Candidatus Pelagibacter ubique: SAR11_0945
Help
Entry
SAR11_0945 CDS
T00257
Symbol
ispD
Name
(GenBank) IspD/ispF bifunctional enzyme
KO
K12506
2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase / 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase [EC:
2.7.7.60
4.6.1.12
]
Organism
pub
Candidatus Pelagibacter ubique
Pathway
pub00900
Terpenoid backbone biosynthesis
pub01100
Metabolic pathways
pub01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pub00001
]
09100 Metabolism
09109 Metabolism of terpenoids and polyketides
00900 Terpenoid backbone biosynthesis
SAR11_0945 (ispD)
Enzymes [BR:
pub01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.60 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase
SAR11_0945 (ispD)
4. Lyases
4.6 Phosphorus-oxygen lyases
4.6.1 Phosphorus-oxygen lyases (only sub-subclass identified to date)
4.6.1.12 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase
SAR11_0945 (ispD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YgbB
IspD
NTP_transf_3
CTP_transf_3
NTP_transferase
Fe-ADH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ21757
UniProt:
Q4FM31
LinkDB
All DBs
Position
complement(928972..930087)
Genome browser
AA seq
371 aa
AA seq
DB search
MNSCFIILAGGESKRFNSNTPKPYTNYKGKPLLLHSIDKAKVFNKFNKIVLVVNKKHKNF
IKKLNIKNIRIITGGKTRAESAYNALKSIKENNFKNVIIHDAARPNFSLKLLNKLMNELK
LNDCVIPAIQTADTVKQKISNNVKNLKRENIYLIQTPQAFNYKKLFELQNNKSEEVTDDA
NLFVRAGKKIKIIKGETTNNKITINSDIKFNNLIKFGIGFDVHRLVPNKKLYLGGVKIPS
PIGTLGHSDGDPVLHAVTDAILGACSMGDIGEKFSDKNKKFKNIRSTILLSEIIKQTLKK
GYLINNLDINIITQKPKIQKYKKQILNCIAKICNISPTQINIKGKTTEKLGVIGKEKAIA
CEVIASVIKND
NT seq
1116 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagttgctttataatacttgctggaggtgaaagtaaaagatttaattcaaatact
ccaaaaccctacacaaattataaaggtaaacctttattattgcattcaattgataaagct
aaagtttttaataaatttaataaaattgttctggtagtaaataaaaaacacaaaaatttt
atcaagaaacttaatattaaaaacatcagaattatcacaggtggaaaaacaagagcagag
tctgcttataatgccttaaaaagtattaaagaaaataattttaaaaatgtaataattcat
gatgctgcaagaccaaatttttctttaaaacttttaaataaattaatgaatgaattaaaa
ttaaatgattgtgtaattcccgcaattcaaactgcagatacagttaagcagaaaatatcg
aataatgttaaaaatttaaaaagagaaaatatttacttaatccaaacacctcaagcattt
aactataaaaaactttttgaacttcaaaataataaaagtgaggaagttactgatgatgct
aacttatttgtaagagctggtaaaaaaataaagattataaagggcgaaactactaataat
aaaattacaataaattcagatattaaatttaataatttaataaaatttggaataggtttt
gatgttcataggttagtgcctaacaaaaaactttatttaggtggggttaaaataccctca
cctattggcacattaggtcattctgatggagatcctgtgttacatgctgtaacagatgct
atacttggagcgtgttctatgggtgatattggtgaaaaattctcagataagaataagaaa
tttaaaaatattagatctacaattctattaagtgaaataattaagcaaactctaaaaaaa
ggttatctaataaataatcttgatattaatatcattactcaaaaacctaaaattcaaaaa
tataaaaaacaaatattaaactgtattgcaaaaatttgtaatatctctcccactcaaatt
aatataaaaggtaaaacaactgaaaagttaggtgtaattggtaaagaaaaagctatagct
tgtgaagttatagcctcagttattaaaaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system