Sphingobacterium sp. DR205: G6053_29545
Help
Entry
G6053_29545 CDS
T06466
Name
(GenBank) lantibiotic dehydratase
KO
K20483
class I lanthipeptide synthase [EC:
3.13.2.4
]
Organism
spdr
Sphingobacterium sp. DR205
Pathway
spdr02020
Two-component system
spdr02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
spdr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
G6053_29545
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
G6053_29545
Enzymes [BR:
spdr01000
]
3. Hydrolases
3.13 Acting on carbon-sulfur bonds
3.13.2 Thioether and trialkylsulfonium hydrolases
3.13.2.4 lanthipeptide synthase
G6053_29545
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lant_dehydr_N
Lant_dehydr_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIH36745
LinkDB
All DBs
Position
7019476..7022568
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MRRFKHYGKAILRVPLNSFLLSNNLSDYRDNKLFMEGVYLSSKEFYKIIDTNIYTVNDNG
KNDQTRQSLLKYWNRSCTRCTPFGTFASTSIIDILPTESRVVLDPQNRYRRSRIDMEYLS
SIIESLLQNIESKRNVKWYINDSLYRGTNFLRYIDWNVKNNNRTYGLNTVETTDYLDFII
ELAASGLKLDEVISILKIKYDLHSEEIWEYIDELINARILVPEIGAMVIQPTPFYTLEKI
VEIVPGDREKNSIKQLLTILKKLEVNAVIDDYEKINDILKDISPEVGKVENTIQTDMFLN
VEKGALNEKDIDKIITQVEETMALSKDYKSSTLDEFMRRFTERYDDNEISLLHALDSDIG
VGYGTFSDLSIGSSDILDNLPVSYPTIKGGYDSAVDKFVIKKFNDFLNGNDDIINIGEEE
LKKLESELDNNKSPNSTYIMGTYYLQREHGFKFDLTSIGGSSGANLLTRFSYGGKEFLEL
IKEITDKESEFIGTNNACNAEIVHLPDSRLGNILMRPSIRDFEITFLGNSTSDESTKIKL
SDLYVSVRNGTVFLKSKKHNRYIVPKLTSAHNYEYKSLPFYKFLCDLQQQNRSTPVVWDW
GILSDNRYLPRVEYKNLILAKARWKIIFEDIFVGSATLPKENEQKLKDFIVTANIPKKAL
LVEGDNTLLLDFESEDCIDILLKHLITKKTVILCEYLSSVENSIIEDNSSFYYNNEVIIP
IYSSTPSQEFFPKPAVNTTVKRRFLIGEECLFIKIYGGPESLDQILVDRLASFILAKSNY
FEKFFFIRYKDEFNHLRLRFFQSDKRTLSEFQETLTEFLNHLVDAEFIHSWTIDVYNREL
ERYFPENIDISETLFHYDSLTVLEALKSVRGEPEEEKYRLLIGLLGFLNYLDMFNLNLNE
KHEFAKKGANDFYQEFGGQKILQKEINKMYKIFQKDILSFLSDETSEEYGIFLKESFSLY
YEQLGVISTEILKNISNHKATGSIKNNLISSYVHMFINRLFINQQRKWEMIIYHFMERYF
LFKLKTNPNG
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaagatttaagcactatggaaaagctatattacgggttccactcaatagcttcctg
ttaagtaataatttatcagattacagggataataaacttttcatggaaggtgtatatctt
tcgagcaaagagttttacaagattatcgataccaatatttatacagtcaatgataatggg
aaaaatgatcagactagacaatctttattaaaatactggaatcggagctgtactcggtgt
actccttttggaacgtttgcttccacatctataattgatatactccccacagaaagtcgg
gttgtccttgatcctcaaaatagatatcgaagatctcggattgatatggaatacctatca
tctattatcgagtcacttttgcaaaacattgagtctaaaagaaatgtcaaatggtatatc
aatgatagcctttatagaggaacaaattttcttcgatatattgattggaatgtaaaaaat
aataatcgaacatacggattaaacactgttgaaactactgattatcttgattttataata
gaattagcagcttcaggtttaaaactggatgaagtgatctctatattgaaaataaaatat
gatttacactccgaagaaatttgggagtatattgatgaattgattaatgcgaggattctt
gttccagaaattggggcaatggtaatccaacctacccctttctatacattagaaaaaata
gtagaaattgtaccaggtgatcgagaaaaaaattcaattaaacaattgcttactatccta
aaaaaacttgaagttaatgcagtaattgatgattacgaaaaaatcaatgatattttaaaa
gacatttctccagaagtaggaaaagtcgaaaatacaattcaaaccgatatgttcttaaat
gttgagaagggggcattgaacgaaaaagatattgacaagataataacccaagtagaggaa
actatggctttgtcaaaagattataaatcttcgacattggacgaatttatgagacggttt
acggaacggtatgacgataatgaaatctctctattacatgcattggattcggatattgga
gtaggttacggaactttttcagatttatctattggcagttcagatattttagacaattta
ccggtttcttaccctacaataaaaggcggttatgattctgctgtcgataaatttgtaatt
aaaaaattcaatgactttctgaatgggaacgacgatattataaatattggggaggaggag
cttaagaagttagaatctgaattagataacaataaaagcccaaatagtacttatataatg
ggtacttattacctccaaagagagcatgggttcaaatttgatctaacatcaataggcgga
tcatcaggagcaaatttgctgacaagattctcttatggcggtaaagaatttttggaacta
ataaaagagattacagataaagagtctgaatttataggaactaataatgcttgtaatgct
gaaatcgttcatctacccgactcccgcttaggtaatattctgatgcgaccatcaattaga
gattttgaaattacatttttaggtaattcaacttcagatgaaagcactaaaattaaactt
tccgatttatatgttagtgttcgcaatggtacagtgtttttgaaaagtaaaaagcataat
cgttatattgtgcctaaattaaccagtgcccataattacgagtataaaagtctaccgttt
tataaatttttatgtgacctgcaacaacaaaatagatctacccccgtagtttgggactgg
ggtatactatctgataatcggtacttaccaagagtagaatacaaaaatttgatacttgcc
aaggcaagatggaaaattatttttgaggacatattcgttggaagtgctactctcccaaaa
gaaaacgagcaaaagcttaaagattttattgttaccgctaatataccaaagaaagcttta
ctggttgagggagataatactttactgctagattttgaatcggaagattgtattgatata
ctattaaaacatttgattacaaaaaagacggttattctgtgtgaatatctatcgtcagtt
gaaaattcaattatagaagataacagttcattttattataataacgaagttataatacca
atttatagctcaactccatctcaggagttctttcctaaaccagcagtcaacacaactgta
aaaagaagatttttaattggtgaagaatgtctttttattaaaatttatggtgggccggag
agcctagatcaaattcttgtagacagattagcctcctttattctagccaaatcaaattac
tttgagaaattctttttcattcgctataaagacgaatttaatcatttaaggctacgtttc
tttcaaagtgacaaaagaaccctctcggaatttcaggagaccttaaccgaatttctaaat
cacttggttgatgctgaatttatccattcatggacaattgatgtttataatcgagaatta
gaacggtattttcccgaaaatatagatatttctgaaaccttatttcattacgattcgtta
actgttctagaagcattaaaatcggtaagaggggagcctgaagaagaaaaatacagacta
ttgattggactcttaggctttttaaattacctagacatgttcaacttaaacttaaatgaa
aaacatgagtttgctaaaaagggagcaaacgatttctaccaagaattcggcggtcaaaaa
atactgcaaaaagagatcaacaaaatgtataagatatttcaaaaagatattctgtctttt
ctttctgatgagacaagtgaggaatatggaatttttttgaaagaaagtttcagcttgtat
tacgaacaactcggggttatttcaacggagatcttaaagaatatttctaatcacaaagcg
acaggttctataaaaaataatctaatttctagctatgtacatatgttcataaatcggcta
tttataaatcaacaaagaaaatgggaaatgattatctatcattttatggagcgatatttt
ctattcaaattaaaaactaatcctaatgggtga
DBGET
integrated database retrieval system