KEGG   Tamlana sp. s12: JJL45_01605
Entry
JJL45_01605       CDS       T10518                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
tay  Tamlana sp. s12
Pathway
tay01501  beta-Lactam resistance
tay01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tay00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    JJL45_01605
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    JJL45_01605
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:tay02000]
    JJL45_01605
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:tay01504]
    JJL45_01605
Transporters [BR:tay02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   JJL45_01605
Antimicrobial resistance genes [BR:tay01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    JJL45_01605
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C Patched
Other DBs
NCBI-ProteinID: QQY82717
LinkDB
Position
complement(377207..380341)
AA seq 1044 aa
MLKTFIERPVLSTVISIIIVMLGLISISSLPIEQYPDIAPPTIKVSASYPGANAETVLES
VIIPIEEQINGVEGMTYITSTASNNGTADITVYFDQNTDSDIAAVNVQNRVSRANSLLPQ
EVKQIGVTTQKQQTSALMFASLYSDNDDYDATFIQNYLKINVIPKLQRINGVGDVNVFSQ
QDYAMRIWLKPEKLAAYNLIPSDITAVLQEQNLEAAAGALGENNGEAFSYIVKYSGRFKN
ESQYSNMIIKALGNGEFLRLADVADIELDAQSYSSGAQSLGKPAVFMGIYQTKGSNAQEI
IDNIKITMVQIKKDLPKGLDIFTPYDTSLFLGASIEKVVHTIFEAFLLVFFVVFIFLQDF
RSTLIPAIAVPVSIVGTFFFLNVFGFSINLLTLFAIVLAIGIVVDDAIVVVEAVHAKIDE
GEKNPRKATLDAMHEISGAIISITLVMAAVFIPVTFIQGPTGVFYKQFGVTLIIAILISA
VNALTLSPALCALLLKSHDEEALKDKNALQRFYTLFNRGFNATIYRYGQSLQFLYKKKWI
SVVLVIIAAVGIIWASKTTPTGFVPNEDRGMVFANIELPAGASLDRTNEIIQDLYGKTEG
LPGVEGVSFVRGRSLLSGSGSNYAIGFIKLDDWSEREDPSLSTQATIGKLFGIASTVPGA
NIIFFAPPSIQGFGNSAGFEVNLLDKFGGDFAELDKTNQEFIGALMKHPEIQYAQSAFNT
KYPQYEMDVNVPLAKEKGVPINSIFATLQGYIGGVYASDFSRFGKQFRVYIQSLPEDRAD
VSSLNSMYVRTDKNEMTPITQFVTLKRVYGPQSVTRFNLSNSTTLTGATNSGFSTGDAIR
VIEEEASKLPNNYEIAYSGLTREEVNAGNQTTFIFILSILFVYFLLCAQYESYILPLAVV
LSLPFGVFGAYISTKFLGLENNIYFQIALIMLIGLLAKNAILIVEFALQRRRKGATIVDA
AIDGAKARLRPILMTSFAFILGLMPLVLAKGVGAAGNNSIGTGAAGGMLIGTILGLFVIP
ILFIFFQWLQEKVSSKPQIQTTED
NT seq 3135 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaaaacatttattgaaagacctgtactgtctacggtgatttctattattattgtc
atgcttgggttaataagtatttcaagcttgcctattgaacagtatccggatattgcgcct
cctaccattaaagtttcggcttcctatcctggtgctaatgccgaaacggttttagaaagt
gttatcattcctattgaagaacagattaatggtgttgaagggatgacttatatcacctct
actgcatcaaataatgggacagccgatattaccgtttattttgatcaaaatacggattcc
gatatcgctgctgtaaacgttcagaatcgtgtgtctagagcaaattctttgttacctcaa
gaggtgaagcaaattggtgtaactacccaaaagcaacaaacaagtgcattgatgtttgct
tccttgtattccgataacgatgattacgatgccacttttattcagaattatttaaaaatt
aatgtcattcctaaattacaacgtattaatggtgttggtgatgtgaatgtattctctcaa
caggattacgccatgcgtatttggttgaaaccagaaaaactagccgcatacaatttaata
ccttccgacattacagccgttttacaagaacaaaatttagaggctgctgctggtgcttta
ggagaaaataatggtgaagcgttttcatatatcgtaaaatacagcggacgatttaaaaat
gagagtcagtatagcaacatgattattaaagctctagggaatggtgaatttctacgctta
gcagatgtggccgatatcgaattagatgcacaatcctattcctcgggtgcgcaaagttta
gggaagcccgctgtttttatggggatttaccaaaccaaaggttccaatgctcaggaaatt
atcgacaacataaaaataaccatggtgcaaattaaaaaggatctgcctaaagggttagat
atttttacaccttatgataccagtttgtttttaggagcttccattgaaaaagttgtacat
accatttttgaagcctttttgttagttttcttcgtggtatttatctttttacaggacttt
agatcgacattaattccagctatagccgtgccagtatctattgtaggaacctttttcttc
ctcaatgtatttgggttttcaattaatttattaaccctatttgctattgtattggcaatt
gggattgttgttgatgatgctattgttgttgttgaagctgttcatgccaaaatagatgaa
ggtgagaaaaatccgagaaaggcaacactcgacgccatgcatgaaatatcaggggctatt
atttctattaccctcgttatggcggctgtatttattcctgtaacctttattcaagggcca
actggggttttttataaacagtttggagtcaccttaattattgccattcttatctctgct
gttaatgccttaacgctaagccccgctttatgtgccttacttctaaaatctcatgatgag
gaagcgcttaaagataaaaatgccttacaacgtttttatactctttttaatcgtggtttt
aatgcgacaatttatagatacggacaatcacttcagtttttatataaaaagaaatggata
tcggttgtgctagttattattgcggctgttggtattatttgggcttctaaaacaacacct
acagggtttgtgcctaatgaagaccgcggcatggtgttcgccaatatcgaattgccagca
ggagcttctttagatagaaccaacgaaattattcaagacctttatggtaaaacagaaggt
ttacctggtgtagaaggggtgtcctttgttagaggccgaagcttattaagtggttcaggt
agtaattacgctattggttttattaagttagatgattggtctgaacgagaagatccatca
ctttctacacaggctaccattggaaaactatttggaattgcatcaaccgttcctggggct
aatattattttctttgcaccaccaagtattcaaggttttggaaactcagctggtttcgaa
gtaaacttgttagataagtttggaggcgattttgccgagctcgataaaaccaaccaagag
tttattggagctttaatgaagcatcctgaaatccagtatgcgcaatcggcttttaatacc
aaatatccgcagtatgaaatggatgttaatgtaccgctagctaaagaaaaaggggtgcct
attaatagtatttttgctactttacaagggtatattggaggggtttatgcttccgatttc
tctagatttgggaaacagtttcgtgtatatattcagtcgttaccagaagatagagctgat
gtgtcttcgttaaatagcatgtatgttagaacggataaaaacgagatgactcctatcaca
cagtttgttactttaaaacgagtatatgggccacaatcggtaactcgttttaatttgtct
aattcaacaaccttaactggtgcaaccaattcaggttttagtactggtgatgccatccgt
gtgattgaagaggaggcttcaaaactgcctaataattacgaaatcgcttactctggttta
accagagaagaggttaatgccggaaaccaaacaacttttatctttatactaagtatcttg
tttgtatactttttattatgtgctcagtatgaaagttatattttgccactagccgtggtg
ctttctttaccttttggtgtttttggagcatatattagtaccaagtttttaggtttagaa
aacaacatttattttcaaatagccttaatcatgcttattggattgttagccaaaaatgcg
attcttattgtggagtttgccttgcaacgccgccgaaaaggggcaactatagtcgatgct
gcgatagatggtgcaaaagcccgtttacgacctattttaatgacctcatttgcctttatt
ttaggattgatgccattggttttagctaaaggtgttggtgctgcgggaaacaattctatt
ggaacaggtgcagctgggggtatgctaattggtaccatattggggctgttcgttattcct
attttgttcatatttttccaatggttacaagaaaaagtatctagtaaaccacaaattcaa
acaaccgaagactaa

DBGET integrated database retrieval system