Xenopus laevis (African clawed frog): 108712909
Help
Entry
108712909 CDS
T01010
Symbol
fbn1.S
Name
(RefSeq) fibrillin-1
KO
K06825
fibrillin 1
Organism
xla
Xenopus laevis (African clawed frog)
Pathway
xla04350
TGF-beta signaling pathway
xla04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xla00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04350 TGF-beta signaling pathway
108712909 (fbn1.S)
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
108712909 (fbn1.S)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
108712909 (fbn1.S)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
xla00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
108712909 (fbn1.S)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_TEN
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108712909
NCBI-ProteinID:
XP_018110911
Xenbase:
XB-GENE-17346022
UniProt:
A0A1L8GSW8
A0A974HR69
LinkDB
All DBs
Position
3S:50369668..50488438
Genome browser
AA seq
2869 aa
AA seq
DB search
MRLLGSLWGCWALTLLLLLCVNSSHTADKDATAADSAKEPRASRAKRRGGGTGAAHDVLK
GPNVCGSRYNAYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRHSCGDGFCSRPNMCTCPTGQIGPSCGSK
SIQQCNIRCMNGGSCSDEQCQCQNGYTGTHCGQPVCEHGCLNGGRCVAPNRCACPYGFTG
PQCERDYRTGPCFTVVSNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATVGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRG
FIPNIRTGACQDVDECQAIPGMCQGGTCINTVGSFECKCAAGHRFNDITQKCEDIDECST
LIGICESGECANTVGSYFCKCPPGFFTSADGSRCVDIRPGYCFTSLANGRCNNQQPQTVT
KQQCCCDSGRCWSPGPTTSSDICPNRGTDEYRKLCIIPGVPPGPGPVIIPERVPPFPPVF
PPAVLPVYPTRGPPVVVGFNVSQQFPPHQPQQLDYCSLFRNLCLNGRCIPTPGSYRCDCN
KGFILDGRGECIDIDECEKNPCLHADCVNTPGSYICKCYSGFQSTSTKTECKDIDECLQN
GRICNNGRCVNTDGSFHCVCNAGFQVAADGKNCEDMDECSVRNMCLNGMCINEDGSFKCI
CKPGFQLSPNGRFCTDIDECETAGICMNGHCVNTEGSFRCECFPGLAVGLDGRVCVDTHM
RSTCYGGYKRGQCVRPLLGAVTKSECCCASTDFAFGEPCQPCPAKTSEEYQALCSSGPGM
TSVGTDINECALDPDICPNGICENLRGTYKCICNAGYEVDATGRNCVDIDECALNRLLCD
NGQCRNTPGSFSCTCPSGFVYTPDLKTCEDIDECESNPCINGVCRNIPGAFVCECPTGST
LDKTKTICIETIKGTCWQNIVNGRCEININGGTLRSQCCSTLGAAWGSPCMPCEADTVCA
KGFARSKGTTCEDVNECDVFPGLCTNGQCVNTMGSFVCQCPSGMTLDASKRTCLDIRLEI
CYLKHEDEECSAQIAGRHRMDACCCSVGAAWGPDCEECPDKGTPEFETLCPRGPGFASKE
ITPGKIFSKDINECRMIPSLCKYGKCKNTIGSFKCRCDNGFALDAEERNCTDIDECRISP
DVCGQGNCVNTPGDFECDCFEGYESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGVCLNTEGSFKC
ECPPGHEVAPDNSACIDINECDLSTDLCRHGRCINLIGRYQCACEPGYQLTPDKLSCVDT
NECDFFNGGCDTFCTNSEGSYECHCRDGYALMPDHRTCTDIDECENNPNICDGGQCTNIP
GEYRCLCFEGFMASDDMKTCLDVDECELHLNICLSGSCENTKGSFICHCDSGYSGKKGQT
GCTDINECEIGAHNCDRHAICTNTPGSFKCSCSPGWEGNGIKCKDQDECSNGTHLCSPNA
DCKNTMGSYRCLCREGYEGDGFTCTDIDECTANLNLCGNGQCLNTPGGYRCDCDMGFLPG
VDGKACEDIDECTLPNICVFGTCRNLPGLFRCDCDIGYELDRTGGNCTDVDECAEPTMCI
SGTCLNTAGSYSCDCPPDFELNPTKVGCVDTRSGTCYLDVKPRGDNGDVSCSNEIGVSVP
KASCCCSLGKAWGTPCELCPAVNSSEYKVLCPGGEGFKPNPITVILEDIDECLELPGLCQ
GGKCINTFGSFQCRCPPGFYLNEETRVCDDVNECDQPGICGPGTCFNTVGNYTCICPPDY
MQVNGGNNCMDMRRSLCFRNYYAENQTCDGELLYNMTKKMCCCSYNIGRAWHRPCEECPL
PSTDEFASLCGSARPGFLIDIYTGLPVDIDECREIPGVCENGVCINMVGSFRCECPMGFF
YNDKLLICEDIDECQNGPVCQRNADCVNTPGSYRCDCKPGYKFTSTGQCVDRNECQEIPN
VCSHGECTDTTGGYYCVCHNGFKTNEDQTMCLDINECERDPCGNGTCKNTIGSYNCRCFD
GFILSHNNDCIDIDECTTLNGQLCRNGQCVNTIGSFECLCNEGYEMASDGRTCLDINECA
LDPGKCAPGTCQNLDGTYRCICPPGYLLKEDTCEDINECEEEPETCALGTCSNVPGSFTC
LCPEGFVLSSTGKRCQDLRVSLCFAKFEEGQCTSPKARNHSKQECCCALKGAGWGSPCEL
CPVEGDEAFRQICPFGSGVVVGLDDERVDMDECIDPDKCKNGQCINTDGSYRCECSFGYV
LSGDECIDIDECSEGNPCGNGTCKNIIGGFECTCEEGFEPGPMMSCEDVNECAQNPLLCA
FRCVNTYGSYECKCPAGYVLREDKRMCKDQDECEDEAHDCESKQMTCKNLIGTYMCICGP
GYQRRLDGEGCMDLNECLKPGVCDNGKCVNTMGSYKCDCLEGFNASATETECIDNRLGYC
FTEVLHTMCQIGSSNKNSVTKSECCCNSGRGWGINCEICPFQGTVQFKKLCPYGKGFTTG
GEDIDECQVLHGICQNGQCVNERGTYRCECNPGYVPDMTGTSCIDLDECRQSPKPCNFIC
KNTEGSFQCSCPRGYILQEDGRSCKDLDECAMKQHNCQFICVNTIGGFTCKCPPGFTQHH
TACIDNNECASDVSLCGAKGICQNSPGSYSCDCQRGFSLDQSGASCEDVDECEGSHRCQH
GCQNIVGGYRCGCPQGYLQHYQWNQCVDENECMSAHICGGASCHNTLGSFKCMCPTGFQF
EQFAGACQDVNECSSSQAPCSFGCSNTEGGYVCGCPSGYFRIGQGHCVTGAGISRAQDMA
VSGEIDDNSLSPEACYDCKINGYPKRGRKRRSTNETGINDEEEQLEPPVSLASWDIEKPL
ILSFNISHVNNKDRILELTPALTTLTNHNRYLIDSGNEDGLFRINQKDGVSYLHLSKKKP
VPGSYSLQINSVPLYKEKELIQLEDKHDRDYLSGELGDILQMKITILLH
NT seq
8610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggctactggggagcctgtggggctgctgggcacttacactgctgctgctcctgtgt
gttaactccagtcacaccgccgacaaagatgcaacggccgcagatagcgccaaggagccc
agagccagcagagccaagaggagaggcggaggcacaggcgcagcgcacgatgtacttaaa
gggcccaatgtttgcggatcgcggtacaatgcttactgttgtcctggatggaaaacccta
cctggagggaaccaatgtattgtccctatttgccggcattcttgtggagatggtttttgt
tctcggcctaatatgtgcacttgtcccactggacagataggtccatcatgtggatccaag
tctatccagcagtgtaacatcagatgtatgaatggaggatcttgcagtgatgaacagtgc
caatgtcagaacggatatacagggacacactgtggccagcctgtctgtgaacatggatgc
ctaaatggtggcaggtgtgttgcaccaaatcgatgtgcctgcccttatggtttcacagga
ccacagtgtgaaagagattacaggacaggaccatgcttcacagtcgtaagcaaccaaatg
tgccaagggcagctgagtggtatagtgtgtacaaagacactatgctgtgcaacagttggc
agagcttggggtcacccttgtgaaatgtgccctgctcagccacatccgtgccggcgtggc
ttcataccaaacatccgaacaggagcatgtcaagatgtggacgaatgtcaggcaatccca
ggaatgtgtcaaggtggaacttgtattaatacagttggatcttttgaatgcaagtgcgca
gctgggcacaggttcaatgatataacacagaagtgtgaagatattgatgaatgcagcact
ttaataggaatctgtgaatctggtgaatgtgcaaatacagttggcagttacttctgcaag
tgtcctccaggattttttacttcagctgatggttcaagatgtgtagatatccgtcctggg
tattgtttcacttcattagcaaatggaaggtgcaacaaccagcaaccacaaacagtaaca
aaacagcagtgttgctgtgattctggaagatgctggtctccagggccaacaacatcatca
gatatatgtcccaatcgtggaactgatgagtatcgcaaactgtgtataataccaggcgtc
cccccgggtccaggtcctgttataattcctgaacgtgttccaccatttccacctgtcttt
ccacctgcagttctcccagtttatccaacccgtggccctcctgtggttgttggctttaat
gtgagccagcagttcccgccacaccaaccgcagcagttagattactgttctctattccgt
aacctctgtttaaacggccgttgtatcccaacccctggaagttaccgttgtgattgtaac
aaaggcttcattttggatggaagaggagaatgcattgatattgatgagtgtgaaaaaaat
ccatgtctccacgctgattgtgttaacacgccaggatcctatatttgcaaatgctactct
ggatttcagagtacatcaaccaagacagaatgcaaagacattgacgagtgcttacaaaat
ggaagaatttgtaacaacgggcgatgtgtgaacacggatggaagttttcactgtgtgtgt
aatgcaggctttcaagttgcagctgatggaaaaaattgcgaagacatggatgaatgcagt
gtgcgtaacatgtgcctaaatggcatgtgcattaatgaagatggaagtttcaaatgtatt
tgcaaacctggcttccagctttctccaaatggacgcttctgcacagatattgatgagtgt
gagacagccggcatctgtatgaatggacactgtgttaatacggagggttcttttaggtgt
gagtgcttccctggtcttgcagttggacttgatggacgagtttgtgttgatacacacatg
agaagcacatgctatggaggctacaagcgaggtcaatgtgtccgaccattattgggagca
gttacaaaatccgagtgttgctgtgccagcactgattttgcctttggagagccatgccag
ccttgccctgcaaagacttcagaggagtatcaagccctgtgtagcagtggacctggcatg
acatctgtaggaactgatatcaatgaatgtgcactggatcctgacatatgccccaatgga
atttgtgaaaatcttcgtggaacctacaaatgtatttgtaatgcaggatatgaagtggat
gcaactgggagaaattgcgttgatattgatgaatgtgctttaaacaggctgctctgtgat
aatggacagtgtcggaataccccaggaagtttttcttgcacctgccctagtggatttgtc
tatacacctgaccttaaaacgtgtgaagatattgacgaatgcgagtccaacccctgcatt
aatggggtatgccgcaatatcccaggcgcctttgtgtgtgaatgtcccactggaagtact
ctggacaagacaaagacaatctgtattgaaaccataaaaggcacctgttggcagaacatt
gtgaatggaaggtgcgagatcaacattaacggtgggaccctgagatctcagtgttgttcc
actctaggagcggcttggggaagtccttgcatgccctgtgaggcagataccgtctgcgca
aaaggctttgcccggtccaaaggcacaacatgtgaagatgttaatgagtgtgatgtattt
cctggattgtgcactaatggccagtgtgttaacacaatgggatcctttgtctgtcaatgc
ccaagtggaatgacgctggatgcttcgaaacgcacatgtcttgacatccgcctggagatc
tgctacctgaaacacgaagatgaagaatgcagtgcacagattgctggtcggcacaggatg
gatgcatgttgctgttccgtgggtgctgcctggggtcctgattgtgaggagtgccctgac
aaaggaacacctgaatttgagactctatgcccaagggggccaggctttgcttctaaggag
ataacacctggaaaaatattctctaaagatatcaatgaatgcagaatgatcccgagtctg
tgcaagtatgggaagtgtaaaaacaccataggcagtttcaagtgtaggtgtgacaatgga
tttgctcttgatgctgaggaaagaaactgcacagatattgatgaatgccgaatatcccct
gatgtctgcggacagggcaattgtgttaacactccaggagatttcgagtgtgactgcttt
gaaggatatgaaagtggctttatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaa
agaaaccccctgctgtgtcgtggtggtgtctgtctgaatactgaaggaagctttaaatgt
gaatgccctcctggtcatgaagtggccccagataattctgcgtgtatagatatcaatgaa
tgtgacctcagtactgatctctgcagacatggcagatgtataaaccttattggcagatac
cagtgtgcctgtgaacctggatatcagttaacaccagataaactatcctgtgttgacaca
aatgagtgtgatttcttcaatggaggatgtgacaccttctgtaccaactctgaaggaagc
tatgagtgccactgcagagacgggtatgctctaatgcctgaccaccgaacatgtactgat
attgatgagtgtgagaataatccaaatatttgcgatgggggtcaatgtaccaacattcct
ggagaatacaggtgcttgtgctttgaaggattcatggcatcagatgatatgaaaacttgc
ctggatgtcgatgagtgtgaacttcacttgaacatctgtcttagtggaagctgtgagaac
actaaaggttcattcatctgtcactgcgattctggttattctggcaaaaaaggacaaact
ggatgcacagatatcaatgagtgtgagattggagcccataactgtgacaggcacgctatc
tgtacaaatactccagggagtttcaaatgcagttgcagtccaggatgggaaggaaatgga
atcaaatgcaaagatcaagatgagtgctcaaatggaacgcatttgtgtagccctaatgct
gactgtaagaacacaatgggatcgtacagatgtttgtgcagagaaggatacgaaggggat
ggatttacatgcacagacattgatgagtgcacagcaaatctgaatctatgtggaaatggc
cagtgcctgaataccccaggaggataccgctgtgattgtgacatgggatttttaccaggt
gttgatgggaaggcatgtgaagacattgatgaatgcactttgcccaacatctgtgtgttt
ggaacatgccgaaatcttcctggccttttccgctgtgactgtgacatcggctatgagttg
gacagaactgggggtaactgcacagatgtggatgaatgtgctgaaccaacaatgtgtatc
agtggtacttgcctgaatactgctggcagctacagctgtgattgtcctccagattttgag
ctgaacccaacaaaggtcggatgtgtcgacaccagatctggaacttgttatttggatgtg
aaaccacggggagataatggagatgtgtcctgcagtaatgaaattggagttagtgttcca
aaggcttcttgctgttgctcccttggaaaagcctgggggacaccatgtgaactgtgtcca
gctgtaaactcaagtgaatataaagtattgtgtcctggtggagaagggtttaaaccaaat
cctattacagttatcttggaagatattgatgaatgcctggagttgcctggtctttgtcag
ggtggaaagtgtatcaacacgtttgggagctttcagtgtcgctgtccacctggattctac
cttaatgaagagacccgtgtttgtgatgatgtcaatgaatgtgatcagcctggcatttgt
ggacctggaacatgctttaacactgttggaaactatacctgcatatgtcctcctgattac
atgcaagtcaatggaggaaataattgcatggatatgagaaggagtttatgcttcagaaat
tattatgctgaaaaccaaacctgtgatggagaactgctttacaacatgacgaaaaagatg
tgttgctgttcctataatattggccgagcatggcacagaccttgtgaggaatgtcctttg
ccaagtactgatgaatttgcaagtctttgtggaagtgcaagacctggatttttgattgat
atttacacagggctgcctgttgacattgacgagtgcagagaaattcccggagtgtgtgaa
aatggagtttgtataaatatggtgggaagcttcaggtgcgaatgtcccatgggatttttc
tacaatgacaaacttctgatatgtgaagatatcgatgaatgccagaacgggcctgtatgt
caaagaaatgcagactgtgtaaacactccaggaagttatcgctgtgactgcaaacctggt
tacaagtttacatccacaggacaatgtgttgatcgcaacgaatgccaagaaattccaaat
gtatgcagtcatggagaatgcacggacaccacaggagggtattattgtgtttgtcacaat
ggatttaaaacaaatgaagatcagacaatgtgtctggatattaatgagtgtgaacgagat
ccttgtggaaatggaacttgtaaaaacactattggttcctacaactgtcgctgctttgat
ggatttattctgtcccacaataatgactgcatagatatagatgaatgtaccacccttaat
ggacagctatgtagaaatggacagtgtgttaataccattggatcttttgagtgcctgtgc
aatgaggggtatgagatggcatctgatggacgaacttgtcttgatatcaatgagtgtgcc
cttgatcccggcaaatgtgcaccaggcacttgccagaatctagatggtacataccggtgc
atctgtcccccaggatatctgttgaaggaggacacatgtgaagacattaatgaatgtgaa
gaagaacctgaaacctgcgctttgggtacctgcagcaatgttcctgggagtttcacatgt
ctttgcccagaaggttttgtgctgtcgtctacaggaaagagatgtcaagatttaagagta
agtttatgcttcgctaagtttgaggagggacagtgcacttctcccaaggctcgaaatcac
tccaaacaggaatgctgttgtgccttgaaaggagccggatggggatctccatgtgaactg
tgcccagtggaaggagatgaagccttccgtcagatttgccccttcggaagtggagtagtt
gttggcttagacgatgaacgagttgatatggatgaatgtattgacccagacaaatgcaaa
aatggacagtgtattaacacagatggttcctatcggtgtgaatgctcctttggatatgtt
ctttcaggagacgaatgtatagatatcgatgaatgttctgagggaaacccttgtggcaat
gggacatgcaagaatatcattggtggatttgagtgcacttgcgaggagggctttgagcca
ggtccaatgatgtcctgtgaagatgtgaatgaatgtgctcagaatcccctgttgtgtgca
ttccgttgtgtcaatacttatggatcttatgaatgcaagtgtccagcaggatacgttctc
cgggaagacaagagaatgtgcaaagatcaagacgagtgtgaagatgaagctcatgattgt
gaatcgaaacaaatgacttgcaagaatctaattggaacatacatgtgcatatgtggaccc
ggatatcagcgtagattggatggtgaaggatgcatggatctgaacgaatgcctaaaacca
ggagtttgcgacaatggaaagtgtgtgaacacaatgggaagttacaaatgtgactgtctt
gagggtttcaatgcgagtgctactgagacagaatgcattgacaacaggctgggctattgc
tttactgaagtgttacataccatgtgccagatcggatcttccaacaagaattcagtcacc
aagtccgaatgctgttgcaactctggcagaggctggggtataaattgtgagatttgcccc
ttccaaggcacagttcagtttaagaagctttgtccttatggtaaaggattcaccactggt
ggagaagatattgatgagtgtcaagtgcttcatggcatctgccagaatggacaatgcgtt
aatgagagagggacgtatcggtgtgagtgcaatcctggttatgtacccgatatgactggc
acgtcttgcatagatctggatgagtgcagacagtcacccaaaccttgcaactttatatgt
aaaaacacagaggggagtttccagtgttcttgcccaagaggatacattctgcaggaggat
ggaagaagctgcaaagaccttgatgaatgtgcaatgaagcaacataactgccagtttatt
tgtgttaacaccatcggaggattcacatgtaaatgtccccctggtttcacacagcatcac
acagcatgcattgacaacaacgagtgtgcttcagatgttagcctatgtggagctaaaggt
atctgccagaattccccagggagctattcttgtgactgccagcgtggatttagtctggat
cagagtggagcttcttgtgaagatgtggatgagtgtgaaggaagtcatcgttgtcaacac
ggatgccagaacatagttggagggtatagatgtggctgcccacaaggatatcttcaacat
taccagtggaatcagtgtgtggatgagaacgaatgtatgagtgcccatatctgtggagga
gcctcctgccacaatactcttggaagcttcaagtgcatgtgtcctacaggatttcagttt
gagcagtttgctggagcttgccaagatgtcaatgaatgcagttcttctcaagcaccttgc
agttttggctgttctaacacagaaggtggctacgtgtgtgggtgtccatctggatacttc
cgaataggacaaggtcactgtgtaacaggagcaggaataagtagagctcaggatatggct
gtcagtggcgaaatagatgacaactccctgtcacctgaagcgtgctatgactgtaaaata
aatggctatcctaagagaggaaggaaaagaaggagcactaatgagacaggcataaatgac
gaagaggaacaacttgaacctccagttagtcttgcaagttgggatatcgaaaaaccatta
atcctatctttcaacatatctcacgtaaacaacaaagaccgtattttagagctcacccct
gccctaactacgttaacgaaccacaacagatatttaatagactctggaaacgaagatgga
ctcttcagaataaatcaaaaagatggtgtaagttacttacacctgtcaaagaagaagcca
gtgcctggttcttactccctacagatcaacagtgttcctctgtacaaggagaaagagctt
atccaacttgaagataaacacgacagagactacctcagtggggaactgggcgacattctt
caaatgaaaattacaatcttactccattaa
DBGET
integrated database retrieval system