Rivularia sp. PCC 7116: Riv7116_0702
Help
Entry
Riv7116_0702 CDS
T02364
Name
(GenBank) hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family transporter
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
riv
Rivularia sp. PCC 7116
Pathway
riv01501
beta-Lactam resistance
riv01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
riv00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
Riv7116_0702
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Riv7116_0702
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
riv02000
]
Riv7116_0702
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
riv01504
]
Riv7116_0702
Transporters [BR:
riv02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Riv7116_0702
Antimicrobial resistance genes [BR:
riv01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
Riv7116_0702
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
MgtE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY53291
UniProt:
K9R743
LinkDB
All DBs
Position
complement(888663..891836)
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MFADFFIKRPVFTSVCAIIVLLVGAISIPTLPTARYPQISPTQINVTANYVGANAEVVEK
TVTTVLEQQLNGVEGLKYMSSSSSNSGTSSIRVTFDASRNKDIAAVDVQNRVSLAEPQLP
EAVQRTGVVVSKESSNILLAMGLYSQNQEFNNVFLSNYADLYIRDNLQKIDGVSRAQIFG
ERRYAMRLWLDPNRLASRNLTAQDVINALNEQNVQVGAGQLGQQPTPPNQMYQIDLRAVS
RLQKVEEFEDIIVSAGENGVLIKLKDVGRAELGAENYNSFLRFKGNEGVGIGIFPTPGSN
ALEVAAAVKAEMANLAKDFPPGMQYQVAFDTTAFVEESLSEVIKTLLLAIGLVVLVIFIF
LQDWRTTVVPVVTIPLALIGTFGFVKLFGFSINTLTLFGLTLATGMVVDDAIVVVEDISR
LINQKEMSPKKAASAAMRELTGAVIATSLVLMAVFVPVAFFPGSTGKIYRQFALTIAFAV
VISTFLALTLTPALSGLLFRRKTSSGGFLNKIFDAVNWFLDSLRDGYSFLLQRLTHLKFL
VLVVFAALLVTTGWLYTIVPQAFLPEEDQGYFITIIQGPEGVSLNYTSQVMQKVEQQILE
LPEVVGTFAIGGFGFSGSTANSGVIFTTLKPWGERTGEGQSSQEIIGRLMQQFGGITDAR
VLAVNPPSIQGLGSFSGFQFQLQDRRGNSSLDVMLQEMGELIGAASQREEIAGAFSTFSA
NMPQLLIEVNRNRAKALQVDIDDIFSTLQTYIGSRYVNDFNLEQRTYRVYVQADAQYRSN
PEDIGQLYVRSQNNQMIPMSNLVKVTSTTGAQTINHYNLYRSIEINGQTAPGYSSGEALE
AMEEVAQEVLPRSFGYEWAGISAEEKESGGQAPLIFGLGLVFVFLVLAAQYENYIDPLII
MLSVPLAILGALSAQYLRGLENDVFCQVGLVMLIGLASKNAILIVEFANQLREEGLSINK
AAVRAAQERLRPILMTALSTLLGIFPLLIAKGAGAGSRQSLGTAVFGGMFVATFLSLFVV
PVLYIVIVSLREQLLPSKREKEMEFVEENSQVPATRE
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgctgacttttttattaagcgacctgtttttactagcgtttgcgcgattattgtt
ctgttggtaggagcaatcagtattcccacactacctacggcaaggtatccgcagattagt
ccaactcaaattaatgttactgctaactatgttggtgctaacgccgaagtagtcgaaaaa
actgtaactacggttttagagcagcagttaaatggtgtggaaggcttgaagtatatgtct
tcgagcagtagtaacagcggtaccagttctattcgagttacttttgatgcttcgcgaaat
aaagatattgctgcggttgacgtacaaaatcgggtttctctagccgaacctcagttaccc
gaagccgtacaaaggacgggggttgttgttagtaaagagtcgagcaatattctcttggca
atggggctttatagtcaaaaccaagaatttaataacgtatttttaagtaattacgctgac
ctttatataagagataatttacagaaaatcgatggtgtcagtcgagcgcaaatcttcggg
gaacgccgttatgcaatgcgcttgtggctcgatccaaatcgtctggcaagtcgtaattta
actgctcaagatgtaattaatgctctcaatgagcaaaacgtgcaagtgggtgccggacaa
ctcggacagcagccgacaccaccaaatcaaatgtatcaaattgatttgcgcgctgtgagt
agactgcaaaaggttgaggagtttgaagatattatcgtcagcgctggggaaaatggcgtt
ttaatcaaattgaaggatgtaggaagggcggagttaggagcagaaaattataattcgttt
ttaagatttaaaggcaatgaaggggtaggtattggcatattccccactcctggaagtaat
gctttggaagtcgctgctgctgtgaaagcagaaatggctaatttagcaaaagattttcct
cccggaatgcagtaccaagttgcgtttgacaccactgcttttgtcgaagaatcgctttcg
gaagttatcaaaacgcttttattagctattggtttagttgttttagtaatctttattttc
ttgcaggattggcgaacaacggtagttccagttgtgactattcctttagcattaattggt
acttttggttttgttaagcttttcgggttttcgattaacactttaactttattcggttta
accttagcaacggggatggtagttgatgatgcgattgttgttgtagaagatatttctcgc
ttgattaatcaaaaggaaatgtcgcccaaaaaagctgcttcggctgcaatgcgcgaactg
actggagccgtaattgcaacttctttggttttgatggcggtatttgtccccgtagcattc
tttcccggttccaccggcaaaatttaccgacagtttgcactgacaattgcctttgctgta
gtaatttcgactttcttagccttaactttgactcctgctttatcaggattattattcaga
agaaaaactagcagtggtggttttctcaataagatttttgatgctgttaactggtttctg
gattcgttgcgggatggctattcatttctattacaacgtttgacacacctcaaattttta
gtattagttgtatttgccgccttattagtaactactggttggctttatactatagttcct
caagcttttttaccagaagaagaccaaggttattttattacgattattcagggaccagaa
ggagtttcgcttaactacacgagtcaggtgatgcaaaaggtagaacagcaaatcttagaa
ttaccggaagtggtaggtacttttgctattgggggttttggttttagcggtagcactgct
aatagcggcgtaatttttaccactttgaaaccttggggagaaagaactggagaagggcag
tcgtctcaagaaattattggtagattaatgcaacagtttggtggcattaccgatgccaga
gttttagccgttaatcctccatcaattcaaggattaggtagttttagcggttttcagttt
cagttgcaggatagaagaggaaacagcagcttggatgtaatgctgcaagaaatgggagaa
ttaatcggagcagcaagtcaaagagaagaaatagcaggagctttcagtactttttcggcg
aacatgccgcaattgttaattgaagttaatcgtaatagagccaaagctttgcaggtagat
atcgacgatatttttagtactttacagacttatatcggttctagatacgtcaacgatttt
aatttggaacagcggacttatcgagtttacgtacaagcggatgctcaatatcgttccaat
cctgaagatatcggtcaattgtacgtccgctctcagaataatcaaatgattcccatgagt
aacttagtgaaagttacctcgactaccggagcgcaaactattaaccattacaacctgtat
cgttcaattgaaatcaacggacaaacagcacccggttacagttccggagaagctttagag
gcaatggaagaagttgcacaagaagttttaccgagaagttttggttacgaatgggctgga
atatcagccgaagaaaaggaatcgggagggcaagctccgttaatttttggtttgggactt
gtttttgtattcttagtattagcagcgcaatacgaaaactatattgaccctttaattatt
atgctttcagttcccttagctattttgggagcgctatcggcacagtatttaagaggttta
gaaaatgatgtattctgtcaagttggtttggtaatgttgattggtttggcttctaaaaat
gcgattttaattgtagaatttgccaatcaattgagagaagaagggctttcaatcaacaaa
gcagcagttagagcagcgcaagaaagattgcgaccaattttaatgacagcattgtcaact
ttattgggaatttttcctttattaattgcaaagggtgcgggtgctggcagccgtcaatct
ttaggtactgctgtatttggaggaatgtttgttgcgacgtttctaagtttgtttgtggta
cctgttttatatattgtaattgtgtccttacgagagcaattgttaccttctaaaagagaa
aaagaaatggaatttgtggaagaaaacagtcaagttccggcaactcgggaatag
DBGET
integrated database retrieval system
