Staphylococcus aureus subsp. aureus FDAARGOS_5: X998_0117
Help
Entry
X998_0117 CDS
T03492
Symbol
tet(38)
Name
(GenBank) tetracycline efflux MFS transporter Tet(38)
KO
K08168
MFS transporter, DHA2 family, metal-tetracycline-proton antiporter
Organism
sauf
Staphylococcus aureus subsp. aureus FDAARGOS_5
Module
sauf_M00704
Tetracycline resistance, efflux pump Tet38
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sauf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sauf02000
]
X998_0117 (tet(38))
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
sauf01504
]
X998_0117 (tet(38))
Transporters [BR:
sauf02000
]
Major facilitator superfamily (MFS)
Drug transporters
Drug:H+ antiporter-2 (14 spanner) (DHA2) family [TC:
2.A.1.3
]
X998_0117 (tet(38))
Antimicrobial resistance genes [BR:
sauf01504
]
Gene variants
Tetracycline resistance genes
Transporters
X998_0117 (tet(38))
Gene sets
Vancomycin resistance modules
Tetracycline resistance, efflux pump Tet38 [MD:
M00704
]
X998_0117 (tet(38))
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHW66410
LinkDB
All DBs
Position
complement(2246180..2247532)
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MNVEYSKIKKAVPILLFLFVFSLVIDNSFKLISVAIADDLNISVTTVSWQATLAGLVIGI
GAVVYASLSDAISIRTLFIYGVILIIIGSIIGYIFQHQFPLLLVGRIIQTAGLAAAETLY
VIYVAKYLSKEDQKTYLGLSTSSYSLSLVIGTLSGGFISTYLHWTNMFLIALIVVFTLPF
LFKLLPKENNTNKAHLDFVGLILVATIATTVMLFITNFNWLYMIGALIAIIVFALYIKNA
QRPLVNKSFFQNKRYASFLFIVFVMYAIQLGYIFTFPFIMEQIYHLQLDTTSLLLVPGYI
VAVIVGALSGKIGEYLNSKQAIITAIILIALSLILPAFAVGNHISIFVISMIFFAGSFAL
MYAPLLNEAIKTIDLNMTGVAIGFYNLIINVAVSVGIAIAAALIDFKALNFPGNDALSSH
FGIILIILGLMSIVGLVLFVSLNRWTQSEK
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgttgaatattctaaaataaagaaagcagtacctattttattattcttatttgta
ttcagtttggttatagacaactcatttaaattgatttctgtagccattgctgatgactta
aacatatctgtaacgacagtaagttggcaagcgacattagccggtttagtaattggtatt
ggcgctgtagtatacgcttcattatctgatgccattagtatacgcacactatttatttat
ggcgtgatattaatcattatcggatcaattattggttacattttccaacatcaattccca
ttacttttagttggacgtattattcaaactgccggtttagctgctgcagagacattatat
gtgatatatgttgcaaagtatctttctaaagaggaccagaagacttaccttggcttaagt
acgagcagttattccttgtcattagttatcggtacattatcaggtggatttatttctacg
tatttacactggacaaatatgtttttaattgcattaatcgtagtatttacgttgccattc
ctatttaaattattaccaaaagaaaataatacgaataaagctcatttagattttgttggc
ttaattctagtggcaactattgctacaacagtcatgctgtttattacgaactttaattgg
ttatatatgattggtgccttaattgcgattatcgtttttgcgctatatattaaaaatgcg
caacgtccattagtaaataaatcatttttccaaaataaacgttatgcttcatttttattt
atagtatttgtaatgtatgctatccaattgggttatatttttacgttcccattcataatg
gagcaaatttatcatctgcaactagacacaacatcactgttattagtaccgggttatata
gtagcagtcattgttggtgcactaagtggtaaaatcggcgaatatctgaattcaaaacaa
gcgattatcacagcaattattttaatagcactgagcttgattttacctgcatttgcagta
ggtaatcacatttcaatcttcgtcatttctatgatattctttgcaggtagctttgcttta
atgtatgcacctttacttaacgaagccattaaaacaatagatcttaatatgacaggtgtg
gctattggtttttataatttaattattaatgtggcggtatctgtaggtattgcgattgct
gcggctctaatcgattttaaagcattaaatttcccaggcaatgatgcattaagttcacat
ttcggtattattttaattattttaggtttaatgagtattgtcggattagttttattcgtc
agcttaaatcgttggacacaatctgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system