Suncus etruscus (white-toothed pygmy shrew): 126020918
Help
Entry
126020918 CDS
T09902
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
setr
Suncus etruscus (white-toothed pygmy shrew)
Pathway
setr04350
TGF-beta signaling pathway
setr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
setr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
126020918 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
126020918 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
setr00536
]
126020918 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
setr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
126020918 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_TEN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126020918
NCBI-ProteinID:
XP_049638481
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(92892195..93163652)
Genome browser
AA seq
2869 aa
AA seq
DB search
MRRRGVLEVTLGFTALLAAYTSLGVGASLEAGNGKETRASRAKRRGGGGHDALKGPNVCG
SRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPSGQISPSCGSRSIQHCN
IRCMNGGSCSDDHCLCQKGYIGTHCGQPVCESGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQCERD
YRTGPCFTVVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIR
TGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHKFNEVSQKCEDIDECSTIPGICE
GGECTNTVSSFFCKCPPGFYTSSDGTRCIDVRPGYCYAGLTNGRCSNQMPQSITKMQCCC
DTGRCWSPGVTVAPEICPIRQTEDFNRLCSVPLVTPERPGYPPGPPLGPLPPVHPVPPGF
PPGPHVPGPRPPVDVYPSRGPPRKTSKVLPVNVTDYCQLFRYLCQNGHCIPTPGSYRCEC
NQGFQLDLRGECIDVDECERNPCAGGDCVNTPGSYICQCRSGYQSTLTRTECRDIDECLQ
NGRICNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFHVTVDGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKC
ICKPGFQLASDGRYCKDINECETPGICMNGRCVNTEGSYRCECFPGLAVGLDGRVCVDTH
MRSTCYGGYKRGQCVKPLFGAVTKSECCCASTEYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPG
MTSSGSDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNSGYEVDSTGKNCIDINECALNSLLC
DNGQCRNTPGSFVCTCPKGFIYKPELKTCEDIDECESNPCINGVCKNSPGSFICECSSES
TLDATKTICIETIKGTCWQTVIDGRCEININGATLKSECCSSLGAAWGSPCTLCQLDPIC
GKGYSRIKGTQCEDINECQVFPGVCKNGVCVNSPGSFRCECPSGMTLDTTGRICLDIRLE
TCYMRYDDEECTLPISGRHRMDACCCSVGAAWGTHECEECPVRNTPEYDELCPRGPGFAT
KEITNGKPFFKDINECKMIPSLCTHGKCRNTIGSFKCKCDTGFSLDSEERNCTDIDECRI
SPDLCGRGQCVNTPGDFECKCDEGYESGFMMMKNCMDIDECQRDPLLCRGGNCLNIEGSY
RCECPPGHQLAPNISACIDINECELSGNLCPHGRCVNLIGKYQCACNPGYHSTPDRLFCV
DIDECSIMNGGCETFCTNSEGSYECSCQPGFALMPDQRSCTDIDECEDNPNICDGGQCTN
IPGEYRCLCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLNPNICLSGTCENTKGSFICHCDMGYSGKKG
KTGCTDINECEIGAHNCDRHAQCTNTAGSFKCSCSPGWIGDGIKCTDLDECSNGTHMCSQ
HADCKNTMGSYRCLCKEGYSGDGFTCTDLDECSENLNLCGNGQCLNAPGGYRCECDMGFV
PSADGKACEDIDECSLPNICVFGTCQNLPGLFRCVCETGYELDQSGGNCTDVNECLDPTM
CISGNCVNTPGSYTCDCPPDFELNPTGVGCVDTRSGHCYLDIRPRGDNGDTACSNEIGVG
VSKASCCCSLGKAWGTPCELCPSVNTSEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGL
CQGGKCINTFGSFQCRCPTGYYLNEDTRVCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPP
DYMQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELVFNMTKKMCCCSYNIGRAWNRPCEQC
PIPSTDEFATLCGSQRPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPMG
FLYNDKLLICEDIDECQNGQVCQRNAECINTAGSFRCDCKPGYRFTSTGQCSDRNECQET
PNICSHGQCIDTVGSFYCICHTGFKTNDDKTMCLDINECERDACGNGTCRNTIGSFNCRC
NHGFVLSHNNDCIDVDECATGNGNLCRNGQCINTVGSFQCQCNEGYEVAPDGRTCVDVNE
CALDPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYSLQNDKCEDIDECVEEPEICALGTCSNTEGSF
TCLCPDGFSLSSTGRRCQDLRVSYCYSKFEGGKCSAPKSRNHSKQECCCALKGEGWGDPC
ELCPTEPDEAFRNICPYGSGIIVGPDDSAVDMDECKEPDVCKHGQCINTDGSYRCECPFG
YILEGNECVDTDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLL
CAFRCVNTYGSYECKCPDGYVLREDKRMCKDEDECETGKHDCAEKQMECKNLIGMYMCIC
GPGYQRRPDGEGCVDENECQTRPGICENGRCLNTVGSYTCECNDGFTASPTQDECLDNRE
GYCFTEVLQNMCQLGSSNRNPVTKSECCCDGGRGWGPQCEICPFQGTVAFKKLCPHGRGF
MTNGADIDECKVIHDVCRNGECVNDEGSYHCICKTGYTPDITGTACIDLNECSQAPKPCN
FICKNTEGSYQCSCPKGYILQDDGRSCKDLDECATKQHNCQFLCVNTIGGFTCKCPPGFT
QHHTACIDNNECTSDINLCGSKGVCQNTPGSFTCECQRGFSLDQSGGSCEDVDECEGNHR
CQHGCQNIIGGYRCSCPQGYLQHYQWNQCVDENECLSAHICGGASCHNTLGSYKCTCPTG
FQFEQFSGGCQDINECGSSQAPCSYGCSNTEGGYLCGCPPGYFRIGQGHCVSGMGMGRGL
SEPQASSEMDDNSLSPEACYECKINGYPKRGRKRRDTNDMHQSEIEANVSLASWDVDNTA
TFDYNISNFDHKVRILELFPALTTLTNHNRYLIESGNENGLFKINQKQGISYLHFTKKKP
VAGTYSLQIGSTPLYKKKELKQLEDKHDKDYLSGELGDNLKMKVQISLH
NT seq
8610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgacggcgcggggtgctggaggtcaccctgggatttaccgcgctcttagctgcctac
acgagcctgggcgtgggcgccagtttggaagctgggaatgggaaggagaccagagccagc
agagcgaagagaagaggcggcggaggacacgacgcgctcaaaggacccaatgtctgtgga
tcacgttataatgcttattgttgtcctggatggaaaaccttacctggtggaaatcaatgt
attgttcccatttgccggcattcctgtggggatggattttgttctaggccaaatatgtgc
acttgcccatctggtcagatatcgccttcctgtggctcccgatccatacaacactgtaat
attcggtgtatgaatggaggtagctgcagcgacgaccactgtctatgccagaaaggatac
atagggacacactgtgggcaacctgtctgtgaaagtggctgtctcaatggaggtcggtgt
gtggctccaaatagatgcgcttgcacttatggctttactggaccccagtgtgaaagagat
tacaggacgggcccatgttttactgtggtcagcaaccaaatgtgccaggggcagctcagt
gggattgtctgcacaaaaacgctctgctgtgctactgtgggaagagcctggggccaccct
tgtgagatgtgcccggcccagccacacccgtgtcgtcgtggtttcattccaaacatccgc
acaggagcttgtcaagatgtggatgaatgccaggccatccctggactgtgtcaaggagga
aattgcattaatactgttgggtcttttgagtgcaaatgcccagctggacacaaatttaat
gaagtgtcacaaaaatgtgaagatattgatgaatgcagcaccattcctggaatctgtgaa
gggggagaatgtacaaacacagtcagcagtttcttttgcaaatgcccccctggattttac
acctcttctgatggcaccagatgcatagatgtccgcccaggatactgttatgcaggcctg
acaaacgggcgctgttctaaccagatgccgcagtccatcaccaaaatgcagtgttgctgt
gacactggccgatgttggtctccaggggtcacagtcgcccctgagatatgtcctatcaga
caaacagaggatttcaacaggctgtgctctgtccctctggtaactcctgagagaccagga
tatcctcctggaccaccacttggccccctcccaccagttcaccctgttcctcctggcttt
cctcctggacctcatgttccgggacctcgtccaccagtggatgtgtatccatctcgggga
ccaccacgtaagacttcaaaggtgctgcctgtcaatgtcactgattactgccagttattt
cgctatctctgtcaaaatggacactgcatcccaactcctgggagctaccgatgtgagtgt
aaccaaggattccagctggacctccgtggagaatgcattgatgttgatgaatgtgagaga
aacccctgtgctggtggagactgtgtcaacactccgggttcctacatctgccagtgccga
agtggataccagagcaccctcacccgcacagagtgccgagacattgacgaatgtttacag
aatggccgtatctgcaacaacggacgttgtgtcaacacggatggcagtttccactgtgtc
tgtaatgcaggctttcatgtgactgtagatggcaagaactgtgaagatatggatgaatgc
agcataaggaatatgtgcctgaatggaatgtgcatcaatgaagatggaagctttaaatgt
atttgcaaacctggattccagctggcatcagatgggcgttattgcaaagatatcaatgag
tgtgaaacacctggaatttgcatgaatgggcgatgtgtcaacactgaaggctcctataga
tgcgagtgcttccctggattggctgtgggcctggatggacgtgtgtgtgtcgacacacat
atgcgaagcacatgctacggtggatacaagagaggccagtgtgtgaaacctttgtttggt
gctgtgactaaatctgaatgctgttgtgccagcactgaatatgcttttggggaaccttgc
cagccatgtcctgcacagaattcagcggaatatcaggcgctctgcagcagtgggccagga
atgacatcatcaggcagtgatataaacgagtgcgcattagatcctgatatttgtccaaat
ggaatttgcgagaatcttcgtggcacctacaaatgtatatgcaattcaggatatgaagtg
gattcaactggaaaaaattgcattgatattaatgagtgtgcattgaatagtttactttgt
gacaatggacagtgtaggaacactcctggaagttttgtctgtacctgtcctaagggattt
atatacaaacctgaactaaaaacctgtgaagacattgatgaatgcgaatcgaatccttgc
attaatggagtctgcaaaaacagccctggctctttcatttgtgaatgttcgtctgaaagt
accttggatgcaaccaaaaccatctgcatagaaaccatcaagggtacttgctggcagacg
gtcattgatgggcggtgtgaaattaatatcaatggtgccaccttgaagtctgagtgttgt
tcttcccttggcgctgcctgggggagcccatgtaccctttgtcaacttgatcccatttgt
ggtaaaggatattcaaggattaaaggaacacaatgtgaagatataaatgaatgtcaagtg
tttccgggagtatgcaaaaatggtgtatgtgtcaactctccaggatcctttaggtgtgaa
tgtcccagtggaatgactttggataccacagggagaatctgcctagatattcgcctggaa
acatgttacatgcgctatgatgatgaggagtgtactctgcccatttctggccgccaccgc
atggatgcctgctgctgctctgtgggggcagcctggggtacccacgagtgtgaagaatgt
ccagtgagaaacacacctgagtatgatgaactctgtcctagaggacctggatttgccaca
aaagaaatcacaaatggaaagcccttcttcaaagatatcaacgagtgcaagatgattccc
agtctctgtacccacggcaagtgcagaaacacaattggcagcttcaagtgcaaatgtgac
actggcttctcacttgattctgaagagaggaactgcacagatattgatgaatgccgcatc
tctcctgacctctgtggccgaggccagtgtgtgaacactccaggggactttgagtgcaag
tgtgatgaaggctatgaaagtggattcatgatgatgaagaactgcatggatatcgatgag
tgtcagcgagacccgcttctgtgtcgaggaggtaattgcctgaacatcgaaggcagttac
cgctgtgaatgtcctccgggccatcagctggcccccaacatctcagcctgtatagacatt
aatgagtgtgagctgagtgggaacctctgcccccatggccgctgtgtgaacctcattggg
aagtaccaatgcgcctgcaaccctggctatcattctacgcccgacaggctgttctgtgtg
gacattgatgaatgcagcatcatgaatggtggctgtgagaccttctgtacaaactctgaa
ggcagctatgaatgtagctgtcagccaggatttgcactaatgcctgaccagagatcatgc
actgacattgacgagtgcgaagataaccccaatatctgtgatggtggtcaatgtaccaat
atacctggagagtacaggtgcttatgttatgatggatttatggcatctgaagatatgaag
acttgtgtagatgtaaatgaatgtgacctgaatccaaatatctgcctaagtggaacttgt
gaaaatacaaaaggctcatttatctgccattgtgatatgggatattctggaaaaaaaggg
aaaactggctgtacagacatcaatgaatgtgaaattggagctcacaactgcgacagacat
gctcaatgtaccaacacagcaggaagcttcaaatgtagctgcagccctggctggatagga
gatggcattaagtgtactgatctcgatgaatgctccaatgggacccatatgtgcagccag
catgctgactgcaaaaacaccatgggatcataccgctgtctctgcaaggaaggctacagt
ggcgatggcttcacatgtacagatcttgatgaatgctctgagaacctaaatctgtgtggc
aacggccagtgcctgaatgcccctggagggtaccgctgtgaatgtgacatgggctttgtg
cccagtgctgacgggaaagcttgtgaagatattgatgagtgctcacttccaaatatctgt
gttttcgggacttgccaaaaccttcctggcctattccgttgtgtgtgtgaaacaggctat
gaactggaccaaagtggtggaaactgtacagatgtgaatgagtgtctggatccaaccatg
tgtattagtgggaattgtgtcaacactccgggcagctacacctgcgattgtccacctgat
ttcgaactgaatcccactggagttggctgtgttgatacccgctccggacattgctacttg
gatatccgacctcgaggtgacaatggagatacagcctgtagcaatgaaattggagttggt
gtttccaaggcttcctgctgctgttctctgggtaaagcctgggggactccttgtgagctg
tgcccctctgtgaacacatctgagtataaaactctttgtcctggaggagaaggttttcga
cccaaccctatcactgtgatattagaagatattgatgagtgccaggagcttccaggacta
tgccaaggagggaaatgtatcaacacatttggcagtttccagtgccgctgtccaacaggc
tactacttgaatgaagatacccgtgtgtgtgatgatgtgaatgaatgtgaaactccagga
atctgcggtccagggacatgttacaacacggtgggcaactatacctgtatttgccctcct
gactacatgcaagtgaatgggggcaataattgcatggatatgagaagaagtttatgctac
agaaattattatgctgacaaccagacctgtgatggagaactggtatttaatatgaccaag
aagatgtgttgttgttcctataacattggtcgagcctggaataggccatgtgaacagtgt
cccatccccagtacagatgaatttgctacactctgtggaagccagagaccaggttttgtc
attgacatttacactggattacccgttgatattgatgaatgccgagagattcctggagtc
tgtgaaaatggggtgtgtatcaacatggttggcagcttccgttgtgaatgtcccatgggc
ttcttgtacaatgacaagttgttaatttgtgaagatattgatgagtgccagaacggccag
gtatgccaacgcaatgctgaatgcatcaacaccgctggcagcttccgctgtgactgcaag
cctggctaccgcttcacctccactggacagtgcagtgatcgcaatgaatgtcaagaaaca
cccaatatatgtagccatggacagtgtattgatacagtgggaagcttttattgcatttgt
cacactggctttaaaacaaatgatgataaaactatgtgtttggacataaatgagtgtgaa
agagatgcctgtggaaatggaacttgccgaaacaccattggctccttcaattgccgttgc
aatcatggttttgtcttatctcacaacaatgactgcatagatgttgacgaatgtgccacc
ggaaatggaaacctttgcagaaatggccagtgcatcaatacagtggggtcctttcaatgt
cagtgcaatgaaggctatgaagtggctccagatggcaggacctgtgtggatgtaaatgaa
tgtgctctggatcctggaaagtgtgcgccaggtacctgtcaaaatttggatggatcttac
agatgcatttgtccacctggatacagtctacagaatgacaagtgtgaagatattgatgag
tgtgttgaagagccagaaatttgtgccttgggaacttgtagtaacactgaaggcagcttt
acatgtctatgtccagatggcttctctttgtcctctacgggaaggaggtgccaagatttg
cgagtaagctattgttactcaaagtttgaaggaggaaaatgctcagcacccaaatctaga
aatcactccaagcaagaatgctgctgtgccttgaagggagaaggttggggtgatccctgt
gaactgtgccccaccgaacctgatgaagccttccgaaatatatgtccctatggaagtgga
attattgtgggacctgatgactcggcagtggacatggacgagtgtaaagagccagatgtc
tgtaaacatgggcagtgcatcaatacggatggttcctatagatgcgagtgtccctttggc
tacattttggaagggaatgaatgtgtggatactgatgaatgttctgttggtaacccttgt
ggaaatggaacttgcaagaatgtgattggaggctttgaatgcacctgtgaggagggattt
gaacctggtccaatgatgacttgtgaagacataaatgagtgtgcccagaatcccctactg
tgtgctttccgatgtgtaaacacatatgggtcatatgaatgcaagtgtccagatggatat
gttctaagagaagacaaaaggatgtgcaaagatgaggacgagtgtgaaactggcaaacat
gactgtgctgagaagcaaatggaatgcaagaacctcattggcatgtatatgtgtatctgt
ggacctggctaccagcgaagacctgatggagaaggctgtgtagatgagaacgaatgccag
accagacctggaatctgtgagaatgggcgctgccttaatactgtggggagctacacctgt
gagtgcaatgatggattcacagccagccccacgcaggatgaatgcctcgacaaccgggaa
gggtactgcttcacagaggtgctacaaaacatgtgccagcttggctcaagcaacaggaac
cctgtcaccaagtctgagtgctgctgtgatggaggaagaggttggggtccccagtgtgag
atctgccctttccagggtacagtggctttcaaaaaactctgcccccatggacgaggattt
atgaccaatggagcagatattgatgaatgtaaggttattcatgatgtttgccgaaatgga
gaatgtgtcaatgacgagggatcataccactgcatttgtaaaactggctacactccagac
ataactggaactgcctgtatagatctgaatgagtgcagccaggctcccaaaccctgcaat
tttatctgcaaaaacacagaaggaagttaccagtgttcgtgcccgaaaggctatatactg
caagatgatggaagaagctgtaaagatcttgacgagtgtgcaaccaagcaacacaactgc
cagttcctgtgtgtcaacaccatcggtggcttcacatgtaaatgtccccctggattcacc
cagcaccatactgcctgcattgataacaatgaatgcacttctgacatcaacctgtgtggc
tctaagggcgtttgccaaaatactcctgggagctttacctgtgaatgtcaacgaggattc
tctcttgatcagagtggaggcagctgtgaagatgtggatgagtgtgaaggaaaccatcgc
tgccagcatggctgccagaatatcattggaggctaccggtgcagctgcccccagggctat
cttcaacactaccagtggaaccagtgtgtcgatgagaatgaatgtttgagtgctcacatc
tgtggcggagcttcctgtcacaatacactggggagttacaagtgcacatgtcctactggc
ttccaatttgaacagttcagtggaggatgtcaagacatcaatgaatgtggctcttcacaa
gcgccctgcagttatggttgttccaatactgagggtggctatctgtgtggctgcccacct
ggttacttcagaataggccaaggccattgtgtttctggaatgggcatgggacgtggcctt
tcagagccacaggccagcagtgaaatggatgacaattccctctctccagaggcttgttat
gagtgtaaaatcaacggctaccccaaacgaggcaggaaacggagagacaccaatgacatg
catcagtcggagatagaagccaatgtgagtcttgcaagttgggatgttgacaatacggcc
acattcgattacaatatctccaatttcgatcacaaggtccgaattctggagctctttcca
gcgctgacaactctaacaaatcacaacagatacttgattgaatctggcaatgaaaatggc
ttgtttaaaatcaaccaaaagcaagggatcagctatctccactttaccaagaagaagcca
gtggctggaacctattcattacaaatcggtagtactccactttataaaaagaaagaactt
aagcagctagaagataaacatgacaaagactacctcagtggtgaactgggtgataatctg
aagatgaaagttcagatatcacttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
