KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00025356001
Entry
GSPATT00025356001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14314  nuclear pore complex protein Nup210
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm03013  Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    GSPATT00025356001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ptm03019]
    GSPATT00025356001
Messenger RNA biogenesis [BR:ptm03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Nuclear pore complex
     GSPATT00025356001
SSDB
Motif
Pfam: Ig_NUP210_2nd Ig_NUP210_5th Ig_NUP210_9th
Other DBs
NCBI-GeneID: 5045802
NCBI-ProteinID: XP_001460019
Genoscope: GSPATT00025356001
UniProt: A0EBF5
LinkDB
Position
undetermined
AA seq 1439 aa
MPSQSFIYVNSKSQDASQFIVEVVVQEISKLSIITKQKQLDLDTQEELHVQAYDDKGNTF
TTLEGLKFEWRVGALEMVKFSESGLKVSEKRARLEFNSDIIVVKGKKEGKETVFTRVVEK
KYYETKIETNVDLVVIQKFQFSPDYPVYYLPTHSVIQFHLLRADGKTRIKLPSQTHLWST
TSKVSTIDQNGVLTTQNIERNLNLKVINSEYNQIQAIYHVVNPKYIDIDIWEDGKEKREG
KVTHLIVGKLYRFQAYLKDESHQRIYSTDVFSYDSKDITLNEQTVISDRERQNVKLTFQR
GTLESSVTIHFVKPIQISTIFKTYIHLPIYEQYNLVVTGGSGSYKYQQRYQSPTIFEIKS
SHILAAIELGENTLTIYDEFNVYNSLEVTVYVTDVSQILPFERRKELIVNESDDTFYQAI
GDPKVGNYTQCRAVKFTIDNFDIFTTSQIAGDLSNYLVCNGLKMQSATPGQYNLQINTQK
ISVTQQVRVYDYLHFDKPFYYVTPHSTITTKVLGGPTTWDQTPYNEKLSEGIIKIDMEKY
HFNCFQSKAEFRITRINKQSDLLPNPKLVSNSLPVKCLLPEAFKIYNEKNQEVNWLFKEE
TVQISVVALYQNFLFYNSSSLHLDHSTRGLKYQNRYLSYDIQSGISDCKFIVASNSYNNH
KDTFLTIRSELDLIIHHTLKLIPSGEQYVLIDQSVLFRIESSTNNIQCQYDSNIIGCEKD
QVTITPKKLGQFQLVVYDLSLNYSVSATLNVIDPSQLNLELSQQITVVGNSINATSAFNY
YKRQVHVTTWSSLRLIDTYGFNNINQVNNQFLITPNREGLFKLQTQYDSINSNQVDLKVI
PKLQADTVYMPTECETHVLFPSYSQFTYSAISNENIETSVSQNIVTIKSKKINGNYIVTV
FLRQSNILIDSVDIPVVVNKPNRAILYYGRKIELGSSVRIVADFLIQDHQMNLCLCPTHK
IHWYQDEKLVQTAPNSLGFSVSTVVVGKINIKIKAYDLEAQTLLEVERLNSYTRNLFINT
KALYHIPLLVPTNSRLALGQEIKSVEQLNMNLPNIIESDSITLQPQLLLATTPMLIQVEE
IYQMYPMSEFVNLKVDEKIEIPIAYLNQEGYQFEDIEDNKLEVLGYTRHIVQIKVNNNGI
EIQGLDQGFALIKLSCGNNKIDYILVKVGATLLQMKAYLGSTITYQMDNSEKPIWNSNCG
NFKGSQLTIEKELNECYVEVNDQGNKFKAGLEVIRPSHIIIDSNKVDNYLNIKLNVNPKI
PQSNKVNPNFDIKIEVDQPQWFELVKTDNLFEYNIKPIIAQDNTPMPKKVKVNAFISNQF
IQLDGSKEIVYEREFYLPNNEVIIQNSQPIQTLRIPYYRNIEKTHQDNHLLGLITTSFSQ
GRVEIQFDFSQCHEPTEGDAYFENGQKIRVKFVQESSYEFIIFLAALVFFILVLMNYFR
NT seq 4320 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgccaagctaatcatttatatatgtaaattcgaagtcccaagatgcatctcaatttata
gtggaagtagtagtacaggaaataagcaaattgagcataattactaaataaaaataattg
gatttggatactcaagaagaattgcatgtttaagcatatgatgacaaaggaaatacattc
acaacattggaaggccttaaatttgaatggagagtcggtgcattggaaatggttaagttt
tctgaatccggactaaaagtatcagagaaaagagcaagattagagtttaatagtgatatc
attgtggtgaagggaaagaaagaagggaaagaaacagtatttactagagtggtagagaag
aaatattatgaaaccaaaatagaaactaatgtagatttagttgtaatttaaaaattttaa
ttttcccctgattatccagtatattacttaccaacacattctgttatctaattccatcta
ttgagagcagatggaaaaacaagaataaaattaccaagtcaaactcatttatggagtaca
acatccaaagtatcaaccattgatcagaatggtgttttgacaacatagaatattgagagg
aatttgaatctaaaggtaatcaattctgagtacaattaaatccaagcaatctatcatgta
gtgaatcctaagtacattgatattgatatttgggaagatggcaaagagaagagagaagga
aaggtgactcatttaatagtaggaaaattgtacagattctaagcctatctcaaggatgaa
tcacattaaagaatatattcgacagatgtattctcctatgattctaaagatataacattg
aacgagtagaccgtcatatcagatagagagagacaaaatgttaaattaacattccaaaga
ggaacattggaatcctctgttactattcactttgttaagcctatataaatttcaacaatc
tttaaaacctacatccacctcccaatctacgaacaatataacttagttgtcactggagga
tcaggatcttataaatattagtaaagatatcaatcacctactatttttgaaattaaaagt
tctcacatacttgcagctatagaacttggagagaacaccttaacaatctatgatgaattt
aatgtctataacagtttagaagtgactgtctatgtgactgatgtcagctaaatacttcca
tttgagaggagaaaagaattgatagtgaatgaatccgatgacacattttatcaagccatt
ggagatcctaaagttggaaactatacttagtgcagagcagttaagtttactattgataat
tttgatatattcaccacatcataaatagctggagatctctctaactatttagtttgcaat
ggtttgaaaatgcaatcagcaacaccaggtcaatataatcttcaaattaacactcaaaag
atctctgtaacacaataagtcagagtctatgactacttgcatttcgataagccattttat
tatgtgactcctcattctactattacaactaaggttttgggaggaccaacaacttgggat
taaacaccatacaatgagaagctgtcagaaggtattatcaaaatagacatggaaaaatat
catttcaattgtttctagagcaaagctgaattcagaattacaagaatcaataaacaatca
gatttattgcctaatccaaaattagtgagcaatagtctacctgtaaaatgcttattacca
gaagcattcaaaatttataatgaaaagaatcaagaagtaaattggttattcaaagaagaa
actgtttaaattagtgtggtggctctctattagaatttcttattctacaattccagcagt
ttgcatttagaccattcaactagaggattaaaatattaaaatagatatttatcatatgat
atttaatcaggaatctctgattgtaaattcattgtggcttcaaattcttacaacaatcat
aaagacacattccttaccataaggagtgaattagacttaatcatccatcacactttaaaa
ctgataccaagtggagaacaatatgtcctgattgattaaagtgttttattcagaatagaa
tcatcaaccaacaatatacaatgctaatatgatagcaatattattgggtgcgagaaggat
taagttactattactccaaaaaaattaggttaattctaattagtagtttacgatttatcc
ttaaattacagtgtctcagccacccttaatgtaatcgacccatctcaattgaatttggaa
ttaagttaatagatcactgtagtcggaaattcaatcaatgcaacctctgcattcaattat
tataagagataagtacatgtgacaacttggtcatcactaagattgattgatacctatgga
ttcaacaatattaactaagtcaataatcagtttttgatcactcccaatagagaaggctta
ttcaaattataaacacaatacgattcaatcaattctaatcaagtcgatttgaaagtaata
cccaagctgtaagctgatactgtctacatgccaaccgaatgtgagactcatgtgttgttc
ccctcctattcttagttcacttattcagccatttccaatgagaatattgagacttcagtt
agtcaaaacatagttactattaaatccaaaaagataaatggaaattacatagtcacagta
tttttaagataatctaacatactaattgactcagtcgatatacctgtagtagtgaataaa
ccaaatagagcaattttatactatggcagaaaaattgaattaggttcatcggttagaata
gtggctgacttccttatacaagatcattagatgaatctttgtttgtgtccaacacataaa
atacattggtaccaagatgaaaagttggtttagacagctccaaattctttgggattttct
gtttcaacagttgtagttggaaaaattaatatcaaaatcaaagcctatgatttagaggct
tagactttacttgaagtagaaagattaaactcttacaccaggaacctatttattaacacc
aaagccttgtatcatattccacttctagttcctacaaacagcaggttggctttgggataa
gaaatcaagagtgttgaacaattgaacatgaacctcccaaatattattgaaagtgatagc
atcaccttgcaacctcaattactattagccacgactccaatgttaatacaagtagaagaa
atctatcaaatgtatcctatgtcggaatttgttaatttgaaagtggatgagaaaatagaa
attccaattgcctacttgaattaagaaggatatcaatttgaagatatagaagacaacaaa
ctcgaggtcttgggatatactagacacatagtgtaaattaaggtgaataataatggaatt
gaaatttaaggtttggatcaaggatttgcattgatcaaattaagttgtggaaataacaaa
attgattatatccttgtaaaggtaggagccactctattgtaaatgaaggcttatcttgga
tccacaatcacatattaaatggataattccgagaaaccaatatggaattccaattgtggt
aacttcaagggaagttaattgacaattgaaaaggagttgaatgaatgctacgttgaggtt
aatgattaaggcaacaagttcaaagctggactcgaagtcattagaccctctcatataatc
attgattcaaataaagtggataactatttgaacatcaaattgaatgtcaatcctaaaata
ccctaatccaataaggtcaatcctaactttgatattaaaattgaagtcgatcaacctcaa
tggtttgaattggtaaagactgacaacctctttgaatataatatcaaacctattattgct
caagataatactcctatgccaaagaaggtgaaggttaacgcattcatctccaatcaattc
atataattggatggcagcaaggaaatagtctatgagagagaattctatcttccaaacaac
gaagtgatcatttaaaatagtcaaccaatccaaaccttgagaattccttattatagaaac
attgaaaaaactcatcaagacaatcatttactaggattgataaccacatcattttctcaa
ggccgagttgagatttagtttgattttagccaatgtcacgaaccaacagaaggagatgct
tattttgagaatgggtaaaaaataagagtcaaatttgtctaagagtctagttatgaattc
atcatatttttagcagcactagtcttctttatcttagtattaatgaattatttcagatga

DBGET integrated database retrieval system