Weissella sagaensis: AB9G37_04305
Help
Entry
AB9G37_04305 CDS
T11351
Name
(GenBank) DUF1542 domain-containing protein
Organism
wsa Weissella sagaensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1542
KxYKxGKxW_sig
GA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XEC92301
LinkDB
All DBs
Position
complement(860264..864943)
Genome browser
AA seq
1559 aa
AA seq
DB search
MGINNSKEHYKMYKDGKRWVFASISIMTVMLTGAVHADSVHADTTNDASSEVSNDDNATN
ELSQPQVVLDNKPVTKEDNLPASEDKQITTENISASNKVEQDEQINDDSSNISSASSNNE
VTTVKTESNLNDADSQTSAATSSAASVNSSAASADSEVTATSDATGVNSEAVTANSSAVV
SGSSSAAVTDAEIKKANTVPRTKAASQVISSVHVSSWNDFTSALKNKDINEIIIDNNIVA
SGSGSQSVAVRDNNTLLIRSNDGGRYAIDFRGAYPKGQLNLTYENIDLYGTVYYGVINTD
VFLSSKQSNITFRNTSYTGAQLVYASDNTTVTFQGKNTIKAVSSYVSPVDGSIVSVSNSQ
QVLEFTGKNDYIIFDEGSIFEGSTFKDNVIRMTGNNSGITVKKGAIVTLTPHDNGTGKNG
SAEWGNKANGIYMSGSGVLTVENGGTLNINAGEDSSQGVAAISITDKNTIMNINDGGTVN
INVTGNISSYGGSGQSSNTAVYINGQLNTGYGASFNVNGHDMGSFSGTLVQISGNAKLLG
STFKIVLDDAISGTGSIVLLNTGGNVSIESPKDFLLHLGTNSQAQWIKDGSFSLSKARLK
TNGTTTGPFKTISFTVSGGNVLVTDADSKKIIGLTQADENKLISLLNQIGSDASVASLEF
VQANGEVNIVDDNVTVTKENGKYLEVSGYTDTPGAYIHATINGNEFAGQKLDSPYWRENG
IDTTVVYAAQASMTKDPNGKGYKFTFEIPNDVINTLTPGTNINLYATYNFLDSDVVSADL
GILTAQQYRDKVNAAATDATSHINGLTHLTNQQKESLIGQVNTSVASVIDKFVDNVSQNS
ANSDAYDSFINDLNTITGLADGQDYAMDLLQTATENVINDINNIDGLTSTQISDYESQIN
KVHDDAILEIGQTLSPEDALTAEQNGEISFTNIKNTAQVQAAKNDAVNAINTAATNAIAA
IENNTSLTAGQKDAYKEQITNAATDAKHDINQATNVADVTTAEDAGAANISAVSDAAKLQ
AVKNDGIAKLDEAKNTTIAQITQSGLSADRQNALINAVNEAHDTAVDKVTADTTIVQVNQ
DTTDGVNAINGIAGTVTEESEALQAAQEIAQNTINAAAEAAKNDINNNASLTADEKHDLV
AAVDEAANTAKDQIAQATSPDEATEATQTGEANIAVVSDAAKLQAAKNDAVAAIDTAATN
AIAAIENNTSLTAGQKDAYKEQITNAATDAKHDINQATNVADVTTAEDAGTANISVVSDA
AELQAAKNDGIAKLDEAKNTTIAQITESGLSADRQNALINAVNEAYDTAVDKVTADTTIV
QVNQDTTDGVNAINSIAGTVTEESEALQTAQNVAKDKINQIAQAAIKEINQNSNLTSKEK
QRFIDGILQVITDFNSHITNTTSSQEVALAEKDSGIAINNISCAAKLQAAKNVSINKLDK
AKVTVIDKVYHSGLSINRQNELINKIKQVYNDAVGKVKNDKTINSVEHDTIVGLNAINSI
LSEISKEMASLHDAQVVAISHINEIANNIMNTINHNNALTDKQKDEFINQIMETVNNNS
NT seq
4680 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtattaataattcgaaagaacattacaagatgtataaggacggtaagcggtgggtt
tttgccagcatatctataatgaccgtgatgttaacgggggcagttcatgctgatagtgta
catgcggatacaactaatgatgctagttctgaagttagtaacgatgataatgcaacaaat
gagctatcacaaccacaagtcgttttagataataaaccagtaacaaaggaagataattta
cctgcttctgaggataagcaaataacaacagaaaatatttctgctagtaataaagtagaa
caagatgaacaaataaatgatgattcatcaaatattagttcagcttcttcaaataatgaa
gtgactacagttaagactgaatcaaatttaaacgatgctgactcgcaaacatcagcagca
acaagcagtgctgcgagtgttaatagtagtgccgcaagtgcagatagtgaagtaacagca
acaagcgatgctacaggtgttaatagtgaggcagtaacggcaaatagtagtgcggtagta
agcggaagtagttcagcagctgttacggatgccgaaataaaaaaagctaatacagtacca
cgtactaaagctgcatcgcaggttatttctagtgttcatgtttccagttggaatgatttt
acgagtgctttaaaaaataaagatattaatgaaataattatcgataataatattgttgca
tcaggtagtggttcgcaatccgttgcagtcagagataataatactttattaattcgctca
aatgatggtggtcgttacgctattgattttagaggcgcatatccaaaaggtcaacttaac
ctaacctatgaaaatattgatctttatggaacggtttattatggtgttattaatacagat
gtttttttgtcttctaagcaatcaaatattacgtttaggaatacaagttatacaggggca
caattagtttatgctagtgataatacaactgttactttccagggtaaaaatacgattaag
gccgttagttcttatgttagtccagtagatggttcgattgtaagtgttagtaattcacaa
caagtcttagaattcactggaaagaatgattatattatttttgatgaagggtcgattttc
gaaggctcaaccttcaaagacaatgttattcgtatgacaggaaataatagtggtattacg
gttaaaaaaggggcaatcgttactttaaccccacacgataatggtaccgggaaaaatggt
tccgctgaatggggtaataaggctaatggaatctatatgtcaggtagtggtgtcttaact
gttgaaaacggtggtactttgaacatcaacgcgggtgaagattcatctcaaggggttgct
gcaattagtattacagacaaaaatacaattatgaatattaacgatggtggtaccgttaat
atcaatgttacaggaaacattagcagttatggcggtagtggacaatcatcaaatacagct
gtttacattaatggtcagttaaacactggttatggcgcatcttttaatgttaatggtcat
gatatgggatcattttctggtacattagttcaaatttctggaaatgctaaattattgggt
agtacttttaaaattgtactggatgatgcaattagtggtactggatcaattgttttatta
aatacaggtggaaatgtttcaattgaaagtccaaaagatttcttattgcacttagggact
aattcacaagcacagtggattaaagacggtagttttagtttgtcaaaagcgcgattgaaa
acaaatggcacaactacaggaccttttaagacaattagttttactgttagtggtggtaat
gttctggttactgacgcggatagtaaaaaaatcattggtttaacacaggctgatgaaaat
aaattaatttcattattaaatcaaataggtagtgatgcaagtgttgcatcactggaattt
gttcaggctaatggcgaagtaaatatcgttgatgataatgttactgttactaaagaaaat
ggtaaatatttagaagtgagtggttatacggatacgccgggtgcgtatattcatgccaca
attaatggcaatgaatttgctggtcaaaaattagatagtccatactggagagaaaacggg
atagataccacagttgtttatgctgcacaagcatcaatgacaaaagatccaaatggtaaa
ggttataaattcacatttgaaattcccaatgatgttattaatacattaacacctggtaca
aatattaatttatatgcgacatacaattttttggatagtgatgtcgtatcagctgactta
ggtattttaactgctcaacaatatagagataaagttaatgcagcagcaacagatgctaca
tctcatattaatggattaactcatttaacaaatcagcaaaaagagagcttaattggtcaa
gttaacactagtgttgctagtgttattgataaatttgtagataatgtttctcaaaattca
gcaaattcagatgcttacgattcatttattaatgacttaaacacaataactggtttggca
gatggccaggattatgccatggatttattacaaacggcaacggaaaatgtgattaatgat
attaataatatagatggtttaacaagtacacaaattagtgattatgaatcacaaataaat
aaggtgcatgatgatgcaattttggaaattgggcaaacattaagtcctgaagatgctttg
accgctgaacagaatggcgagattagttttactaatattaaaaatacagcccaggtacaa
gcagctaagaatgatgctgtgaatgcaattaataccgctgcaacaaacgcaatcgctgcg
attgagaacaacacgagtctgacagctggacaaaaggatgcgtacaaagagcaaatcact
aatgcagcaacagatgcgaagcatgacatcaatcaagcaacgaacgttgccgatgttacg
acagctgaggatgcaggtgcagcaaacattagtgctgtaagtgatgcggctaagttacaa
gcggtcaagaatgatggtatcgcaaagttagacgaagctaagaacacaacgattgcccaa
attacacaatcaggtttgagtgcagatcgacaaaatgcattgattaacgccgtcaatgaa
gcgcatgatacagccgttgataaggtgacggcagacacaacgattgtccaagttaaccaa
gatacgacggatggtgttaatgccattaatggtattgcaggcacagttactgaagaaagt
gaagccttacaagccgcacaagagatagcgcaaaataccattaatgcagcagcggaagct
gccaagaacgacattaataataatgcaagtctaacagcggatgaaaagcatgatttagtg
gctgccgttgatgaagcagcgaatacagcaaaggatcaaattgcacaagcaacaagtcca
gacgaagcaactgaagcaacacaaactggtgaagccaatattgcagtcgtgagtgatgcc
gctaaattacaagcagctaagaatgatgctgtggctgcaattgataccgcagcaacaaac
gcaatcgctgcgattgagaacaacacgagtctgacagctggacaaaaggatgcgtataaa
gagcaaatcactaatgcagcaacagatgcgaagcatgacatcaatcaagcaacgaacgtt
gccgatgttacaacggctgaggatgcaggtacagccaatattagtgtcgtgagtgatgcc
gctgagttacaagcagccaaaaatgatggtatcgcgaagttagatgaagctaagaacaca
acgattgctcaaattacagaatcaggtttgagtgcagatcgacaaaatgcattgattaat
gccgtcaacgaagcgtatgatacagccgttgataaggtgacggcagacacaacgattgtc
caagttaaccaagatacgacggatggcgttaatgccattaatagtattgcaggcacagtt
actgaagagagtgaagccttacaaacagcacaaaatgttgctaaggataaaattaatcaa
atagctcaagcggccattaaggagattaatcaaaactcaaacttaacgtccaaagaaaag
caacgatttattgatggaatactgcaagtaattactgattttaatagtcacatcactaat
acaacatcttctcaagaagttgctcttgctgaaaaagatagtggaatagctattaataac
attagttgtgctgctaaattgcaagctgctaagaatgtttctattaacaagttggataaa
gctaaagtgacagtgattgataaagtttatcattcaggattaagtatcaatcgacaaaat
gagttaatcaataagatcaaacaggtctacaatgatgccgttggaaaggtaaagaacgat
aaaactattaattcagttgaacatgatactatagttggcttgaatgcaattaacagtatt
ttaagtgaaatatcaaaagaaatggcatcactacatgatgcacaagtagttgcgattagt
catattaatgaaattgcaaataacataatgaatacgattaatcataataatgctttgaca
gataaacaaaaggatgaatttattaatcaaatcatggagactgtgaataataacagttag
DBGET
integrated database retrieval system