KEGG   Thalassobellus suaedae: RHP49_01530
Entry
RHP49_01530       CDS       T10801                                 
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
tsx  Thalassobellus suaedae
Pathway
tsx01501  beta-Lactam resistance
tsx01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tsx00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    RHP49_01530
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    RHP49_01530
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:tsx02000]
    RHP49_01530
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:tsx01504]
    RHP49_01530
Transporters [BR:tsx02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   RHP49_01530
Antimicrobial resistance genes [BR:tsx01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    RHP49_01530
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran SecD_SecF_C MMPL
Other DBs
NCBI-ProteinID: WNH12947
LinkDB
Position
complement(367446..370640)
AA seq 1064 aa
MKEGLAGKIAKVFISSKLTVLLMIVFMVIGVYSSFLIPREEEPQIDVPIADIFVGYPGAS
PTEVESRVIKPLEQLISNIKGVEYVYSTSMKEQGMVIVQFYVGEDIERSFVKLYNEINKH
MDEMPKGVTFPLVKTRAIDDVPMLGLTLWSENYDDFQLGQMAQELENEIKKVNDVAITHK
IGGRNRQLRVVLDKDKLAASGLDFLMVSEMINANNAQLNSGSFDKNDTEFLVNTGKFLES
VTDIENLVVGVQQNQPIYLKQIATIIDGPEIPQNYVSLGFGQASSKGGEYQSEYPAVTIS
VAKRKGADAMKISDVIIDKVAHLRKNLIPDDVHVEITRNYGETASHKVSELLLHLIGSII
AVTFVVMLAMGWRGGLVVFLSVPITFALTLLSYYMLDYTLNRITLFALVFVTGIVVDDSI
IIAENMHRHFKMKRLPFKQAALYAINEVGNPTILATFTVIASVLPMAFVSGLMGPYMAPM
PIGASIAMILSLFVALTITPYLGYIFLREKDKKGAKEKSEKPLEETYIYKIYNKFERPLI
ENKTKRWLFLGLTFALLMGSMALFFTKSVAVKMLPFDNKNEFQVVIDMPEGTTLERTAVV
AQEIAQYLSTRPEVVNYQNYIGTSAPITFNGLVRHYDLRGGSNMADIQVNLIDKGARSAQ
SHDIARLFRPEIQKIASKYHANVKLVEVPPGPPVLSTIVAEVYGPDYNKQIDIANSIKNI
LKNTDDVVDIDWMVEDDQIEYQFDINKEKAMLYGVAPQQIAYTMNMAMSNRTITNLYDED
ASNQVGLILALDEKEKSTINDISQLKVKSKQGNMMPIADLVDIKQVVSAKSIYRKNQKRV
VYVMADMAGELESPAYAILGMEEKLKEINLPEGYKLNEIYLGQPDYEDDYTVKWDGEWQI
TLEVFRDLGIAFLGAIILIYILIVGWFQNFKAPVVMMVAIPLSLIGIILGHWLMGAFFTA
TSFIGMIALAGIMVRNSVLLIDFINLRLADGIPLKQAAIEAGAVRTTPILLTAGTVVIGA
FVILFDPIFQGLAISLMGGTIVSTVLTLLVVPLVYYMIEKKNYK
NT seq 3195 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagaaggtttagctggaaaaattgccaaggtctttataagttctaaacttacagtg
cttttaatgatcgtttttatggttattggggtatatagttcgtttttaattccgcgagaa
gaagaaccacaaattgatgtgcctattgccgatatttttgtaggctatccaggagcaagc
cctactgaagtagaatcgcgtgttattaaacccttagaacaattaatttcaaacataaaa
ggagttgagtatgtgtattcaacatctatgaaggagcaaggaatggttattgttcagttt
tatgttggtgaagatattgagcgttcgtttgtgaaattatacaacgaaattaataagcat
atggatgaaatgccaaagggcgtaacatttccgttggtaaaaacacgtgctattgatgat
gtgcctatgttggggttgaccttatggagtgagaattacgacgatttccaattagggcaa
atggcgcaggagctagaaaatgagattaagaaggtaaatgatgtcgccattacacataaa
ataggtggtagaaaccgacaattacgtgtggttttagataaagataaattagctgctagc
ggattagattttttgatggtttctgaaatgataaatgctaataatgcgcaattaaattcg
ggaagttttgataaaaatgacacagagtttttagtaaatacagggaagtttttagaatct
gttacagatattgaaaatttagtggttggcgtacaacaaaatcaacctatatatttaaaa
caaattgccacaattattgatggaccagaaataccacaaaattatgtgagtttaggcttt
gggcaagcgagtagtaaaggtggagaatatcaatctgaatatcctgcagttactatatct
gttgccaaaagaaaaggtgctgatgctatgaaaatatcagatgtaattattgataaggta
gcccatttacgtaaaaatctaattcctgacgatgtgcatgtagaaatcaccagaaattat
ggtgaaacggcatcacataaagtatccgaattattgttacaccttataggttctattatt
gcggtaacttttgtggttatgttagcaatgggttggcgtggtggattggttgtatttttg
tcggtgccaattacctttgctttaaccttgttgagttattatatgctagattatacgctt
aacagaattacgctttttgcattggtttttgtaactggtattgtggttgatgattcaatt
attattgccgaaaacatgcataggcattttaaaatgaaacgtttgccatttaaacaagcg
gcattatatgctattaatgaagttggtaatccaactattttagcaacatttacagtaata
gcctctgtattgcctatggcttttgtatcgggtttaatgggaccttatatggcgccaatg
cctattggagcttctattgctatgattttgtcgttgtttgtagctttaactataacgcct
tatttaggttatattttcttaagagaaaaagataaaaaaggcgcaaaagagaaatcagaa
aaacctttagaggagacttatatttataaaatatataacaaatttgaacgccctttaata
gaaaataaaacaaaaagatggttatttttaggattaacttttgccttgttaatggggtct
atggcgttgttttttactaaatcggttgctgtaaaaatgttgccatttgataataaaaat
gaatttcaagtggtcatagatatgccagaaggcacaactctagaacgtacagcagttgtt
gctcaggaaattgcacaatatttatctacacgaccagaagtggtgaattatcagaattat
attggtacatcggcacctataacgtttaatggtttggtgcgtcattacgatttacgtggt
ggtagtaatatggcagatattcaagtaaatttaattgataaaggagcacgtagtgcccaa
agtcatgatattgcgagattatttcgtccagaaattcaaaaaattgcatcaaaatatcat
gcgaatgtaaaattggtagaagtgccaccaggaccaccagttttgtcaaccatagtagct
gaggtttatggaccagattataacaagcaaatagacatagctaatagtattaaaaatatt
ttaaaaaacacagatgatgttgtagatattgattggatggttgaagatgatcaaattgag
tatcagtttgatattaataaagaaaaagcgatgctttatggtgtagcgccacaacagatt
gcatatactatgaatatggcaatgtctaacagaaccattacgaatttgtatgatgaagat
gcttcaaatcaagtggggttaatattggctttagatgagaaagagaaatctactataaat
gatatttcgcaattaaaagtgaaatcgaagcaaggtaacatgatgcctattgccgattta
gttgatattaaacaagtggttagtgcaaaaagtatttatagaaagaaccaaaaacgtgtg
gtttatgtcatggcagatatggctggagaactagaaagtcctgcttacgctattttagga
atggaagaaaaattgaaagaaataaaccttccagaaggctataaattaaatgaaatatat
ttaggtcagccagactacgaagatgattataccgtaaaatgggatggcgaatggcaaatt
actttagaagtgtttagagatttaggaatcgcctttttaggcgctattatcttaatttat
attttaattgtaggctggtttcaaaattttaaagcacctgtggttatgatggttgctata
ccattatcattaattggaattattttaggtcattggcttatgggtgctttttttacagca
acttcatttatcggaatgattgcattagcaggtattatggtacgtaattcggtattgtta
atcgattttattaatctgcgtttggcagatggtattccattaaaacaagctgctattgaa
gcaggtgcagtgcgtacaacgcctattttgctaaccgcaggaaccgttgttattggagct
tttgttattttatttgatcctatttttcaaggtttagccatttcgttaatgggaggtaca
atcgtttctacggtgttaactttattggtggtaccattggtgtattatatgattgagaag
aagaattataaataa

DBGET integrated database retrieval system