Thalassotalea psychrophila: RGQ13_07190
Help
Entry
RGQ13_07190 CDS
T10151
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
tpsy Thalassotalea psychrophila
Pathway
tpsy01501
beta-Lactam resistance
tpsy01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpsy00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
RGQ13_07190
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
RGQ13_07190
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tpsy02000
]
RGQ13_07190
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
tpsy01504
]
RGQ13_07190
Transporters [BR:
tpsy02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RGQ13_07190
Antimicrobial resistance genes [BR:
tpsy01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
RGQ13_07190
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC73768
LinkDB
All DBs
Position
complement(1727518..1730787)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MNVVNVAVKRPVTVWMFTFAVLLFGMVSLSKLSVNLLPELSYPTLTIRTDYIGAAPGEVE
QLVTKPIEEAVGIVKGVRNIQSISKAGQSDVLLEFEWGTEMDFASLEVREKLDVIRLPLD
VKKPLLLRFNPNLDPIIRFALKTKQSSENFDEQKLKSIRDYADEELKRKLESVSGVASVK
LGGGFEKEIQILIDQHKVSQLGIDSQLIVERLQQENINQSGGRVEDGTQEYLVRTLNQFK
SLNDMRNVYITSVDGKHIRLSDIAKVIDSHKERTSITRVNGAEAVEIALYKEGDANTVKV
AKSVDFRVEQLTEELPEGLELVKVYDQSKFIANAISEVKNAAIIGGLLSMLILFFFLKNI
WATAIISISIPVSVIATFNLMYGNDISLNIMSLGGIALAVGLLVDNSIVVLENIARQKEL
LDGSESAANKNAAVIGTKEVSTAIMASTLTTMAVFFPLVFVEGIAGQLFRDQALTVTFAL
LASLIVALTLIPMLSSREFKQSSVDEDITSKRQLTINASKFQKVKYHLATPFIWLFRGLF
YYLPLLISMVITFTFRGLKLLLSKVFTPLLWIFDKVYNRLASLYQNLLAIALNQRVAVLI
IIIAMSTSAIPLVKQLNVEAIPSLAQGEFYVEISQQPGTPLEQTDSTLAKLSNEAATLTQ
VDRSYALAGTGSLMNASPAQGGDYWGRLNVVLKEGSTKADEQLVMMHLRKYLQTIPGIQM
KFSSPELFSFKPPIEIELSAFDLDLLKHYSDVITNKLNDNKRFIDVKTSLQNGHPEIKVF
FDHQRLAQLGLTAPQVAKLLSTKVGGTIASQYSIKDKKVDILVRADEASRDSVNDIKQII
INPQSDKAIPLSAVAEVKLSVGPSEITRIGQQRAAVISANFAFGDINAAVQEVQSIIDEL
NIPLNVSANITGQNEEMDVSFTSLMYALLLAVFLVYLVMASQFESLLHPLLILFTVPLAA
AGSIYGLYITQTSLSVIVFIGLIMLAGIVVNNAIVLVDRINQLRESGMAKGDAIMASATS
RLRPIVMTTLTTTLGLLPLAISSGDGAEIRAPMAITVIFGLLFATLLTLFFIPVLYSVFD
RKRFGEANA
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgtggttaatgttgcggttaaaaggccggtaactgtatggatgtttacgtttgct
gtgctgttatttggtatggtgagtctatcaaagttatcggttaatttattaccagaatta
tcttaccctactctaacaattcgtaccgattatataggtgcagcaccaggagaagttgaa
cagcttgttacaaaacctattgaggaagctgttggtattgttaaaggtgtgcgcaatata
cagtcaatctcaaaagcaggtcagtcagatgtattgcttgaatttgaatggggaacagag
atggacttcgccagccttgaagttcgagaaaagctcgatgttatccgcctccccctagac
gtaaaaaaacctctgttattacggtttaaccctaatttagatcctattattcgttttgct
ttgaaaacaaaacaaagtagtgaaaactttgatgaacaaaaacttaaatcaataagagac
tatgccgacgaagagttaaaaagaaagcttgaatcggtcagtggcgttgcgtcagtaaaa
ttgggcggcggcttcgaaaaagaaattcaaattttaattgaccaacataaagttagccaa
cttggtattgacagccagcttattgttgaacgattacagcaagaaaatatcaaccaatcg
ggcggtcgtgtagaagatggcacacaagaatatctagtacgcaccttaaaccaattcaaa
agcttaaatgacatgcgcaatgtctatattaccagtgtagatggtaaacacattcgcttg
tctgatattgccaaagttattgattcacacaaagagcgtacgtcaattacccgtgttaac
ggtgctgaagcagtagaaatcgctttatataaagaaggtgatgcaaatactgttaaagtt
gccaaaagtgtggattttcgagtggaacaattaaccgaggaactgcccgaaggtttagag
cttgttaaagtttatgaccaatcaaagtttatcgctaacgccattagtgaagtaaaaaac
gccgcaattattggtggcttattatctatgctgattttattctttttcttaaaaaacatt
tgggcaactgcaataatatctatttcaattccagtgtcggtaattgccacatttaattta
atgtatggtaatgatattagtctgaatatcatgagcttaggtggaattgcgttagcggta
ggcttattagtagataattctattgtagtattagaaaacatcgctcgccaaaaagaatta
ttagatggctcagaaagcgctgccaataaaaatgcagccgtaataggcacaaaagaagta
tctacggcaattatggcctcgacattaaccactatggcggttttctttccgttggtgttt
gtcgaaggtatcgcaggacaattatttagagatcaggcgttaacggttacttttgcctta
ttagcttcgcttatcgttgctttgacccttattccaatgttgtcatcacgtgagtttaag
caatcaagtgttgatgaagacatcaccagtaagcgccaattaaccattaatgctagtaaa
tttcaaaaagtaaaatatcacttagctacaccgtttatttggttgtttagaggattattt
tattacctaccattacttatttctatggtgattacctttacgtttaggggtttaaaacta
ctgttaagcaaagtttttacgccactgttgtggatattcgataaagtttataatcgctta
gctagcttatatcaaaaccttttggctattgccttaaaccaacgagttgctgtacttatt
attatcattgctatgagcacatcggctattccattagttaaacaattaaatgtcgaagcg
atcccgtctttagcacaaggtgagttttatgtagaaattagccaacaacccggtacgcct
ttagaacaaaccgatagtactttggccaaactttctaacgaagcagcaacgttaacacaa
gttgatagaagctatgctttagccggaacaggtagcttaatgaacgcatcaccagctcaa
ggtggtgattattggggtcgattaaatgtggtactaaaagaaggtagcacgaaagccgat
gaacaattggttatgatgcacttgcgcaagtatttgcaaacaattccagggattcaaatg
aaattttcaagccctgaactatttagctttaagccaccaattgaaattgaactttcggct
tttgatttagatttacttaaacactatagcgatgtgatcactaacaaacttaatgataat
aaacgctttattgatgtaaaaacttctttgcaaaatggtcatcctgaaataaaagtattt
ttcgatcatcaacgtttagcacaacttggtttaacggcgccgcaagtggcaaaattatta
tcaaccaaagttggtggcacaattgccagtcaatattcgataaaagataagaaggttgat
attttagtgcgcgccgatgaagcaagtagagattcggttaacgatataaaacaaattatt
attaatccacaaagtgataaagctatccctctttcagcggtagccgaggtaaagctttca
gttggacctagtgaaattactcgcatcggacaacaacgagcagcggttatttcggctaat
tttgcttttggtgatatcaatgccgctgtacaagaggtacaaagcattattgatgaatta
aatattcctttaaacgttagtgccaacattaccggccaaaatgaagaaatggatgtgtcg
tttacctcgcttatgtatgccttgctacttgcggtttttcttgtgtatttagtgatggcc
tcgcaatttgaatctttactgcatccgttactcatattgtttaccgtgccattagctgct
gcagggtcaatttatggcctgtatattacccaaacgtcactgagtgtcattgtttttatc
gggctgatcatgctagccggtatagtggttaataacgccattgtattagttgatcgcatt
aaccaacttcgcgagtcaggtatggctaaaggtgatgctattatggcatcagcgacatct
cgtttacgccctattgtaatgacaacgttgaccacaaccctaggcttactaccattagca
ataagttctggtgacggcgctgaaatcagagcaccaatggctattacggtaatttttggc
ttgttatttgccacgcttttaacgctatttttcatccctgttctatacagcgtttttgac
cgcaagcgttttggagaagcaaatgcctag
DBGET
integrated database retrieval system
