Thalassotalea nanhaiensis: RI845_11575
Help
Entry
RI845_11575 CDS
T10168
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
tnn Thalassotalea nanhaiensis
Pathway
tnn01501
beta-Lactam resistance
tnn01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tnn00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
RI845_11575
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
RI845_11575
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tnn02000
]
RI845_11575
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
tnn01504
]
RI845_11575
Transporters [BR:
tnn02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RI845_11575
Antimicrobial resistance genes [BR:
tnn01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
RI845_11575
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
OAD_gamma
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC67160
UniProt:
A0ABY9TH95
LinkDB
All DBs
Position
2655219..2658488
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MNVVNVAVKRPVTVWMFTFAVLLFGMVSLSKLSVNLLPELSYPTLTIRTDYLGAAPGEVE
QLVTKPIEEVVGIVKGVRNVQSISKAGQSDVLLEFEWGTEMDLASLEVREKLDVIRLPLD
VKKPLLLRFNPNLDPIIRFALKTKQSSEDFDEQKLKSIRDYADEELKRKLESVSGVASVK
LGGGLEKEIQILIDQHKVSQLGIDSQLIVERLQQENINQSGGRVEDGTQEYLVRTLNQFK
NLNDMRNVYITSVDGKHIRLSDIAKVIDSHKERTSITRVNGAEAVEIALYKEGDANTVNV
AKKVDFRVEQLTGELPEDLELIKVYDQSTFIANAINEVKSAAIIGGLLAMLVLFFFLKNI
WATVIISISIPVSVIATFNLMYGNDISLNIMSLGGIALAVGLLVDNSIVVLENIARQKEL
LDSSDNTSNKNAAVIGTKEVSTAIMASTLTTMAVFFPLVFVEGIAGQLFRDQALTVTFAL
LASLIVALTLIPMLSSREFKQSTIDESITSKRQLASDATKFQKLKYYLATPFVWLFRGLF
YYLPLLVSMVVTFIFRSLKLLLSKAFTPLLWMFDKIYNGLARIYQNLLAMALNQRIAVLF
IIIAMSGSAIPLVKQLNVEVIPPLAQGEFYVEISQQPGTPLEKTDNTLAKLSNEAATLAQ
VDRTYALAGTGSLMNASPAQGGDYWGRLNVVLKEGSTKADEQFVMVHLRNFLQTIPGIQM
KFSSPELFSFKPPIEIELAGYDLDLLKRYSDVISNKLNDNKRFIDVKTSLQNGHPEIKVF
FDHQRLAQLGLTAPQVAKLLSTKVGGAIASQYSIKDKKVDILVRADEASRDSVSDIKQII
INPQSDKAIPLSAVADVKLSVGPSEITRIGQQRAAVISANFAFGDISGAVQELQTIIDDL
NIPLNVSATITGQNEEMDVSFNSLMFALLLAVFLVYLVMASQFESLLHPLLILFTVPLAA
AGSIYGLFITQTPLSVIVFIGLIMLAGIVVNNAIVLVDRINQLRESGMAKSDAIMTSATS
RLRPIIMTTLTTTLGLLPLAISTGDGAEIRAPMAITVIFGLLFATLLTLFFIPVLYSLFD
RKRFGEAHA
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgtggttaatgttgcggttaaaagaccggtaactgtgtggatgtttacgtttgct
gtattactatttggtatggtgagcttatcaaagttatcggtaaatttattacccgaatta
tcttaccctaccctaacaattcgtaccgactacctcggagcagcaccaggtgaagttgaa
cagttggtgactaaacctattgaagaagttgtcggcattgttaaaggtgtacgcaatgtg
caatcgatttcaaaagcaggacaatcagacgtgttgcttgaatttgaatggggtaccgaa
atggatttggccagccttgaggttagagaaaagctcgatgttatacgcctgccattagat
gttaaaaaacctttattgttacgatttaaccctaatttagatcccattattcggtttgca
ttaaaaactaaacaaagtagtgaagattttgatgagcaaaaactaaaatcaataagagat
tacgctgacgaagaattaaaaagaaaacttgaatcagtcagcggtgttgcatctgtaaaa
ctgggtggcggtttagaaaaagagattcaaattctaattgaccagcacaaggtgagccag
cttggcattgacagccaacttattgttgaacgattacagcaagaaaatattaatcaatca
ggcggccgtgtcgaagatggtacccaagaatatctagttcgtaccctaaaccaattcaaa
aatttaaatgacatgcgtaatgtgtatatcactagtgttgatggaaaacacattcgctta
tcagacattgctaaagttattgattctcacaaagagcgtacttcaattactcgagtaaat
ggcgctgaagctgttgaaattgccttatataaagaaggcgatgcaaacacggtaaatgta
gccaaaaaagtagattttcgagtagagcaattaaccggtgagctccctgaagatcttgag
cttattaaagtttatgatcaatcaacgttcattgcgaatgccattaatgaagtaaaaagt
gcagcaattatcggtggcttattagctatgctggttttgttcttcttcttaaaaaacatt
tgggcaaccgtcataatatctatctcaattcccgtatcagttattgctacctttaattta
atgtatggaaacgacattagcctaaatatcatgagcttaggtggtattgctttagctgtt
ggcttgttggtagataactccattgtggtattagaaaatattgctcgccaaaaagagtta
ctagatagctctgacaacacttcaaataaaaacgcagcagtaataggaacaaaagaagtg
tccaccgctattatggcatcgacattaaccactatggcagtatttttcccgttggtgttt
gttgagggcattgcaggacaactatttagagatcaagcattaaccgttacgtttgcacta
ctcgcgtcgcttatcgttgccttgacgcttattccaatgttgtcatcgcgtgaatttaaa
caatcaacgattgatgaaagcattaccagcaaacgacaattagcgtctgatgcaacaaaa
tttcaaaaattaaaatactatcttgcgacaccatttgtctggttgttcagaggattattt
tattacctgccattacttgtttctatggtagtcaccttcatctttagaagcttaaagtta
ttattgagcaaagcgtttactccgctgctttggatgttcgataaaatttataatggctta
gcccgtatatatcaaaacttattggcgatggcgctaaaccagcgtattgctgtactgttc
attatcattgcaatgagcggctctgccataccactggttaaacagttaaatgttgaagtt
atcccaccgcttgcgcagggtgagttttacgtagagatcagccaacaacctggtacaccg
ctggagaaaacagataatacgctagccaaactttctaacgaagctgcaaccttagcacaa
gtagacagaacgtatgcgttagcgggaacaggtagcttaatgaacgcatcgccagctcaa
ggtggtgactactggggtcggttaaatgtagtactgaaagaaggcagtacaaaagcagac
gaacaatttgttatggtgcatttgcgtaactttttacaaacaattcctggcatacaaatg
aagttttcaagcccagagctgtttagttttaagccacctattgagattgaacttgcaggc
tatgacttagatttactcaaacgatatagcgatgtgatcagtaacaaacttaatgataat
aaacgctttattgatgtaaaaacctctttgcaaaatggtcaccctgaaattaaagtattt
ttcgaccatcaacgtttagcgcaactgggcttaactgctccgcaagttgccaaactttta
tcaaccaaagttggcggagctattgccagccaatattcgataaaagataaaaaggtcgat
attttagtacgcgctgatgaagcaagtcgtgactcagttagcgacattaaacaaattatt
attaaccctcaaagtgacaaagctattccactttcagcagtagccgatgtgaagctttca
gtcggccctagtgagatcactcgtattgggcaacagcgagcagctgttatttcagcgaac
tttgcctttggtgatatcagcggtgcggtacaagagctacaaaccatcattgatgattta
aatatcccgttaaatgttagtgctaccattaccggccaaaatgaagaaatggatgtgtca
tttaactctctaatgtttgcgctattacttgcagtatttctagtgtacctggtaatggcc
tcgcagtttgagtctttactgcaccctttactgattttgtttaccgtaccattagctgcc
gcagggtcaatttatggtctgtttatcacgcaaacgccactaagtgtcattgtgttcatt
ggtcttatcatgttggccggtatagtcgttaacaacgccattgtcttagttgatcgcatt
aaccaattacgcgaatcaggtatggctaaaagtgatgcgattatgacatctgcaacatcg
cgattgcgccctattataatgacaacactaaccacgacccttggcttattaccattagcg
ataagtaccggtgacggtgctgagattagagcaccaatggcaatcacggttattttcggt
ttattatttgcgacgctgttaacgctgtttttcatcccagttttgtacagtttatttgat
cgtaaacgatttggagaagcccatgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system