Shewanella baltica OS223: Sbal223_1188
Help
Entry
Sbal223_1188 CDS
T00803
Name
(GenBank) transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family
KO
K18299
multidrug efflux pump
Organism
sbp
Shewanella baltica OS223
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sbp02000
]
Sbal223_1188
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
sbp01504
]
Sbal223_1188
Transporters [BR:
sbp02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Sbal223_1188
Antimicrobial resistance genes [BR:
sbp01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexEF-OprN [MD:
M00641
]
Sbal223_1188
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK45701
LinkDB
All DBs
Position
1399796..1402954
Genome browser
AA seq
1052 aa
AA seq
DB search
MLSQFFIKRPIFAAVLSLLFFITGAIAVWQLPITEYPEVVPPTVVVTANYPGANPKVIAE
TVASPLEQEINGVEDMLYMSSQATSDGRMTLTITFAIGTDVDRAQTQVQSRVDRAMPRLP
QEVQRLGIVTEKSSPDLTMVVHLLSPDNRYDMLYLSNYAALNVKDELARIKGVGAVRLFG
AGEYSLRIWLDPNKVSALGLSPADIIAAVREQNQQAAAGSLGAQPSGSADFQLLINVKGR
LTELSEFEDIIIKVGQNGEVNRLKDVARIELGATSYALRSLLDNKDAVAIPVFQASGSNA
IQISDDVRAKMAELSKGFPEGLTYEIVYDPTVFVRGSIEAVMKTLLEAVLLVVLVVVLFL
QTWRASIIPLVAVPVSLVGTFAFMHLLGFSLNALSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVERN
IAAGLSPVAATQKAMKEVTGPIVATTLVLAAVFIPTAFMSGLTGQFYKQFALTITISTFI
SAINSLTLSPALSALLLKSHDAPKDGLTRLMDKLLGGWLFTPFNRLFSRASDGYGWLVRK
VIRFGGIIGLVYLGMVALTGVQFAHTPTGYVPGQDKQYLVAFAQLPDAASLERTDTVIKK
MSEIALNHPGVAHSIAFPGLSINGFTNSPNSGVVFVALDDFELRKSPELSANAIAGQLNK
EFAGIQDAFIAIFPPPPVQGLGTIGGFRLQIQDRANLGYEALYQVTQQVMYKAWADPQLA
GIFSSYQVNVPQLELDIDRTKAKQQAVSLDQIFQTLQTYMGSTYVNDFNRFGRTYQVNMQ
ADEAFRQSPQQISQLKVPNLNGDMIPLGSFINVSQSSGPDRVMHYNGFTTAEINGGPAAG
VSTGQAQAAIEKILAETLPNGMTYEWTELTYQQILAGNTGLLVFPLVILLVFMVLAAQYE
SLSLPLAIILIIPMTLLSALSGVLIYGGDNNIFTQIGLIVLVGLATKNAILIVEFAKEKQ
DHGMAPMDAILEAARLRLRPILMTSIAFIMGVVPMVFSTGAGAEMRQAMGVAVFAGMIGV
TVFGLILTPLFYYALAKRGSKKVEEHKELAVS
NT seq
3159 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatcgcagttttttattaaaagaccgatatttgcagccgtactctcactgctgttt
tttatcacaggggcgattgctgtttggcaactgccgatcactgaataccctgaagttgtg
ccgcccacagtcgtggtgaccgctaactacccaggcgctaaccctaaagtgattgccgaa
accgtggcttcgccgctggagcaggaaatcaacggcgtcgaagacatgttgtacatgtca
tcgcaagcgacgtccgatggacgcatgaccttgaccatcacctttgccattggcacggat
gtggacagggcgcaaacccaagtgcagagccgagtcgatcgcgctatgccgcgtctgcca
caggaagtgcaacgcttaggcatagtcaccgaaaagtcatcgccggacctcaccatggtg
gtgcatttgctgtcaccggataaccgttatgacatgttgtatttgtctaactatgcggcg
ctgaacgttaaagatgagctcgcacggattaaaggtgtgggcgcggtacgcttgtttggc
gctggggaatacagcctgcgtatttggctcgacccgaataaagtctcggcgctgggttta
tcacctgcggacattattgctgccgtgcgtgagcaaaaccaacaggcggcagcgggcagt
ttaggtgctcagccaagtggtagtgctgacttccaactcttaattaacgtgaaaggccgt
ttaactgaactgtctgaatttgaagatatcatcatcaaagtcggtcaaaacggtgaagtg
aatcgtttgaaggatgtagctcgtatcgagctgggtgcgacaagctatgcgctgcgctca
ctgctggataacaaagatgccgtggcgattcctgtgttccaagcatcgggttcaaatgcg
attcagatttccgatgatgtgcgcgccaaaatggctgaattgtctaaaggattccccgaa
ggattaacgtacgaaatcgtttacgacccaaccgtgttcgtgcgcggctcgattgaggcg
gtgatgaaaaccttgcttgaagccgtgttgctggtggtgttagtggtagtgctgttcttg
caaacgtggcgcgcctcaattattccgctggtggctgtgcctgtatcgttagttggtacc
tttgcctttatgcatttgctcggcttctcgcttaacgcactgtcgctgtttggactcgtg
ctcgccatcgggattgtggtggacgatgcaattgtggtggtcgaaaacgtcgagcgtaat
attgccgctggtttaagcccagttgcggcaacgcaaaaggcgatgaaagaagtgaccggc
ccgattgtggcaaccaccttggtgctggcggcggtgtttattcctacggcgtttatgagt
ggtttaaccgggcagttctataaacagtttgccttgacaatcactatttcgacctttatt
tcggcgattaactcactcactttaagtccagcattatccgcgttattgctcaagagtcat
gatgcgccgaaggatggtttaacccgtctaatggacaagttgctgggtggttggttgttc
acgccttttaaccgcttatttagccgtgcatccgatggctatggttggttagtgcgtaaa
gtgatccgttttggcggcattatcggcctagtgtatttaggcatggtagcgctaacgggc
gtgcaatttgctcatacaccaacgggttatgtaccgggtcaagataaacagtatttagtg
gcgtttgctcagttgcccgatgcggcttcccttgaacgtaccgataccgtgatcaaaaag
atgtctgagattgcccttaatcaccctggtgtggcgcactcgattgccttcccaggcctt
agtatcaacggttttactaatagtcctaactcaggcgttgtgtttgtcgcgcttgatgat
tttgaattgcgtaagagtccagagctgtcggcgaatgccattgctggacaattgaataaa
gagtttgctggtattcaagacgcatttattgccatcttcccgccgccacctgtgcaaggc
ctcggcactataggagggttccgtctgcaaattcaagacagagccaaccttggttatgag
gccttgtatcaggtgacccaacaagtgatgtacaaggcgtgggccgatcctcagttagcc
ggaattttctctagctatcaggtgaatgtgccacaacttgaactggatattgatcgaact
aaagcgaaacagcaggcagtgtcgctcgatcaaatcttccagacattacaaacctatatg
ggctcgacctatgtcaacgatttcaatcgtttcggtcgaacctatcaggtgaatatgcaa
gccgatgaggcgttccgtcaaagcccgcagcagataagtcagctgaaggtaccgaatctg
aatggtgatatgatcccgctagggtcgtttatcaacgtcagccaaagctcaggcccagac
agagtgatgcactataacggctttacgaccgctgaaatcaacggtggcccagcagcaggt
gtgagtaccggccaagcgcaggcagcgattgaaaaaatcctcgccgaaacgttgccaaac
ggtatgacctacgaatggactgagttaacttatcagcaaatcttagcgggcaatacgggc
ttgttagtcttcccgctggtgatcttgctggtgttcatggtgctcgcagcccagtacgag
agcttaagcttgccattggcgattatcttaatcattccaatgaccttgctctcagccctc
agtggagtattaatttacggtggcgacaacaatatcttcacccaaattggcctgatagtg
ctggtgggactcgcgactaagaatgctatcttgattgtcgagttcgccaaggagaaacaa
gatcacggtatggcacctatggatgcgatattagaggcagcaagattacgtttacgtcct
atcttgatgacatctatcgcctttattatgggagtggtgcctatggtattctccactggc
gctggcgccgagatgcgtcaagccatgggcgtggcagtattcgccggtatgattggtgtg
acagtgttcggccttatcctaacgccattgttctactacgcactggcaaagcgaggcagt
aaaaaagtcgaagagcataaagagctagccgtcagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
