KEGG   Rodentibacter caecimuris: FEE42_09655
Entry
FEE42_09655       CDS       T06473                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
rhey  Rodentibacter caecimuris
Pathway
rhey01501  beta-Lactam resistance
rhey01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rhey00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    FEE42_09655
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    FEE42_09655
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rhey02000]
    FEE42_09655
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:rhey01504]
    FEE42_09655
Transporters [BR:rhey02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   FEE42_09655
Antimicrobial resistance genes [BR:rhey01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    FEE42_09655
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL
Other DBs
NCBI-ProteinID: QIA77586
LinkDB
Position
1959918..1963073
AA seq 1051 aa
MKFTDIFIRRPVLAVSISLLIIILGLQAISKLAVREYPKMTTTVITVATAYPGADANLIQ
AFVTSKLEESIAQADNIDYMSSSSAPSSSIITVKMKLNTDPAGALADVLAKVNAVRSELP
SGIEDPTVSSSSGGSGIMYISFRSKKLDSSQVTDYINRVVKPQFFTIEGVAEVQIFGAAE
YAMRIWLDPQKMAGQNLSASQVMSALSANNIQTAAGSDNGYYVIYRNKVETTTKSVEQLG
NLIVASNGDDLVRLRDIATVELNKESDNSRATANGADSVVLGINPTSSANPLTVAEKIRP
LYESIKNQLPDSMETDILYDRTIAINSSINEVIKTIVEATVIVLVVILMFIGSLRAILIP
VLTIPISLIGVLMMLQSLDFSINLMTLLALILAIGLVVDDAIVVLENVDRHIKEGETPFR
AAIIGTREIALPVISMTVSLIAVYSPMALMGGITGTLFKEFALTLAGSVFISGIVALTLS
PMMTSKLLKSNAEPTWMERKVEHTLSRMNNVYNYMLDIVMQNRKSMVVFAVAIFSTLPFL
FNSLSSELTPNEDKGAFIAIGSAPSNVNVDYIQNAMQPYMKTVMDTEEVSFGMSIAGAPS
SNQSLNIVTLKDWKARSRKQSEVMNELNTKAKGLPEVSISAFNFPEIDTGEQGPPVSIVL
KTAQDYNALANTAEKFLQAMRASGKFVYTNLDLKYDTAQMTISVDKEKAGTYGITMQQIS
NTLGSFLSGATITRVDIDGRAYKVISQVKRDDRLSPESFKNYYLNASNGEAVPLSSLVSM
KLETQPTSLPRFSQLNAATIQAVPMPGTSTGDAVAWLQEHADTTLPQGYTYDFRSESRQL
IQEGNALALTFVLAVVIIFLVLAIQFESIRDPLVIMISVPLAVSGSLVVLNLPSALQGFL
GFIGHITGIAAIAQFGQSITMTGYTLNIYSQVGLITLVGLITKHGILMCEVAKEEQLLHG
KNRIDAITAAAKVRLRPILMTTAAMVAGLIPLLYATGAGAVSRFSIGIVIVAGLSIGTIF
TLFVLPVVYSYVATEHKPLPVFEENESKTAH
NT seq 3156 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatttactgatatatttattcgtcgtcccgttttagcggtttcgattagcctgctt
atcattattttaggcttgcaggctatttcaaaattagcggtgcgtgaatatcctaaaatg
acaactacggtgattaccgtagcaacagcttatccgggggctgacgcgaatttaattcaa
gccttcgttacctccaagttggaagagtcgattgctcaagcggataatattgactatatg
tcttcatccagcgcgccgagttcttctattattaccgtaaaaatgaagctgaatacggat
cctgccggtgcgttggctgatgtattggcgaaagtaaatgcggtacgttccgaattacca
agcgggattgaagacccgacggtgtcgtcttcatcgggtggttccgggattatgtatatt
agtttccgctctaaaaagttggattccagccaagtaacggactatatcaaccgcgtagtg
aaaccacaattctttacgattgaaggtgtggcggaagtccaaatttttggtgcggcggaa
tatgcaatgcgcatttggcttgatccgcaaaaaatggcgggacaaaatctttcggcttcg
caagtcatgtccgcactttctgctaataacattcaaactgccgcagggagtgataacggt
tattatgtgatctaccgtaataaggttgagacaaccaccaaatccgttgaacaattaggt
aatttaatcgttgcctcgaatggggatgacttagtccgtttgcgtgatattgcaaccgtt
gaattgaataaagaaagtgataattcacgggcaacagcgaatggtgcggattctgttgta
ttaggtattaatccaacctcttcggctaacccattaacggtggctgaaaaaatccgtcca
ctctatgagagcattaaaaatcagcttccggacagtatggaaacggatattctttatgac
cgcaccattgcgattaatagttctattaacgaggtgattaaaactatcgttgaagcaacg
gtaatcgtactcgtggtgattttgatgtttatcggttcattacgtgcgattttaattccg
gtattaactattccgatttctttgatcggggtgttaatgatgttacaaagtttggatttc
tccattaacctgatgactttgttagctctgattcttgcgataggtctcgtggtggacgat
gcaattgtcgtattggaaaacgttgaccgtcatattaaagagggggaaacaccgttccgt
gccgcgattatcggtacccgtgaaattgccctgccggttatttcaatgacggtttcttta
attgcggtttactcgccaatggctcttatgggcggtattacgggaacacttttcaaagag
tttgcgttaacccttgccggttcggtgtttatttccggtattgtggcattaaccctttcc
ccaatgatgaccagcaaactattgaaatccaatgcagaaccgacatggatggaacgtaaa
gtagagcatacactttctagaatgaataacgtgtataactatatgctggatattgtgatg
caaaatcgtaaatccatggtggtgtttgccgtggcgattttttctacattaccgttcctc
tttaattcgctttcaagcgaattaacaccaaatgaagataaaggggcgtttattgcgatt
ggttccgcaccttctaatgtgaatgtggattatattcaaaatgcaatgcaaccttatatg
aaaacggtgatggatacggaggaagtttcttttggtatgagtattgcgggcgcaccgagt
tctaaccaatctttaaatattgtgacactaaaagattggaaagcgcgttcacgcaagcaa
tcggaagttatgaatgaactgaataccaaagcaaaaggattaccggaagtctcaatttct
gcatttaacttccctgaaattgatacaggggaacaagggccgccggtttctattgtgtta
aaaacggctcaagattataacgccttggcgaataccgcagaaaaattcttacaagctatg
cgggcatcaggtaagtttgtttatactaacctcgatttaaaatatgataccgcccaaatg
acgatttccgttgataaagaaaaagcgggcacttacggtatcaccatgcagcaaatcagt
aatacgctgggaagctttctttccggcgcaacgattacccgtgtagatattgatggacgt
gcttataaagtcatttcacaagtaaaacgtgatgatcgcttgtcaccggaaagtttcaaa
aattactacctaaatgcaagtaatggtgaagctgtaccgttgagcagcttggttagtatg
aaacttgaaacacagcctacctcattgcctcgttttagtcagttaaatgcagcaacgatt
caagccgtaccaatgccgggaacatcaacaggggatgcggtagcgtggctacaagaacat
gccgatactactttaccacagggctatacttacgatttccgttcggaatcccgtcagtta
atccaagaagggaatgcgttggcactcacttttgtgttagcggttgtgatcattttctta
gtattggcgattcagtttgaatcaatacgtgatccgttggtgattatgatttcggtgccg
ttagcagtgagtggatcgttagtagtactcaatttaccttccgctttgcaaggatttcta
ggattcattgggcatattacggggattgccgcaattgctcaattcggacaaagtataaca
atgacaggatataccttaaatatttactcacaagtgggattaattaccttagtgggtttg
attacgaaacatggtattttgatgtgtgaagtagcaaaagaagagcagctgttacacggt
aaaaaccgtattgatgcgattaccgctgcggctaaagtgcgtttgcgtccaattttgatg
acaactgccgcaatggtagcgggtttgattccattgctttatgcaacaggcgccggtgcg
gtatcacgctttagtatcggtatcgttatcgtagccggcttgtctatcgggacaatcttt
acattgtttgtacttccggtggtgtatagctatgtggcaaccgaacacaaaccattaccg
gtatttgaagaaaatgaaagcaaaacggctcattaa

DBGET integrated database retrieval system