Scomber japonicus (chub mackerel): 128360884
Help
Entry
128360884 CDS
T09718
Symbol
megf6
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
sjo
Scomber japonicus (chub mackerel)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sjo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
sjo04990
]
128360884 (megf6)
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
sjo04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
128360884 (megf6)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
EGF
EGF_2
EGF_TEN
EGF_3
DSL
hEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128360884
NCBI-ProteinID:
XP_053177407
LinkDB
All DBs
Position
6:12618777..12671914
Genome browser
AA seq
1624 aa
AA seq
DB search
MSPDILILCVISFCTMHIASSVELQLGMPNVCAEQEMSMLGARQPCVNAFTRMVKVWKQG
CTSQRWCMGYERRTAYFTAYRQVYSMDMHTVYKCCPGWTQKGEELGCLHRECSANTCFNG
GRCAESGDHICQCPGGFKGPRCQYDVNECEVDEGGCEGYCCNTIGSFYCKCPEGSRLGPD
GKACHDVNECAELNGGCQQTCVNTPGSYHCECSEGFRMHSDARTCIAVNSCSVLNGGCEH
KCVDMGNNHYKCECRRNYQLKRDGRHCELRDPCEERNGGCTQLCFSEGGRAHCSCRSGFT
LAGDGKTCEDIDECSSGQARCSHGCVNMLGSFSCVCHPGFELGADGKQCYRIEMEIINSC
EKNNGGCSHQCEHTTNGPLCSCNHGYQLDEDRKTCVDSDECFSGESCCSHFCRNYPGGYE
CSCRAGHRLNPDGCGCDDIDECLTEISGCEHYCVNTLGTYECFCRLGFRLDQDQHTCISL
YGRDLEEEDEEEEEEEEEQLEVHRLPDLLFRKAPQLLQYTAALQYHYDSDDDDDGDGGDN
DKELEFQRERRGELRLDSHIVCLDNSFGDDCSLSCEDCLNGACSENRKRCECSPGWTGVI
CNETCPQGTYGQACNSLCRCQNGGSCDPVTGKCLCPPGVQGLLCEDGCPRGYFGRYCNRK
CNCPNNGHCHRLYGACLCSPGLYGRFCHLPCPRWTHGAGCSKECVCVREHSTGCDPKTGS
CFCKPAYHGPQCEKECEPGFFGAGCEQSCDCTGGGSCDPRTGECNHRCPAGLHGDKCQQA
CSAGSYGESCRLTCDCGGAACDPITGQCICPAGKTGDSCQEDCTVGFWGMKCQSFCPPCE
NGGSCNKQTGVCDCQPGFTGTFCQNECPQGYYGPGCLTRCSCHNDAICDPQTGQCVCPPG
KRGHRCATSCESGYWGQGCISKCQCQETSLGCDPVTGQCVCEAGFTGDYCEGKCMNGTYG
QGCAQQCQCQSGALCDHVSGACTCSPGYAGTFCEKMCPDGFYGLDCGQMCECRNGARCHH
ITGACLCTAGWAGPHCILECQEGHFGEQCSQICECQNRARCDHITGRCSCMAGWTGVSCQ
LPCPAGQYGEHCSGQCLCQNGGSCDSVTGQCSCLSGWTGAACELECEEGHYGENCIQICS
CANGGRCDRVTGRCVCLLGWMGELCQSACSKGFFGEGCERRCDCAHSSGCHHVTGRCDCE
PGWRGAKCDKPCLPGSYGASCAQRCQCQAGVSCHHETGSCGCPAGLTGPGCEKTCPAGMF
GQNCSQLCQCSGDQEQCHPVTGKCSCLPGYYGSRCHLRCRAGTFGPNCKTRCSCVNGGRC
DFRTGACYCPPGFIGANCSSTCPSGYYGKDCAKLCSCGEGGKCHSATGRCICAAGRMGQS
CHQACPRGRYGLQCRSTCNCQNGGICDPVNGSCKCGLGWTGPRCDTACSQRKYGLDCAQD
CPCLNNGTCDRFVGTCSCTAGYYGHSCQHRCPSGFFGMNCALTCDCKVGQTCDHVTGQCV
CPPGYYGPQCQRRCEVGRFGLNCESSCDCAGEAPCDPSTGRCLCSPGRTGQRCEKDCGGD
RFGPDCSLPCQCSHGAHCDGLTGRCLCQLTWLGPTCSEALLHQTPGVLKFSVSQRKRRAG
SKTT
NT seq
4875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccccagatattttgattttgtgtgtgatatcattctgcactatgcacatcgcgtca
tctgtggagctgcaacttggcatgccaaatgtttgcgctgagcaggagatgtccatgttg
ggggcccgtcagccatgtgtcaatgcttttacacgcatggttaaagtgtggaagcagggc
tgcacaagccaaagatggtgtatgggctacgagaggaggacagcatacttcacagcctac
aggcaggtgtacagcatggatatgcatacagtctataagtgctgccctggctggactcag
aagggtgaagagctgggctgtctgcatagggagtgtagtgccaatacatgtttcaatggg
gggcgatgtgcagagagtggagaccatatatgccagtgtccagggggcttcaaagggcca
agatgccagtatgatgttaacgaatgtgaggtggatgaaggtggctgtgaggggtactgt
tgcaacaccattggcagcttctactgcaagtgtcctgagggcagtagactggggccagat
ggcaaggcatgtcacgatgtaaatgagtgtgcggaactcaatggaggatgccagcaaaca
tgtgtcaacacaccgggctcttatcactgtgaatgcagcgaaggcttccgtatgcactct
gatgctcggacctgtattgctgtgaattcttgctcggtgcttaacggtggatgcgagcat
aagtgtgttgacatggggaacaatcactacaagtgtgagtgtcgaaggaactaccagctg
aaaagagatgggaggcactgtgaattgagggacccctgtgaggagaggaatggaggctgc
acccagctctgtttttcggaaggtggccgggctcattgcagctgccgatccggttttaca
ctggctggagatggaaagacatgtgaagacattgatgaatgcagttcgggtcaagccagg
tgttcccatggctgtgtcaacatgctgggctcctttagctgtgtgtgtcatccgggtttt
gaactcggtgctgatggcaaacagtgctaccgcattgagatggagatcatcaacagctgc
gagaagaacaatggaggttgctctcatcaatgtgagcacaccaccaatgggcccctctgc
tcctgcaaccatggctaccagctggacgaggataggaagacctgtgtagatagcgatgag
tgtttcagtggggagtcctgctgcagccacttctgcagaaactatccgggtggctacgag
tgcagctgcagagcaggccacagactaaacccagacggctgtggctgtgatgacattgat
gagtgcctgacagagatctcaggctgtgaacactactgtgtcaacacacttggaacatat
gagtgtttttgtcgactgggcttccgcttggatcaggaccaacacacctgcatctctctc
tatggcagagacctggaagaagaagacgaggaggaggaggaagaagaggaggagcagctg
gaagtccacaggttaccagatctgctgtttcgcaaagctcctcagcttcttcagtacaca
gcagccttgcaatatcattatgacagtgatgatgatgatgatggtgatggtggtgacaat
gataaagaattagagtttcagagagagcgtcgaggagaacttagactggacagccatata
gtgtgtctagacaactcgtttggggatgactgcagtttgagctgtgaagactgtttgaac
ggagcgtgtagtgaaaacagaaagcgatgtgaatgttcacctggttggactggggtcatc
tgcaatgaaacttgtccacaggggacctatgggcaggcatgtaacagtctttgccgttgt
cagaatggaggctcgtgtgaccctgtgaccgggaagtgtttgtgcccccctggggtgcaa
ggcctgctctgcgaggatggttgtccaaggggttatttcggaaggtactgcaacaggaag
tgtaattgtcccaacaatggacactgccatcgtctgtatggagcatgcctgtgctcccca
ggattatatggccgcttctgccacctgccttgtcccaggtggacacacggtgcgggctgt
tccaaggaatgcgtctgtgttcgagaacattccactggctgtgaccccaaaacgggaagc
tgtttctgtaagcctgcataccatggtccacagtgtgagaaagaatgtgagcctggcttc
tttggtgcaggctgtgagcagtcatgtgactgcacaggtggagggtcatgtgacccgagg
actggagagtgtaaccatcgatgtcctgcaggacttcatggagataaatgtcagcaggcc
tgctcagctgggagctatggagagagctgtcgtctgacctgtgactgtgggggagctgct
tgtgatcccataaccggacagtgcatctgtcctgctgggaagaccggagactcatgtcag
gaagactgcactgttggattctgggggatgaagtgccagtcgttttgtccgccatgtgag
aatggaggctcctgcaacaagcagactggtgtctgcgactgccagcccggcttcacagga
acattctgccaaaatgagtgtccccaaggttactatggaccaggctgtttaacacgctgt
tcatgtcacaatgatgccatctgtgacccacagacgggacagtgcgtctgccctcctggc
aaaagaggccacagatgtgcaacttcatgtgaatctggttactggggccaaggttgcatc
agtaaatgtcagtgccaagaaacctctctgggctgtgatcctgtcaccggtcagtgtgtg
tgtgaggctggtttcactggagactactgtgaaggaaagtgtatgaatggcacttatggt
caggggtgtgcacagcagtgccagtgtcagagtggagccctgtgtgatcacgtgagcgga
gcctgcacatgttcccctggatatgctggcacgttctgtgaaaaaatgtgcccggacggc
ttttacggtcttgactgtggccagatgtgcgagtgcaggaacggtgcccgctgccaccac
atcacaggagcctgcctatgcaccgccggctgggcaggaccacactgcattctggaatgc
caggagggtcattttggggagcagtgcagtcagatctgtgagtgtcagaacagagccagg
tgtgaccacatcaccgggagatgcagctgtatggctgggtggaccggagtcagctgccaa
ctgccatgtcctgcaggacaatatggggaacactgttctggccaatgtctgtgtcaaaat
ggaggctcctgtgacagtgtgactggccagtgctcctgcctgtctggctggacaggagct
gcttgtgagttagagtgtgaggagggacattatggagagaactgtatccagatctgcagc
tgtgcaaatggaggcagatgtgacagagtgacaggaagatgtgtctgtctgctcggttgg
atgggggagctctgtcagtcagcctgttctaagggattctttggtgagggctgcgagcgg
cgatgtgactgtgcccatagctcgggttgccaccatgtgacgggccgctgtgactgtgag
ccaggctggagaggagccaagtgcgacaaaccctgcctcccagggtcctatggtgcttcc
tgtgcccagcggtgtcagtgccaggctggggtgtcctgtcaccatgagacggggagttgt
ggctgcccagctggactcacagggcctggctgtgagaaaacgtgtcctgctggcatgttt
gggcaaaactgcagccagctgtgccagtgttcaggagaccaagagcagtgccatccagtg
acaggaaaatgtagttgtttacctggttactacgggtcacgctgtcacttacgatgtcga
gcagggactttcggaccaaactgtaagaccagatgcagttgcgtcaacggtggtcgctgt
gacttcaggactggggcttgctactgtcctcctggcttcatcggagctaactgtagctca
acttgtccgagtgggtattatgggaaggactgtgccaagctgtgttcctgtggagaagga
gggaagtgccactcagcaaccgggaggtgtatctgtgcggctggcaggatgggacagtcc
tgtcatcaagcatgtcctagggggcgttacggcctgcagtgcagaagcacatgcaactgt
cagaatggagggatttgtgatcctgtcaacgggtcttgtaagtgtggactgggctggact
ggaccccgctgtgacacagcctgttcacagagaaaatatgggcttgattgtgcgcaagac
tgtccatgcctcaacaacgggacctgtgaccgttttgttggcacctgcagctgtactgct
ggatattacggccactcctgtcaacacagatgtccctctgggttttttggaatgaactgt
gctcttacctgtgactgtaaggtgggacagacctgtgaccatgtcacaggacaatgtgtg
tgtccaccaggctactatgggccacaatgccaaagacgatgtgaagttggaaggttcgga
ttgaactgtgaaagttcatgtgactgtgctggtgaggctccatgtgatccatcaactggg
cggtgcctctgctccccaggaaggacagggcagagatgtgaaaaagactgtggtggagac
cgctttggtcccgactgctctctgccgtgccagtgttcccatggcgcccactgtgatggg
ctgactgggcgatgtctgtgccaactcacctggctgggccccacctgtagtgaagctctg
ctacaccaaaccccaggagtgttgaagttttctgtgtcccaaagaaagagaagagcaggc
agcaaaaccacataa
DBGET
integrated database retrieval system