KEGG   Pedobacter mucosus: LOK61_20125
Entry
LOK61_20125       CDS       T08291                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
pmuo  Pedobacter mucosus
Pathway
pmuo01501  beta-Lactam resistance
pmuo01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmuo00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    LOK61_20125
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    LOK61_20125
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pmuo02000]
    LOK61_20125
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:pmuo01504]
    LOK61_20125
Transporters [BR:pmuo02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   LOK61_20125
Antimicrobial resistance genes [BR:pmuo01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    LOK61_20125
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL
Other DBs
NCBI-ProteinID: UKT64062
LinkDB
Position
complement(4798533..4801730)
AA seq 1065 aa
MKITDISIKRPTLVIVVFTALTLLGLLSYFSLGYELLPKFSNNVVSISTIYPGASPNEVE
NTVTKKIEDAVSSMENIKKINAVSFESLSTVTITLTDAANIDISLNDAQRKVNAILSDLP
EDVKTPSLSKFSLDDLPVITMTASANMDDITFYDLIDKRIAPVISRVTGVAQVNLIGGSE
REIQVSLDADRLQGYNLSVPQVQQMILSSNLDFPTGSVKTQNQDVLIRLSGKYRSIEELR
NLVLTTSKAGAQIRLGDVADVQDSQKETEKLARVDRKASIAIQIIKQSDANAVEVSKGTH
AIIEKLKTEYAANKLDIKIVNDSSIFTLESADAVIHDLILAVILVAFVMLFFLHSLRNAL
IVMVSIPASLIATFIGIKLFGYTLNLMSLLGLSLVVGILVDDAIVVLENIQRHMEMGKNK
VRAASDATREIGFTVVSITMVIVVVFFPIAISSGLVSNILRQFCVVVIIATLLSLVASFT
IVPLLFSRYGKLEHIEGKNVFGRFILWFEKQLKKFTIWITAILTWSLNHKRRTIAAVFVL
FVAAMWLAGAGFIGSEFFPKSDKGEFLIQIELPKDAPLEKTNFYTQRAEAFLDKQPEIVQ
LITTVGQASGDFGGTQATAYKSEINVKLVERDKREGMSSDIFATKMSRALAKELVGAKVK
TVPISILGIAENAPISLVVMGSNLDSALKYAEGAQKLLKTIPGATEIKLSVEKGTPEINV
QVDRDKMSAVGLTLSTVGSTMQTAFAGNTDGKYRKGEYEYDINIQYQDFNRKDIDDVRNL
IFINDQGAQIKLSQFANITEGSGPSQLERLNKSTSVSVQAQSIGRPTGTVVADFKAKLIE
LQKNGKLKAPIGVSYTWGGDEENQAEGFGTLGVALLASIILVYLIMVALYDSFIYPLVVM
FSLPLALIGAFLALALTNNSIGIFTILGFIMLMGLVAKNAIILVDFTNHMKAEGKNTIEA
LILANHARLRPILMTTIAMIFGMLPIALASGAGAEWKNGLAWVIVGGLTSSLFLTLIVVP
VVYLIFDIMLDKLGFNKKVKTIDELMAEPYDHKDVLEYDVELEKH
NT seq 3198 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaataacagatatatctataaaaaggcctacgttggtaattgtggtttttaccgca
cttacattacttgggctgcttagttacttttcgttgggttacgaattacttccaaaattc
tcaaacaacgtagtatctatttcaacaatctacccaggtgcatcgccaaatgaggtagaa
aataccgtaaccaaaaaaattgaggatgcggtatcatcgatggaaaacattaagaaaatt
aatgcggtttctttcgaaagtttatctacagtaaccattactttaaccgatgcagctaat
atcgacatatctttaaatgatgcgcaacgtaaagttaatgcaatcctttctgatttacct
gaagatgtaaaaacaccatcattaagtaaattctcgttagatgatttaccggtaattacc
atgacggcttcggcaaacatggatgatattaccttttacgatttaattgataagcgtatt
gctccagttatttcgagggtaacgggtgttgcacaggtaaatttaattggtggttctgag
cgtgaaattcaggtttcattagatgctgataggttacaaggttacaatctttctgttcct
caggttcaacaaatgattttgagctctaacttagatttccctactggaagtgttaaaact
caaaatcaggatgtattaattcgtctttcaggtaaatatagaagcattgaagaattaaga
aatttagttttaaccacttcaaaagcgggtgcgcaaattcgtttaggcgatgttgccgat
gttcaggattcacaaaaagaaactgagaaattggcccgtgtagatcgtaaagcatccata
gcaattcaaattattaaacaaagtgatgcgaatgcagtagaagtaagtaaaggtacacat
gccattattgaaaaacttaaaacagaatatgcagccaacaaacttgatattaagattgta
aatgacagctccattttcacattagaatctgctgatgccgttattcacgatttaatttta
gcagtaatattggttgcgtttgtaatgcttttcttcttgcacagtttacgtaatgcgtta
attgtaatggtttctattccggcatctttaatcgcaacttttattggtattaaacttttc
ggttataccttaaacttgatgtcgttattaggtttatcactcgtggttggtatcctagtg
gatgatgcgattgtggttctggagaatattcaacgccacatggaaatgggtaaaaacaag
gttagagccgcatctgatgcaactcgtgaaattggttttacagtagtatccatcaccatg
gtaattgtagtggtattcttccctatcgcaattagttctggtttggtttcgaatatttta
cgccagttttgtgtagtggtaattatcgcaaccttactttcgttagttgcttcatttaca
attgtacctttacttttctctagatatggaaagttagagcatattgaaggtaaaaatgta
tttggtcgttttattttatggtttgaaaaacaattaaagaaatttaccatttggattacc
gctattttaacttggtctttaaatcataaaagacgtacaattgcagctgtatttgtatta
tttgtggcggcaatgtggttagctggcgcaggttttatcgggtcggagttttttcccaaa
tcggataaaggtgagttcttaattcaaattgagttaccaaaagatgcacctttagaaaaa
accaatttctacacgcaaagagctgaagcgtttctagataaacaaccagaaattgtacaa
ttaattacaacagtcggacaagccagtggtgactttggtggaacgcaagcgacagcctac
aaatcagaaattaacgtaaagttagtagaacgtgataaacgcgaaggcatgtcttctgat
attttcgctactaaaatgagtcgtgctttagcgaaagaattggttggagcaaaagtaaag
acagtgccaattagtattttaggtattgcagaaaatgccccgattagcttggtagtgatg
ggttctaacttagatagcgctttaaaatatgcagaaggcgcacaaaaactgcttaaaact
attcctggtgctacggagatcaaactttcggtagaaaaaggtacaccagaaatcaatgtt
caggtagatagagataaaatgtcggccgttggtttaaccttatcaacagttggttctaca
atgcaaactgcctttgcaggaaacactgatggtaaatataggaaaggcgaatatgagtac
gatatcaatattcaatatcaagatttcaatagaaaagatattgatgatgttcgtaatctg
atttttattaacgatcagggagctcaaattaagctttcacagtttgcaaatattaccgaa
ggttctggcccaagtcagttagaacgtttaaataaatcaacttcagtatcggtacaggcg
caatctattggtcgccctacaggtactgtagtggcagattttaaagcaaaattaattgaa
ctgcaaaaaaacggcaagttaaaagcgccaattggtgtaagttatacttggggtggtgat
gaagaaaatcaagcagaaggttttggtactttaggtgttgctttattggcgtcaatcatt
ttagtttacttaattatggtggcgctttatgatagttttatttatccgttagtagtaatg
ttctcgttaccgctggcgttaatcggagctttcttagcattggccttaaccaataactca
atcggtattttcactattttaggttttattatgctgatgggtttggtggcaaagaatgca
attatccttgtcgattttacaaaccacatgaaagccgaaggaaaaaatacgatagaagcg
cttattttagctaaccacgcacgtttacgcccgattttaatgacgaccattgcaatgatt
tttggtatgcttcctatcgctttggcgagtggtgcaggtgctgagtggaaaaacggtttg
gcatgggttattgtaggcggtttgacaagctcgttattcttaactttaattgttgtacca
gtagtttatttaattttcgatattatgttagataagctaggtttcaacaaaaaagtaaaa
accattgatgaattaatggcagaaccatacgatcataaagatgtattggaatacgatgtt
gaattagaaaaacattaa

DBGET integrated database retrieval system