Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil): 100926696
Help
Entry
100926696 CDS
T02286
Symbol
FBN1
Name
(RefSeq) fibrillin-1 isoform X1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
shr
Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil)
Pathway
shr04350
TGF-beta signaling pathway
shr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
100926696 (FBN1)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
100926696 (FBN1)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
shr00536
]
100926696 (FBN1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
shr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
100926696 (FBN1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_TEN
EGF_Teneurin
EGF_PEAR1L
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100926696
NCBI-ProteinID:
XP_031811011
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(499917849..500186267)
Genome browser
AA seq
2373 aa
AA seq
DB search
MRRGGLLELALGFTVLLSSYTSHGAEGNSETGNVKETRASRAKRRGGGGHDALKGPNVCG
SRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQISPSCGSRSIQHCN
IRCMNGGSCSDDHCLCQKGYTGTHCGQPVCESGCLNGGRCVAPNRCACTYGFTGPQCERD
YRTGPCFTLVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPNIR
TGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSFECKCPAGHRFNEVTQKCEDIDECITIPGVCD
GGECSNTVSSYFCKCPPGFYTSPDGTRCIDVRQGFCYASLANGRCNNQLPQQLSKVQCCC
EVGRCWAPGPATAPEMCPIRATEEFHRLCTLPGIVPGRPDIPLPPGVFPPSGPVPPGVPV
PPGIYPPIPRPQLPEPYPSREPSRVLPVNITDYCQLYRGLCLNGHCIPTPGSYRCECNKG
FQLDIRGECIDVDECEKNPCVGGECVNTQGSYICQCRVGYQSTLTRTECRDIDECLQNGR
ICNNGRCINTEGSFHCVCNAGFHVASDGKNCEDMDECSIRNMCLNGMCINEDGSFKCICK
PGFQLASDGRYCKDINECETPGICMNGRCVNTDGSYRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHMRS
TCYGGYKRGQCVKPLFGAVTKSECCCASTEYAFGEPCQPCPAQNSAEYQALCSSGPGMTS
GGSDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNSGYEVDASGKNCVDINECALNTLLCDNG
QCRNTPGSFTCTCPKGFVYKPDLKTCEDIDECESSPCVNGVCKNTLGSFVCECSSESTLD
TTKTICIETIKGTCWQSIVDGRCEININGATLKSQCCSSLGAAWGSPCTPCQTDPICAKG
YSRIKGTQCEDIDECVVFPGVCKNGHCVNTLGSFVCQCPSGMTLDLTGRICLDIRLETCY
LKHEDEECSLPVAGRHRMDACCCSVGAAWGSVECEECPLRNTPEYDALCPRGPGFATRGE
IINGKPFFKDINECKMIPTLCTHGKCRNTIGSFKCRCDNGFALDSEERNCTDIDECRISP
DLCGQGICVNTPGDFRCECFDGYESGFMMMKNCMDIDECQRDPLLCRGGTCLNTEGSYRC
ECPPGHQMAPNISACIDINECDLSVNLCRNGRCVNLIGKYQCACNPGYHATPDKLFCVDI
DECSIMNGGCDTFCTNSEGSYECSCRQGFALMPDQRSCTDIDECEDNPNICDGGQCTNIP
GEYRCLCYDGFMASEDMKTCVDVNECDLNPNICLSGSCENTKGSFICHCDMGYSGKKGTT
GCTDINECEIGAHNCDRHAVCTNTAGSFKCSCSPGWIGNGIKCTDLDECSNGTHMCNQHA
DCKNTMGSYRCLCKEGYTGDGFTCIDLDECSENLNLCGNGQCLNAPGGYRCECDMGFVPS
ADGKACEDIDECSLPNICVFGTCHNLPGLFRCECETGYELDRTGGNCTDVNECLDPTTCI
SGNCVNTPGSYTCDCPPDFELNPTRVGCVDTRSGNCYLDIRPRGDNGDTSCSNEIGVGVS
KASCCCSLGKAWGTPCELCPAVNTSEYKILCPGGEGFRPNPITVILEDIDECQELPGLCQ
GGKCINTFGSFQCRCPTGYYLNEETRVCDDVNECETPGICGPGTCYNTVGNYTCICPPDY
MQVNGGNNCMDMRRSLCYRNYYADNQTCDGELLFNMTKKMCCCSYNIGRAWNKPCEQCPI
PSTDEFATLCGSQRPGFVIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPVGFF
YNDKLLVCEDIDECQNGPVCQRNAECMNTPGSFRCDCKPGYRFTSTGQCNDRNECQEIPN
ICSHGQCIDTLGSYYCLCQTGFKTNAEKNMCVDINECERDACGNGTCRNTVGSFNCRCNH
GFILSHNNDCIDVDECATGNGNLCRNGQCLNTVGSFQCQCNEGYEVTADGRSCIDINECL
ADPGKCAPGTCQNLDGSYRCICPPGYSLQNDNCEDIDECVEEPEICALGTCSNTPGSFKC
LCPEGFSLSSTGRRCQDLRMSYCYAKFEGGKCSSPKSRNHSKQECCCALKGEGWGDPCEL
CPTEPDEAFRQICPYGSGIIVGPDDTRIDMDECKEPDICKYGQCINTDGSYRCECPFGYI
LHGVECVDTDECSVGNPCGNGTCKNVIGGFECTCEEGFEPGPMMTCEDINECAQNPLLCA
FRCVNTYGSYECKCPTGYVLREDRRMCKDENECEEGKHDCAEKQMECKNLIGTYMCICGP
GYQRRPDGEGCIDENECQTKPGICENGRCLNTRGSYTCECNDGFTASPAQDECLDVIFSL
LLLFPAFHSHFFWPRVKYASFSFLLFVCFVFNI
NT seq
7122 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggagagggggtctgctggagctagccctgggatttacagtgctcttgtcttcctac
acgagccatggtgctgaagggaattcggagactgggaatgtgaaggaaaccagagccagc
cgggcaaagagaagaggcggaggaggacacgatgcgctcaaaggaccaaatgtgtgtgga
tcacgttacaatgcttattgttgccctggatggaaaaccttacctggtggaaatcagtgc
atcgtcccaatctgtcggcattcctgtggagatggattttgttcaaggccaaacatgtgt
acttgcccaactggacagatatctccttcctgtggctcaagatcaatacaacactgtaac
atccggtgtatgaatggaggtagctgtagtgatgatcattgtttgtgccagaaaggatat
acgggaacacattgtggacaacctgtctgtgagagtggttgtcttaatggaggtagatgt
gtggcgcccaatcgctgtgcttgtacatatggtttcacaggacctcagtgcgaaagagat
tacagaactggtccatgtttcacactagtcagcaaccagatgtgccagggacagctcagc
gggattgtctgtacaaagaccctttgctgtgccacagtaggaagagcttggggccatccc
tgtgagatgtgcccagcccaacctcacccctgccgcagaggcttcatcccaaacatccga
acaggagcttgtcaagatgtggatgaatgccaagccatccctgggctctgtcaaggagga
aattgcattaacactgttggatcatttgagtgcaagtgccctgctggacacagatttaat
gaagtaacacaaaaatgtgaagatattgatgagtgtatcactattcctggagtctgtgat
gggggtgaatgttcaaatactgtcagcagttatttttgcaaatgtcccccaggattttat
acctctcctgatggaaccagatgtatagatgttcgccaaggattctgttacgcgtccctg
gccaatgggcgctgcaacaaccagcttccccagcagctctccaaggtccagtgctgctgc
gaggtgggccgctgctgggccccggggcccgcgacagcccccgagatgtgccccatccgg
gccacagaggaattccacaggctttgcaccctacctgggatagttcctggaagacctgat
attcctttgcctcctggtgtcttccctcccagtggtccagtgcctcctggtgtccctgta
cctcctggcatctatccaccaatcccaagaccacaactcccagagccttatccatctcgg
gaaccgtcacgggtgttgccagtcaatatcacagattactgccagctgtatcgaggtctc
tgcctcaatggtcactgtattcccactcctgggagctaccgctgtgaatgcaacaaagga
ttccagcttgatattcgtggagaatgcattgatgttgatgagtgtgagaaaaatccttgt
gtaggtggagagtgtgtcaatactcaaggatcctacatatgtcagtgtcgagttgggtat
cagagcacattgacaaggactgaatgtcgagatattgacgaatgtttacagaatggccgg
atctgcaataatggacgttgtataaacacagaaggcagtttccattgtgtgtgtaacgct
ggtttccatgtagcaagtgatgggaaaaattgtgaagatatggatgaatgcagcataagg
aacatgtgcctcaatggaatgtgcatcaatgaagatggcagttttaagtgcatttgtaaa
cctggcttccagctggcatcagatggccgttactgcaaagatattaatgaatgtgaaaca
cctggaatctgcatgaatggacgctgtgtgaatacagatggatcctatcgatgtgaatgc
ttccctggactggcagtggggctagatggacgagtgtgtgttgatactcacatgcggagt
acatgttatggtggatacaagagaggacagtgtgtcaaacctctgtttggagcagttact
aagtctgaatgctgctgtgccagcaccgaatatgcctttggggagccttgccagccttgc
cctgcacagaattcagcggaatatcaagcactttgcagcagtgggccaggaatgacttca
ggaggcagtgatataaatgaatgtgccttggatcctgatatttgcccaaatggaatttgt
gagaatttacgtggcacatacaagtgtatatgcaattcaggatatgaagtggatgcgagt
gggaaaaactgtgttgatattaatgaatgtgcattaaacaccttgctttgtgacaatggg
caatgcagaaatactcctggaagtttcacttgtacctgtcccaagggatttgtatacaaa
cctgacctaaaaacttgtgaagatattgatgaatgtgaatcaagtccttgtgttaatgga
gtatgcaagaacactctgggttcttttgtttgtgaatgttcttcagaaagtactttggat
acaacaaaaactatctgcatagaaacaattaaaggtacatgttggcagagtattgttgat
ggaagatgtgaaatcaatatcaatggagccacattgaagtcacaatgctgttcttcactg
ggtgctgcctggggaagcccatgtacaccgtgtcaaacagacccaatatgtgctaagggg
tactcaagaattaaaggaacacagtgtgaagatatagatgaatgtgttgtattccctgga
gtgtgcaaaaatggccactgtgtcaatactttgggatcatttgtttgccagtgccccagt
gggatgactttggatctcacaggaagaatctgccttgatatccgcctagaaacttgctat
ctgaaacatgaagatgaagaatgctctttgcctgttgctggccgtcaccgaatggatgca
tgctgctgttctgttggggctgcttggggcagtgtagaatgtgaggagtgtcccctgaga
aatactcctgaatatgatgctctttgccctagagggcctggatttgccacaagaggagag
ataataaatggaaaacctttcttcaaagatataaatgagtgcaagatgatcccaactttg
tgtacacatggcaaatgcagaaataccattggcagctttaaatgcaggtgtgataatggt
tttgctctcgattctgaagaaaggaactgcacagatattgatgaatgccggatatctcct
gatttgtgtggccaaggcatctgtgtgaataccccaggagactttagatgcgagtgcttt
gatggatatgaaagtggatttatgatgatgaagaactgcatggatattgatgaatgtcag
agagaccctctactttgtcgaggtggcacatgcctaaatacagaaggaagttaccgatgc
gagtgccctcctggccaccaaatggctcctaatatctcagcctgtatagatatcaatgag
tgtgatctaagtgttaacctttgcagaaatggtcgctgtgtgaacctgattgggaagtac
caatgtgcttgcaatccaggctaccatgccacacctgataaactgttttgtgttgatatt
gatgaatgtagcataatgaatggaggctgtgacaccttctgcaccaactctgaaggcagt
tatgaatgcagttgtcgacagggatttgcacttatgccagatcagagatcttgcactgac
attgatgagtgtgaagataaccctaatatttgtgatggaggtcagtgtacaaacatacct
ggagagtacaggtgcctatgttatgatgggttcatggcatcggaggatatgaagacatgt
gtagatgttaatgaatgtgatcttaatccaaacatttgtctgagtggcagctgtgagaac
acgaaaggctcatttatctgtcattgtgacatgggatattcaggcaaaaaaggaacaact
ggctgtacagacatcaatgaatgtgaaattggagcacataattgtgacaggcatgctgtc
tgcactaacacagcaggaagcttcaaatgcagctgcagtccaggatggattggtaatggc
attaagtgcacagatttggatgaatgctctaatgggacgcatatgtgtaaccaacatgct
gactgtaaaaatacgatgggatcataccgctgtttatgtaaggaaggatacactggagat
ggattcacttgtatagatcttgatgaatgctcagaaaatctaaacctttgtggaaatggg
caatgccttaatgccccaggaggatatcgatgtgaatgtgatatgggatttgtgccgagt
gctgatggaaaagcatgtgaagatattgatgagtgttcccttcctaatatctgtgtcttt
gggacttgtcataatcttcctggtcttttccgttgtgagtgtgagactggctatgaactg
gacagaactggaggaaactgcacagatgttaatgagtgcctggaccctacaacttgtatt
agtgggaattgtgtgaataccccaggcagttatacctgtgattgtccacctgattttgag
ctgaaccccaccagagttggctgtgttgatacacgatctggcaattgctatttggatatt
cgccctcgaggagacaatggagatacatcatgtagcaatgaaattggagttggtgtttct
aaggcttcctgctgctgttccctgggtaaagcttggggcactccttgtgaactctgcccg
gctgtgaatacatctgaatataagattctttgcccaggaggtgaaggctttcgaccaaat
cctatcactgttatattggaagatattgatgagtgtcaagaactgcctggactttgccaa
ggagggaaatgtatcaacacatttggcagtttccagtgtcgctgcccaactggttactac
ttgaatgaagaaacccgagtgtgtgatgatgtaaatgaatgtgaaactcctggtatctgt
ggtcctggaacgtgttataacacagttgggaactacacttgcatttgtcctccagactat
atgcaagttaatggtggaaataactgcatggatatgagaaggagcttatgctaccgaaat
tattatgctgacaaccagacctgtgatggagaactgctgttcaatatgaccaagaaaatg
tgttgctgttcctataacattggccgtgcctggaataagccttgtgaacagtgtcccatt
cccagcactgatgaatttgctacactgtgtggtagtcagaggcctggctttgtcattgac
atttatactggcttaccagttgatatcgatgaatgccgagagatccctggagtctgtgaa
aatggagtttgtatcaatatggttggtagcttcagatgcgaatgtcccgtggggttcttt
tataatgacaagttattggtttgtgaagatattgatgaatgccagaatggccctgtatgt
cagcgcaatgcagaatgtatgaacacaccagggagcttccgctgtgactgtaaaccagga
tacagattcacctcaacaggacaatgcaatgataggaatgaatgccaagaaattcctaat
atctgcagccatggtcaatgcattgacacacttggaagttactattgcctttgtcaaact
ggatttaaaacaaatgctgaaaaaaacatgtgtgtggatataaatgagtgtgaaagagat
gcctgtggaaatggaacttgtagaaacactgttggttctttcaactgccgatgcaaccat
ggattcatcctctcacacaacaacgattgtatagatgttgatgaatgtgctactgggaat
gggaacctttgcagaaatggtcagtgtctcaatacagttggatccttccagtgtcaatgc
aatgagggctatgaagtgactgctgatggaagaagttgtattgatataaatgagtgtcta
gctgatcctggaaaatgtgcaccaggcacatgtcaaaacttggatggatcctacagatgc
atttgtcctcctggttacagcctgcaaaatgacaactgtgaagatattgatgagtgtgtg
gaagagccagaaatctgtgccttaggcacctgcagtaacactccaggcagcttcaaatgt
ctctgtccagaaggtttttcattatcctctactggaagaagatgccaagacttaagaatg
agctactgctatgcgaagtttgaaggaggcaaatgttcatctcctaaatccagaaatcat
tccaaacaagaatgttgctgcgccttaaagggagaaggttggggggacccatgtgagctg
tgtcctactgagccagatgaagcatttcgtcaaatctgcccatatggaagtggtatcatt
gttggacctgatgatactcgtattgatatggatgaatgcaaagaacctgatatctgcaaa
tatggccaatgtatcaacacagatggttcctaccgctgcgagtgtccttttgggtatatc
ctccatggagttgagtgtgtagataccgatgaatgttcggtgggtaatccttgtggaaat
ggaacgtgcaagaacgttattggaggttttgaatgtacctgtgaggaagggtttgagcca
ggtcccatgatgacatgtgaagatatcaatgaatgtgctcagaatcctctgctctgtgcc
ttccgatgtgtaaacacttatgggtcatatgaatgcaaatgtccgactggttacgttctt
agagaagacaggagaatgtgcaaagatgagaatgaatgtgaagaaggaaagcatgactgt
gctgagaaacaaatggagtgcaagaacctaattggcacatatatgtgcatctgtggtcct
ggctaccaacgaagacctgatggagagggttgcatagatgagaatgaatgtcagaccaag
ccaggaatctgtgaaaatggacggtgcctcaataccagaggaagctatacatgcgagtgc
aatgatggtttcacagctagccctgctcaagatgagtgtcttgacgtcatcttttctctc
ttgctgctgtttccagcttttcactctcatttcttctggcccagggttaagtatgcttcc
ttttcatttcttttgtttgtttgttttgtttttaatatctga
DBGET
integrated database retrieval system
