Theileria annulata: TA09375
Help
Entry
TA09375 CDS
T00253
Name
(RefSeq) U5 snRNP subunit, putative
KO
K12852
116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
Organism
tan
Theileria annulata
Pathway
tan03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tan00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
TA09375
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
tan03041
]
TA09375
Spliceosome [BR:
tan03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
TA09375
Complex C
U5 SnRNP specific factors
TA09375
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
EFG_C
EFTUD2
EFG_IV
GTP_EFTU_D2
MMR_HSR1
EFG_III
Roc
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3863287
NCBI-ProteinID:
XP_952844
UniProt:
Q4UAD2
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(<317755..>322943)
Genome browser
AA seq
1269 aa
AA seq
DB search
MDQNLYDEFGNYIGPGFEDDYDNGFNSDISDTESNYNSNHNNKIQDSIDNSIDNLKVDSV
VDSLKDSINSLKDSVDSINSLKDTVNEEEVYKGVEVYIREEDIQTIEIPIIKSNEINKRK
KYKLDSDITLKNFHILEENLPENKFNFQFLSSITKNPQFIRNICIAGNFHDGKTTFIDRL
IEFTRQHTHTHTFHTNSHYNTNNSNSPNNSTNSHKSTVKYNKYSNRNGDMEYNRYMDNRM
DEQLRELSIKSTPISIILENRLYEKINEESNYPKYKSYLFNIFDTPGHVNFMDEFVYSLA
ICDGCVLIVDVLIGLTKVTEQIIIQCLQTGVHMCLILNCIDRLILELKLPPADAYLKIQH
TIIEINQFIYSSSTVLGHTGTTSTKVSSSNTNTKETHFGDKETPFGGTLGPSTVTELFDP
KNNNVGFGSSKFGIFFTLKSFATLYTNDNVTQFSKLLYGNYYYDPIHNIITTNNTTTNST
RTNGVGVNGMSDGLDGTSDRVNGMEEGNNEIELERTFVVFILEPLYKLISHIASDEKEDL
DLILSDLSNSLFNTKLTHTKNTNFNTEDLDTEDYDMEDVDMEDEEDEENSSIENSFKNNK
KKIILRKLDYKLTTNKIIRKVFNQIFTDASAFVDLILTTIPSSLENNLNKFICHYSGTLY
KNLLNSVGNCDPSGPLIIFITKNYYFDDGFSLFGRIFSGTIFKGQKVKLLGPSYTLDDDE
DVIIRNISNIWIYEGRYRIEVTNMTAGNWVMLSGIDLSHYKITTIVNSSSTVLGPTDTNG
PNTITNGPNTNTNGVYNNKEAPFGAVDTGAVGASPVTEELELMKIITNIKCIRPIFKIGL
EPLNPNELPKMINGLRSIEKSYPGSLVKVEESGEHIILGTGELYLDCILHDLRLFGNLEI
KVSDPVVKFSETITESTSLITFTHTNNLKNKLYMISQPLESNISTLLDSTIGVNSIRLDS
GLNGMGLNGGLDSMGLNGVNRGVYRGVGMSSMGMSGLDMELNKEWDILDIKNVWSFGNGI
PDVLINDTIPNEVDINLLNHIKSSIIQGFQWAIKEGPLIEEHIRYCVTVLATAAPISPLT
STVTPNVKFRLINCELSNEYINITPGQIIPATRRLCYSSFLLSTPRLMEPILFSEIFCPA
DCVSEAYKILSKRRGHVLKDMPKPGTPFYIVHAYLPAIESFGFETDLRVDTSGQAFCLSM
FDHWNIVPGDPLDKSIILRTLEPAPIPHLAREFLVKTRRRKGLTEDVSINTFFDEEMITS
LAENLQEFY
NT seq
3810 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcaaaatttgtatgatgaatttggtaattatattggaccaggatttgaagatgat
tatgataatggttttaattctgatatttcagatactgaatccaattataattccaatcat
aataataaaatacaagattctatagataattctatagataatttaaaagtagattctgta
gtagattctctaaaagattctattaattccctaaaagattcagtagattctataaattct
ctaaaagatacggtaaatgaggaagaagtatataaaggagtagaagtatatattagagaa
gaagatatacaaacaatagaaataccaataataaaatcaaatgaaataaataaaagaaag
aaatataaattagattcagatataacattaaagaattttcatatattagaagagaattta
ccagaaaataaatttaattttcaatttctatcatcaattactaaaaacccacaatttata
cgtaatatttgtattgctggtaattttcatgatggtaaaactacttttattgatcgttta
atagaatttacacgtcaacatacccatacccatacatttcataccaattctcactataat
accaataattctaattctccaaataatagtacaaattctcataaatctactgtaaagtat
aataagtatagtaataggaatggtgatatggaatataatagatatatggataatagaatg
gatgaacaattaagagaattgagtataaagagtacaccaatatcaataatattagagaat
agattatatgagaagataaatgaagagagtaattatccgaaatataaatcatatttattt
aatatatttgatacaccaggacatgtgaattttatggatgagtttgtatattctttagct
atttgtgatggttgtgtattaattgttgatgtattaattggattaactaaagtaactgaa
caaattattattcaatgtttacaaactggtgtacacatgtgtttaattttaaattgtatt
gatagattaatattagaattaaaattaccacctgctgatgcttatcttaaaatacaacat
acaattattgaaattaatcaatttatttattcctccagtacggtgcttggtcacacaggt
actactagtactaaggttagtagtagtaatactaatactaaggaaacccattttggggat
aaggaaaccccttttgggggtaccttaggaccaagcaccgtaacggaattatttgatcct
aaaaataataatgtaggatttggatcaagtaaatttggtatattttttacattgaaatca
tttgcaactttatatacaaatgataatgtaacacaattctcgaaattgttatatggtaat
tattattatgatcctatacataatattattactaccaataatactactactaatagtact
cgtactaatggagtgggtgttaatggtatgagtgatggattggatggtacgagtgataga
gttaatggtatggaagaaggaaataacgaaatagaattggaaagaacatttgtagtattt
atattggaacctttatataaattaatatcacatattgctagtgatgaaaaagaagattta
gatcttatattatctgatttatccaattctttattcaatactaaattaacacatactaaa
aatacgaattttaatactgaagatttggatactgaagattatgatatggaagatgtggat
atggaagacgaggaagatgaagaaaattcttctatagaaaattcttttaaaaataataag
aaaaaaataatattaagaaaattagattataaattaacaacgaataagataatacgtaaa
gtatttaatcaaatatttacagatgcatcagcatttgtagatttgatattaacaacaata
ccatcatcattagagaataatttgaataaatttatatgtcattatagtggtacactttat
aagaatttgttaaatagtgttggaaattgtgatccatcaggtccattaataatatttata
acgaaaaattattattttgatgatggatttagtttatttggtagaatttttagtggtaca
atatttaaaggacaaaaagttaaacttttaggtccaagttatacattagatgatgatgaa
gatgttattatacgtaatatttctaatatttggatttatgaaggtcgatatcgtattgaa
gttactaatatgactgctgggaattgggttatgttatctggtattgatttatcacattat
aaaattactactattgttaattcctccagtacggtgcttggtccaacagatactaatgga
cctaatactattactaatggacctaatactaatactaatggagtttataataataaggaa
gcccctttcggggctgttgatactggtgccgttggagcaagccccgtaacggaagaacta
gaattaatgaaaataataacaaatataaaatgtattagaccaatatttaaaataggatta
gaaccattgaatccaaatgaattaccaaaaatgataaatggattaagaagtatagaaaaa
agttatccaggttcattagtcaaggtagaagaaagtggagaacatataatacttggtaca
ggagaattatatttagattgtatattacatgatctaagattatttggtaatttagaaatt
aaagtctcggatcctgttgttaaattcagtgaaactataactgaatccacttctctcata
acatttacacatacaaataatcttaaaaataaattatacatgatctcacaaccattagaa
agtaatatttctactttactagattctacaataggagttaatagtataagattggatagt
ggattgaatggtatgggattgaatggtggattggatagtatgggattgaatggagttaat
agaggagtttatagaggagtaggaatgagtagtatgggtatgagtggattggatatggaa
ttgaataaagaatgggatatattggatataaagaatgtatggtcatttggtaatggtata
ccagatgtattaataaatgatacaatacctaatgaagttgatataaatttattaaatcat
attaaatcttctattatacaaggatttcaatgggctattaaagaaggaccattaattgaa
gaacatattaggtactgcgttacggtgcttgcaacagcagctccgatatcaccacttaca
agcaccgtaacaccaaatgttaaatttcgattaataaattgtgaattatcaaatgaatat
attaatattacaccaggacaaattataccagccacaaggagattatgttattcatcattt
ttattgagtacaccaagattaatggagccgatattatttagtgaaatattttgtccagca
gattgtgtatcagaagcatataaaatcttatcaaaaagacgtggacatgtacttaaagat
atgccgaaacctggtacacctttctatatagtacatgcatatctaccagccattgaatct
ttcggttttgaaactgatcttagagttgatacaagtggacaagcattttgtttatcaatg
tttgatcattggaatattgtaccaggagatcctctagataaatcaataatattacgtaca
ttggaaccagcaccaataccacatttggcacgagaattcctagtcaaaacacgtagacgt
aaaggattaacagaagatgtatcaattaatacattctttgatgaagaaatgattacatca
ttagcagaaaatttacaagaattttattaa
DBGET
integrated database retrieval system