Pseudoalteromonas sp. A25: PA25_12620
Help
Entry
PA25_12620 CDS
T07990
Symbol
mexF
Name
(GenBank) resistance-nodulation-cell division (RND) multidrug efflux transporter MexF
KO
K18299
multidrug efflux pump
Organism
psaz
Pseudoalteromonas sp. A25
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
psaz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
psaz02000
]
PA25_12620 (mexF)
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
psaz01504
]
PA25_12620 (mexF)
Transporters [BR:
psaz02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
PA25_12620 (mexF)
Antimicrobial resistance genes [BR:
psaz01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexEF-OprN [MD:
M00641
]
PA25_12620 (mexF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBN81277
UniProt:
A0A5H2YED7
LinkDB
All DBs
Position
1:1510327..1513500
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MSFSHFFIHRPIFAAMLSLVIFIAGALSLFQLPVSEYPEVVPPTVVVSASYPGANPKVIA
QTVATPLEQEINGTENMLYMFSQATSDGRMTLTVTFALGTDLDRAQVQVQNRVNSALPRL
PQEVQRLGVVAEKASPDLTMVVHLYSPENTHDTAYLSNYADLYVKDEIARLSGVGDVQLF
GGGKYAMRVWLNPDALASNQLTAMDVVNALREQNQQVAAGSLGAQPAADESQFQVLLNVR
GRLSSIEEFEQVVIKVGQQGAITRLKDVARVELGQSQYALRALLNGQPALAMPIFQRPGS
NAIELSDQVRATMARLSESFPQGVEYDIVYDPTVFVRGSIDAVIKTLLEAIVLVVLVVII
FLQTWRASIIPLIAVPVSLVGTFAVMQWLGVSINTLSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVE
RNIANGLTPIEATKRAMNEVTGPIIAIALVLCAVFIPTAFITGLSGQFYKQFALTITIST
IISAINSLTLSPALSALLLKPHNSAPDKLTVVLDKLFGRWLFAPFNRFFDASAQGYEKLV
KKLIRLSTVVAVLYLVLVGSTVKLFDAVPGGFIPAQDKQYLVAIAQLPDAASLDRTEAVT
REMERIALQVPGVANTVSFPGLSVNGFTNSPNSAIVFTPLEGFAERDDPSLSAMAIAAEL
NKRFTAIDEAFVAVFPPPPIQGLGTTGGFKLQIEDRGNKGFEALFSALQSVTNEARKDPA
LTGLFSSFRIQVPQMDIDIDREQALLQGIPLSEVFNALQVYMGSLYVNDFNLFGRTYQVT
AQAQAQSRLDPQQILALKVRNVRGDMVPLGSVLTATPTTGPDRVMHYNGYPSAELNGSPA
PGYSSDQAQQAIEAILAEHLPAGMAYEWTDVTYQQILAGNTMAYIFPLVVLLVFMVLAAQ
YESLRLPLAIILIVPMTIFSALLGVWWIGGDNNIFTQIALIVLVALACKNAILMVEFAKE
QTDSGQTSFEAIIRACRLRLRPILMTSIAFTAGVVPLVLATGAGAEMRHAMGVAVFFGML
GVTLFGLLFTPVFYMLVSTKKEQLKKQKNEEAGAQVL
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgttttctcacttttttattcatcgaccaatatttgccgctatgttgtctttggtg
attttcatagcgggtgctttgagtttgtttcagctgccagtgagtgagtaccccgaagta
gtaccgcctacggttgtagtctcggcgagttaccccggtgcaaatccaaaagttatcgca
cagacggtggcaacccctttggaacaagagatcaatggtactgaaaacatgttgtacatg
ttttcacaggcaaccagtgatggtcgtatgaccttaacggtaacgtttgcgctgggcacg
gacttagatcgtgcccaagtacaagttcaaaatagggttaatagtgccttaccccgcctg
cctcaggaagtacagcgcttaggtgtggtagcagaaaaagcgtctccagatttgacgatg
gtggtacacctttactctcctgaaaatactcatgacactgcttatttatcaaactatgcg
gatctgtatgttaaagacgaaattgcgcgcttaagcggtgtgggtgatgtgcagttgttt
ggtggtggtaaatacgcgatgcgtgtgtggcttaacccagatgcattggcatctaatcag
ctgacagctatggatgttgttaatgcacttcgtgaacaaaatcagcaggttgctgccggt
agcttaggtgcgcaacccgctgctgatgagtctcagtttcaagtgttgctcaatgtgaga
ggacgtttaagtagtatcgaagaatttgagcaagttgttattaaagtggggcagcaaggg
gctatcacgcgccttaaagatgttgctcgtgtggaacttggacaaagccagtatgcacta
agagcgttgcttaatggccaacctgcgctggccatgcccatctttcagcgcccaggttcc
aatgccattgaactatcagatcaggttcgagcaacgatggcacgtctgagtgaatcgttc
ccgcaaggtgttgagtacgatattgtatatgatcccacggtgtttgtgcgaggctcgatt
gatgcggtgataaaaacgttgcttgaagcaatcgttttggtggtattggtcgttatcata
tttttgcaaacatggcgcgcctcaattattccactcattgcagtgcctgtgtctttggtc
ggcacttttgctgttatgcaatggctcggtgtttctatcaatacattgtcattatttgga
ttagtattggccattggcattgtggtcgatgatgcaatagtggtggttgagaatgtggag
cgtaacattgccaatggtcttacccctatagaagcaactaaacgagcaatgaatgaagtg
acagggccaattattgcgatagcattggtgttatgcgcagtgtttataccaacggcattt
atcacaggcttgtctgggcagttctataaacaatttgcattgactatcaccatatcaacg
attatttcggctattaactctttgacattatctccggcattgtcggcgttgctattaaaa
ccacataacagcgcaccagataagcttacggttgtattggataagttgtttggtcgttgg
ctatttgcaccgtttaaccgcttttttgatgcaagtgctcaagggtatgaaaagttagtt
aagaagctgatccgcttatctacagttgtagcagtattgtatctggtgctcgtaggttcc
actgttaagctgtttgatgcggtaccaggtggatttattcccgcgcaagataaacaatat
ttagtggcgattgcgcaattgcctgacgcagcgagccttgatagaactgaagctgtcacc
cgcgagatggaaagaatagcattacaggtgccgggtgttgcaaacacggtgtcattccct
ggcttgtcggtgaatggttttactaacagtcctaattcagccattgtttttactccgctt
gaaggttttgctgaacgtgacgacccaagcctatcagccatggcgattgccgctgagcta
aataagcgatttaccgccattgatgaggcatttgtagctgtatttccgccaccgccaatt
caaggtcttggcaccactggtgggtttaaactgcaaatcgaagaccgaggcaataaaggg
tttgaagcattattttctgcattacagagcgtaactaatgaggctcgaaaagatcccgcg
ttaacgggcctattttcaagctttagaattcaagtgccacagatggatattgatatagat
agagagcaagcattattgcaaggtattccactatcggaagtctttaatgcgctacaagtc
tatatggggtcgctgtatgtgaatgacttcaatctatttggtcgtacttatcaagttacc
gcgcaagctcaggcgcaaagccgtttagaccctcaacagattttagctttaaaagtgcgc
aatgtgcgcggggatatggtgcctttaggctctgttttaaccgcaacgccaactactggg
ccagacagagtgatgcactacaatggctatccaagtgcagagcttaatggcagcccagca
cctggctacagttcagatcaggcacaacaagcaatagaagcaatattggccgaacattta
ccagccggtatggcttatgagtggaccgatgtgacctatcagcaaatattggcgggtaac
accatggcatatattttcccgttggtcgtgctgttggtgtttatggtgttagcggcacaa
tatgagagtttacgcttacctttagcgattattttaatagtacccatgaccatattttca
gctttattgggagtatggtggataggtggcgataataatattttcacccagatagcactg
attgttttggtggctttggcctgtaaaaatgccattcttatggtggaatttgccaaagaa
caaacggactctgggcaaacgtcttttgaggcaattattcgcgcctgtcgattgcgttta
cggccaatattaatgacgtcgattgcgtttaccgcaggcgttgtacctttagtacttgca
accggtgccggagcagaaatgcgccatgccatgggggttgctgtgttttttggcatgctt
ggtgttaccttatttggcttactgtttaccccagtgttttatatgctggtaagcaccaaa
aaagagcagcttaaaaagcaaaagaatgaggaggcaggcgctcaggttttatag
DBGET
integrated database retrieval system