KEGG   Pseudoalteromonas sp. A25: PA25_12620
Entry
PA25_12620        CDS       T07990                                 
Symbol
mexF
Name
(GenBank) resistance-nodulation-cell division (RND) multidrug efflux transporter MexF
  KO
K18299  multidrug efflux pump
Organism
psaz  Pseudoalteromonas sp. A25
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:psaz00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:psaz02000]
    PA25_12620 (mexF)
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:psaz01504]
    PA25_12620 (mexF)
Transporters [BR:psaz02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   PA25_12620 (mexF)
Antimicrobial resistance genes [BR:psaz01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexEF-OprN [MD:M00641]
    PA25_12620 (mexF)
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBN81277
UniProt: A0A5H2YED7
LinkDB
Position
1:1510327..1513500
AA seq 1057 aa
MSFSHFFIHRPIFAAMLSLVIFIAGALSLFQLPVSEYPEVVPPTVVVSASYPGANPKVIA
QTVATPLEQEINGTENMLYMFSQATSDGRMTLTVTFALGTDLDRAQVQVQNRVNSALPRL
PQEVQRLGVVAEKASPDLTMVVHLYSPENTHDTAYLSNYADLYVKDEIARLSGVGDVQLF
GGGKYAMRVWLNPDALASNQLTAMDVVNALREQNQQVAAGSLGAQPAADESQFQVLLNVR
GRLSSIEEFEQVVIKVGQQGAITRLKDVARVELGQSQYALRALLNGQPALAMPIFQRPGS
NAIELSDQVRATMARLSESFPQGVEYDIVYDPTVFVRGSIDAVIKTLLEAIVLVVLVVII
FLQTWRASIIPLIAVPVSLVGTFAVMQWLGVSINTLSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVE
RNIANGLTPIEATKRAMNEVTGPIIAIALVLCAVFIPTAFITGLSGQFYKQFALTITIST
IISAINSLTLSPALSALLLKPHNSAPDKLTVVLDKLFGRWLFAPFNRFFDASAQGYEKLV
KKLIRLSTVVAVLYLVLVGSTVKLFDAVPGGFIPAQDKQYLVAIAQLPDAASLDRTEAVT
REMERIALQVPGVANTVSFPGLSVNGFTNSPNSAIVFTPLEGFAERDDPSLSAMAIAAEL
NKRFTAIDEAFVAVFPPPPIQGLGTTGGFKLQIEDRGNKGFEALFSALQSVTNEARKDPA
LTGLFSSFRIQVPQMDIDIDREQALLQGIPLSEVFNALQVYMGSLYVNDFNLFGRTYQVT
AQAQAQSRLDPQQILALKVRNVRGDMVPLGSVLTATPTTGPDRVMHYNGYPSAELNGSPA
PGYSSDQAQQAIEAILAEHLPAGMAYEWTDVTYQQILAGNTMAYIFPLVVLLVFMVLAAQ
YESLRLPLAIILIVPMTIFSALLGVWWIGGDNNIFTQIALIVLVALACKNAILMVEFAKE
QTDSGQTSFEAIIRACRLRLRPILMTSIAFTAGVVPLVLATGAGAEMRHAMGVAVFFGML
GVTLFGLLFTPVFYMLVSTKKEQLKKQKNEEAGAQVL
NT seq 3174 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcgttttctcacttttttattcatcgaccaatatttgccgctatgttgtctttggtg
attttcatagcgggtgctttgagtttgtttcagctgccagtgagtgagtaccccgaagta
gtaccgcctacggttgtagtctcggcgagttaccccggtgcaaatccaaaagttatcgca
cagacggtggcaacccctttggaacaagagatcaatggtactgaaaacatgttgtacatg
ttttcacaggcaaccagtgatggtcgtatgaccttaacggtaacgtttgcgctgggcacg
gacttagatcgtgcccaagtacaagttcaaaatagggttaatagtgccttaccccgcctg
cctcaggaagtacagcgcttaggtgtggtagcagaaaaagcgtctccagatttgacgatg
gtggtacacctttactctcctgaaaatactcatgacactgcttatttatcaaactatgcg
gatctgtatgttaaagacgaaattgcgcgcttaagcggtgtgggtgatgtgcagttgttt
ggtggtggtaaatacgcgatgcgtgtgtggcttaacccagatgcattggcatctaatcag
ctgacagctatggatgttgttaatgcacttcgtgaacaaaatcagcaggttgctgccggt
agcttaggtgcgcaacccgctgctgatgagtctcagtttcaagtgttgctcaatgtgaga
ggacgtttaagtagtatcgaagaatttgagcaagttgttattaaagtggggcagcaaggg
gctatcacgcgccttaaagatgttgctcgtgtggaacttggacaaagccagtatgcacta
agagcgttgcttaatggccaacctgcgctggccatgcccatctttcagcgcccaggttcc
aatgccattgaactatcagatcaggttcgagcaacgatggcacgtctgagtgaatcgttc
ccgcaaggtgttgagtacgatattgtatatgatcccacggtgtttgtgcgaggctcgatt
gatgcggtgataaaaacgttgcttgaagcaatcgttttggtggtattggtcgttatcata
tttttgcaaacatggcgcgcctcaattattccactcattgcagtgcctgtgtctttggtc
ggcacttttgctgttatgcaatggctcggtgtttctatcaatacattgtcattatttgga
ttagtattggccattggcattgtggtcgatgatgcaatagtggtggttgagaatgtggag
cgtaacattgccaatggtcttacccctatagaagcaactaaacgagcaatgaatgaagtg
acagggccaattattgcgatagcattggtgttatgcgcagtgtttataccaacggcattt
atcacaggcttgtctgggcagttctataaacaatttgcattgactatcaccatatcaacg
attatttcggctattaactctttgacattatctccggcattgtcggcgttgctattaaaa
ccacataacagcgcaccagataagcttacggttgtattggataagttgtttggtcgttgg
ctatttgcaccgtttaaccgcttttttgatgcaagtgctcaagggtatgaaaagttagtt
aagaagctgatccgcttatctacagttgtagcagtattgtatctggtgctcgtaggttcc
actgttaagctgtttgatgcggtaccaggtggatttattcccgcgcaagataaacaatat
ttagtggcgattgcgcaattgcctgacgcagcgagccttgatagaactgaagctgtcacc
cgcgagatggaaagaatagcattacaggtgccgggtgttgcaaacacggtgtcattccct
ggcttgtcggtgaatggttttactaacagtcctaattcagccattgtttttactccgctt
gaaggttttgctgaacgtgacgacccaagcctatcagccatggcgattgccgctgagcta
aataagcgatttaccgccattgatgaggcatttgtagctgtatttccgccaccgccaatt
caaggtcttggcaccactggtgggtttaaactgcaaatcgaagaccgaggcaataaaggg
tttgaagcattattttctgcattacagagcgtaactaatgaggctcgaaaagatcccgcg
ttaacgggcctattttcaagctttagaattcaagtgccacagatggatattgatatagat
agagagcaagcattattgcaaggtattccactatcggaagtctttaatgcgctacaagtc
tatatggggtcgctgtatgtgaatgacttcaatctatttggtcgtacttatcaagttacc
gcgcaagctcaggcgcaaagccgtttagaccctcaacagattttagctttaaaagtgcgc
aatgtgcgcggggatatggtgcctttaggctctgttttaaccgcaacgccaactactggg
ccagacagagtgatgcactacaatggctatccaagtgcagagcttaatggcagcccagca
cctggctacagttcagatcaggcacaacaagcaatagaagcaatattggccgaacattta
ccagccggtatggcttatgagtggaccgatgtgacctatcagcaaatattggcgggtaac
accatggcatatattttcccgttggtcgtgctgttggtgtttatggtgttagcggcacaa
tatgagagtttacgcttacctttagcgattattttaatagtacccatgaccatattttca
gctttattgggagtatggtggataggtggcgataataatattttcacccagatagcactg
attgttttggtggctttggcctgtaaaaatgccattcttatggtggaatttgccaaagaa
caaacggactctgggcaaacgtcttttgaggcaattattcgcgcctgtcgattgcgttta
cggccaatattaatgacgtcgattgcgtttaccgcaggcgttgtacctttagtacttgca
accggtgccggagcagaaatgcgccatgccatgggggttgctgtgttttttggcatgctt
ggtgttaccttatttggcttactgtttaccccagtgttttatatgctggtaagcaccaaa
aaagagcagcttaaaaagcaaaagaatgaggaggcaggcgctcaggttttatag

DBGET integrated database retrieval system