KEGG   Aliivibrio fischeri ES114: VF_A1149
Entry
VF_A1149          CDS       T00236                                 
Symbol
acrF
Name
(GenBank) multidrug efflux system protein
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
vfi  Aliivibrio fischeri ES114
Pathway
vfi01501  beta-Lactam resistance
vfi01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vfi00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    VF_A1149 (acrF)
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    VF_A1149 (acrF)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:vfi02000]
    VF_A1149 (acrF)
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:vfi01504]
    VF_A1149 (acrF)
Transporters [BR:vfi02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   VF_A1149 (acrF)
Antimicrobial resistance genes [BR:vfi01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    VF_A1149 (acrF)
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran MMPL SecD_SecF_C Pyridox_ox_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAW88219
UniProt: Q5DYC7
LinkDB
Position
II:complement(1291345..1294497)
AA seq 1050 aa
MLSRFFIQRPKFALVISIILTLAGAIALAVLPVAEYPKISPPSVSVSAYYTGASAEVVEQ
AIADPIETSVNGVENMIYMSSKSANDGSYSLNVTFDVGTDPDMAQVNVQNRVAQIESKLP
QEVRMVGVTVKKRSPDLLMVLNFYSPDGKYDDQFLINYVNLNIKDQLARVTGISEVGVLG
GGEYAMRVWLDPDKMTNLGLTTSDVHAALAEQNVQVAAGKIGAAPYASAQDVQFNLVTKG
RLESVEEFENVVLRANNDGSSVYLKDIARVELGKKFYDGNGQFRGKDASIVTLSLQSDAN
ALESGKAVMEMLEKLSATFPEGLAYETSYDTTLFVSESIKGVVKTLIEAILLVIAVTYLF
LGSARATLIPVVAIPVSLIGTFAVMLMTGFTINTVTLFGLILAIGIVVDDAILVIENVDT
IMKRDPSLSPRKATLIAMKEVTGPIITSTLVLLAVFIPVAMLPGITGIMYRQFALTICIA
VIISSINALTLSPALCSLVLKRGGDNTARWFKAFNRGLDKVTDKYGEIAGFFVRKTMILM
TFFVIALGAVTFFAKTTSTAFVPQEDKGILLVNVQLPDSASLSRTEEVSAKVLEIIEQEQ
GVDGVTVANGYAFLTGAAASNGASLFVKLKPWGERNDMDGDNSSFAITNRINGRAAMELP
EAVIFAMGAPAVPGMGAASGFEFVLEDTLGRSRTDLANVMNQVIQTANQQPEIQYTFSTF
RANVPHYYVDIDREKAKQLGVSLGSIFQTLQGNLGSMYVNDFTMFGKNFRVTMQADGQYR
SSMDDLDKFHVRASSGQMVPLSTLVTYDTVFEPDVAWRYNMYRSAVIQGQPAAGYSSGDA
IAAMERVAAEVLPHGYQYEWTGMAYQEVKAGNQAIYAFALALIFIYLFMVAQYESWSIPL
AIILVVPVATFGSFLALNLTGMPLNLYAQIGLVLLIALAAKNAILIVEFAKNEREEKEVG
LDDASVNGGRLRFRAVNMTSWSFILGILPLVFASGAGYISQNSLGVSLIGGLLCVLLVGT
LLIPGFYAMVQRRREKLHGGSTKLIPLDDE
NT seq 3153 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctaagtcgattttttatacagcgtcctaaatttgctctggttatttctattatcctc
actcttgccggagccattgcattagcagtattacctgttgctgaatacccaaaaatcagt
ccgccatcggttagtgtaagtgcttactacacgggggcaagtgctgaggtggttgaacag
gcgattgctgaccctatagaaacctccgtcaatggcgtagagaacatgatttacatgtct
tcaaaaagtgccaacgacggttcatattcattaaatgtcacctttgatgtgggcaccgat
cctgacatggcacaggttaacgttcagaaccgtgtggcgcagattgaatctaaattgcca
caagaagtgcgtatggtgggggtgactgttaagaagcgttctccagaccttttaatggta
ttgaacttctactcgcctgatgggaaatatgacgatcaattcttaattaactacgtaaat
ctgaatatcaaagatcagttggctcgtgttactggcatcagtgaagttggtgtgcttggt
ggtggtgaatacgccatgcgtgtttggcttgatccagataaaatgaccaacttaggttta
accacatccgatgttcatgccgcgttagctgaacaaaacgtacaagttgcagcgggtaaa
attggtgctgcaccttatgcgagtgcgcaagatgtgcagtttaacctcgtaacgaaagga
cgtttagagtcggttgaagagtttgaaaatgtcgttcttcgagcaaataacgatggatct
tctgtttatttaaaagacattgcccgtgttgagttaggcaagaaattctatgacggtaat
ggtcaattcagaggaaaagacgcctctatcgtaacgctttctttgcaatctgatgcgaac
gcattggagagtggaaaggcggtaatggagatgcttgaaaagctaagtgcgactttccct
gaaggtctggcgtatgaaaccagttatgacactacgctgtttgtttcagaatccattaaa
ggggtagtaaaaaccttaattgaagcgattctattggttattgctgtaacgtatctgttc
ttaggcagtgctcgtgcgacgttaattccagttgtagctattccagtatccttaattggt
acctttgctgtcatgcttatgacagggtttaccattaataccgtgacgttatttggtctt
attcttgccattggtattgtggtggatgatgccattttggttattgaaaacgtcgatact
attatgaagcgtgatccttcattaagcccaagaaaagccactctaattgcgatgaaagaa
gtaacaggcccaatcattacttctactcttgtactgcttgcggtatttattcctgttgcc
atgcttccgggtattactggcatcatgtatcgtcagttcgcattaaccatctgtattgcg
gtaattatttcatccattaatgcactgacactgtcgccagcattgtgttctctggttcta
aaacggggaggggataatacggctcgttggtttaaagcctttaaccgtggtttagataaa
gtaacggataaatacggtgagattgctggtttctttgtacgaaaaaccatgatcctgatg
acattctttgtgattgctttaggtgcagtaaccttctttgcaaagaccacatcaacggcg
tttgtaccacaagaagataagggtattttactggttaacgttcaactacctgattcagcg
tcactttctcgtactgaagaggtatctgccaaagtgcttgaaatcatagagcaagagcaa
ggtgttgatggggttaccgtcgccaatggttatgcgtttttaacaggtgcggcagcatca
aatggtgcgtcactgtttgtgaaattaaagccttggggtgagcgtaatgacatggatgga
gataactcttcatttgcaattaccaaccgcattaacgggcgtgcagcgatggagttacca
gaagccgttatttttgcaatgggtgcaccagcggttccgggaatgggggcagcgtctggt
tttgaatttgttcttgaagataccttaggtcgtagtcgtactgatttggctaatgttatg
aatcaagtgattcaaaccgccaatcaacagcctgaaattcaatatacattcagtacgttc
cgtgccaatgttccacactactatgtggatattgaccgtgaaaaagcaaaacaattaggc
gtgtcattaggctctattttccaaacactgcaaggtaacttaggttcaatgtacgtgaat
gactttactatgtttggtaagaacttccgagttacgatgcaagcagatgggcagtatcgt
agcagcatggatgatttggataaattccacgttcgtgcaagctcggggcaaatggtgcca
ttaagtacattagtcacttatgacacggtatttgaacctgatgtagcgtggcgttacaac
atgtatcgttcagctgtgatccaaggacagccagcggctgggtattcaagtggtgatgcc
attgcagcgatggaacgtgttgcagctgaagtgcttccacatggttaccaatatgaatgg
actggtatggcgtatcaagaagtgaaagcgggtaaccaagcgatttatgcgtttgcgcta
gcgctgatctttatctatctattcatggtggcacaatacgagagttggagtattcctctt
gcgattattcttgtggtgccagtggcaacctttggctccttccttgcgcttaatttaacg
gggatgccgttgaatttatacgcacaaattggtttggttcttttaatcgcattggccgcc
aaaaatgccattttgattgttgaatttgcgaaaaatgagcgtgaagagaaagaagtgggc
ttagatgatgcgtcagtaaacggtggtcgattacgattccgtgcggtaaacatgacatcg
tggtcgtttatcttgggtatcttaccgcttgtgtttgcatcgggtgcaggctacatcagc
caaaactcattgggtgtgtcgttgattggtggcctactgtgtgtgttattagtgggtacg
ctacttatccctggcttctatgcaatggtacaacgtcgtcgtgaaaagctgcacggcgga
agcaccaaacttattcctttagacgatgagtaa

DBGET integrated database retrieval system