Candidatus Syntrophocurvum alkaliphilum: SYNTR_1856
Help
Entry
SYNTR_1856 CDS
T06326
Name
(GenBank) RND efflux system, inner membrane transporter
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
salq
Candidatus Syntrophocurvum alkaliphilum
Pathway
salq01501
beta-Lactam resistance
salq01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
salq00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
SYNTR_1856
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
SYNTR_1856
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
salq02000
]
SYNTR_1856
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
salq01504
]
SYNTR_1856
Transporters [BR:
salq02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
SYNTR_1856
Antimicrobial resistance genes [BR:
salq01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
SYNTR_1856
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Hit1_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGU00450
UniProt:
A0A6I6DKF6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1898949..1902074)
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MKIVDFSVKRPVTITIIVAVLVILGFFTLSRMSIELYPDINLPVAAVITSYPSAGPEEVE
SQVSIPMEGMLATVSNVTNLHSTSSAGSSMIIIEFNWGTDMNEAMANMRDQVGMVERFLP
DGAENPLIVRMDPTMMPILQMGISGDDLAQVQTIAEDVIEPRLARIPGVASVMTLGGLER
EVKVEVDPVKLENYGLAMSQVVQVLQTENFAMSGGQVAQGEREYYVRTLQEFETVEEIKD
VTIATPAGHILQLREIATIVDGYKDQNQLTRVNGDPAVAVNVLKQTDANTADTCAAVVAE
LDKINQELGVDIQFDIAFDQSEFIHEALNNTQRLIIQGAILAMLILFVFLRNARSTLIIF
TAIPLSIVSAFILMYFTNYTVNMITLGALALGLGRMVDDSIVVFENIYRHRSLGLSAKEA
AKKGASEVGTAVLATTLTILAVFAPMLFVEGIAAIFFLPLAITVCFALICSLVIALTVIP
LMSSKLLTDESMKKTREKTGRIANATNKFGELLEKISEKYKALLKWALGRRKTVVAAVTF
LFVASFSGVPFIGAEFLPTMDTGEISVTIETDKGSVIGHTDEVTSQVEEELRQIPEVETI
FSTIGSSGNMMDDSGQPDRTTIYTKLVPLDQRDRSVEEVTEEIRNKVNYIPGAKINATVF
DVFSFGGTSGPINVQVRGDDLDILREISYELVNIIENVSGTREVSSSLMDGNPELQIKVD
RQRAAQYGLTPMQISNEIQNVMEGRVATQYSFEGSEIDVRVTYDSKDYKDVEYLSNLPIM
SQTGAIVRLSEVATFEVEQGPVQISRVDQVRLADINAHLVGRDLASVMEEIREEANKLNL
PAGYTIEYGGETQEMEESFKTLAMALMLAIVLAYAVMAIQYESFFNPFVIMFSVPVAFIG
VVLGLVITGKAFSVPAFVGLIMMVGIVVSNAIILVDYLNRLRAEGMERNEAIIEAGRIRL
RPILMTTLSTVLAMLPLAIGMGEGTEFQAPMAIVVISGLLVSTLVTLVLVPVVYSIFDDL
GIRIRKRFSKDTEEEEASIES
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatagtagatttctcagtaaaaaggccggtaaccataactataatagtagctgtt
ttagttatccttggtttttttactttatcacgaatgtcaatagaactatatccggatata
aatcttccggtagcagcggtaattacttcctatcctagtgcaggacccgaggaagttgag
tcccaggttagtattcctatggaaggaatgctagcaactgtatctaatgttacaaacctt
cattctacttcaagtgctggaagttcaatgattattattgaatttaactggggtacagat
atgaatgaggctatggccaacatgcgagatcaagttggcatggttgaacgttttctcccc
gatggtgcggaaaacccattaatagttaggatggaccccacaatgatgcctatcctgcaa
atgggtattagtggtgatgatttagctcaggtacaaaccatagcagaggatgttattgaa
ccacgtttagctaggattcctggtgtagcatcagtaatgacactaggagggcttgagcgt
gaagtaaaggtagaagttgacccagtaaagcttgaaaactacggacttgccatgtcacag
gtagttcaggttttacagactgaaaactttgctatgtcaggtggtcaggttgctcagggt
gaacgtgaatattatgtacgtacactacaggagtttgaaacagttgaagagataaaagat
gttacaatagcaacacctgccggacatattttgcagcttagagaaatagctaccatagtt
gatggctacaaggaccaaaaccaattaactagggtgaatggtgatcccgcggtagcagta
aatgttttaaagcagacagatgcaaatactgctgatacctgtgcagcagttgttgctgaa
ttagacaagataaatcaggagcttggggttgatatacaatttgatatagcctttgatcaa
tctgaattcatacatgaagctcttaataatacccaaaggctaataattcaaggtgctata
ttagcgatgcttattttgttcgtattcttaagaaatgctcgtagtaccttaattatattt
acagctataccattatcaatagtcagtgcattcatattaatgtactttactaactataca
gttaatatgataacccttggggctttggcacttggattagggcgaatggttgatgactcg
attgttgtttttgaaaatatttatcgacatcgatcgctgggcttgtcagccaaagaagct
gccaaaaaaggagcttctgaagttggaactgccgtattggctacaaccctaacaatttta
gcagtttttgctcccatgttatttgttgagggaatagcagcaatattcttcttaccatta
gcaattacagtatgttttgctctaatatgttcattggttattgctctaacagttatacca
ctaatgtcttcaaagttattaactgatgaatcaatgaagaaaacaagggaaaagactggt
aggatagctaatgcaactaataaatttggagagttgttagaaaaaataagtgaaaaatac
aaagctttgctaaaatgggctttaggacgtcgcaaaacagtggtagcagcagtaacgttc
ctattcgttgcttcattttcgggggttccatttatcggagctgaattcttacctacaatg
gatacgggtgaaatttcagttactatagaaaccgataaaggctcagttattggccataca
gacgaagtaacaagtcaggtagaggaagagctgcgtcaaatacctgaggtagaaacaatt
ttcagtactattggtagttcaggcaatatgatggatgattcaggtcagcctgataggact
acaatatatacaaagctagttccccttgatcaacgcgatcgtagtgttgaggaagtaaca
gaggagattagaaataaagtaaactatatccctggtgcaaaaataaatgctacagttttt
gacgtatttagttttggaggtacatccggacctataaatgttcaggtgcgtggagatgac
ttagatatattaagggaaatttcctatgaactagttaatattattgaaaatgtttcaggt
actagagaagtatcatcatcactaatggatggaaacccagaactccaaataaaagtagat
agacaaagagcagctcaatatggtttaacaccaatgcaaatatcaaatgaaatacaaaat
gttatggaaggtagggttgctacccaatacagctttgaaggctctgaaatagatgtaaga
gtaacctacgattcaaaagattataaggatgttgagtatttgagcaatctacccattatg
agtcaaactggggcaattgttaggctatcagaagttgctacttttgaagtagaacagggg
cctgtacaaataagccgtgtggatcaagtcaggttagcagatattaatgcccacttagta
gggcgcgatcttgctagtgttatggaagaaatacgagaagaagctaataagttaaactta
ccagctggatataccatagaatatggtggagagactcaggaaatggaggaaagcttcaaa
actctagctatggccctaatgttagctattgtgctagcatatgcggttatggcaatacaa
tatgaatcattctttaacccgtttgttatcatgttttcagtcccagtagcctttataggg
gttgtgctaggccttgtgataactggtaaagcatttagtgtgccagcctttgttgggtta
attatgatggttggtatagtagtatctaatgctattatactagtagactatctaaaccgc
ctaagagctgagggtatggaacgaaacgaagctataattgaagcagggagaataagatta
agaccaattctgatgactacattaagtacggttttagcgatgttaccacttgctataggt
atgggcgaaggtactgaattccaagcaccaatggctatagtagttattagtggattactt
gtgtcaactctagtaaccctagtcttagttcccgtagtctacagcatattcgatgactta
gggattagaattagaaaaagattttctaaggatacagaagaggaagaagcaagtatagag
tcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
