Tetrahymena thermophila: TTHERM_00079910
Help
Entry
TTHERM_00079910 CDS
T01020
Name
(RefSeq) elongation factor G domain protein
KO
K12852
116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Pathway
tet03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tet00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
TTHERM_00079910
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
tet03041
]
TTHERM_00079910
Spliceosome [BR:
tet03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
TTHERM_00079910
Complex C
U5 SnRNP specific factors
TTHERM_00079910
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
GTP_EFTU
EFTUD2
EFG_IV
EFG_C
GTP_EFTU_D2
EFG_III
EFL1
EF-G_D2
MMR_HSR1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7824607
NCBI-ProteinID:
XP_001015831
TGD:
TTHERM_00079910
UniProt:
Q23FM4
LinkDB
All DBs
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MDDEDLYDEFGNYKGPEIEENYDEDEQYFDRENEEFEEDQNGANVNEEHEEIMERAVVLH
EDKQYYPEMSEVYPEAENLVMEEDAQRIEEPIVAPVKEKDFDLVDRGNQETNSTIQFMQQ
IMKKTELVRNVGIVGHLHHGKTGLMDMFVKQTHVHREWDLEKEYRFTDARKDEQERLLSI
KSSPMSLILPDFRDKSYLLNIFDTPGHPNFSDEVCCALRMCDGVVLVVDALDGVMLNTER
IIRYCVKEKIAITILINKIDRLIIETKLPPVDAYLKIRHTIDEINDIIASLGRDDFDSLK
VSPLLGNVCFGSTAYGFVFSIQSFAEMYSKSYGIQKDFFTKLLWGNYYFNSDTRKFMNKP
TKDFNKRCFVEFILEPIYKIFSHVVSKEKDQLKPVLGKLGVYLKNSDYKLDIKPLLKLVF
STFFGNTGALVSMVAQHIPSAKQGTRLKVEQNYVGNRKNPAFEKIKECDPEGPLVINVVK
QYNKQDCMSFDVFGRVISGTIRKNQTVKVLGERYNLEDEEDMTVKDVRKLFIFQARYKIE
VNEITAGNWVLIEGIDQSIQKSATIISQDDSNKIEIFRPVKHDTTPVIKVAIEPLIPSEL
PKMLEGLRKVSKSYPLLVTKVEESGEHILIGTGELYIDCVLHDLRRMYSDIEIKVSDPSV
SFCETIIDTSSIKCYADTPNKKNRLTMLASQLDKGLAKDIEKEVISLDFEKPIVSKFFQE
KYDWDILAARNVWSFGPEKSGANVLIDDTLPNEVDKNILRECKEHINQGFCWATREGPLC
DEPVRNVKFKLIEANISSEPLYRAGGQMIPTARRTCYSAFLMAQPRLMEPLLYVEIQCTA
DAINGCVTVLAKRRGHVEKQIAKAGSPLYTVTAFLPAIDSFGFETDLRIHTCGQAFCVSV
FDSWDLLPGDPLDKSIKLNLLEPSPPQDLAREFMIKTRRRKGLNENVSIVKYFDDSALLE
ALKQDKDYKDYI
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacgacgaagatttgtatgatgagtttggtaactacaaaggaccagaaatagaagaa
aattatgatgaagatgagcaatattttgacagggaaaacgaagaatttgaagaagattaa
aatggagctaatgtaaacgaagagcatgaagaaattatggagagagctgtcgtacttcat
gaagataagtaatattaccctgagatgagtgaagtctatcctgaagcagaaaatttggtt
atggaagaagatgcttagagaattgaagaacctattgttgctcctgtaaaggaaaaagat
tttgacttagtcgatagaggaaatcaagagactaattctaccatttaattcatgtagtaa
attatgaaaaaaaccgagttagtgcgtaatgtaggtattgtaggacatcttcatcacgga
aagacaggtttgatggatatgtttgttaaacaaacacacgttcatcgtgaatgggattta
gaaaaagaatatcgttttacagatgcccgtaaagatgaataagagcgtttattgagtatt
aaaagctctcctatgtcattaattctacctgattttcgtgacaagagttatcttttgaac
attttcgatactcctggacatcctaatttttctgatgaagtctgctgtgctttaagaatg
tgtgatggtgttgttttagttgttgatgctttagatggtgttatgcttaacacagaaaga
attataagatattgtgtaaaagaaaaaattgcaattactatcttgatcaataagattgat
agactcattatcgaaactaagttacctcctgttgatgcttatcttaaaatcagacacaca
atagatgaaattaatgatattattgcttctttaggaagagatgattttgattctttgaag
gtctctcctttgcttggtaatgtttgttttgggtcaactgcctatggattcgtttttagc
atttaatcttttgctgaaatgtacagcaaatcatatggaatttaaaaagatttctttact
aagcttctatggggtaactattacttcaactcagatactagaaaatttatgaacaagcct
acaaaggacttcaataagcgttgctttgttgaatttatcttagagcctatttataaaata
ttttctcatgtggtctcaaaagaaaaagaccagttaaagcctgttttaggtaagttagga
gtctacttaaagaactcagattacaagcttgatatcaagcctctccttaaattagtgttt
tccactttctttggcaacacaggagcattagttagcatggtcgcttagcacattcctagt
gcaaaataaggtactagacttaaagtagaatagaattatgtaggtaacagaaagaatcct
gcatttgaaaagattaaagaatgtgatcctgaaggtccactagttattaacgttgtaaaa
taatataataaataagattgcatgagtttcgatgttttcggccgtgttatttctggtaca
attcgtaaaaactaaactgttaaggttcttggtgaaagatacaatcttgaggacgaagaa
gacatgacagtaaaagatgttagaaagctatttattttttaggcaagatacaaaattgaa
gtaaatgagattactgctggtaattgggtattgattgagggtattgattagtctatttaa
aagtcagctactattattagttaagatgattcaaataagatagaaatattcagacctgta
aagcatgacacaactccagttataaaggtcgctattgaacctcttattcctagtgaatta
cctaaaatgttagaaggtctccgtaaagtaagcaaatcatatccacttttagttactaag
gtagaagagtcaggtgaacatattttaattggtactggtgagttatatattgattgtgtt
cttcatgatcttcgtcgtatgtattctgatatagaaattaaggtcagtgatcctagtgtc
agcttttgtgaaacaattatcgatacttcttctataaaatgctatgcagatactccaaat
aagaaaaatagactaactatgcttgcatctcagcttgataaaggtcttgccaaagatata
gaaaaagaagtcataagtctggattttgaaaaacctattgttagtaaattcttctaagaa
aaatacgactgggatattctagcagctagaaatgtttggagttttggacctgaaaaaagt
ggtgctaacgttttaatcgatgacactcttcctaacgaagtagacaagaacatactcaga
gaatgcaaagagcacatcaatcaaggtttttgctgggcaactagagaaggacctttgtgt
gatgaacccgtcagaaatgtaaaattcaaacttattgaagctaacatttcaagcgaacct
ttgtacagagctggtggttaaatgattccaactgctcgtagaacatgttacagtgccttt
ttgatggcttaaccacgtttaatggaacctctcttgtatgttgaaatctaatgtacagca
gatgccataaatggttgtgttactgttcttgcaaagagaagaggtcatgttgaaaaacaa
atagctaaagcaggttctcctttatatacagttactgctttcctccctgctatcgattct
tttggttttgagacagatttacgtatccacacttgtggtcaagccttttgtgtcagtgta
tttgactcttgggacttacttcctggtgaccctcttgataaatccatcaagctcaatttg
ttagagccttctcctccttaagatcttgccagagagtttatgattaagacaaggagaaga
aaaggtttaaacgaaaatgtttctattgtaaaatattttgatgactctgctttattggaa
gctttaaaataagataaagactataaagattatatatga
DBGET
integrated database retrieval system
