGLY
QVIRKDKDVHIIYDKLSQITGYAFYQPAVIDDKWIKKVDKPSIVMTHQEGNILTVSAVTP
DLNMTRQKAATPVTINVTVKGKWQPTAQDSEVTYNVSGDNTELIFTSYFGIPQEIKLSPL
S
NT seq
3066 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgatatttcgttttactgcgcttgcaatgacattggggttattatcaaccccctat
catgttattgctgccaccagcaatcctgcatttgatcccaatcatcttatgcaatcagaa
atctatcattttgcacaaagtgatccattagctgatttttcatcagataaaaattcaaca
ctaactttatctgataaacgtagcattatgggaaaccaatcccttttatggcaatggaaa
ggtggcagtagttttactttacataaaaagcttatagttcccacagataaagaagcctct
aaagcatggggacgcgcttctacacctgttttatcattttggctttacaacgaaaaacct
attgatggttatctcactgttgatttaggggaaaagctcaatgccaccagcgaagcccaa
gctggttttaaagtaaaactaaatttcactggctggcgtgctattggtatctctttaaat
aacgatcttgaaaatcgtgagatgactttaaatgcaacaaatacatcatccgatggtact
caagatagtattggtcgctctttaggtgcgaatgtcgacagcattcgttttaaagcccct
tctaatatcagtcagggtgaaatctatatcgaccgtattatgttttctattgatgacgcc
cgttaccaatggtctgattatcaaataaaaacacgattatcagagccggaaattgaattt
cacaccgtacaacctcaattacctgtaacaccagaaaatttagctgcgatagatcttatt
cgccaacgtcttatcaatgaatttgttggtggtgaaaaagagacgaatcttgctttagaa
gagaatatcagcaagctaaaaacggattttgaggcactgaatattcgccctctttcggat
ggaggaatgcaaggtcgacatcttatcaccgataaacaaactatcatctatcagccagaa
cagcttaattctcaagacaagcaactttttgataattacgtcattcttggtaactacacc
acattaatgtttaatattagccgtgcttatgtgctcgaaaaagatccaacacaaaaagaa
cagctaaaacagatgtacctcttgatgaccaagcatctattagatcaaggatttgtcaaa
ggtagtgccctagtaaccactcaccactggggatatagttcacgttggtggtatatctct
acattattaatggctgatgcactaaaagaagctaatctacagacagaagtctatgattct
ctactttggtattcacgagaatttaaaagtagttttgatatgaaagttggcgcaaatagc
tctgatttagactattttaataccttatctcgtcaacatttagcgctattattacttgaa
cccgatgatcaaaaacgtattaacttagtcaattcttttagtcattatatcactggtgcc
ttaactcaagtaccaccggggagtaaagacggtttgcgtcctgatggtacggcatggcga
catgaaggtaattatcccggctactctttcccagcatttaaaaatgcctcacagctgatt
tatttattacgagaaacacctttttctgtaggtgaaagtggctggaataacctaaaaaag
gcaatgatttcagcatggatctatagtaatcctgaagttggcttacctttagcgggaaga
cacccctttaactcaccttccctacaatctatagcacaaggttactattggctcgcgatg
tctgcccaaccagcgccagataaacagttagcatctatttatttagcaattagtggtaaa
tcgcgaaatgaatctcccactatttttggtgaagagataacgccagcgtcccttcctcaa
gggttctatgcctttaacggtggtgcctttggtattcaccgttggcaagacaaaatggtg
acattaaaagcctataataccaatgtatggtcatctgaaatttacaataaagataaccgt
tatggccgttatcaaagtcatggtgttgctcaaatcgttcgcaatggctctcaactttca
caaggctatcagcaagaaggctgggattggaatagaatgcctggcgccacaaccattcat
cttccgcttaaagaacttgatagccctaacccacacaccttaatgcaacgaggtgagcga
ggatttagcggcacatcagcccttgaaggaaaatatggcatgatggcgtttgatcttctt
tatcccgctaatcttgcgcgttttgatgctaactttaccgctaaaaaaaccgtcttagcg
gcggataaccatttaatttttgtcggtagcaatattaatagcagcgataaagatcaccct
gtggaaacaacgttattccaacatgctattacgcctgagttaaacactatttggattaat
ggccaaaaaatagaaggttttccttatcaaactacgctaaaacaaggagattggataatc
gatagtaatggtaacggttatttaattactcaagcagaaaaagtgaatgtcagccgccaa
caccagacttcggctgaaaataaaaatcgtcaacccacgcaaggaaattttagctccgca
tggatcgaccacggtattcaacccaaagatcatagttatgagtacatggttttcttagat
gcaacaccggaaaaaatggcgcaattagccgagaaattccgtgctaacaatgggttatac
caagttattcgtaaagataaagatgtacatattatttacgataaactcagtcaaataaca
ggttatgcattttatcaaccagcagtcattgacgataaatggatcaaaaaagtcgataag
ccgtccattgttatgacacatcaggaaggaaatatactgacggtgagtgctgtaacacct
gatttaaatatgactcgccaaaaagcggcaacccccgtcaccattaatgtgacagtgaaa
gggaaatggcaacccacagctcaagacagtgaggtaacatataacgtttctggggataat
accgaacttattttcaccagttactttggcattccacaagaaattaaactctctcctctc
tcttga
DBGET
integrated database retrieval system
