Pedobacter mucosus: LOK61_15030
Help
Entry
LOK61_15030 CDS
T08291
Symbol
ileS
Name
(GenBank) isoleucine--tRNA ligase
KO
K01870
isoleucyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.5
]
Organism
pmuo
Pedobacter mucosus
Pathway
pmuo00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmuo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
LOK61_15030 (ileS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
pmuo01007
]
LOK61_15030 (ileS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pmuo03016
]
LOK61_15030 (ileS)
Enzymes [BR:
pmuo01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.5 isoleucine---tRNA ligase
LOK61_15030 (ileS)
Amino acid related enzymes [BR:
pmuo01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
LOK61_15030 (ileS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
pmuo03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Multi-aminoacyl-tRNA synthetase complex (MSC)
LOK61_15030 (ileS)
Prokaryotic type
Other AARSs
LOK61_15030 (ileS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
DUF5915
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1e
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKT63075
LinkDB
All DBs
Position
3591952..3595356
Genome browser
AA seq
1134 aa
AA seq
DB search
MYSEFKQLELAKIGQEILDFWKKENIFEKSISSRPKSNPFTFYEGPPSANGMPGIHHVMA
RAIKDIFCRYKTLKGYQVKRKGGWDTHGLPIELAVEKKLGITKEDIGKKISVDDYNSACR
TEVMKYTDVWNDLTEKMGYWVDLEKPYITYENDYIETLWWIIKQLYDKGFLYKGYTVQPY
SPAAGTGLSSHELNQPGTYKMLKDTSITAQFGLKKDQNHPLIAQLFDNDNENTVIIAWTT
TPWTLPSNGALAVGEKINYVKVKTFNQYTFEPVSVVLAKDLVAKHFKKDAENLSFSDYKG
GDKLIPWTITSEFTGKELVGLRYHQLMNYVTSPDLEENAFRVIPADYVTTEDGTGIVHIA
SVFGGDDFRVAKENNVPAVMIFDENGLELPLVDKQGKFVKEVTDFAGRYVKEEYYSDAER
EDPNFRSTDVLLAIKLKEDNKAFDVKKYEHSYPHCWRTDKPILYYPLDSWFIATTKVKDK
MVALNKTINWKPESTGTGRFGNWLENLVDWNLSRSRYWGTPLPIWRTADGLEEKCIGSMA
EMNAEIAKSIAAGFLPAGFELKDMHRPYVDDVILTSSKGEKMTRETDLIDVWFDSGAMPY
AQWHFPFENKEEFANAYPADFIAEGVDQTRGWFFTLHAIAVMLSEASDEIKAVNEQVSNP
GVAFKNVVSNGLVLDKNGNKMSKRLGNAADPFSTIETYSADATRWYMISNASPWDNLKFS
LEGLDEVRRKFFGTLYNTYAFFALYANIDKFEIDKNNLSNVADRTELDRWILSLLQNLIN
EVDEAYNTYEPTKASRAMQTFVDEHLSNWYIRLSRRRFWKGEMTDDKRTAYETLYICLET
LAQLMSPIAPFFADWLYKNLTVNDKNAEQSVHLTLWNDADQTLIDNALNERMVFAQDISS
MVLSLRKKSSINVRQPLAKILIPSLNGDFEQKISKVADYILSETNVKHIEFITDTHGIVK
KKLKPNFKSLGKKVGKDMSLVKEALENANQDDIQRLELEGFIIVVGSNDLEFTIDLNTDV
EVFAEDIPGWQVTNLGNLTVALDVTISEELKQEGISRELVNRIQNLRKELNFEVTDRIKV
RLQNDNLVTNAVAKNKAYICAEILADELLLTDEIVDANKIVIDDVELNISVNKI
NT seq
3405 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatagcgaatttaaacaattggaacttgccaaaatagggcaagaaatattagatttt
tggaaaaaagaaaacatctttgaaaaaagtatttcttctcgcccaaaatctaatcctttt
actttttacgaaggcccaccgtctgctaatggcatgcccgggattcaccatgtaatggct
cgtgctataaaagacattttttgccgttacaaaacactaaaaggctatcaagttaaacga
aaaggtggttgggatactcatggattaccaattgaacttgctgttgaaaaaaaattaggt
atcacaaaggaagacattggaaaaaaaatcagcgttgatgattacaattctgcctgccgt
accgaagtgatgaaatatacagatgtttggaacgaccttaccgagaaaatgggctattgg
gttgatcttgaaaagccatacatcacatatgaaaatgactatattgaaaccctttggtgg
attataaaacaactttacgataaaggatttttgtataaaggctatacggttcagccgtat
tctccagcggcaggtacaggtttaagctcgcatgagttaaatcaacctggcacttacaaa
atgttgaaagatacttctataaccgctcaattcggcttaaagaaagatcaaaatcatccg
ctgatcgctcagttatttgataatgataacgaaaatacggtcataattgcctggacaacc
acgccatggactctgccaagtaacggtgctttagcagttggtgaaaaaattaattatgtt
aaagtaaaaacttttaatcaatatacttttgaacctgttagtgttgttttagcaaaagat
ttagtcgctaaacactttaaaaaagatgcagaaaacttatcattctctgattataaaggt
ggtgataaattaatcccatggacgatcacttctgaatttacaggcaaagaattagttggt
ttgcgttatcatcaattgatgaactacgttacaagtccagatttagaggagaatgccttc
cgtgttattcctgctgattacgttactacagaagatggaacaggtattgttcatatcgcg
tcagtttttggtggagatgactttcgtgtagccaaagaaaataacgttccggcagtgatg
attttcgatgaaaatggattggaattacctttggttgataaacaaggaaagtttgtaaaa
gaagtaactgattttgctggtcgatacgttaaagaagaatattatagcgatgcagaacgc
gaagatcctaatttccgttctactgatgtattgcttgctattaaactaaaagaagataat
aaagctttcgatgtaaaaaaatacgaacacagttatccgcattgctggagaacagataag
ccgattttatattatcctctagatagctggtttattgcaactacaaaggttaaagataaa
atggttgcccttaataagaccatcaattggaaaccagaatctacaggaacaggccgtttt
ggcaactggttagaaaacctagttgattggaatttatcgcgttctcgctattggggcacg
cctttaccaatctggcgaactgccgatggcttagaagaaaaatgtattggttcgatggca
gaaatgaatgcagaaattgcgaaatctattgcagctggttttttgcctgcaggtttcgaa
cttaaagatatgcaccgcccttacgttgatgatgtaattttaacttcatcaaaaggcgaa
aaaatgactcgcgaaaccgatctaattgatgtttggtttgatagcggtgcgatgccttat
gcgcaatggcatttcccttttgaaaataaagaggaatttgcaaatgcctatcctgcagat
tttattgctgaaggtgtagatcaaacccgtggctggttcttcaccttacatgctattgca
gtgatgttaagcgaagcgagtgatgagattaaagcagttaatgaacaggttagcaatccg
ggtgtagcctttaaaaatgtagtttcaaatggattagtgctggataaaaacggcaataaa
atgtctaaacgtttaggcaatgctgccgatccgtttagtactattgaaacttatagcgct
gatgctacgcgttggtatatgatcagcaatgcttccccatgggataaccttaaatttagt
ttagaaggtttggatgaagtacgccgtaagttttttggaacgctttataatacctatgcc
ttctttgcgctatatgcgaacatcgataaatttgaaatcgacaaaaataatttgagtaat
gttgcagatagaacagaattagaccgctggattttatcgctattgcaaaacttgattaat
gaagttgatgaggcttataatacctatgagccaacaaaagcatcaagagccatgcaaact
tttgttgatgaacatttaagtaattggtatataaggttaagtcgccgacgtttttggaag
ggcgaaatgactgatgataagcgcactgcttacgaaacgctttacatttgtttagaaaca
ttagcgcagctaatgagtccgattgcaccattttttgccgattggttgtataaaaactta
accgttaacgataaaaacgcagaacaatctgtccaccttactttatggaatgatgcagat
caaaccttaattgataatgcacttaacgaacgaatggtttttgctcaagatatttcttcg
atggttttatcgttacgaaaaaaatcgagcattaatgttcgtcagcctttagcgaagatt
ttaataccatctttaaacggtgatttcgaacaaaaaatctcaaaagttgctgattatatt
ttaagtgaaacaaatgtgaagcatattgagtttattaccgacacgcatggcattgttaag
aaaaagcttaaacctaattttaaatcgttaggtaaaaaagttgggaaggatatgagtttg
gtaaaggaggctttagagaatgctaatcaagatgatattcaacgtttagaactagaagga
tttataatcgttgtcggtagcaatgatcttgaatttacgattgatttgaacactgatgta
gaggttttcgctgaagatattcctggatggcaagttacaaatttaggcaacctcactgtg
gctttagatgttacgatttcagaagaactaaaacaagaaggtatttctcgtgagttggta
aataggattcaaaatttgcgtaaagaattaaattttgaagttaccgataggattaaagtt
aggttacaaaatgataacttagtaacaaacgctgttgcaaaaaacaaagcttacatttgc
gccgaaatattagcagatgaactgttattaacagatgaaatagttgacgcaaacaaaatt
gttatagatgatgttgagttgaatatttcagtaaataaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
