Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1: SYO3AOP1_1132
Help
Entry
SYO3AOP1_1132 CDS
T00715
Name
(GenBank) acriflavin resistance protein
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
sul
Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1
Pathway
sul01501
beta-Lactam resistance
sul01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sul00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
SYO3AOP1_1132
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
SYO3AOP1_1132
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sul02000
]
SYO3AOP1_1132
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
sul01504
]
SYO3AOP1_1132
Transporters [BR:
sul02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
SYO3AOP1_1132
Antimicrobial resistance genes [BR:
sul01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
SYO3AOP1_1132
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
MMPL
Peptidase_M17_N_1
Beta-prop_FBX42
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD66746
LinkDB
All DBs
Position
complement(1179762..1182866)
Genome browser
AA seq
1034 aa
AA seq
DB search
MLKWYISKPHLIFSILIAFAFMGIIGFFSMPRDLFPPADRPQIAVVVQEPGATAKYIADH
TASIIERQLYTISGIRRVYSTSNDGFCTVIAEFHYSKPLAEAKTDVANALSKVQNLLPKD
ILPPQIYEITSYTPPVMVLIVSPKKDSHPSLEDVRYIAENQIKNEILRTNAVANVDVFGG
YTKEVHIQIDNAKLSSYGLSPQDIINAIQKSNNDMPLGIMINKDTQNTFILKTEAKSLDE
LKNIQITKDVKLSDVAKVEFGIKPPTAMYQGNGKEGIALAIQRPYGGAVLSTISAVEEVL
PKIKAQFPQLNIDISDTQKELVKQSNENMLEALRDAIIFTSLVIFLFLANLRMTIIAGLS
IPFVYLATIAFMWLFGIGFNTVSLTGVILALGMLVDDAIVILENIERHLFELKKSPVEAA
IDGTKEVMLVVFGGTVATAAVIFPMLFVGDFPEKIFRPLAGTLLIAILVSYVVSITLIPI
LAIKFLKNADKKSAWELKINQLMLAWLNPLKNIYTDWIKTLIHKKKIRPLAVLPLTVLFV
ISLKLIPFTGRDLMPPMDTGIVKANVVFNSNTSIWQVNQEVKKIQDYIYSLGNVKRVSVA
IGTEPGVLTISGGTPQTASFTITFVNRFERKETIWQLEDKIRDYIHTLPNVKYTDVYDYG
ATALSSIKANLDTTLYSDNLEALNKTGNTILEIANNTPGLKSASKSWDMDKIEYEFKIDK
QKTALYNTTPYDVAVQVSAGLQGQISSVLTIPNETGFLIRVILSQEQRSYIDQFKSYLIK
TPKGFVPLEALGEFTQKAEPTIITRQALDYTQDVYGYRGTNAISHIMENFQKEFEKYAKT
HPGFPLPNIKIEQTGDIQQMMDSMGRMFKAILIGLVILYLVLAAVFKSWKDPVAIMLAIP
LSVIGGSWSLLIADKHMCLPAIMGFILLAGIIVKNSILIIEFIKTYREKGYSKEEAILES
VNIRTRPVMMTAFGTAVGMIPIALEWAIGLERLSPLAVVAIGGLIVGTFLSLVYVPFFYY
LIDRGEKNEKTANT
NT seq
3105 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaatggtatatatctaaacctcaccttatattttcaattttaattgcttttgct
tttatgggaattatcggatttttttctatgccaagggatttatttccaccggctgataga
cctcaaatagcagtagtagttcaagagccgggagcaactgcaaaatacatagcagaccat
acagcatctattattgaaaggcagctttatactataagcggtataagaagagtatattca
acatcaaacgatggattttgtacagttatagcagaatttcattattctaagccattagca
gaggcaaaaacagacgtagccaatgctcttagcaaagtccaaaacttacttccaaaggat
atattgccaccacagatttatgaaataacatcttacacaccacctgtaatggttttaatt
gtaagtcctaagaaagattcgcacccgtctttggaagatgtaaggtatatagcagaaaat
cagattaaaaatgaaatacttagaacaaatgcagtagcaaatgtagatgtttttggaggc
tatacaaaagaagtacatattcaaatagacaatgctaagttaagctcttatggattatct
cctcaggatataatcaatgctatccaaaaatcaaacaatgatatgccacttggaataatg
attaacaaagatacacaaaacacgtttatcttaaaaacagaggcaaaaagcttagatgaa
ctaaaaaacattcagataacaaaagatgttaagcttagcgatgttgcaaaagtagagttt
ggtatcaaaccacctactgcaatgtatcaaggaaatggaaaagaaggaatagctcttgca
attcaaagaccttacggtggagctgttttaagtacaatttcagcagttgaagaggttctg
ccaaaaataaaagctcaatttccacagttaaatatagatatatcagatacacaaaaagag
ttggttaaacaaagtaatgaaaatatgcttgaggctttaagagatgcaataatctttaca
tctttggtaatctttttattcttggcaaatctaagaatgactataatcgcaggtttatca
ataccttttgtttatttggccaccatagcctttatgtggctttttggtataggatttaac
acagtttctttgacaggtgtaatcttagctcttggtatgcttgttgatgatgcgatagtt
attttagagaatatagaaagacatctatttgaattaaaaaaatcgcctgttgaagctgca
atagatggaacaaaagaagttatgcttgttgtttttggtggcactgttgcaactgctgct
gtcatatttccgatgttatttgttggagactttccagaaaaaatatttagaccattggca
ggtacacttttaattgctatccttgtatcttacgttgtttcaatcactttaattccaatt
ttagcaatcaagtttttgaaaaatgcagataaaaaatcagcttgggagcttaaaatcaat
caacttatgctagcatggctaaatcctttaaaaaatatttacacagattggataaaaacg
ttgattcacaaaaagaaaataagacctcttgccgttttacctcttacagtgctgtttgtt
ataagtttaaaacttattccttttacaggaagagatttaatgccaccgatggatacagga
attgttaaggcaaacgttgtttttaacagtaatacatctatttggcaggtaaatcaggaa
gttaaaaaaattcaagattatatttactctcttggaaatgtaaaaagagtttctgtcgca
ataggaactgaaccgggagtcttaacaatcagcggtggaacacctcaaaccgcatcattt
acaataacatttgtcaatagatttgaaagaaaagaaacaatatggcagcttgaagacaaa
ataagggattatattcacactttacctaacgtaaagtatactgatgtctatgactacgga
gcaacagctttatcatcaataaaagcaaatcttgatacaactttatactcagataatctc
gaagctttaaataaaacaggaaacacaattttagagatagcaaacaatacaccggggcta
aaatcagcatctaaaagctgggacatggataagattgagtatgagtttaaaatagataaa
caaaaaacagctctttataatacaactccttacgatgtagctgttcaagtaagtgctggc
ttgcaaggtcagatctcatctgttttaaccattccaaatgaaacaggatttttaatcaga
gtgattctttcgcaagaacaaagaagctatatagaccagtttaaaagctacttgataaaa
actccaaaagggtttgtaccgttagaagctcttggagagtttactcaaaaagcagagccg
acaataatcacaagacaagctttagattatacacaggacgtttacggatacagaggcaca
aatgctatatctcacataatggaaaacttccagaaagagtttgaaaagtatgcaaaaact
catccaggttttccactgcctaacataaagatagagcaaaccggagatatccagcagatg
atggattctatgggaagaatgtttaaagctattttgattggattggtaattttatattta
gttttagcagcagtgtttaaatcttggaaagaccctgtggcaattatgttagcaattcct
ctttctgtaataggtggttcatggtcattactgattgcagataaacatatgtgtttaccg
gctattatgggatttattctccttgctggaatcatagttaaaaattcaattctgattata
gagtttataaaaacatacagagaaaaaggttactctaaggaagaggctattttagaaagt
gttaacataagaacaagaccagttatgatgactgcattcgggacagctgttggtatgata
ccaattgcattagaatgggctataggacttgaaagactttcacctcttgcagtggttgct
ataggtggtctaatcgttggaacatttttaagcttagtgtacgtgccatttttctattac
ttaattgatagaggtgaaaaaaatgaaaaaacagctaatacttag
DBGET
integrated database retrieval system