Rhincodon typus (whale shark): 109916808 Help Entry 109916808         CDS       T06055                                  Name (RefSeq) fibrillin-1-like   KO K06825   fibrillin 1 Organism rtp  Rhincodon typus (whale shark) Pathway rtp04350   TGF-beta signaling pathway rtp04518   Integrin signaling rtp04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:rtp00001]  09130 Environmental Information Processing   09132 Signal transduction    04350 TGF-beta signaling pathway     109916808   09133 Signaling molecules and interaction    04518 Integrin signaling     109916808  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     109916808  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:rtp00536]     109916808 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:rtp00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    109916808 SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  EGF_CA cEGF FXa_inhibition EGF hEGF TB EGF_3 Plasmod_Pvs28 Fibrillin_U_N EGF_FBN_1st EGF_PEAR1L EGF_MSP1_1 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  109916808 NCBI-ProteinID:  XP_048472978 LinkDB All DBs Position 36:2467622..3056629 Genome browser AA seq 2710 aa AA seqDB search MWIRWLLKLSVGFTTFLSVAVQTGVDAAEPNPNADKYNNNSNQKTANRLKRRGGSSQDVL KGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNICTCPNGQIAPTCGL KSVQQCNIRCMNGGSCAEDHCICQKGYTGTHCGQPICENGCLNSGRCVAPNRCACTYGFT GAQCERDYRTGPCFTSVEKQMCQGQLTGIVCTKILCCATVGRAWGHPCEMCPAQPQPCRR GFIPNIRTGACQDVDECQAIPGSCSGGNCINTVGSFECKCPAGHRFSEVTQKCEDVDECA TVPGICHGGECSNTIGSYFCKCQHGYLPTGDGSRCIDVIGSSLFVSLMSVTLHQNGVPMS LKLVVDIDECVQNGQICKHGRCVNTEGSFQCICNAGFQLTPDGKNCMDQDECSQKNMCMN GMCINEDGSFKCICKPGFELASHGRVCIDIDECHTPGICMNGRCVNTDGSYRCECPPGLA IGIDGRVCVDTHMRSTCYGGYKRGQCDRPLPGAFTKSHCCCANTDHAFGEPCQPCPAINS AEYHALCSSGPGMTSDGRDINECALDPDICPNGVCENTRGSYRCVCNSGYEVDISGKKCE DIDECFINSLLCDNGLCRNTPGSFTCSCPKGYVFKPESETCEDVNECETNPCINGDCKNV PGSYSCQCFPGSTLDASRTRCVETVKGTCWLQHIGGQCEININGATLKSECCSTLGAAWG SPCIPCKIDSICPRGYTRVNGTICEDVNECKVFPGVCTNADCVNTPGSFKCVCSNGMTLD SSGRTCVDIRLEHCYLKYDEDECIEPLAVRLRIDACCCSVGAAWGPDCERCPKEGTSDYK ALCPRGSGFSSRGEPNGKPLLKDINECRTIPGICSNGKCRNTIGSFRCKCNSGFALDSEE RNCTDINECRISPDLCGPGTCVNTPGSFDCECFEGYESGFMMMKICMDINECERNPVLCR GGTCENTDGSFKCICPRGHEVSADGTSCIDINECELSNNLCKNGRCVNMIGQYQCACNTG YQATPDRQGCVDIDECTIVNGGCETYCTNSDGSYECSCRSGYALLPDQRSCTDIDECEDN PDICDGGQCANVPGEYRCLCYDGFMASEDMRTCLDVNECELNPNICLSGTCENTKGSFIC HCELGYSVKKGTTGCTDINECEISAHNCDKFAICTNTPGSFKCACADGWSGDGIKCSDVD ECSNGTHKCSPNAECMNTDGSYRCTCKEGYKGDGMFCTDIDECAENVNFCENGHCLNAPG GYRCECDMGFVPTVDGRACQDVDECSFADICVFGRCQNLPGLFRCECDLGYELDRSGGNC TDVNECANPVNCINGICVNTPGSYVCNCPSEFELNPTGVGCVDPRLGKCFLEYSLRGDNT LSCSNEIGVGVSRASCCCSLGRAWGFPCELCPSINSSEYRTLCPGGEGFRPNPITVILED IDECKELPGLCQGGTCVNTFGSFQCECPRGFYLNEETRVCEDLNECSASPGICGPGTCFN TVGNYTCICPPDYMQVNGGNNCMDNRKSFCFKYFDRENGTCNGELAFNMTKKLCCCSYMI GKAWNRPCEQCPLPVTDDFQFLCGSRRPGYIIDISGQAVDIDECHWIPGICANGVCINQL GSFRCECPMGFQYNDQLISCEDMDECQNGPLCQQNANCINTPGSYRCECLPGYRLTVAGH CIDRNECHDIPNVCSHGQCTDTVGSYYCTCRNGFKATPDKTMCMDIDECERQPCGNGTCK NTVGSYSCLCFPGFMLSHNNDCIDVDECTTMNGALCRNGQCINTIGTFQCFCHEGYELTA DRRSCIDINECLAVPRPCTPGTCQNLDGSYRCICPSGYSLIDDKCIDIDECASDPGLCVS GTCTNTEGSYKCICPPGSILSGGRRCIDIRESFCFSKFENGVCSAPKFKNITKATCCCSL MPGEGWGVPCEICPKSTEEAFGKLCPSGLIGTRIDVDGSHVDTDECAIDPGMCKNGQCIN TDGSFRCECPFGFSIDYTGINCEDTNECSVGNPCGNGTCTNVIGGFECACEEGFEPGPMI TCEDINECAQNPLLCAFRCVNTIGGYECTCPAGYVLRQDGKMCRDQNECEEQLDGCASRG MICKNLIGTFMCICPPGLVRAPDGEGCIDENECRTKPGICQNGRCINTPGSYKCDCNEGF TASSTQTECIDNRKGFCFSEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGWGTQCEICPLPG TGPYKKLCPLGPGYTTDGKDIDECQVLAKLCQNGQCINTVGSYRCLCKTGYTTDLSGISC VDLDECVQAPKPCNFICKNTEGSYQCACPRGYLLQENGKSCKDLDECATKQHNCQFLCVN TIGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECISETNVCGAKGVCQNIPGSFLCECQRGFLLDQTG HSCEDIDECEGSHRCQHGCQNLIGGYRCSCPHGYLQHYQWNQCVDENECMNSQVCGGASC HNTLGSYKCLCPTGFSFEQLTGSCHDVNECSSSKNPCNYGCSNTDGGYLCGCPPGYYRVG QGHCVSGVGFSKGQMFPIGGDTEDNSLSPEACYDCKINGYPKGRTRRTTNEKEAIISNDA EDNNADSLQMSLASLSTDNPFIFNLNISELSNKDHILQFVPAISTLTNHVRYLIDLGNEK GLFKVNQKDGISYLHLTKKKPVPGAYSLQISSMPLFKKKELDRLEDKHDKDYLTGELGGI LQMKIQIVLH NT seq 8133 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtggatacggtggctgctgaaactttccgtgggatttacaactttcttatctgttgcg gtgcagacaggcgtagatgcggcggaaccaaatcccaatgctgataaatataataacaac agcaaccagaagactgcaaataggttaaaacgacgaggcggatcaagccaggacgtacta aaagggccaaatgtttgtggatcacgtttccattcatactgctgcccgggttggaaaacg ttacctggtggaaaccaatgcattgtcccaatttgcaggaactcgtgtggtgatggattt tgttcacgaccaaacatatgcacatgcccaaatggtcagatagcgccaacatgtggctta aaatcagtccaacagtgcaacattcgatgcatgaatggtgggtcctgtgctgaggatcac tgtatttgtcagaaaggatatactgggactcattgtgggcagcctatctgtgagaatggc tgtttgaacagtggaagatgtgttgctcccaatcgatgtgcctgtacgtatggatttaca ggagcacaatgtgaacgagattacagaactggaccatgtttcacatcagtagaaaagcag atgtgccaaggacaactgactggcattgtctgcaccaaaatcctttgctgcgcaacagtt ggacgagcctggggacatccatgtgagatgtgtcccgcccagccacaaccatgtcgtcgt ggttttattccaaatattcgaacaggagcttgtcaagatgtggatgaatgccaagctatt ccaggaagctgcagtggaggaaattgtataaacactgtaggctcctttgaatgcaaatgc ccagctggacatagatttagtgaagtgactcaaaaatgtgaagatgttgatgagtgcgct actgttcctggtatatgccatggaggtgaatgctccaacacaattggaagttatttttgc aagtgtcaacatggttacctacctactggagatggttcaagatgcattgatgttattgga tcttctctctttgtatcgctgatgtcggtgacccttcatcagaatggagtaccaatgagc ctgaagttagtggtggatattgatgaatgtgttcagaatggtcaaatctgtaaacatggt cgttgtgtgaatacggaaggcagtttccagtgtatttgtaatgctggctttcagctgaca ccagatgggaaaaattgcatggaccaggatgaatgttcccagaaaaacatgtgtatgaat ggaatgtgcatcaatgaagatggcagcttcaagtgcatctgtaaacctggctttgaatta gcttctcatgggcgtgtatgcattgacattgatgagtgccacacaccaggaatttgtatg aatggacgatgtgtgaacacagatggctcatacaggtgtgaatgtcctcctggcctagct atcggaattgatggacgagtctgtgttgatactcatatgagaagcacctgctatggtggt tacaagagaggccagtgtgatcgcccattaccaggagccttcaccaaatctcactgttgc tgtgccaatactgatcatgcctttggagaaccgtgtcaaccttgtccagcaattaattct gctgaatatcatgcactttgcagcagtggacctggtatgacaagtgatgggagagacatc aatgaatgtgcgttggatcctgatatctgtcctaatggagtgtgtgagaacactcgtggc agttaccgatgtgtttgcaattctggttatgaagttgatatatctgggaaaaaatgtgaa gatatcgatgaatgttttattaatagtctgttatgtgacaatggtctctgcagaaacaca cctgggagttttacttgttcctgcccgaagggatatgtatttaaacctgaatctgaaaca tgtgaagatgtaaacgaatgtgagaccaatccttgcattaatggagattgtaagaatgta cccggcagctattcatgtcagtgttttccaggaagtactcttgatgcatcaagaactcgg tgcgtagaaacagttaagggcacatgctggttgcaacatattggtggacagtgcgaaata aacatcaatggtgctacactgaaatcagaatgctgctcaacattgggtgctgcatgggga agtccatgtattccttgtaaaatagatagtatctgccctagaggatacacaagagttaat ggaacaatctgtgaggatgtaaatgagtgtaaagtcttccctggcgtgtgcaccaatgct gattgtgtgaatacacctggatcatttaagtgcgtctgttctaatggtatgaccttggac agcagtggacgaacgtgtgttgatattcgtttggagcactgctatttgaaatatgatgaa gatgaatgcatagaacctttagcagtccgattacgcattgatgcttgctgctgttctgtc ggtgctgcttggggaccagactgcgagagatgtcccaaagaaggcacaagtgactacaaa gctctttgtccgcgaggatcaggattttctagcagaggagaacccaatgggaaacctttg ctaaaagatatcaatgaatgcaggactatcccaggtatctgtagcaatgggaagtgcaga aacactattgggagctttagatgtaaatgtaatagtggcttcgcccttgattcagaagaa agaaactgtacagatattaatgagtgccgtatctcccccgatttatgtggtcctggaact tgtgttaacacgcctggaagttttgattgcgaatgctttgaaggatatgaaagtggattt atgatgatgaagatctgcatggatattaatgaatgtgaacgaaatcctgttctgtgtcgt ggtggtacctgtgagaatacagatggaagtttcaagtgcatctgtcctcgtggccacgaa gtgtctgcagatggaacatcatgtatagatattaatgaatgtgagttgagtaacaacctt tgtaaaaatggacgctgcgtcaacatgattggacagtaccaatgtgcttgtaatactgga tatcaagcaacacctgacagacaaggttgtgttgacatcgatgaatgcacaattgtgaat ggaggatgtgagacttactgcacaaattctgatggcagttatgaatgcagctgtcgaagt ggctatgcattgttgccagaccaacgatcttgtacagatattgacgagtgtgaggataat cctgatatttgtgatggagggcagtgtgccaatgtacctggagaatatcgatgtctctgc tatgatggatttatggcttctgaggatatgaggacctgcctagatgtcaatgaatgtgag cttaatccaaatatatgtctcagtggcacttgtgagaacaccaaaggatcattcatttgt cactgtgagctgggctactctgtgaagaaaggaacaaccggttgtacagatattaatgaa tgtgaaatcagtgcacataattgtgacaaatttgctatatgtacaaatacaccaggaagc tttaagtgtgcctgtgcagatggctggtcaggagatggcatcaaatgttctgatgtggat gagtgttcaaatggaacccataagtgcagccccaatgctgaatgcatgaacacagatggc tcatatcgatgtacatgtaaagagggttacaaaggagatggcatgttttgtactgacatt gacgaatgtgctgaaaatgtgaacttctgtgagaatggccattgcttaaatgcacctgga ggctaccgttgtgaatgtgacatgggctttgtgccaactgtggatggcagggcgtgtcaa gatgttgacgaatgctcatttgctgacatttgtgtctttggaagatgccaaaatcttcca ggacttttcagatgtgaatgtgatttgggttatgagctagacaggagtggcggcaactgc acagatgtcaatgagtgtgcaaatccagttaattgtataaacggaatttgtgttaatacc cctggaagctatgtttgcaactgcccatctgaatttgagttgaacccaactggagtgggg tgtgttgatcctcgcttgggcaagtgcttcttggaatattcattgcgtggagataacacc ctttcttgcagtaatgagattggagtgggagtttcaagagcttcttgttgctgttctttg ggcagagcctgggggtttccatgcgaactttgtccttctatcaattcatctgaatacaga accctttgtcctggaggagaaggctttcgtcctaatccaatcacagttattctggaggat attgatgaatgtaaggaattacctggactgtgtcaaggaggaacatgtgtcaacactttt gggagcttccagtgtgaatgcccacgtggtttctatttgaatgaagaaaccagagtatgt gaagatcttaatgagtgcagcgcttcacctggcatttgtggccctggtacctgtttcaac acggtaggaaattatacctgcatctgtccaccagattatatgcaagttaatggtggaaac aactgtatggacaatagaaagagcttctgcttcaaatattttgaccgtgaaaatggtact tgtaatggtgagctggcctttaatatgacaaagaagttgtgttgctgttcatacatgatt ggaaaagcttggaacagaccatgtgagcagtgtccacttcctgtcacagatgactttcag tttctctgcggtagtcgaagacctggatatattattgatataagcggacaggcagttgac attgacgagtgccattggattcctggtatttgtgctaatggtgtatgcattaatcaactt ggaagcttccgatgtgaatgtcccatgggatttcaatacaatgatcaactgatcagctgt gaagatatggatgaatgtcagaatggccccctttgtcaacagaatgctaattgtattaac actcctgggagctatcgttgcgaatgtttgccaggttaccgtcttacagtagcaggacat tgtattgatcgtaatgaatgccatgatatccccaatgtttgcagtcatggtcagtgcact gacactgtaggaagctactactgcacgtgtcgcaatggcttcaaagcaacaccagataag acgatgtgtatggatattgatgaatgtgagcggcagccatgtggcaatgggacctgtaag aacacagttggttcctatagctgtttgtgctttcctggattcatgctctcacataacaat gactgcattgatgtcgatgagtgcactactatgaatggtgctttgtgtagaaatggacag tgcattaatactattggaacattccagtgcttctgccatgaaggttatgaactgacagct gataggagaagttgcattgatatcaatgaatgtttggctgtccctcgtccttgtacacca ggcacctgccaaaacctagatggttcttacagatgtatctgcccttctggatactcactg attgatgataaatgcattgatatcgatgaatgcgcatcagaccctgggttgtgtgtatca ggtacatgtactaatactgaaggaagctacaagtgtatctgtccaccaggatcaattctc tcaggtggaagaaggtgcatcgatatcagagagagtttttgcttctctaaatttgagaat ggtgtctgctctgcacccaagttcaagaacatcacaaaggcaacatgttgttgcagttta atgccaggagaaggatggggtgtcccgtgtgagatttgtcccaaaagcacagaggaagca tttggaaaactgtgccccagcggcttaattggaactagaattgatgtggacggttcgcac gtggatactgatgaatgtgctatagacccaggaatgtgtaaaaatgggcaatgcatcaac actgatggttctttccgctgtgaatgcccatttggcttcagtatcgattatactggaatc aactgtgaagacacaaatgaatgttctgttggtaatccctgtggcaatgggacatgtact aatgtgattggaggatttgagtgtgcgtgtgaagaaggctttgaaccaggaccgatgatt acttgtgaagacatcaatgaatgtgcacaaaatcctttactttgtgcattccgatgtgtt aacaccattggaggatatgaatgtacatgtcctgctggctatgttctaagacaagatggg aagatgtgccgagatcagaatgagtgtgaggaacaacttgatggttgtgcgtcaagagga atgatttgcaagaatctgattggaactttcatgtgtatctgcccacctggattagtgcga gcaccagatggtgaagggtgtattgatgaaaatgaatgtcgcaccaaacctggcatttgt caaaatggtcggtgcattaatacccctggtagttacaaatgtgattgcaatgaaggattc acagccagttcgacacagactgaatgtattgacaaccgtaaaggtttttgtttttcggaa gtgcttcagactatgtgtcagatggcctccagtagtcgaaatcttgttacaaaatcagag tgctgctgtgatggtggacgtggctggggtacacaatgtgaaatctgccctttgccagga acaggaccttataagaaactatgtccacttggacctggttacaccacagatggaaaagat attgatgaatgtcaagttcttgcaaaactatgtcagaacggacaatgtattaatactgtg ggatcatatcgatgtctgtgcaagactggttacaccaccgatctatctggcatatcttgt gtagatcttgatgagtgcgtacaagcaccaaaaccttgtaatttcatctgcaagaataca gaaggaagttaccagtgtgcatgtcctagaggatatttgttgcaagagaatggaaaaagt tgcaaagatctggatgaatgtgctacaaagcagcacaattgccagttcctttgtgtgaat acgataggtggatttacttgcaagtgtcctccaggattcacacagcatcatacagcatgc atcgataacaatgaatgcatttctgagactaatgtttgtggagctaaaggagtgtgccag aatatcccaggcagctttctctgtgagtgccagcgtggatttttgctggatcaaactggc cacagctgtgaagatattgatgaatgtgaaggaagccatcgttgccaacatggctgtcag aacctgattggtggatatcgatgcagctgtccacatggttatctacaacactatcagtgg aatcaatgtgttgatgaaaatgaatgcatgaattctcaggtttgcggaggagcttcatgc cacaatacactgggaagctacaagtgtctttgtccaacaggtttttcttttgagcagctt actgggtcttgtcatgacgttaatgaatgttcttcgtccaaaaatccatgcaactatggc tgttcaaacactgatggaggttacttgtgtggctgcccacctggatattacagagttggt caagggcattgcgtttctggagtgggattcagcaaaggccagatgtttccaataggaggt gacacagaggacaatagtttgtcacctgaggcatgttatgattgcaaaattaatggctac ccaaaaggaagaacccgaagaacaacaaatgagaaagaagctataatttcaaatgatgca gaggataacaatgcagacagtttgcaaatgagccttgccagtttaagtacagataatcca tttatcttcaatctcaacatttctgaactcagcaataaagaccacattctacagtttgtt ccagctatttctactttgacaaatcatgtacgttacttgattgaccttggcaatgaaaaa ggtctgttcaaagttaaccaaaaggatggtataagctatctacatctgaccaagaagaag ccagttcctggagcctactcattacaaataagcagtatgcccctctttaaaaagaaggaa cttgatcggcttgaagataagcatgataaagactacctcactggtgaacttggtggaatc cttcaaatgaaaattcagattgtgcttcattaa

DBGET integrated database retrieval system