Schistosoma mansoni: Smp_139200
Help
Entry
Smp_139200 CDS
T01095
Name
(RefSeq) nuclear hormone receptor nor-1/nor-2, putative
KO
K08558
nuclear receptor subfamily 4 group A member 2
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
smm03000
]
Smp_139200
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03310 Nuclear receptors [BR:
smm03310
]
Smp_139200
Transcription factors [BR:
smm03000
]
Eukaryotic type
Zinc finger
Cys4 nerve growth factor IB-like
Smp_139200
Nuclear receptors [BR:
smm03310
]
4. Nerve growth factor IB like
4A. Nerve growth factor IB like receptor
Smp_139200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
zf-C4
Hormone_recep
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8350425
NCBI-ProteinID:
XP_018645049
LinkDB
All DBs
Position
1
Genome browser
AA seq
1550 aa
AA seq
DB search
MAIPITFQSLHETTNSGLMIHSCDIHDTFDSHIPSIPSNHHYYHEVGHIDGSDSMNTNGL
FPEWSLKLSSKQDVYVKSNSEDTTNYTDPLFLSTNLELNYPKLSYTTECNSEQEISSSLL
PDCLSKGLSELVNKLNNDNTDHGIPNQSECYESNELSNCLTTIPSTLNIFTSFTNSEVNN
KVNSLNSSNCYPSLSHKSHSDHLYSPISTKYNDHTSSHSSNLTNESLNISKMFNLDHYET
MKPSFNDKDLIHEGTLQLQTSFEKVKNFTTNKKLLHNDEYTEPSVSLSAEEIVKRHIIHS
YTNKNDEQDKVVSFLNYPTSSIVSYDHLTTTLLNHTSWIHKDETSSSSSFKRNQSLSTLK
QSRLKRKIDDPYSSYTINHGTRNPCRQLSNMNQNFIQEGKHCITDTTNKPYTLHTTHNGL
QSIPESYFIDFTHDHPLNQSDHLCIKEIEQKIKCSLPCCLSYSNEMAYNTPMNCIETPSI
INNQSSYLSHRSIPLDDWDKTIEKSTFNYDISSSSMNHLERIESANNDYSIYTTHEPLNF
TPSFDYYIHPMAQRYSSTCSNDEYHNSNNSNGDNKSIISSTFHQEPQQICHRNNTTNNNS
SNTLDYLNINPLTYFSSNLFPSTDINDKFKMNSSHLTAKQAFLIRNYLHGDNHKNFTKIT
HIHDELFNISNKSSSSSTIMTTNEDTTATTTTTTHTTNNDPSIHSILNNETILPIEHNSN
SNTMNSNNSNITNSNGNSNNINNDLCLNEFDNFLHLTPSNCNCIIDCKGDVDDDGDGDYY
VTVKDNNNALNDYKGNTNKLFQKKFPPKSSLYNPLDIENKSSCYGDKSTTTTTTILCNKL
NYNNYNDTILLNNNKSNTIIHNIDSYHCLNGIESLNEKHIKLYNEHNKCLSPSLLSSSSS
SSHSSSSYLTGNHSTPTPISIPSTSSSTSSSSTLSLSSTSTPSIISSKVSNYNLNDLNSI
TINEIDCHQLCLVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTIQKNAQYVCLQAKNCVVDKRRR
NRCQYCRFQKCLKVGMVKEVVRRDSLKGRRGRLSSKARCQLNEHGGLTNCYSDGSINKNL
LPLHSFLHKRNSISPNYTSINGKRYSGSNIQLNNSNRTNSCTVNSTVTLLSMLSRAYEMV
GPRIHPVIVNHDNSFIQSHECSKKHDVSNGEVGDSLQTSPDDTQIDEQYTTKFCSILEES
MNELKHYAELVPGFMNLSMNDREIMLNLHFLDLLSFRLAWRVAMETEVTTHLNYAPTLFI
ENHSDNCTKLNQIIHDNTLIDKTHDISSSMKMTPITTTMVTTTSAVTKTDTSSNYENIYA
PTINNWNPQNHSEIECYKTNYLLNNSSSKNYQKQIEFVFENGKSMSYYELLKSGFGNWAN
QIQQLSNQLKLLIQDDYNAIWGLAALILVNYKSINYLTPLTNSSEVYSLHHRFVEMLKSH
CCSSTQHINLTTNTQSSLLLDSTHTTNNIISSIHNNPSRKINKLIPNDHITSTSLLRNDS
TYFSKVFQQKDVIHEMTREYLIQPLQRLYEMDPNTYIWLKDIIEIMKLSD
NT seq
4653 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctataccaattacattccaatcattacatgaaacaactaattcaggattaatgata
cattcatgtgatatacatgatacatttgattctcatattccatcaataccctctaatcat
cattattatcatgaagtaggacatattgatggatcagatagtatgaatacaaatgggtta
tttcctgaatggtcattaaaactatcatctaaacaagatgtttacgtgaaaagtaactcc
gaggatacaacaaactatactgatcctctatttcttagtacaaacttagagcttaactat
cctaaactttcttatactacagaatgtaattcagaacaagaaatcagctcatctttatta
cctgattgtttatctaaaggtttaagtgagttagtcaataaactaaataatgataacaca
gatcatggtatacctaatcaatctgaatgctatgaatctaatgaattgtccaattgtcta
actaccattccttcaacattgaatattttcacatcatttactaattctgaagtaaacaat
aaagtaaactccttgaattcatctaactgttatcctagtctaagtcataaatctcattcc
gatcatttatatagtccaatatcaacaaaatacaatgatcatacatcaagtcattcatca
aatctcaccaatgaatcattgaatatatcaaaaatgtttaatttagatcattatgaaaca
atgaaaccgtcatttaatgataaagatttgattcatgaaggaacacttcagctacagaca
tcatttgaaaaagtgaagaatttcacaactaacaaaaaacttttacataatgatgaatat
acagaaccttcagttagtttatcagctgaagagattgttaaaagacatattatccattca
tatacaaataaaaatgatgaacaagataaagtggtttcgtttttgaattatccaacatct
tcaattgtttcatatgatcatcttacaactactttattaaatcatacttcatggattcat
aaagatgaaacttcttcttcttctagttttaaaagaaatcaatcattatcaacattgaaa
caatcacgtttaaaacgtaaaattgatgatccttattcatcttatacaatcaatcatgga
actaggaatccttgtcgacaattatcaaatatgaatcagaattttattcaagaaggtaaa
cattgtattactgatactactaataaaccatatacattacatactactcataatggatta
caatctatccctgaatcctattttatagattttactcatgatcatccattgaatcaatca
gatcatttatgtattaaagaaattgaacaaaaaattaaatgttcattaccatgttgttta
tcctattcaaatgagatggcatataatacaccgatgaattgtatagagaccccttctatc
ataaataatcaatcatcttatctatcacatagatctattccattagatgattgggataaa
acaatcgaaaaatcaacattcaattatgatatatcatcttcatctatgaatcatttagaa
agaattgaatctgctaataatgattattcaatatatactactcatgaaccattgaatttc
actccttcatttgattattatatacatccaatggcacagagatattcatcaacctgttca
aatgatgaatatcataatagtaataatagtaatggtgataataaatcgattataagtagt
acatttcatcaagaaccccaacaaatatgccatagaaacaatactactaataataatagt
agtaatacattagattatttaaatatcaatcctttaacttatttctcatctaatctattt
ccttcaacagatataaatgataaatttaaaatgaactcttctcatttaacagctaaacaa
gcttttcttatcagaaattatctccatggtgataatcataaaaattttacaaaaattact
catattcatgatgaattatttaatataagtaataaaagtagtagtagtagcacaatcatg
acaacaaatgaagatactactgctactactactactactactcatactactaataatgat
ccatccattcattcaatattgaataatgaaactatactacctattgaacataatagtaat
agtaatactatgaatagtaataatagtaatattactaatagtaatggtaatagtaataat
attaataatgatttatgcttaaatgaattcgacaatttcctacatttgacaccatcgaat
tgtaattgtattatagattgtaaaggtgatgtcgatgatgatggtgatggtgactattac
gtaacagtcaaagataataataatgcattgaatgattacaaaggtaatactaataaatta
ttccaaaaaaaattcccccccaaatcttccttatataatccattagatatagagaataaa
agtagttgctatggtgataagtcaacaacaacaacaacaaccatattatgtaataaatta
aattataataattataatgatacaattttattaaataataataaatccaatacaataata
cataatatagattcatatcattgtttgaatggaatagaatcattgaatgaaaagcatatc
aaattatataatgaacataataaatgtttaagtccatcattattgtcatcgtcatcgtca
tcgtcccattcatcatcttcatatttaactggtaatcattcgacaccaacaccaatatca
ataccatcgacatcatcgtcgacatcgtcatcatctacattgtcgttatcatcgacatcg
acaccatcaataatatcatcaaaagtatctaattataatttaaatgatttaaattctata
acaattaatgaaatagattgtcatcaattatgtttagtatgtggtgataatgcagcatgt
caacattatggtgtaagaacatgtgaaggttgtaaaggtttctttaaacggacaattcaa
aaaaatgcacaatatgtatgtcttcaagctaaaaattgtgtagtcgataaacgtcgacgt
aatcgttgtcaatattgtcgatttcaaaaatgtttaaaagttggaatggttaaagaagtc
gttcgtcgggacagccttaaaggtcgtcgtggtcgattatcatctaaagcacgttgtcaa
ttaaacgaacatggtggattaaccaattgttacagtgatggtagtatcaataaaaatcta
ttacctttacatagttttcttcataaacgaaatagtatttcaccaaattatacatctatt
aatggtaaacgttactcaggttctaatatacaattaaataattcaaatagaacaaattct
tgtactgtaaattcaactgttacacttttatcaatgttaagcagagcctatgaaatggtc
ggaccaagaattcatcctgtcatagttaatcatgataatagtttcattcaaagtcatgaa
tgctccaaaaaacatgatgtatcaaatggggaagtaggggattctttacaaacttcacca
gatgatactcaaattgatgaacaatatacaacgaaattttgttcaattctagaagaatca
atgaatgaattaaaacattatgctgaattagttccaggatttatgaatttatcaatgaat
gatcgtgaaattatgttaaatttacatttcttggatttattaagttttcgtttagcatgg
agagttgctatggaaacggaagtaactacccatttaaattatgcaccaaccttatttatc
gaaaatcattccgataattgtacaaaattaaatcaaatcattcatgacaatactttaata
gataaaacacatgacatctcttcatctatgaagatgacacctataacaacaacaatggta
acaacaacatccgccgtgaccaaaacagacacatcatctaattatgaaaatatttatgct
ccaactatcaataattggaatccacaaaatcattcagaaattgagtgttataaaacaaac
tacttattaaataatagtagtagtaaaaattatcaaaaacaaatagaattcgtttttgaa
aatggtaaatctatgtcttattatgaattattaaaatctggttttggtaattgggctaat
caaattcaacaacttagtaatcaattaaaactattaatacaagatgattataatgcaatt
tggggtttagctgcattaattctagttaattataaatcaatcaattatctcactccattg
acaaattctagtgaagtctattcattacatcatagatttgttgaaatgttaaaaagtcat
tgttgttcatcaactcaacatataaatttaacaacaaacacacaatcatccttattactt
gattcaactcatactactaacaatataattagtagtattcataataatccatctagaaaa
atcaataaacttataccaaatgatcatataacatccacttcattattacgtaatgattca
acttatttctcaaaagtatttcaacaaaaagatgtaatacatgaaatgacacgggaatat
ttaattcaaccattacaacgtttatatgaaatggatccaaatacatatatatggttaaaa
gatattatagaaataatgaaattatcagactaa
DBGET
integrated database retrieval system
