Sphingobacteriaceae bacterium GW460-11-11-14-LB5: CA265_05045
Help
Entry
CA265_05045 CDS
T05546
Name
(GenBank) hydrophobe/amphiphile efflux-1 family RND transporter
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
sbx
Sphingobacteriaceae bacterium GW460-11-11-14-LB5
Pathway
sbx01501
beta-Lactam resistance
sbx01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sbx00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
CA265_05045
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
CA265_05045
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sbx02000
]
CA265_05045
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
sbx01504
]
CA265_05045
Transporters [BR:
sbx02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CA265_05045
Antimicrobial resistance genes [BR:
sbx01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
CA265_05045
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Patched
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARS39073
LinkDB
All DBs
Position
1197108..1200308
Genome browser
AA seq
1066 aa
AA seq
DB search
MFQKFIDRPVLSTVISILLVIVGILGLTKLPLERFPNIAPPSVLVTAVYPGANAETILRS
VTPSLEEAINGVENMTYMTSSASNDGTLAITVYFQQGTNPDQAAVNVQNRVSQATSQLPA
EVVQYGITTTKQQNSFIGAIGVYSEDPKKYDAVFVNNYAQINIIPELKRIPGVGSASVFG
GIKDYSMRIWLNPSQLATYKITPNEVITAIQDKNLEAAPGRFGERSSEAFEYIIKYKGKL
TKPEEYQNIAIRSNADGSILRLKDVARVELGAYSYGSVNRLNGHDGITIGVIQLSGSNAN
EIQIAIDKLLAKLSKDFPAGIKHNQFYRTKTDLDESINQVEHTLIEAFLLVFIVVFIFLQ
DFRSTLIPAIAVPVAIIGTFFFMQLFGFSVNLLTLFALVLAIGIVVDDAIVVVEAVHAKM
EENPSLSPRAATTEAMNEITGAIISITLVMAAVFLPVGFMTGSTGIFYKQFALTMAIAII
ISAVNALTLSPALAALFLKNKHAEGGHHAPKKGFVEKFYAGFNGGFNYMTNRYIGGLRVL
IRNKWISMGGLALIVLVTIFLVGRTKTGFIPTEDQGFVAIAVASPSGTSLANTNKILKQA
EAELRAMPSARFVMSLAGYNFLTASNSPSAGQIFLLLKPNDERGAVKNIDEIQNIVRAKM
AAISAGTFFVFSFPTVPGFSNVEAMNVMLQDKTNGRLDKFSGVANNFIAKLMAKPAIAYA
FTSYKADYPQLQLDVNDEKADQLGVSKKDILQTMQTYFGTAQASDFNRFGKYYRVVVQAD
VADRTDPASIDRVFVKNKSGESVPISTLVKLTRVYGSETASRYNLFNSIEVNAIPKPGFS
SGDAIKAIEETAREQLPTGYAYEFSGQTREEISSGGQSTVIFLLCLVFVYFLLSAQYESY
ILPLAVILSIPTGVFGVFVVLGLTGIENNIYVQVALIMLIGLLAKNAILIVEFAVQRRKA
GLSLVNAAIEAARLRIRPIIMTSLAFVFGLFPMSIATGPSAQGNHSISIGAAGGMVSGVI
LGLFIIPVLFVIFQALQEKISKKSRNEVVHHHGEPVNNNHVVYETV
NT seq
3201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcagaaatttatagacaggcctgtactttcgactgttatttccatcttattggta
atagttggtatactgggcttaaccaagttgcccttagagcgctttccaaatatcgcacct
ccgtcggtattggtaacagcggtataccctggggccaatgccgaaacgattttacgttcg
gtaactccatcattggaggaagccattaatggtgtggagaacatgacctacatgacctcc
agcgccagtaatgatggtaccctggcgatcacggtatactttcagcaaggtaccaacccc
gatcaggccgcagttaatgtgcaaaaccgggtttcacaggccaccagtcaactgcctgct
gaggtagtacaatatggtatcaccaccacaaaacagcaaaacagttttattggcgcaatc
ggggtttactcggaagatccaaaaaaatacgatgcggtttttgttaataactatgcacaa
atcaatatcattcccgaacttaaacgtatcccgggtgtaggttcggccagtgtatttggt
ggtattaaagattattcgatgcggatttggttaaacccaagtcaattggctacttataaa
attacacctaatgaagtgatcaccgccattcaggacaaaaacctggaagcggctccgggc
aggtttggagaaagaagtagtgaggcttttgaatacatcattaaatataaaggtaagctg
accaaaccagaggaatatcagaatatcgcgatccgctctaatgcagatggttctatatta
cgtttaaaagatgtggcccgtgttgaattgggtgcatacagttatggtagtgtaaaccgt
ttaaacggacatgatgggattaccattggtgtaatccagttatcaggctcgaatgccaac
gaaatccagattgccattgataaactgttagcgaaactttcaaaagatttcccggcaggt
attaaacacaatcagttttaccgtaccaaaaccgatcttgacgaatccatcaatcaggtg
gaacacactttgatcgaagcctttttactggtatttatcgttgtatttatcttccttcag
gatttcaggtcaactttaattccagcaattgccgttccggtggcgattatcggtactttc
tttttcatgcagctgttcggcttctcggttaaccttttaacgctgtttgcattggtactc
gccattggtattgtggtggatgatgcgattgtggtcgtcgaagcggtgcatgccaaaatg
gaagaaaatccttcgcttagtccgagggcggcaactaccgaagcgatgaacgaaattacc
ggggccattatatcgattaccctggtgatggcagccgtatttttaccggttggttttatg
accggctcaacaggtatcttttacaaacagtttgccttaaccatggccattgccatcatt
atatcggctgttaacgccttaactttaagtcctgctttggcagccttattcttaaagaac
aaacatgccgaaggcggtcatcacgcacctaaaaaaggttttgtagaaaagttttatgca
ggttttaacggtggcttcaattatatgaccaaccgttatattggcggcttaagggtgttg
atccgcaataaatggatcagtatgggcgggcttgctttaatcgttttggttaccattttt
ctggtaggcagaaccaaaacaggctttattccgacagaggatcagggttttgtggcgatc
gcggtggccagtccatcgggaacatcactggctaatacgaataaaatattaaaacaggct
gaagctgagttgagggcgatgccatcagcacgatttgtaatgtcgctggccggttataac
tttttaacggcttccaacagtccatcagctggtcagattttcttattgttaaaaccaaac
gacgaaaggggagcggttaaaaatatcgatgagatccagaatatcgtaagggctaaaatg
gcggctatctctgccggtactttctttgtattcagttttcctacggttccgggctttagt
aatgtggaagccatgaacgtgatgttacaggataaaacgaatggcagactggataaattt
agtggtgtagcgaataactttatcgccaagttaatggcgaaaccggctattgcttatgct
tttacttcttataaagcagattatccgcagttacaactggatgttaacgacgaaaaagcc
gatcagctgggcgtaagtaaaaaagatattttacaaacgatgcagacttatttcggtacg
gcacaggcatcagattttaaccgctttggtaaatactaccgtgtagtggttcaggcggat
gttgccgacaggaccgatccggccagtatcgaccgtgtgtttgtgaaaaacaaatctgga
gaaagtgtgcccatcagtacgctggttaaattaacccgtgtatatggttcggaaacggct
tcacgttataacctgtttaactcgatcgaagtcaatgcgatccctaaaccaggtttcagt
tctggtgatgcgatcaaggcgattgaagaaaccgccagagaacaattgccaacgggttat
gcttacgaattctccggacaaacccgtgaggaaatttcttcaggcggacagtcgacggtg
atcttcctgttatgtttggtgtttgtttacttcttattatcggcacagtatgagagttat
atcctgccattagcggtaatcttatctatccctacaggtgtattcggtgtgtttgtggta
ttgggtttaaccggtatcgaaaataacatttatgtacaggtagcgctgatcatgctgatc
ggattgctcgctaaaaatgccatcctgattgtggagtttgcggtacagcgacgaaaggct
ggactgagtttggttaatgcggccatagaagcagcgcgattaaggatcagaccgatcatt
atgacctcactggcctttgtgtttggtttattcccgatgagtattgccacggggccatcg
gcacagggtaaccactccatcagtattggtgctgcaggcggtatggtatcaggtgtaatt
ttaggtttgttcatcattccggtactctttgtcatcttccaggctttacaggaaaaaata
tcaaaaaaatcaagaaatgaggttgttcaccatcatggagaacctgtcaataataatcat
gtagtttatgaaacggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system