Polaribacter sejongensis: NQP51_01355
Help
Entry
NQP51_01355 CDS
T08505
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
pun
Polaribacter sejongensis
Pathway
pun01501
beta-Lactam resistance
pun01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pun00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
NQP51_01355
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
NQP51_01355
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pun02000
]
NQP51_01355
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
pun01504
]
NQP51_01355
Transporters [BR:
pun02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
NQP51_01355
Antimicrobial resistance genes [BR:
pun01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
NQP51_01355
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWD32327
LinkDB
All DBs
Position
396242..399415
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MKLAEISIKRPSLIIVLFTILIIGGLFSYSQLSYELVPKFETNVITVSTVYPGASPNEIE
NTVTKKIEDAVSSLENIKKIDSKSYESLSTVMITLTSNANADYSINEAQRKINSILADLP
KDADPPSLIKFSLSDLPIMTIGTNGKMDEAEFYDLIDKKISPVLSRIDGVAQVNIIGGQE
REIQVNLNATKLQGYGLSVPQVQQIILASNLDFPTGSIQTREQKILIRLAGKYKNVDELR
NLVVSSQNNIQIRLKDIADVQDTQKNAEKIARVNQKSAIILQIIKQSDANAVAVSDKVVS
TIKLLENDYKTNQLKFNIAKDSSRFTLEASDSVIHDLMIAVFLVAFVMLFFLHSIRNSLI
VMVSIPASLIATFIGIYLLGYTLNLMSLLALSLVVGILVDDAIVVLENIYRHMEMGKNRV
RAAYEGTSEIAGTVTSITLVIVVVFLPIALSSGLVSDIITQFCVTVIISTLFSLLASFTL
IPWLSSRFGKLEHIEGKNFFGRIILRFESFLTNFTNWISRILTWCLDYYKTTLIIVLVLF
FSSVALLPAGFIGSEFFAASDSGEFLVQIEMPKNASLEQTNFMTQKAEAFLNSKKYVYSQ
YSTVGQTSEGMGAAQATAYKAEINVKMIDQNERTDGATVFAAKIKRELEKVLVGAKVKTV
PVGLLGSAENATLALVVTGPNVESAMKFAKLAELELRKIAGTTEIKLTVEEGSPEVNVQV
DRDKMSALGLTLQTVGVTMQTAYSGNTDGKFRGGEYEYDINIKYNAFDRKNINDVSNLIF
VNNIGQQIKLSQFAAITEGSGPSQLERRDKSPSVTVQGQNVGVSSGTIVTQWQEKLDKLE
KPIGVNYIWSGDQENQSEGFGTLGIALLAAIILVYLVMVGLYDSFIHPFVVLFAVPLSFI
GALLALALTNNSLNIFTILGIIMLIGLVSKNAIMLVDFTNQRRAAGESIRTALIQANHAR
LRPILMTTIAMVFGMIPIAIASGAGAEWKNGLAWVIIGGLISSLFLTLVVVPVIYEIMEK
IVDKLTKGESVDYEAAMHEVYEHHDLSEDGYTPKHEM
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattagcagaaatatccataaaaagaccttcactaattattgtgctttttacaatt
ctaattattggtgggcttttcagttatagtcaattaagttacgaattagtcccaaaattt
gaaacaaatgtaatcaccgtttcaaccgtatatcccggagcgtctccaaatgagattgaa
aataccgttactaagaaaattgaagatgcagtttcctcgttagaaaatattaaaaaaatt
gattctaaatcttatgaaagtctttcaacagtaatgattacattgacatcaaatgccaat
gcagattattcaataaacgaagcacaacgtaaaattaattcaattctagcagatttacct
aaggatgcagatcctccttcattaataaaattttctttaagtgatcttccaatcatgact
attggaaccaatggaaaaatggatgaagctgaattctatgatttaattgataaaaaaata
tcgcctgtgttatcccgtattgatggtgtggcacaagtaaatattattggtggtcaagag
cgtgaaattcaagtaaatttaaatgcaacaaaacttcaagggtacggtttatcagtacca
caagtgcaacaaatcattttagcatctaacttagattttccaacaggaagtattcaaact
agagaacagaaaatattaattcgattagcaggtaaatataaaaatgttgatgaattaaga
aacttggtagtatcctctcaaaacaatattcaaattcgtttaaaagatattgcagatgtt
caagacactcaaaaaaatgctgaaaaaatagcacgtgtaaatcaaaaaagcgcaattatt
ttacaaattataaaacaatcagatgccaatgcagttgctgttagtgataaggttgtaagt
acaataaaattacttgaaaatgattataaaacaaaccaattaaaatttaacatagctaaa
gatagtagtcgttttacattagaagcatctgattctgttatacatgatttaatgattgct
gtatttttggtagcttttgtaatgctgtttttcttacatagcattagaaattctttaatt
gtaatggtttccattcctgcatctttaattgcaacatttataggtatttacttacttgga
tatacactaaacttaatgagtttattggcattatcactagttgttgggattcttgttgat
gatgcaattgttgtgcttgaaaatatttataggcatatggaaatggggaaaaatagggtt
cgtgcagcttatgagggcacttctgaaatagcaggaacggtaacttcaattaccttagta
attgttgtagtttttttaccaattgcattgagttctggtttagtttccgacattatcacc
caattttgtgttaccgtaattatttctacattattttctttattagcgtctttcactctt
attccttggttatcctctcgttttggaaaactagagcatatagaaggtaaaaatttcttt
ggaagaattattctacgttttgaaagctttctaacgaattttacaaactggatttctaga
atactaacttggtgtttagattattataaaactactttaattattgttttagtgttgttt
tttagttctgtagcacttcttcctgctggatttattggtagtgaattttttgcggcatct
gatagtggtgagtttttagttcaaattgaaatgcctaaaaatgcttcattagagcaaacc
aactttatgactcaaaaagcagaagcttttttaaattcaaaaaaatatgtttacagtcag
tattcaactgttggtcaaaccagtgaaggaatgggggctgctcaagctacggcatacaaa
gctgaaattaatgttaaaatgattgaccaaaacgaacgtacggatggtgctactgttttt
gctgcaaaaataaaacgagaattagaaaaggttttagttggtgctaaagttaaaacggtt
cctgttggtcttttaggatcagccgaaaatgcaacattagcattggttgttacaggtcca
aatgtagaaagtgccatgaaatttgccaaattagcagagttagaattacgtaaaattgca
ggaactactgaaattaaactaactgttgaagagggaagtccggaagttaatgttcaagta
gatcgagataaaatgtctgctttaggtttaacacttcagacagtaggtgtaactatgcaa
acagcttatagtggtaatacagatggaaaatttagaggcggtgaatacgaatatgacatt
aatattaaatacaatgcatttgatagaaaaaacattaatgatgttagtaatcttattttt
gtgaataacattggacaacaaattaagttatcacaatttgcagcaatcactgaaggttct
ggtccaagtcaattagaacgaagagataaatctccttcggtaactgttcaaggacaaaac
gttggagtttcatcaggaacaattgtaacacaatggcaagaaaagcttgataaattagaa
aaaccaattggagttaattatatttggagtggagatcaagaaaaccaaagtgaaggtttt
ggtactttaggaattgcactattagctgctattatattagtttatttagtaatggtgggg
ctttatgatagttttattcatccatttgtagttttgtttgctgttccattatcatttatt
ggagcgttgttagcattggccttaactaataattcattaaatatatttactattcttggt
attattatgctaattggtctagttagtaaaaatgccattatgttggtagatttcaccaac
cagcgaagagctgcaggagaatctattagaacagctttaattcaggctaatcacgctagg
ttacgtccaattttaatgacaactattgctatggtgtttggtatgataccgattgcgatt
gcttcaggagcaggtgcagaatggaaaaacggtttggcttgggtaattattggaggatta
attagttctctttttcttacgctggtggttgtgcctgtaatttatgaaataatggaaaaa
atagttgataaattaactaagggtgaatctgtagattatgaagcagcaatgcatgaagtt
tacgaacatcatgatttgagtgaagatggatatactcctaagcacgaaatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
