Trichoplax adhaerens (placozoan): TRIADDRAFT_27805
Help
Entry
TRIADDRAFT_27805 CDS
T01069
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19949
otoferlin
Organism
tad
Trichoplax adhaerens (placozoan)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tad00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
tad04131
]
TRIADDRAFT_27805
Membrane trafficking [BR:
tad04131
]
Exocytosis
Small GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
TRIADDRAFT_27805
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
C2
FerB
Ferlin_C
dsrm_Ferlin
FerI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6755566
NCBI-ProteinID:
XP_002114353
JGI:
27805
UniProt:
B3S2M2
LinkDB
All DBs
AA seq
1667 aa
AA seq
DB search
VNIRIHEARQLSGININPVVHVTVGSDKKKTNVKEATNCPLYNEFFVFDYQIPHALVMEK
MILLEVNSTGGKLSLKSHSLVGMYKLDIQTVYNAPDHQFYRKWAYLTDPHDHTNSCKGYL
KVDIAVIARGTSISTPGKVKNEDDIDSNLLSPDGGSADRARANYKFNIYYADGLPQMDSG
ILPNIKRVITRGEKELTDAYVEVNFFGHSVKTPVKRHTYKPIWNECICITDLFPPLCATA
KVQIKDSDAVATDVPIATHVIEMSKISYNKLSKGFLPTYGPTSIYLYGSTRDFSMFDENI
KLNQGEGEGAAYRGRLVISLTVHLCETHHGSVACGNKVSSIPALPKVVINNTLLGKQERF
LLFALLSECSMINKKYSDKPVELELTMGNYGNEIDFNASDDAHTVVSTAEEHHGSEHILY
HHATTHPMLPDSFDDTYFFIPWENTKPCLYIQSKWLAHLYRIYLANMIDKIRHSLLCGLV
EIEDLAKHKDARTIDYFRAVLDELIAGCNQVVIMLKNESISHRLGITDLDIARMKLCSRE
MIVVSNLAYEISKRSDTLVYIKGKLASFHQVVERLTNLVDTPQQALPDVFLWMIAGGKRI
AYARIPAADIIHSELECQRGIDCGKMTSFFLRVPGKKGYGFNENTVQARVRLMLWLGLQS
HKKDYVRGIPKGYKLTNKLKNADEFSLVPPKSVKYIEEHKFELRAYLYQARSLAACDKSG
FSDPFARIMYSNITVETRIIRETLSPIWDETIRMRSIVLYGTLEDIVKSPGTIVIDVFDN
DLVGSSEFLGRTVAKPNVKILSEEYVKPKFPSTLRWYSLYKGGIEAGAILAAFELFEVKF
GMDFDYLPPLPLAVTRNEIEKVIPVPSGIRPVLSKFRIQVLFWGVRDMRKLQLQAVVHPQ
IEIECGGQVVQSEICSNAKKNPNFTNVVASLDVEVPENTLFWAPIAVRVKDYRNFGRFYL
VGSCEIDNFDRFWYKRRKKGAGSLFANQSSINIQMSNKIHPALADSKSTTDLDKAQSVSS
IPGAHIKRSAPSQATKKSQAEHEKIDWWSKYYASQNTFSDVDRKKFTNVDTLKIYDSELE
NQPEFGGFKDVIQSFALYRGKRDNNADDNAKIVGCFKGNLKICRLPLPQCVIENSTNGMF
TDVPASKPTSVLVRIYIIKANNLHPTDINGKADPYLIVSLGKTKINDRENYISKNLSPIF
GRAFHIEATIPLETTLTVQVYDMDMIGSDDLIGETKIDIENRFYSKHRPSCGLPITYSEI
GYNKWRDPLKPTQILNRLCKEEKLDGPYYADGEVSIGKCIITGPTELIDSRGRLVITDEH
VALKALHQWHKISGRGMKLVPEHIETRPLYNPGRPGIEQGNLEMWVDVFPMDIPIPEDHV
DISPRKPARYELRVVIWNTEDVICNDHNMLSGEQMSDIYVKCWIKGHENNKQSTDIHHKS
YTGEGNFNWRMIFEFDYLAAEEKVVVKKKEHFYSLDETEHYEPFNLIVQVWDADMFSSDD
FTGMTTFDLLDMPRGVKEAAHCELNMLKSDNHPRFDLMKQKSARGWFPVVAQNHKSEDIL
AGKVEIELTLLTEDEAKHRPAGLKREAPEPLPKPNRPEDAVGWFSSPFKACKFGVCRNYK
RDLFILFLVFLLFMFAATFVYAIPVSYCLTDHLYYYYDKYYQLIRIM
NT seq
5004 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gttaacatccggattcacgaagctcgacaactaagtggtataaatatcaatcctgtagtt
catgttactgttggtagtgataagaaaaagacgaacgtcaaagaagctacaaattgtccg
ttatataatgagttttttgtatttgactatcagatacctcatgccttagtgatggaaaaa
atgattctacttgaagtaaattcaactggcggaaaattatcacttaaatctcattcttta
gttggaatgtataagcttgacattcaaacagtatataatgcgcccgatcatcaattttac
cgtaaatgggcctatcttaccgatccacacgatcatacaaattcttgcaaaggatactta
aaggttgacattgcagttatagcacgtggaacgagtatttcaaccccagggaaagttaag
aacgaagacgacattgacagcaacctactgagcccggatggaggttccgctgacagagct
agagcgaattataaatttaatatttattatgcagatggtctaccacagatggatagtggt
attttaccaaatatcaagcgagttatcacacgcggagagaaagaacttacagatgcttac
gttgaggtcaatttttttgggcattctgtaaaaactcctgtaaaaagacatacctataaa
ccaatatggaacgaatgcatttgtattactgatttatttccgccattatgtgctactgca
aaagttcaaataaaagatagtgatgctgtagcaaccgatgttcctattgctacccatgtg
atagaaatgtccaagatatcttataataaattatctaaaggttttctgcctacatatgga
cctacaagcatttatctctatggatcgactagagatttttctatgtttgatgaaaatatc
aaactaaatcagggcgaaggagaaggtgcagcatatcgtgggagattggttatatcgtta
acggtccatttatgtgaaacgcaccatggatcggtagcatgtggtaataaagtttcgtca
attcccgccttgcctaaggttgttataaataatacactgcttgggaaacaggaaaggttc
ttactatttgcgttattatcagaatgtagtatgataaacaaaaaatatagtgacaaacct
gtagaattggaactaactatgggtaattatggcaatgagatcgattttaatgcctccgat
gacgcacacacggtagttagcactgctgaagagcatcatggatctgaacatatcctatat
catcatgcaacaacacacccaatgttgccggattcttttgatgatacttatttcttcata
ccctgggagaatacgaagccttgtctatatattcaaagcaagtggcttgctcatctgtat
aggatttacttggcgaatatgattgataagattcgccattctttattatgtggattagtt
gaaatagaagatctggcaaagcataaagatgcacgaactattgattactttagagccgtc
ctggatgaattaattgctggatgcaaccaagtggttatcatgcttaaaaatgagagtatt
agccaccgattaggaataacagatctagatattgctagaatgaaattgtgcagccgcgaa
atgattgtcgtttcgaatttagcatacgaaataagtaaacggtccgataccctagtgtat
attaagggaaaactagctagctttcatcaagtggtagaaagattgactaatttggttgat
acgccgcaacaagccttgccggacgttttcttatggatgatagctggtggtaaacgaatc
gcttacgcaaggatacctgctgctgatattatccactctgagttagaatgccaacgggga
atagactgtggaaagatgacctctttctttttacgggtacctggcaaaaagggctatgga
tttaatgagaatactgttcaagctagagtgcgccttatgttatggctcggcttgcagtcc
cacaaaaaagattatgtccgtggtataccgaaaggttataaattaacaaataagttaaaa
aatgcagatgagttctctttggttccgccaaagtctgtcaagtatattgaggaacacaaa
ttcgaactacgagcttatctctatcaagctcgtagtttagcggcttgtgataaatcagga
ttttctgatcctttcgctagaatcatgtattctaacataacagtggaaacaagaataatt
agagaaactttgagcccaatttgggatgagacaattagaatgcgatcaatcgttttatat
ggtactttagaagatattgttaaaagtcctggaaccatcgttattgatgtctttgataat
gatcttgtgggttcttcagagtttcttggtagaacagtagcgaaacctaatgttaaaatt
ttgagtgaggaatatgttaaacctaaatttccgtccacgctgagatggtattcactatat
aaaggtggaatcgaagctggagcaattctagcggcatttgaactcttcgaggttaaattt
ggaatggattttgattacctacccccattacctttagccgtcactcgaaatgaaatagaa
aaagttattcccgttcccagtggaattcgaccagttctaagcaaatttcgtattcaggtt
ttattttggggtgtaagagatatgagaaaacttcagctacaagccgttgttcatccacaa
atagaaattgagtgtggtggtcaagtagtccagtctgaaatttgtagtaatgctaagaaa
aatcccaacttcactaacgttgttgcttctttggatgtggaagtaccagaaaatacgtta
ttctgggctccaattgccgttcgcgttaaggattatcgtaactttggtcgattttattta
gttggttcttgcgagatcgataatttcgatagattttggtataaacgtcggaagaaggga
gcaggctcattattcgccaatcaatcgagcattaatattcagatgtcaaataagatacat
ccagctttagctgatagcaaatctacaactgatcttgacaaagcccaatcagtatcttcc
atacctggagctcacattaaacgctctgcaccttcacaagcaactaagaagagtcaagcg
gagcatgaaaaaattgattggtggtcaaagtactatgcatcacaaaacacttttagtgat
gttgatcgcaaaaaatttactaatgtcgatacactaaagatttatgacagtgagttagaa
aatcaaccggaatttggtggttttaaggatgtaatacagtcatttgccctctatcgtggc
aagcgcgataataatgctgatgataacgctaaaatagtcggttgtttcaaaggcaatctg
aaaatctgtcgattacctttaccacaatgcgttattgaaaatagtacgaatggaatgttt
accgacgtgccagccagtaaacccactagcgtattagtcagaatttatattattaaggcc
aataacctccacccgacagatattaatggcaaagcagacccttacttaatagtttcacta
ggtaaaacgaaaattaatgaccgagaaaattatatttccaaaaacttaagcccaattttt
ggaagggcatttcatattgaagcaactattcctttagagactacattgacggttcaagtc
tatgatatggatatgattggatcggacgatttaatcggtgaaactaaaattgacattgaa
aatcggttttatagcaagcatcggccgtcatgtggactgccaataacctactcagagata
ggctacaataaatggcgggatcctcttaaaccgactcagatattgaatcggctatgcaag
gaagaaaaattagatggtccttactatgctgatggtgaagtatcgattggtaaatgtatt
attactggacccactgaattgattgattctagaggtcggctcgtaattactgatgagcac
gttgcactaaaagctttacatcaatggcacaagatctccggcagaggaatgaaactagtt
cctgagcatattgaaacacgaccactttataacccaggtcgtccgggcattgaacaggga
aatttagaaatgtgggttgatgtctttcctatggatatacccatccccgaggatcatgtt
gacatctcaccaagaaagccagcacgttatgaactacgagtcgttatttggaacactgaa
gatgtcatatgcaatgaccataacatgttatcaggagagcaaatgagcgacatttacgta
aaatgctggattaaggggcacgaaaacaacaagcagagtaccgatattcatcacaaatcc
tataccggggaaggaaattttaattggcgaatgatctttgaattcgattacctagccgcg
gaagagaaagttgtggttaagaaaaaagaacacttttattcattggatgaaaccgaacat
tatgaacctttcaacttgattgttcaagtttgggatgccgatatgttttcaagtgatgat
tttactggtatgaccacatttgacttactggacatgccccgtggtgtcaaggaagcagct
cattgcgaattaaatatgctaaaatcggacaaccatccaagattcgatttgatgaaacag
aaatctgccagaggatggtttccagttgtagcccagaatcataaatctgaagatattttg
gctggaaaagtggaaatagagttaaccctacttactgaagatgaagcgaaacatagacct
gcaggattaaagagagaagcacctgaacctttaccgaaaccaaatcgaccggaagatgct
gtaggctggttttcttctccgtttaaagcatgcaaatttggcgtttgtcgtaattataaa
agagatttattcatattatttttggtcttcttattatttatgtttgcggcaaccttcgta
tatgcaattccggtaagttactgcctaaccgatcatctttattattattatgataagtat
taccagttgatacgcataatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
