Thalassotalea psychrophila: RGQ13_17320
Help
Entry
RGQ13_17320 CDS
T10151
Name
(GenBank) multidrug efflux RND transporter permease subunit
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
tpsy Thalassotalea psychrophila
Pathway
tpsy01501
beta-Lactam resistance
tpsy01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpsy00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
RGQ13_17320
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
RGQ13_17320
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tpsy02000
]
RGQ13_17320
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
tpsy01504
]
RGQ13_17320
Transporters [BR:
tpsy02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
RGQ13_17320
Antimicrobial resistance genes [BR:
tpsy01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
RGQ13_17320
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC71860
LinkDB
All DBs
Position
complement(4147842..4150991)
Genome browser
AA seq
1049 aa
AA seq
DB search
MIEFFINRPKFAIVLSIVMTLTGILTMLKMPVSLYPTVTPPTIMITATFPGADHNTIRDT
VASVLEQDINGVENMIYMDTKSANDGTYIGRVTFAIGTDPDRAQSLVQNRVNKALPKLPG
IVKQLGVTVQKSSPSMLVSVSLYSPNNTYDDVFLSNYMTLNILDQLLRVNGVGELKMLGQ
KDYSLRIWIDNEKMAGFGITDTEVSNAVAAQNATISAGKIGESPNPEGTTFQYTIKTKGR
LKNIEEFEDIVVRVLPDGSDIRLKDIARIELGSKAYNAQASWSDKPSPLLIAYQAPGANA
IVVANEVKAKMQEISKAFPEDIEYDIAFDSTTFISASMNEVYKTLFEALILVAIITFMFL
QNWRATIIPLIAIPVSLVATFLVFKMMNIDINTISMFGLILAIGIVVDAAIVVIENVERL
MHEEHLPAKEATSKAMKEVTAPLIASALVLMAVFVPVSLAPGMVGILYAQFGVAIVASTV
LSTVVALTLTPALCATLMQVKPLATKGPLGWFNRFVDVTREKYGWLVDFLGRRLMLTMVI
FVALLAYIGYLGKTMPTGFIPEEDKGNFIVDVSLPEAATLERTIEQVNQMTREIEAIPGV
ARVVSASGFSMLKGALATNSAMLIVSLDDWSLRKTPELSLVSVLGQTRGLLAANKEIKGL
AITTPAIPGMGTSSGLSIVLQDTMGRSTESLAPVLQKFSMDLMARPEIAFAFSTYTANVP
QLYLDIDYELAMKLGVQPTAINSTLSTMFGKKYVNDFTKFGKNYQVNIMSDGQFRDDESD
LNTLYVASGTGELIKFSSFAEFKPAIGADVSARYNLYNSTQLMAAAAPGYSSGDAIKAVQ
EVAKTLPDGYTTDWTGQTYQEVETGGGIIFLFALAILFTYLFLVAQYESWMTPFAIILCV
PTALFGALFLVSMMGGTLNIYTQIGLVLMIGMAARNAILIVEFAKVLREDKGLTILESGI
QAAKLRMRAVAMTAFAFILGVVPLMIASGAGAASRNVMGQTVFGGMLSATIIGCIFVPIF
FIMFQRLREHFGSKTQIASIADAARDGKE
NT seq
3150 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaatttttcataaatcgtcccaaatttgcaatagtattatctatcgtaatgacg
ttgaccggtatattgaccatgctgaaaatgcctgtgtcgttatacccaacagtaacaccg
cctactattatgatcacagctaccttccctggtgccgatcataacactattcgtgatacc
gttgcctctgtattagagcaagatatcaacggtgttgagaacatgatttatatggatact
aaatcagctaatgatggtacctatattggacgcgttacattcgctattggtacagatcct
gaccgtgcacaatcgctagtacaaaaccgagtgaataaggctttgcctaaattacctggt
atcgtaaagcaacttggtgtgacggtgcaaaaatcatctccatcaatgctagtttctgta
agtttatattcaccgaataatacttacgatgacgtatttttatcaaattacatgacatta
aacattctggatcaattgttacgagtaaacggtgttggtgagctgaaaatgcttggtcaa
aaagattactcgttacgtatttggattgataatgaaaaaatggcaggttttggtattacc
gatactgaagtaagcaatgccgttgctgcacaaaacgcgacaatttctgctggtaaaatt
ggtgaatcaccaaacccagaagggacaacatttcaatatactatcaagactaaaggtcgt
ttgaaaaacattgaagagtttgaggatatagttgtccgtgttttgcctgatggcagtgat
attcgcttaaaagatattgctcgtattgagttaggttcaaaggcctataatgcgcaagca
agttggagtgataaaccttctcctctgttaattgcttatcaagcacctggtgctaatgcc
attgttgtggccaatgaagtaaaagcaaaaatgcaagaaatttcaaaagcattccctgaa
gatattgaatacgatattgcctttgactcaactacttttatatcagcttcgatgaatgag
gtttacaaaacgttatttgaagcgctaatacttgtagcaatcattacttttatgttcttg
caaaactggcgtgctacgattattccattaatcgctataccagtatctcttgtcgctaca
ttcttagtatttaaaatgatgaatattgacattaataccatttcgatgttcgggttgatt
ttggctattggtattgtagttgatgccgctatcgtggtgatagaaaacgttgagcgatta
atgcatgaagagcatttaccggcaaaagaagctacatctaaggcgatgaaagaagttacc
gcaccgctaatcgcatcagcattggtattaatggcggtatttgtacctgtatcactagca
ccgggtatggttggtatcctttatgcacaatttggtgtggcaattgtagcctcaacggtt
ctatcaacagttgttgcactaacattaacaccagcactgtgtgctactttaatgcaggta
aaaccgcttgccactaaaggcccattaggttggttcaaccgttttgttgatgttacgcgt
gaaaaatatggttggctagtagatttccttggtcgtcgtttaatgctgactatggttatt
tttgtcgcgctacttgcttatattggctatttaggtaaaaccatgccgaccggttttatt
cctgaagaagataaaggtaactttatcgttgatgtgtctttgcctgaagcggcaacatta
gaacgtactatcgaacaagttaatcaaatgactcgtgaaatagaagctatcccgggtgtt
gcccgtgttgtttcggcatcaggctttagtatgcttaaaggtgccttggcaacgaattcc
gcaatgcttattgtttctttagatgattggtctttacgtaaaacacccgaactatcgcta
gtatctgtgcttggccaaactcgtggtttacttgcagcaaataaagaaattaaaggctta
gcaattaccactcctgcaattccaggtatgggtacatcatctggtttgagcattgtttta
caagataccatgggacgttcaacagagtcacttgcgccggtattgcaaaagttctcgatg
gacttgatggctcgccctgaaattgcttttgcattttctacctatacagctaatgttcca
cagctgtacttagatattgattatgaattagcaatgaaactgggggttcagccaacagca
attaactcaactttgtcgactatgtttggtaaaaaatacgttaacgacttcaccaaattt
ggtaaaaactatcaggttaatattatgtctgatggccaatttagagatgatgagtcggat
ctaaatactttatatgttgcgagtggcactggcgagttgattaaattctcgtcgtttgct
gaatttaaacctgctattggtgcagatgtttcagcccgttataacttatataattcaacg
caacttatggcagcagcagcgcctggctattcatctggtgacgcgatcaaagctgtacaa
gaagtagcgaaaacattacctgatggatatacgactgactggactgggcaaacgtatcaa
gaagttgaaactggtggcggtatcattttcctattcgcactggctattttatttacatac
ttgttcttagttgcacagtatgaatcttggatgacaccatttgctatcattctatgtgtt
ccaacagcattattcggtgcgttattcttggtaagtatgatgggtggaaccttaaatatt
tatactcaaattggtttagtcttgatgataggtatggctgctcgtaacgcgatattgatt
gttgaatttgctaaggtattacgtgaagataaaggcttaactattttagaatcaggtatt
caagcagctaaattacgtatgcgagcggttgcgatgacagcatttgcctttattttaggc
gttgtgccactgatgatcgcatcaggtgcaggtgccgcgtctcgtaacgtaatgggacag
acggtatttggcggtatgttgtcagcaactatcatcggttgtatcttcgttcctatcttc
tttattatgttccaaagattgcgagaacactttggctcaaaaactcagatagcatcaatt
gctgatgcagcacgagatggtaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
